MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 380

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	AGA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009650	CATG	2	8	430	437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009650	CT	3	6	1117	1122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009650	T	6	6	1122	1127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009650	T	8	8	1185	1192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009650	TGA	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009650	CTG	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009650	TGAA	2	8	1246	1253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009650	AATA	2	8	1254	1261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009650	AGC	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009650	TA	3	6	1325	1330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009650	TAA	2	6	1372	1377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009650	A	8	8	1441	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009650	AAG	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009650	GAA	2	6	4096	4101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009650	ATT	2	6	4118	4123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009650	T	6	6	4122	4127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009650	ATG	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009650	CGT	2	6	4244	4249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009650	CTC	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009650	TTAC	2	8	4921	4928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009650	TATCT	2	10	4964	4973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009650	CTA	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009650	CT	3	6	5031	5036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009650	AAGT	2	8	5122	5129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009650	GTA	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009650	TCC	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009650	TTG	2	6	5509	5514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009650	AAT	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009650	TGA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009650	TCT	2	6	5614	5619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009650	GGAA	2	8	5631	5638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009650	TTCC	2	8	6632	6639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009650	A	6	6	6642	6647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009650	CCGG	2	8	6649	6656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009650	CTA	2	6	6688	6693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009650	TAT	2	6	6696	6701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009650	TAA	2	6	6935	6940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009650	GCCC	2	8	6997	7004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_009650	AG	4	8	7043	7050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009650	GCCA	2	8	7140	7147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009650	CAC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009650	GCC	3	9	7174	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009650	TGT	2	6	7226	7231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009650	GTG	2	6	7256	7261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009650	CAG	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009650	ATT	2	6	7426	7431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009650	T	6	6	7451	7456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009650	TCGCT	2	10	7462	7471	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009650	ACGC	2	8	7549	7556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009650	A	7	7	7573	7579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009650	AAG	2	6	7581	7586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009650	AG	3	6	7585	7590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009650	T	6	6	7620	7625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009650	CAC	2	6	7633	7638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009650	A	7	7	7663	7669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009650	ATG	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009650	GAT	2	6	10004	10009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009650	CAC	2	6	10018	10023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009650	CTT	2	6	10069	10074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009650	CGG	2	6	10980	10985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009650	CG	4	8	10990	10997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009650	T	6	6	11776	11781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009650	CAC	2	6	11794	11799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009650	GTT	2	6	11828	11833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009650	T	6	6	11851	11856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009650	CGC	2	6	11878	11883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009650	T	6	6	11909	11914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009650	ATTA	2	8	11989	11996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009650	GGCCT	2	10	14623	14632	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009650	TGG	2	6	14667	14672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009650	GTT	2	6	14752	14757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009650	GAGCA	2	10	14812	14821	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009650	GC	3	6	14823	14828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009650	GGCG	2	8	14836	14843	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009650	TGA	2	6	14856	14861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009650	CTT	2	6	14878	14883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009650	GTT	2	6	14887	14892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009650	CCTG	2	8	17941	17948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009650	ATA	2	6	18050	18055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009650	ATA	2	6	18682	18687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009650	AAT	2	6	18812	18817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009650	GCC	2	6	19481	19486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_009650	TGA	2	6	20356	20361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009650	A	7	7	20361	20367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009650	TGC	3	9	20371	20379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009650	TGA	2	6	20429	20434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009650	CAT	2	6	20456	20461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009650	CGT	2	6	20511	20516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009650	GT	3	6	20515	20520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009650	GA	3	6	20633	20638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009650	ACAA	2	8	20647	20654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009650	TGT	2	6	20684	20689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009650	GCA	2	6	20699	20704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009650	GTC	2	6	20825	20830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009650	TCT	2	6	20864	20869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009650	AGCGGC	2	12	20976	20987	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009650	GTC	2	6	21022	21027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009650	TGGGC	2	10	21043	21052	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009650	A	7	7	21055	21061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009650	GTT	2	6	21072	21077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009650	AGGAA	2	10	21095	21104	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009650	CGG	2	6	21119	21124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009650	CG	3	6	21245	21250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009650	TAT	2	6	21327	21332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009650	ATA	2	6	21345	21350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009650	AT	3	6	21371	21376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009650	CGGTT	2	10	21407	21416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009650	GAC	2	6	21421	21426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009650	ATA	2	6	21729	21734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009650	AAT	2	6	21859	21864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009650	AT	3	6	22763	22768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009650	GATT	2	8	22775	22782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009650	TTTAA	2	10	22795	22804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009650	GAT	2	6	23287	23292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009650	CAC	2	6	23301	23306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009650	CCT	2	6	25959	25964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009650	GCC	2	6	27688	27693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009650	TGT	2	6	28153	28158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009650	GTC	2	6	28246	28251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009650	GAC	2	6	28258	28263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009650	TA	3	6	29754	29759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009650	CTGA	2	8	29763	29770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009650	TGTTT	2	10	29798	29807	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009650	TCC	2	6	30463	30468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009650	TGT	2	6	30605	30610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009650	TC	3	6	30613	30618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009650	A	6	6	30637	30642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009650	GC	3	6	30673	30678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009650	TGT	2	6	30733	30738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009650	TCCC	2	8	30740	30747	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_009650	CAC	2	6	30768	30773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_009650	TC	3	6	30796	30801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009650	CGGA	2	8	30849	30856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009650	TTA	2	6	30897	30902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009650	CAGTG	2	10	30904	30913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009650	ATG	2	6	30926	30931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009650	TAT	2	6	30989	30994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009650	CGGG	2	8	30995	31002	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009650	ATTA	2	8	31005	31012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009650	CAA	2	6	32043	32048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009650	AAT	2	6	33622	33627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009650	T	6	6	33698	33703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009650	TGT	2	6	33711	33716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009650	GAT	2	6	33734	33739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009650	TCT	2	6	33741	33746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009650	A	6	6	33805	33810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009650	CTGA	2	8	33826	33833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009650	TCG	2	6	33962	33967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009650	GAAGA	2	10	34003	34012	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009650	TCT	2	6	34044	34049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_009650	GTC	2	6	34080	34085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_009650	CAGC	2	8	34140	34147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_009650	GAG	2	6	34196	34201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009650	TAG	2	6	34202	34207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009650	TAA	2	6	34238	34243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009650	ATT	2	6	34302	34307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009650	TG	3	6	34346	34351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009650	CAG	2	6	34382	34387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_009650	CG	3	6	34417	34422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_009650	CT	3	6	34703	34708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_009650	A	6	6	34712	34717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009650	CAGC	2	8	34749	34756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
164	NC_009650	GCT	2	6	35295	35300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009650	CAC	2	6	35324	35329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_009650	TTGG	2	8	35347	35354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009650	CT	3	6	35370	35375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_009650	GGAT	2	8	43329	43336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009650	ATT	2	6	43402	43407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_009650	ATT	2	6	43514	43519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009650	T	9	9	43523	43531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009650	A	6	6	43535	43540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009650	A	6	6	43559	43564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_009650	CATGA	2	10	43593	43602	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_009650	AGC	2	6	43603	43608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_009650	GAAA	2	8	44415	44422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
177	NC_009650	A	6	6	44427	44432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_009650	T	6	6	44438	44443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_009650	CA	3	6	44488	44493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
180	NC_009650	ATG	2	6	46699	46704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_009650	ATTG	2	8	46722	46729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009650	ACA	2	6	46745	46750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_009650	ATT	2	6	46771	46776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009650	TTG	2	6	46790	46795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009650	GT	3	6	46870	46875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009650	GATGCT	2	12	46924	46935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
187	NC_009650	ATC	2	6	47930	47935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_009650	AT	3	6	47994	47999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009650	GCG	2	6	48270	48275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_009650	ACT	2	6	48279	48284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_009650	CT	4	8	48287	48294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
192	NC_009650	GTG	2	6	48344	48349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
193	NC_009650	ATG	2	6	48384	48389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
194	NC_009650	TCA	2	6	48456	48461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_009650	GGA	2	6	48482	48487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
196	NC_009650	TCG	2	6	48491	48496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_009650	CAGCTG	2	12	48499	48510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_009650	ATG	2	6	48610	48615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
199	NC_009650	TGA	2	6	48701	48706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_009650	TC	3	6	48812	48817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
202	NC_009650	CTG	2	6	48840	48845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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229	NC_009650	AGG	2	6	54836	54841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
230	NC_009650	CCCGG	2	10	54883	54892	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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271	NC_009650	GCG	2	6	58124	58129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_009650	CAG	2	6	58173	58178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_009650	GCC	2	6	58812	58817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_009650	GGC	2	6	58826	58831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_009650	GCG	2	6	60885	60890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_009650	CTG	2	6	60987	60992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_009650	GCG	2	6	61293	61298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_009650	GCG	2	6	61510	61515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.