MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN3

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009649	TATCT	2	10	4964	4973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009649	CAGGG	2	10	7598	7607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009649	TTGCG	2	10	20092	20101	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009649	TTATC	2	10	27747	27756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009649	TGATG	2	10	27939	27948	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009649	AACTG	2	10	34185	34194	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009649	GCTTG	2	10	39408	39417	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009649	ACGAG	2	10	44480	44489	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009649	AACAC	2	10	55944	55953	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009649	ATCAT	2	10	58764	58773	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009649	ATATC	2	10	58835	58844	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009649	TATCA	2	10	58873	58882	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009649	CCCGG	2	10	64277	64286	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_009649	AAAAT	2	10	68098	68107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009649	AGACC	2	10	72932	72941	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009649	CATCG	2	10	74016	74025	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009649	TAAAT	2	10	79103	79112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009649	AATGA	2	10	79132	79141	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009649	CGTCG	2	10	85192	85201	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009649	CTGTC	2	10	85323	85332	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009649	AGGCA	2	10	87159	87168	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009649	TTATC	2	10	92735	92744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009649	ATCAC	2	10	94714	94723	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009649	CTGTA	2	10	100785	100794	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009649	AGACG	2	10	108448	108457	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009649	ACAGA	2	10	108561	108570	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009649	TCACA	2	10	117422	117431	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009649	GGAGA	2	10	119636	119645	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009649	GAGTG	2	10	121335	121344	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009649	GCCAT	2	10	121634	121643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009649	TCGCG	2	10	121738	121747	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009649	GTGCC	2	10	121829	121838	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009649	CTGCG	2	10	121990	121999	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009649	CCTCA	2	10	122683	122692	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_009649	GCCGC	2	10	123721	123730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_009649	TTTCC	2	10	126822	126831	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009649	CTGGT	2	10	133763	133772	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009649	GTAGC	2	10	134190	134199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009649	GCCGC	2	10	135416	135425	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_009649	TTTCC	2	10	137916	137925	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009649	GCCGC	2	10	138204	138213	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_009649	TACCG	2	10	151985	151994	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009649	TTCGG	2	10	152198	152207	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009649	CGTAT	2	10	175218	175227	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.