MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 plasmid pKRAD01

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009806	CACCC	2	10	1489	1498	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_009806	ATGGG	2	10	13153	13162	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009806	CGCAG	2	10	13170	13179	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009806	GACAC	2	10	19587	19596	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009806	CGCCA	2	10	31020	31029	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_009806	CAGCG	2	10	34948	34957	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009806	AGCGC	2	10	36627	36636	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009806	CAAGC	2	10	42999	43008	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009806	GTCAG	2	10	43076	43085	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009806	GCTGG	2	10	56583	56592	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009806	GCCCC	2	10	66339	66348	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12	NC_009806	TCACG	2	10	70195	70204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009806	GCCCG	2	10	71900	71909	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_009806	GCACC	2	10	73215	73224	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_009806	AGCTC	2	10	77965	77974	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009806	CGGAC	2	10	101266	101275	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009806	CTGCG	2	10	106457	106466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009806	CGCGC	2	10	118123	118132	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_009806	GCGCG	2	10	137186	137195	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009806	CACGA	3	15	144322	144336	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009806	GTCCC	2	10	144939	144948	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009806	CTGTC	2	10	157114	157123	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009806	GGGGC	2	10	162795	162804	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009806	GGGAG	2	10	162888	162897	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009806	CCTGA	2	10	163185	163194	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009806	TGGCG	2	10	163504	163513	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009806	CGTCG	2	10	168866	168875	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009806	GGTGC	2	10	171401	171410	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009806	CGGCG	2	10	171432	171441	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009806	TCGTG	2	10	173765	173774	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009806	CGGGG	2	10	173822	173831	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009806	GGGGT	2	10	176025	176034	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009806	GGGGT	2	10	181432	181441	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.