MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN5

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009651	CAGG	2	8	743	750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009651	TCCT	2	8	3710	3717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009651	AGGG	2	8	7633	7640	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009651	CCGT	2	8	9956	9963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009651	GCGG	2	8	10108	10115	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009651	CTGC	2	8	13975	13982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009651	TTTA	2	8	16482	16489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009651	CTCC	2	8	16502	16509	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_009651	TCAT	2	8	17586	17593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009651	CAAG	2	8	17759	17766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009651	ATCA	2	8	18049	18056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009651	TACA	2	8	21429	21436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009651	TGCC	2	8	21478	21485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009651	GCCA	2	8	21499	21506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009651	CGAG	2	8	22829	22836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009651	GGCG	2	8	24035	24042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009651	CAGC	2	8	24352	24359	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009651	ACTA	2	8	27282	27289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009651	AAGT	2	8	29918	29925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009651	GACA	2	8	30099	30106	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009651	TTTA	2	8	30421	30428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009651	AATA	2	8	31872	31879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009651	CTTT	2	8	33989	33996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009651	GCGG	2	8	34053	34060	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009651	CCGA	2	8	35377	35384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009651	TGAA	2	8	36950	36957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009651	CCGC	2	8	37370	37377	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_009651	TTTG	2	8	39583	39590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009651	TAAT	2	8	41318	41325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009651	CGTT	2	8	45532	45539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009651	TTTG	2	8	45622	45629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009651	AGCC	2	8	45917	45924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009651	TATC	2	8	45947	45954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009651	GGAA	2	8	46283	46290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009651	GCCT	2	8	49755	49762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009651	TCCC	2	8	49888	49895	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_009651	AAGG	2	8	50172	50179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009651	CCAC	2	8	53437	53444	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_009651	TTTG	2	8	53504	53511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009651	CTGG	2	8	53528	53535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009651	ATTT	2	8	56348	56355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009651	TCCC	2	8	56356	56363	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_009651	TCGC	2	8	57134	57141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009651	TTGC	2	8	57394	57401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009651	TAAA	2	8	61511	61518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009651	TAAC	2	8	61629	61636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009651	TTTA	2	8	64925	64932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009651	GGGC	2	8	71452	71459	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009651	ATTG	2	8	75008	75015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009651	CGCC	2	8	75130	75137	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_009651	TGGG	2	8	76403	76410	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009651	GGGT	2	8	76425	76432	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009651	GATC	2	8	76465	76472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009651	CTGC	2	8	82105	82112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009651	AATT	2	8	82203	82210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009651	AGGG	2	8	82305	82312	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009651	CAGA	2	8	82329	82336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009651	ACAA	2	8	83670	83677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009651	CTGC	2	8	84301	84308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009651	AATC	2	8	87538	87545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.