MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_R1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018107	CCAGGC	2	12	3004	3015	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397660808
2	NC_018107	AGCGCG	2	12	8621	8632	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397660812
3	NC_018107	GCTGAT	2	12	22416	22427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397660824
4	NC_018107	TCCGGT	2	12	23411	23422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397660825
5	NC_018107	CACCGT	2	12	29450	29461	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397660832
6	NC_018107	GCGAGG	2	12	32129	32140	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	397660835
7	NC_018107	CTGAAT	2	12	35788	35799	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397660838
8	NC_018107	ACCTTA	2	12	38949	38960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397660841
9	NC_018107	GGCTCC	2	12	42380	42391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397660844
10	NC_018107	CAGGGG	2	12	46236	46247	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	397660848
11	NC_018107	ATGAAG	2	12	50092	50103	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397660851
12	NC_018107	AATTTT	2	12	63573	63584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397660856
13	NC_018107	CGTTAA	2	12	68139	68150	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397660858
14	NC_018107	TTAAAG	2	12	69704	69715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397660859
15	NC_018107	TCCTGT	2	12	88347	88358	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397660868
16	NC_018107	GAAAAA	2	12	89725	89736	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397660869
17	NC_018107	TTGATG	5	30	96835	96864	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397660872
18	NC_018107	ATCAAA	2	12	118253	118264	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397660885
19	NC_018107	AGGTCG	2	12	125932	125943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397660893
20	NC_018107	TTCGCC	2	12	142847	142858	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397660910
21	NC_018107	TCAATA	2	12	143597	143608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397660911
22	NC_018107	TCTCGC	2	12	147236	147247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397660913
23	NC_018107	GGCCGC	2	12	150748	150759	0 %	0 %	50 %	50 %	397660916
24	NC_018107	CGCTGG	2	12	154805	154816	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397660919
25	NC_018107	ACAGCG	2	12	161784	161795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397660923
26	NC_018107	CTGTAC	2	12	167669	167680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397660926
27	NC_018107	TGTTGA	2	12	170252	170263	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397660927
28	NC_018107	AATGAC	2	12	170607	170618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397660927
29	NC_018107	GCACCG	2	12	172926	172937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397660928
30	NC_018107	TAAAGG	2	12	173904	173915	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397660930
31	NC_018107	TTAAAT	2	12	180208	180219	50 %	50 %	0 %	0 %	397660933
32	NC_018107	CTTCAA	2	12	182904	182915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397660934
33	NC_018107	CTTCAT	2	12	183084	183095	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397660934
34	NC_018107	AATCAT	2	12	197920	197931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397660939
35	NC_018107	GTTTTA	2	12	198582	198593	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397660939
36	NC_018107	ACAGCG	2	12	199734	199745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397660939
37	NC_018107	TGAAAA	2	12	226597	226608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397660950
38	NC_018107	CAGGTA	2	12	240142	240153	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397660952
39	NC_018107	CTTCAT	2	12	245402	245413	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397660953
40	NC_018107	ACTTTT	2	12	261353	261364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397660957
41	NC_018107	TCGGGA	2	12	309001	309012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397660974
42	NC_018107	CACAGC	2	12	314758	314769	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	397660979
43	NC_018107	GCCCAT	2	12	318473	318484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397660981
44	NC_018107	GCGACG	2	12	336394	336405	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397660998
45	NC_018107	TCTTGC	2	12	340207	340218	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397661001
46	NC_018107	ATATTG	2	12	343518	343529	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397661004
47	NC_018107	GGCGAA	2	12	344269	344280	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	397661005
48	NC_018107	AATGAA	2	12	345503	345514	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397661006
49	NC_018107	CTTTAA	2	12	352796	352807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397661012

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.