MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP1

Total Repeats: 481

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014621	GCC	2	6	810	815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014621	GGA	2	6	816	821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014621	CGA	3	9	2782	2790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014621	GAA	2	6	2872	2877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014621	GGC	2	6	3060	3065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014621	CGT	3	9	3088	3096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014621	GAA	2	6	3124	3129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014621	GAT	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014621	CCA	2	6	3265	3270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014621	GAT	2	6	3293	3298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014621	GCC	2	6	3299	3304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014621	TGA	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014621	CAC	2	6	3395	3400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014621	TCA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014621	GAG	2	6	3620	3625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014621	CGC	2	6	3671	3676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014621	GCG	2	6	3807	3812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014621	CAT	2	6	3814	3819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014621	GCA	2	6	3890	3895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014621	CGT	2	6	3919	3924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014621	CGA	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014621	GTG	2	6	3968	3973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014621	CCG	2	6	4065	4070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014621	GCC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014621	GTG	2	6	4179	4184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014621	ATG	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014621	ATG	2	6	4336	4341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014621	CAG	2	6	4482	4487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014621	TCT	2	6	4564	4569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014621	GCT	2	6	4659	4664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014621	GGC	2	6	4768	4773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014621	ATT	2	6	5866	5871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014621	GTA	2	6	8832	8837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014621	GTT	2	6	8850	8855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014621	GGC	2	6	8856	8861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014621	CGC	2	6	9817	9822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014621	TGT	2	6	9856	9861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014621	GAC	2	6	11929	11934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014621	CCG	2	6	12420	12425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014621	TGT	2	6	12449	12454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014621	GCC	2	6	12529	12534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014621	CAT	2	6	13553	13558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014621	CCG	4	12	13564	13575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014621	CGC	4	12	13584	13595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014621	CGC	2	6	13623	13628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014621	CTC	2	6	13641	13646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014621	AGG	2	6	17409	17414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014621	TGC	2	6	22200	22205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014621	GCA	2	6	22238	22243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014621	CAT	2	6	22273	22278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014621	ACG	2	6	24618	24623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014621	CAG	2	6	27085	27090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014621	ATC	2	6	27168	27173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014621	GCG	2	6	27177	27182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014621	ACA	2	6	31015	31020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014621	GCA	2	6	31031	31036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014621	CGA	2	6	31069	31074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014621	TCT	2	6	31094	31099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014621	CAT	2	6	31200	31205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014621	GCG	2	6	31224	31229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014621	TCG	2	6	31269	31274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014621	TGC	2	6	31357	31362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014621	GCG	2	6	31377	31382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014621	TCG	2	6	31516	31521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014621	CCG	2	6	31781	31786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014621	CCT	2	6	31787	31792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_014621	TGC	2	6	31796	31801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014621	GCC	2	6	34788	34793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014621	GCC	2	6	34912	34917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014621	ACC	2	6	34923	34928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014621	CGG	2	6	34950	34955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014621	CTG	2	6	34988	34993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014621	CGG	2	6	35031	35036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014621	CCA	2	6	35067	35072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014621	TCG	2	6	35156	35161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014621	GGC	2	6	35228	35233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014621	CGC	2	6	35338	35343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014621	GCC	2	6	35422	35427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014621	GAT	2	6	35441	35446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014621	GCT	2	6	35643	35648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014621	TCT	2	6	35653	35658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014621	GCG	3	9	35757	35765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014621	GGA	2	6	35824	35829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014621	GGT	2	6	35866	35871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014621	GCG	2	6	35901	35906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014621	TGG	2	6	36021	36026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014621	GGC	2	6	36049	36054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014621	GCG	2	6	36101	36106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014621	GTG	2	6	36185	36190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014621	CAT	2	6	36206	36211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014621	GAT	2	6	36286	36291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014621	TGC	2	6	36309	36314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014621	GAT	2	6	36406	36411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014621	GCC	2	6	36436	36441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014621	TCG	2	6	36772	36777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014621	ACC	2	6	36821	36826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014621	ATC	2	6	36902	36907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014621	GAT	2	6	36932	36937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014621	CGG	2	6	36939	36944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014621	GGC	2	6	36949	36954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014621	CGG	2	6	36984	36989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014621	CGG	2	6	37140	37145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014621	GGC	2	6	37177	37182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014621	GCT	2	6	37198	37203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014621	GGC	3	9	37312	37320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014621	CGA	2	6	37465	37470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014621	CCG	2	6	37473	37478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014621	TGC	2	6	37500	37505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014621	GCG	2	6	37607	37612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014621	TGC	2	6	37683	37688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014621	GCG	2	6	37691	37696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014621	TGG	2	6	37731	37736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014621	ACG	2	6	37829	37834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014621	GCG	2	6	37853	37858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014621	GCG	2	6	37888	37893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014621	GGA	2	6	37896	37901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014621	ATC	2	6	38002	38007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014621	GCA	2	6	38045	38050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014621	CGA	2	6	38145	38150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014621	GCG	2	6	38156	38161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014621	GCT	2	6	38271	38276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014621	TGA	2	6	38360	38365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014621	ACC	2	6	38419	38424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014621	TGA	2	6	38430	38435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014621	GGC	2	6	38509	38514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014621	CCG	2	6	38531	38536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014621	GCC	2	6	38667	38672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014621	TCG	2	6	38713	38718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014621	GCG	2	6	38927	38932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014621	CTG	2	6	39007	39012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014621	CGC	2	6	39015	39020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014621	GGC	2	6	39023	39028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014621	GCA	2	6	39048	39053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014621	TGG	2	6	39055	39060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014621	TTC	2	6	39226	39231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014621	GCT	2	6	39408	39413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014621	CGC	2	6	39544	39549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014621	TGA	2	6	39558	39563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014621	GCC	2	6	39583	39588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014621	GGC	2	6	39627	39632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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409	NC_014621	ATG	2	6	234994	234999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_014621	TGG	2	6	235014	235019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
412	NC_014621	GGC	2	6	235069	235074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.