MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_R1

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018107	TC	3	6	1133	1138	0 %	50 %	0 %	50 %	397660806
2	NC_018107	CG	3	6	1251	1256	0 %	0 %	50 %	50 %	397660806
3	NC_018107	GC	4	8	3673	3680	0 %	0 %	50 %	50 %	397660808
4	NC_018107	GC	3	6	5495	5500	0 %	0 %	50 %	50 %	397660810
5	NC_018107	GC	3	6	5595	5600	0 %	0 %	50 %	50 %	397660810
6	NC_018107	GC	3	6	5611	5616	0 %	0 %	50 %	50 %	397660810
7	NC_018107	GC	3	6	7368	7373	0 %	0 %	50 %	50 %	397660812
8	NC_018107	CT	3	6	11498	11503	0 %	50 %	0 %	50 %	397660815
9	NC_018107	CG	3	6	11544	11549	0 %	0 %	50 %	50 %	397660815
10	NC_018107	GC	3	6	12040	12045	0 %	0 %	50 %	50 %	397660815
11	NC_018107	TC	3	6	12090	12095	0 %	50 %	0 %	50 %	397660815
12	NC_018107	GC	3	6	12652	12657	0 %	0 %	50 %	50 %	397660816
13	NC_018107	GA	3	6	12771	12776	50 %	0 %	50 %	0 %	397660816
14	NC_018107	GC	3	6	14857	14862	0 %	0 %	50 %	50 %	397660818
15	NC_018107	GA	3	6	14976	14981	50 %	0 %	50 %	0 %	397660818
16	NC_018107	GC	3	6	19990	19995	0 %	0 %	50 %	50 %	397660822
17	NC_018107	AG	3	6	20085	20090	50 %	0 %	50 %	0 %	397660822
18	NC_018107	AT	3	6	20154	20159	50 %	50 %	0 %	0 %	397660822
19	NC_018107	TA	3	6	23700	23705	50 %	50 %	0 %	0 %	397660825
20	NC_018107	CA	3	6	23712	23717	50 %	0 %	0 %	50 %	397660825
21	NC_018107	GT	3	6	24825	24830	0 %	50 %	50 %	0 %	397660826
22	NC_018107	GC	3	6	25846	25851	0 %	0 %	50 %	50 %	397660827
23	NC_018107	CG	3	6	25857	25862	0 %	0 %	50 %	50 %	397660827
24	NC_018107	CT	3	6	26357	26362	0 %	50 %	0 %	50 %	397660828
25	NC_018107	CA	3	6	27509	27514	50 %	0 %	0 %	50 %	397660828
26	NC_018107	GC	3	6	29262	29267	0 %	0 %	50 %	50 %	397660831
27	NC_018107	GT	3	6	29944	29949	0 %	50 %	50 %	0 %	397660833
28	NC_018107	GC	3	6	30333	30338	0 %	0 %	50 %	50 %	397660833
29	NC_018107	GC	3	6	30491	30496	0 %	0 %	50 %	50 %	397660833
30	NC_018107	CA	3	6	30968	30973	50 %	0 %	0 %	50 %	397660833
31	NC_018107	GC	3	6	31027	31032	0 %	0 %	50 %	50 %	397660833
32	NC_018107	GC	3	6	31818	31823	0 %	0 %	50 %	50 %	397660834
33	NC_018107	GC	3	6	32496	32501	0 %	0 %	50 %	50 %	397660836
34	NC_018107	CG	3	6	35711	35716	0 %	0 %	50 %	50 %	397660838
35	NC_018107	GA	3	6	35826	35831	50 %	0 %	50 %	0 %	397660839
36	NC_018107	CA	3	6	35934	35939	50 %	0 %	0 %	50 %	397660839
37	NC_018107	AG	3	6	36245	36250	50 %	0 %	50 %	0 %	397660839
38	NC_018107	GA	3	6	36596	36601	50 %	0 %	50 %	0 %	397660839
39	NC_018107	TG	3	6	39552	39557	0 %	50 %	50 %	0 %	397660841
40	NC_018107	GA	3	6	40676	40681	50 %	0 %	50 %	0 %	397660842
41	NC_018107	AG	3	6	40690	40695	50 %	0 %	50 %	0 %	397660842
42	NC_018107	CA	4	8	43396	43403	50 %	0 %	0 %	50 %	397660846
43	NC_018107	TG	3	6	44058	44063	0 %	50 %	50 %	0 %	397660846
44	NC_018107	CT	3	6	44078	44083	0 %	50 %	0 %	50 %	397660846
45	NC_018107	TG	3	6	46562	46567	0 %	50 %	50 %	0 %	397660848
46	NC_018107	GT	3	6	47174	47179	0 %	50 %	50 %	0 %	397660849
47	NC_018107	TG	3	6	47308	47313	0 %	50 %	50 %	0 %	397660849
48	NC_018107	AG	3	6	47691	47696	50 %	0 %	50 %	0 %	397660849
49	NC_018107	TC	3	6	48335	48340	0 %	50 %	0 %	50 %	397660850
50	NC_018107	CT	3	6	49702	49707	0 %	50 %	0 %	50 %	397660851
51	NC_018107	TC	3	6	54491	54496	0 %	50 %	0 %	50 %	397660853
52	NC_018107	TG	3	6	63550	63555	0 %	50 %	50 %	0 %	397660856
53	NC_018107	GT	3	6	63731	63736	0 %	50 %	50 %	0 %	397660856
54	NC_018107	GA	3	6	65714	65719	50 %	0 %	50 %	0 %	397660857
55	NC_018107	GA	3	6	69961	69966	50 %	0 %	50 %	0 %	397660859
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58	NC_018107	AT	3	6	75027	75032	50 %	50 %	0 %	0 %	397660863
59	NC_018107	TC	3	6	75445	75450	0 %	50 %	0 %	50 %	397660863
60	NC_018107	GT	3	6	76609	76614	0 %	50 %	50 %	0 %	397660864
61	NC_018107	CT	3	6	76808	76813	0 %	50 %	0 %	50 %	397660864
62	NC_018107	CA	3	6	77917	77922	50 %	0 %	0 %	50 %	397660866
63	NC_018107	GA	3	6	84143	84148	50 %	0 %	50 %	0 %	397660867
64	NC_018107	TC	3	6	84357	84362	0 %	50 %	0 %	50 %	397660867
65	NC_018107	CT	3	6	84838	84843	0 %	50 %	0 %	50 %	397660867
66	NC_018107	CT	3	6	85069	85074	0 %	50 %	0 %	50 %	397660867
67	NC_018107	TC	3	6	85096	85101	0 %	50 %	0 %	50 %	397660867
68	NC_018107	AG	3	6	86175	86180	50 %	0 %	50 %	0 %	397660867
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71	NC_018107	AG	3	6	91494	91499	50 %	0 %	50 %	0 %	397660870
72	NC_018107	CA	3	6	94639	94644	50 %	0 %	0 %	50 %	397660872
73	NC_018107	TA	3	6	95688	95693	50 %	50 %	0 %	0 %	397660872
74	NC_018107	TC	3	6	95800	95805	0 %	50 %	0 %	50 %	397660872
75	NC_018107	TC	3	6	97121	97126	0 %	50 %	0 %	50 %	397660872
76	NC_018107	CT	3	6	97623	97628	0 %	50 %	0 %	50 %	397660873
77	NC_018107	AT	3	6	98804	98809	50 %	50 %	0 %	0 %	397660873
78	NC_018107	AT	3	6	99653	99658	50 %	50 %	0 %	0 %	397660874
79	NC_018107	GA	3	6	100869	100874	50 %	0 %	50 %	0 %	397660875
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81	NC_018107	CG	3	6	103406	103411	0 %	0 %	50 %	50 %	397660878
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83	NC_018107	TC	3	6	107643	107648	0 %	50 %	0 %	50 %	397660880
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90	NC_018107	TC	3	6	116155	116160	0 %	50 %	0 %	50 %	397660884
91	NC_018107	AT	3	6	116187	116192	50 %	50 %	0 %	0 %	397660884
92	NC_018107	TC	3	6	116872	116877	0 %	50 %	0 %	50 %	397660884
93	NC_018107	GT	3	6	117262	117267	0 %	50 %	50 %	0 %	397660884
94	NC_018107	CA	3	6	118154	118159	50 %	0 %	0 %	50 %	397660885
95	NC_018107	TC	3	6	118474	118479	0 %	50 %	0 %	50 %	397660885
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98	NC_018107	AT	3	6	118829	118834	50 %	50 %	0 %	0 %	397660885
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103	NC_018107	GC	3	6	124022	124027	0 %	0 %	50 %	50 %	397660889
104	NC_018107	GA	3	6	124265	124270	50 %	0 %	50 %	0 %	397660889
105	NC_018107	GC	3	6	125716	125721	0 %	0 %	50 %	50 %	397660892
106	NC_018107	CG	3	6	125984	125989	0 %	0 %	50 %	50 %	397660893
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108	NC_018107	TC	3	6	129598	129603	0 %	50 %	0 %	50 %	397660898
109	NC_018107	CG	3	6	129716	129721	0 %	0 %	50 %	50 %	397660898
110	NC_018107	TC	3	6	131141	131146	0 %	50 %	0 %	50 %	397660900
111	NC_018107	GT	3	6	132446	132451	0 %	50 %	50 %	0 %	397660901
112	NC_018107	GC	3	6	134289	134294	0 %	0 %	50 %	50 %	397660903
113	NC_018107	GA	3	6	134408	134413	50 %	0 %	50 %	0 %	397660903
114	NC_018107	TA	3	6	136513	136518	50 %	50 %	0 %	0 %	397660905
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117	NC_018107	CT	3	6	141503	141508	0 %	50 %	0 %	50 %	397660909
118	NC_018107	AT	3	6	141601	141606	50 %	50 %	0 %	0 %	397660909
119	NC_018107	GC	3	6	142944	142949	0 %	0 %	50 %	50 %	397660910
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121	NC_018107	GC	3	6	151841	151846	0 %	0 %	50 %	50 %	397660917
122	NC_018107	TA	3	6	154325	154330	50 %	50 %	0 %	0 %	397660919
123	NC_018107	CG	3	6	159302	159307	0 %	0 %	50 %	50 %	397660921
124	NC_018107	GC	3	6	159414	159419	0 %	0 %	50 %	50 %	397660921
125	NC_018107	GC	3	6	160313	160318	0 %	0 %	50 %	50 %	397660922
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139	NC_018107	TA	3	6	180492	180497	50 %	50 %	0 %	0 %	397660933
140	NC_018107	CA	3	6	180681	180686	50 %	0 %	0 %	50 %	397660933
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.