MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Kocuria rhizophila DC2201

Total Repeats: 8352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010617	TGG	2	6	2585700	2585705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_010617	CG	3	6	2585709	2585714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_010617	TGGG	2	8	2585715	2585722	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_010617	G	8	8	2585794	2585801	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_010617	AT	3	6	2585867	2585872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_010617	GCC	2	6	2585894	2585899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_010617	CGG	2	6	2585946	2585951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_010617	CCCCG	2	10	2585956	2585965	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
8009	NC_010617	GGA	2	6	2585982	2585987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_010617	GCG	2	6	2587165	2587170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_010617	GTGC	2	8	2587216	2587223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8012	NC_010617	GCA	2	6	2587270	2587275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_010617	TGC	2	6	2587346	2587351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_010617	AGG	2	6	2587380	2587385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_010617	GAA	2	6	2588271	2588276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_010617	CGG	2	6	2591628	2591633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_010617	ACG	3	9	2593224	2593232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_010617	CG	3	6	2593234	2593239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_010617	CG	4	8	2593243	2593250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8020	NC_010617	GGA	2	6	2593336	2593341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_010617	GCGT	2	8	2593364	2593371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8022	NC_010617	AGG	2	6	2593381	2593386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_010617	AAC	2	6	2595615	2595620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_010617	GCA	2	6	2595622	2595627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_010617	CGA	2	6	2595730	2595735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8027	NC_010617	CGG	2	6	2595761	2595766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_010617	ACCCG	2	10	2595785	2595794	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8029	NC_010617	GGAC	2	8	2595796	2595803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8030	NC_010617	ACC	3	9	2595828	2595836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_010617	CT	3	6	2597376	2597381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8033	NC_010617	CGG	2	6	2597642	2597647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8037	NC_010617	TCGGGT	2	12	2597783	2597794	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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8039	NC_010617	CCG	2	6	2597838	2597843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_010617	CCG	2	6	2597847	2597852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_010617	CCG	2	6	2597854	2597859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_010617	AGG	2	6	2597863	2597868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_010617	GCG	2	6	2598790	2598795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_010617	GC	3	6	2598835	2598840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8045	NC_010617	GCG	2	6	2598852	2598857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_010617	CACC	2	8	2598927	2598934	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8047	NC_010617	TGA	2	6	2598942	2598947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_010617	AAC	2	6	2598977	2598982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_010617	GCT	2	6	2598999	2599004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8054	NC_010617	GCA	2	6	2599543	2599548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8056	NC_010617	CTG	2	6	2599581	2599586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_010617	CGG	2	6	2599607	2599612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_010617	GGGT	2	8	2599642	2599649	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_010617	GA	3	6	2599687	2599692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8062	NC_010617	CG	3	6	2600298	2600303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_010617	CCTGC	2	10	2600736	2600745	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8064	NC_010617	GCG	2	6	2601793	2601798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_010617	CGGTG	2	10	2601820	2601829	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8066	NC_010617	GCC	2	6	2601858	2601863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8067	NC_010617	TCC	2	6	2605469	2605474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8069	NC_010617	GTC	2	6	2605508	2605513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_010617	GTC	2	6	2605517	2605522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8073	NC_010617	CGCC	2	8	2609360	2609367	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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8084	NC_010617	GACG	2	8	2613597	2613604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_010617	GAG	2	6	2613632	2613637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_010617	TCG	2	6	2615348	2615353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_010617	GCC	2	6	2615386	2615391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8096	NC_010617	TCGG	2	8	2616737	2616744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8100	NC_010617	CGG	2	6	2616865	2616870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8107	NC_010617	CG	3	6	2618419	2618424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8110	NC_010617	TGG	2	6	2620796	2620801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8112	NC_010617	CAC	2	6	2621555	2621560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8113	NC_010617	GGC	2	6	2621592	2621597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_010617	GC	3	6	2621625	2621630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8115	NC_010617	GCC	2	6	2621641	2621646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_010617	GCGCG	2	10	2621676	2621685	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8117	NC_010617	GC	3	6	2621693	2621698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8118	NC_010617	GCG	2	6	2621711	2621716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8123	NC_010617	CGA	2	6	2624499	2624504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_010617	AC	3	6	2624553	2624558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_010617	CG	3	6	2624572	2624577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8126	NC_010617	CG	3	6	2624583	2624588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_010617	CGT	2	6	2624590	2624595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8129	NC_010617	GGA	2	6	2624614	2624619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_010617	CTG	2	6	2625459	2625464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_010617	CAA	2	6	2625488	2625493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_010617	CCT	2	6	2625502	2625507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8133	NC_010617	CGT	2	6	2625528	2625533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8134	NC_010617	CCA	2	6	2625545	2625550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8135	NC_010617	GGCA	2	8	2625847	2625854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8136	NC_010617	GAT	2	6	2625907	2625912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8137	NC_010617	TTGCA	2	10	2625939	2625948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8138	NC_010617	CCGT	2	8	2626029	2626036	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8139	NC_010617	GACC	2	8	2626080	2626087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8140	NC_010617	AGG	2	6	2626094	2626099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8141	NC_010617	CCCG	2	8	2629041	2629048	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8142	NC_010617	ACC	3	9	2629074	2629082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8143	NC_010617	TGCAC	2	10	2630453	2630462	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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8148	NC_010617	GGGGC	2	10	2632143	2632152	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8149	NC_010617	GAG	2	6	2632157	2632162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8151	NC_010617	CG	3	6	2632607	2632612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8152	NC_010617	CCGC	2	8	2632617	2632624	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8153	NC_010617	CG	3	6	2633922	2633927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8154	NC_010617	GAC	2	6	2633928	2633933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8157	NC_010617	CCG	2	6	2634936	2634941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8159	NC_010617	GGA	2	6	2640786	2640791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8161	NC_010617	GC	3	6	2640836	2640841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8162	NC_010617	CCG	2	6	2640891	2640896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8163	NC_010617	GCC	2	6	2640945	2640950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8164	NC_010617	GAG	2	6	2643065	2643070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8165	NC_010617	GC	3	6	2644718	2644723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8166	NC_010617	ACG	3	9	2644729	2644737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8172	NC_010617	GCG	3	9	2644857	2644865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8174	NC_010617	GT	3	6	2646347	2646352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8202	NC_010617	GGA	2	6	2658341	2658346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8211	NC_010617	ACG	2	6	2661209	2661214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8229	NC_010617	GC	3	6	2665113	2665118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8230	NC_010617	CGT	3	9	2665134	2665142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8231	NC_010617	GGGC	2	8	2665147	2665154	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8232	NC_010617	CGGG	2	8	2665165	2665172	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8233	NC_010617	GTGC	2	8	2665175	2665182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8234	NC_010617	AAG	2	6	2665222	2665227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8243	NC_010617	ACT	2	6	2668429	2668434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8246	NC_010617	GGCCC	2	10	2671245	2671254	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8247	NC_010617	TGG	2	6	2671274	2671279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8248	NC_010617	GGT	2	6	2671300	2671305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8249	NC_010617	CTT	2	6	2671400	2671405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8250	NC_010617	CGG	2	6	2671438	2671443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8251	NC_010617	ACC	2	6	2671450	2671455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8252	NC_010617	CGT	2	6	2671457	2671462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8253	NC_010617	CACC	2	8	2671470	2671477	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8254	NC_010617	GC	3	6	2671513	2671518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8255	NC_010617	GCA	2	6	2671538	2671543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8256	NC_010617	ACG	3	9	2671550	2671558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8257	NC_010617	CACC	2	8	2671567	2671574	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8258	NC_010617	CG	3	6	2671598	2671603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8259	NC_010617	GGCA	2	8	2671622	2671629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8260	NC_010617	ACG	2	6	2672170	2672175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.