MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044 plasmid pK2044

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006625	CAGA	2	8	1485	1492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006625	TTAC	2	8	1635	1642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_006625	TTTA	2	8	5018	5025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006625	TTCT	2	8	5056	5063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006625	CCAG	2	8	6216	6223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006625	TTAT	2	8	6248	6255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006625	TAAT	2	8	8425	8432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006625	ACAG	2	8	10367	10374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_006625	TATT	2	8	10405	10412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006625	AATT	2	8	10523	10530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006625	TGAT	2	8	10568	10575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006625	TATT	3	12	11368	11379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006625	CAGA	2	8	11429	11436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006625	TGCA	2	8	11592	11599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006625	AAAG	2	8	11686	11693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006625	ATTT	2	8	13290	13297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006625	AATG	2	8	15852	15859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006625	GTAA	2	8	15934	15941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006625	CAGC	2	8	26323	26330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006625	TCCT	2	8	32705	32712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006625	TTGG	2	8	33343	33350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006625	CAAA	2	8	33541	33548	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_006625	TAAT	2	8	35662	35669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006625	ATTT	2	8	45030	45037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006625	GCAG	2	8	45925	45932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_006625	CCTG	2	8	46046	46053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006625	GTCA	2	8	47270	47277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006625	TTAT	2	8	47854	47861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006625	GCAT	2	8	48261	48268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006625	ATAA	2	8	48298	48305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006625	TAGG	2	8	48365	48372	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006625	TCAA	2	8	48427	48434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006625	CGAT	2	8	53943	53950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006625	TAGT	2	8	61266	61273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006625	TATT	2	8	64694	64701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006625	CCCA	2	8	69944	69951	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_006625	ATTC	2	8	70151	70158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006625	TTAA	2	8	71333	71340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006625	TATT	2	8	73060	73067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006625	CCAG	2	8	77552	77559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006625	TTAT	2	8	77584	77591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006625	ATTT	2	8	77639	77646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006625	AATA	2	8	81905	81912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006625	CAAT	2	8	86084	86091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_006625	TTTA	2	8	89716	89723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006625	TTCA	2	8	94438	94445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006625	TCAT	2	8	102045	102052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_006625	AATG	2	8	102068	102075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006625	CTTT	2	8	107512	107519	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_006625	CATT	2	8	107745	107752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_006625	GCAT	2	8	107771	107778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006625	TGTA	2	8	108757	108764	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006625	AAAG	2	8	108931	108938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006625	TCAG	2	8	109275	109282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006625	ATTC	2	8	110789	110796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_006625	GACA	2	8	110801	110808	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006625	CAGA	2	8	110821	110828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_006625	TGTC	2	8	112870	112877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006625	GGTA	2	8	112923	112930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006625	AGCG	2	8	114181	114188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_006625	TCAT	2	8	114304	114311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006625	CTAA	2	8	116154	116161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_006625	ATCT	2	8	119737	119744	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_006625	GCAG	2	8	119786	119793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_006625	GAAT	2	8	120400	120407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006625	TCTT	2	8	123932	123939	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_006625	CCGG	2	8	127297	127304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_006625	AGTC	3	12	127383	127394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_006625	GCTG	2	8	127762	127769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_006625	TTCA	2	8	127857	127864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_006625	AGGA	2	8	128031	128038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006625	ATAC	2	8	129200	129207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006625	CCAG	2	8	129403	129410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006625	GCAT	2	8	132701	132708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_006625	TTCG	2	8	132810	132817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_006625	CCTG	2	8	141520	141527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_006625	ACGC	2	8	143707	143714	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006625	AATC	2	8	144258	144265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_006625	CCAG	2	8	144537	144544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006625	TTCT	2	8	148199	148206	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_006625	CAGG	2	8	148434	148441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_006625	TGAA	2	8	150516	150523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006625	ATTG	2	8	152134	152141	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006625	ATTG	2	8	152146	152153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006625	ATTG	2	8	152305	152312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006625	GAGC	2	8	154994	155001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_006625	TGAA	2	8	161587	161594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006625	TTGC	2	8	161695	161702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_006625	TAGT	2	8	169723	169730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006625	GTTG	2	8	169776	169783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006625	GAAT	2	8	177123	177130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006625	TTGT	2	8	184148	184155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006625	TGAT	2	8	184385	184392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006625	GTGC	2	8	185348	185355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_006625	TCCG	2	8	187308	187315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_006625	ACTT	2	8	187358	187365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006625	GCCA	2	8	192231	192238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_006625	CTCA	2	8	193415	193422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006625	TAGG	2	8	193477	193484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006625	AATT	2	8	194545	194552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006625	AATT	2	8	195111	195118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006625	ATTT	2	8	200003	200010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006625	GGCA	2	8	202280	202287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_006625	CATG	2	8	202314	202321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_006625	TAAA	2	8	203884	203891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006625	TTTA	2	8	203940	203947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006625	TAAA	2	8	204744	204751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006625	ATCC	2	8	204816	204823	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_006625	AATA	2	8	204969	204976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006625	ACTT	2	8	205074	205081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_006625	TACC	2	8	205157	205164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_006625	TTTA	2	8	205296	205303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006625	AAAT	2	8	205679	205686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006625	ATTC	2	8	207632	207639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_006625	AGGG	2	8	207673	207680	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006625	TATG	2	8	208724	208731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006625	CCTA	2	8	209048	209055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006625	ATAG	2	8	209059	209066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006625	ATTT	2	8	209474	209481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006625	ATTT	2	8	217735	217742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006625	CAAT	2	8	217755	217762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_006625	GGCA	2	8	219315	219322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_006625	TCCA	2	8	221681	221688	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.