MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044 plasmid pK2044

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006625	CGAGG	2	10	8379	8388	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_006625	GGGGA	2	10	11342	11351	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006625	CTTAA	2	10	15860	15869	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_006625	TTTTA	2	10	33420	33429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006625	CTGAG	2	10	34722	34731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006625	ATAAC	2	10	45020	45029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006625	CGTTG	2	10	47952	47961	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_006625	GTTAT	2	10	57218	57227	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006625	ATCAG	2	10	57728	57737	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006625	TAACA	2	10	59255	59264	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_006625	CCAGT	2	10	65822	65831	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_006625	GACGC	2	10	66012	66021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_006625	TCCCT	2	10	69606	69615	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_006625	CCTGC	2	10	70078	70087	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_006625	TAAAT	2	10	92520	92529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006625	AATGA	2	10	92549	92558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006625	AATTT	2	10	107544	107553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006625	CATGC	2	10	107664	107673	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_006625	CCCTG	2	10	110603	110612	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_006625	TTCAT	2	10	116978	116987	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_006625	GATGA	2	10	119875	119884	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006625	GCACT	2	10	125068	125077	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_006625	CCGCC	2	10	126976	126985	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
24	NC_006625	ATACG	2	10	139387	139396	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_006625	TTTGC	2	10	144609	144618	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_006625	TGATC	2	10	144651	144660	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_006625	CACAG	2	10	144863	144872	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_006625	CGCTA	2	10	159801	159810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_006625	AACAT	2	10	161230	161239	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_006625	GTCAG	2	10	163123	163132	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006625	TCATA	2	10	169693	169702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_006625	AATAA	2	10	169959	169968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006625	TTTAT	2	10	169999	170008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006625	AAACC	2	10	181695	181704	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_006625	TTTTA	2	10	194590	194599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006625	TAATC	2	10	203800	203809	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_006625	TATTT	2	10	204846	204855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006625	TTCTT	2	10	209503	209512	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_006625	CCAGA	2	10	219411	219420	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_006625	TAGAA	2	10	220707	220716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006625	GTCAT	2	10	222771	222780	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.