MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN3

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009649	CATG	2	8	430	437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009649	TGAA	2	8	1246	1253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009649	AATA	2	8	1254	1261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009649	TTAC	2	8	4921	4928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009649	AAGT	2	8	5122	5129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009649	GGAA	2	8	5631	5638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009649	TTCC	2	8	6632	6639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009649	CCGG	2	8	6649	6656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009649	GCCC	2	8	6997	7004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_009649	GCCA	2	8	7140	7147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009649	TTAT	2	8	8045	8052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009649	TGAG	2	8	20070	20077	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009649	ATTT	2	8	21607	21614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009649	TGAC	2	8	21621	21628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009649	TCTG	2	8	22709	22716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009649	CTCC	2	8	23007	23014	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_009649	TCAT	2	8	24091	24098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009649	CAAG	2	8	24264	24271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009649	CGGG	2	8	25853	25860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009649	AATA	2	8	29608	29615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009649	GCTT	2	8	30871	30878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009649	ATGA	2	8	31045	31052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009649	ATTA	2	8	32147	32154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009649	GGGT	2	8	34298	34305	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009649	GGTG	2	8	34647	34654	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009649	ATCA	2	8	34772	34779	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009649	GATG	2	8	39387	39394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009649	CACC	2	8	39473	39480	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_009649	AGGA	2	8	42498	42505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009649	CGGA	2	8	43096	43103	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009649	TCGT	2	8	44455	44462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009649	GGCA	2	8	47628	47635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009649	ATGA	2	8	50991	50998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009649	GCTG	2	8	56708	56715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009649	TTTA	2	8	56717	56724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009649	ATTT	2	8	56840	56847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009649	TGAC	2	8	63977	63984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009649	CAGC	2	8	64093	64100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009649	ACCA	2	8	64978	64985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009649	GGCA	2	8	65533	65540	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009649	CAGC	2	8	65730	65737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009649	CAGG	2	8	68158	68165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009649	GATG	2	8	71315	71322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009649	ATGA	2	8	72150	72157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009649	CAAA	2	8	72236	72243	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009649	ATTC	2	8	72485	72492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009649	ACTG	2	8	72684	72691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009649	CAGC	2	8	72906	72913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009649	TTTA	2	8	76299	76306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009649	TTCA	2	8	81021	81028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009649	TAAG	2	8	84582	84589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009649	GCTG	2	8	84814	84821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009649	TGGT	2	8	84846	84853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009649	CACC	2	8	85008	85015	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_009649	GCCC	2	8	85116	85123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_009649	GACA	2	8	85141	85148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009649	TCCC	2	8	86093	86100	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_009649	GGCA	2	8	86910	86917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009649	CACG	2	8	87029	87036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009649	TCAT	2	8	88627	88634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009649	AATG	2	8	88650	88657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009649	ATTA	2	8	89062	89069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009649	TTGG	2	8	93732	93739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009649	TCCT	2	8	96319	96326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009649	TAAT	2	8	97124	97131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009649	GCTT	2	8	100711	100718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009649	GTCA	2	8	100797	100804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009649	ATAG	2	8	100941	100948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009649	GCTC	2	8	101263	101270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009649	GATA	2	8	104544	104551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009649	CGCC	2	8	105171	105178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_009649	GTGA	2	8	105666	105673	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009649	CATT	2	8	106876	106883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009649	AAAT	2	8	108357	108364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009649	CGGA	2	8	108801	108808	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009649	GTGC	2	8	109193	109200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009649	CCCT	2	8	110030	110037	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_009649	ACAG	2	8	110308	110315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009649	AATA	2	8	110587	110594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009649	ATAC	2	8	111747	111754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009649	CAGA	2	8	111831	111838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009649	AGTA	2	8	112094	112101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009649	ACGT	2	8	112181	112188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009649	TCTG	2	8	114789	114796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009649	TCTG	2	8	114832	114839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009649	TCTG	2	8	114875	114882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009649	TCTG	2	8	115004	115011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009649	TCTG	2	8	115047	115054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009649	TCTG	2	8	115090	115097	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009649	TCAA	2	8	115365	115372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009649	GGCC	2	8	115583	115590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009649	GTTT	2	8	115897	115904	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009649	CCAG	2	8	116596	116603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009649	AAGC	2	8	116616	116623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009649	GAAA	2	8	117025	117032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009649	GCCA	2	8	119398	119405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009649	CTCC	2	8	121705	121712	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_009649	AGGG	2	8	123036	123043	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009649	TCTG	2	8	123473	123480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009649	AGGA	2	8	124733	124740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009649	TCTG	2	8	126858	126865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009649	CTAC	2	8	134059	134066	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009649	TGAT	2	8	134147	134154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009649	CCCG	2	8	134316	134323	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_009649	CGGG	2	8	134329	134336	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009649	TTCC	2	8	134339	134346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009649	TATG	2	8	134498	134505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009649	CTGC	2	8	137953	137960	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009649	AAAT	2	8	142576	142583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009649	ACCA	2	8	150896	150903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009649	GCGG	2	8	151123	151130	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009649	GCAG	2	8	151567	151574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009649	AGAC	2	8	155132	155139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009649	GAGG	2	8	155175	155182	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009649	ATTC	2	8	165782	165789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009649	ATTT	2	8	165837	165844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009649	TTAT	2	8	165904	165911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009649	GTTA	2	8	166062	166069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.