MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_R1

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018107	TGCTC	2	10	1259	1268	0 %	40 %	20 %	40 %	397660806
2	NC_018107	AGGCC	2	10	1448	1457	20 %	0 %	40 %	40 %	397660806
3	NC_018107	GGTCA	2	10	7054	7063	20 %	20 %	40 %	20 %	397660811
4	NC_018107	GGCCT	2	10	12452	12461	0 %	20 %	40 %	40 %	397660816
5	NC_018107	GAGCA	2	10	12641	12650	40 %	0 %	40 %	20 %	397660816
6	NC_018107	GGCCT	2	10	14657	14666	0 %	20 %	40 %	40 %	397660818
7	NC_018107	GAGCA	2	10	14846	14855	40 %	0 %	40 %	20 %	397660818
8	NC_018107	CTTCA	2	10	18531	18540	20 %	40 %	0 %	40 %	397660820
9	NC_018107	CCAGG	2	10	20354	20363	20 %	0 %	40 %	40 %	397660822
10	NC_018107	TGGCA	2	10	20773	20782	20 %	20 %	40 %	20 %	397660822
11	NC_018107	CGCTG	2	10	20790	20799	0 %	20 %	40 %	40 %	397660822
12	NC_018107	CGCTG	2	10	22649	22658	0 %	20 %	40 %	40 %	397660825
13	NC_018107	GCCGG	2	10	23196	23205	0 %	0 %	60 %	40 %	397660825
14	NC_018107	GCTCT	2	10	23304	23313	0 %	40 %	20 %	40 %	397660825
15	NC_018107	AGCAA	2	10	25544	25553	60 %	0 %	20 %	20 %	397660827
16	NC_018107	AACAT	2	10	26494	26503	60 %	20 %	0 %	20 %	397660828
17	NC_018107	ACACC	2	10	26788	26797	40 %	0 %	0 %	60 %	397660828
18	NC_018107	CAATC	2	10	26996	27005	40 %	20 %	0 %	40 %	397660828
19	NC_018107	CGGTT	2	10	29352	29361	0 %	40 %	40 %	20 %	397660832
20	NC_018107	AGGCC	2	10	31524	31533	20 %	0 %	40 %	40 %	397660834
21	NC_018107	GTTCA	2	10	38131	38140	20 %	40 %	20 %	20 %	397660840
22	NC_018107	CCTGA	2	10	39865	39874	20 %	20 %	20 %	40 %	397660842
23	NC_018107	ATTTC	2	10	40697	40706	20 %	60 %	0 %	20 %	397660842
24	NC_018107	TGGGA	2	10	41218	41227	20 %	20 %	60 %	0 %	397660843
25	NC_018107	GTACT	2	10	43706	43715	20 %	40 %	20 %	20 %	397660846
26	NC_018107	ATTTT	2	10	44654	44663	20 %	80 %	0 %	0 %	397660847
27	NC_018107	AACAA	2	10	65479	65488	80 %	0 %	0 %	20 %	397660857
28	NC_018107	CTTCC	2	10	70346	70355	0 %	40 %	0 %	60 %	397660860
29	NC_018107	GTGAG	2	10	70872	70881	20 %	20 %	60 %	0 %	397660860
30	NC_018107	GTTCA	2	10	70934	70943	20 %	40 %	20 %	20 %	397660860
31	NC_018107	TGAAG	2	10	75051	75060	40 %	20 %	40 %	0 %	397660863
32	NC_018107	GTTTT	2	10	76116	76125	0 %	80 %	20 %	0 %	397660864
33	NC_018107	TGCTT	2	10	84563	84572	0 %	60 %	20 %	20 %	397660867
34	NC_018107	CCCCA	2	10	87340	87349	20 %	0 %	0 %	80 %	397660867
35	NC_018107	GGTTT	2	10	87948	87957	0 %	60 %	40 %	0 %	397660868
36	NC_018107	TGAAT	2	10	88253	88262	40 %	40 %	20 %	0 %	397660868
37	NC_018107	CAGCG	2	10	88788	88797	20 %	0 %	40 %	40 %	397660868
38	NC_018107	CAGAC	2	10	91285	91294	40 %	0 %	20 %	40 %	397660870
39	NC_018107	AAACC	2	10	96815	96824	60 %	0 %	0 %	40 %	397660872
40	NC_018107	GCCCT	2	10	97514	97523	0 %	20 %	20 %	60 %	397660873
41	NC_018107	CGGTT	2	10	100746	100755	0 %	40 %	40 %	20 %	397660875
42	NC_018107	AAACC	2	10	100978	100987	60 %	0 %	0 %	40 %	397660875
43	NC_018107	ATGTC	2	10	103705	103714	20 %	40 %	20 %	20 %	397660878
44	NC_018107	CAGAA	2	10	117098	117107	60 %	0 %	20 %	20 %	397660884
45	NC_018107	ATAAA	2	10	118597	118606	80 %	20 %	0 %	0 %	397660885
46	NC_018107	CAGTG	2	10	121396	121405	20 %	20 %	40 %	20 %	397660886
47	NC_018107	TGCTC	2	10	123399	123408	0 %	40 %	20 %	40 %	397660888
48	NC_018107	AGGCC	2	10	123588	123597	20 %	0 %	40 %	40 %	397660888
49	NC_018107	CGAAA	2	10	124169	124178	60 %	0 %	20 %	20 %	397660889
50	NC_018107	GCGAT	2	10	124526	124535	20 %	20 %	40 %	20 %	397660890
51	NC_018107	GCTTC	2	10	126030	126039	0 %	40 %	20 %	40 %	397660893
52	NC_018107	TGCTC	2	10	129724	129733	0 %	40 %	20 %	40 %	397660898
53	NC_018107	AGGCC	2	10	129913	129922	20 %	0 %	40 %	40 %	397660898
54	NC_018107	TCAGC	2	10	130389	130398	20 %	20 %	20 %	40 %	397660899
55	NC_018107	CGGTG	2	10	130540	130549	0 %	20 %	60 %	20 %	397660899
56	NC_018107	GGACG	2	10	130701	130710	20 %	0 %	60 %	20 %	397660899
57	NC_018107	GGCCT	2	10	134089	134098	0 %	20 %	40 %	40 %	397660903
58	NC_018107	GAGCA	2	10	134278	134287	40 %	0 %	40 %	20 %	397660903
59	NC_018107	ATATT	2	10	137642	137651	40 %	60 %	0 %	0 %	397660906
60	NC_018107	GTGTT	2	10	139830	139839	0 %	60 %	40 %	0 %	397660907
61	NC_018107	ATTTT	2	10	140579	140588	20 %	80 %	0 %	0 %	397660908
62	NC_018107	GGAAA	2	10	144549	144558	60 %	0 %	40 %	0 %	397660911
63	NC_018107	ATCCC	2	10	145652	145661	20 %	20 %	0 %	60 %	397660912
64	NC_018107	CGCTG	2	10	145795	145804	0 %	20 %	40 %	40 %	397660912
65	NC_018107	TACAG	2	10	150903	150912	40 %	20 %	20 %	20 %	397660916
66	NC_018107	GATCA	2	10	155838	155847	40 %	20 %	20 %	20 %	397660919
67	NC_018107	CGAAC	2	10	158734	158743	40 %	0 %	20 %	40 %	397660921
68	NC_018107	ACGGC	2	10	163344	163353	20 %	0 %	40 %	40 %	397660923
69	NC_018107	AGCCA	2	10	165050	165059	40 %	0 %	20 %	40 %	397660925
70	NC_018107	ACATC	2	10	167179	167188	40 %	20 %	0 %	40 %	397660926
71	NC_018107	TCATT	2	10	170312	170321	20 %	60 %	0 %	20 %	397660927
72	NC_018107	AAATG	2	10	172865	172874	60 %	20 %	20 %	0 %	397660928
73	NC_018107	CCTTC	2	10	172888	172897	0 %	40 %	0 %	60 %	397660928
74	NC_018107	AAGTT	2	10	173923	173932	40 %	40 %	20 %	0 %	397660930
75	NC_018107	GAAAC	2	10	174018	174027	60 %	0 %	20 %	20 %	397660930
76	NC_018107	TTTGC	2	10	176634	176643	0 %	60 %	20 %	20 %	397660931
77	NC_018107	TGATC	2	10	176676	176685	20 %	40 %	20 %	20 %	397660931
78	NC_018107	ACCTT	2	10	194589	194598	20 %	40 %	0 %	40 %	397660937
79	NC_018107	ATTTT	2	10	194790	194799	20 %	80 %	0 %	0 %	397660937
80	NC_018107	AACAC	2	10	197049	197058	60 %	0 %	0 %	40 %	397660939
81	NC_018107	GTCCT	2	10	197196	197205	0 %	40 %	20 %	40 %	397660939
82	NC_018107	ACTGC	2	10	197628	197637	20 %	20 %	20 %	40 %	397660939
83	NC_018107	GCTGG	2	10	200463	200472	0 %	20 %	60 %	20 %	397660939
84	NC_018107	ACAGA	2	10	200553	200562	60 %	0 %	20 %	20 %	397660939
85	NC_018107	GATCA	2	10	202745	202754	40 %	20 %	20 %	20 %	397660942
86	NC_018107	GCAAA	2	10	202787	202796	60 %	0 %	20 %	20 %	397660942
87	NC_018107	TTTTC	2	10	214126	214135	0 %	80 %	0 %	20 %	397660948
88	NC_018107	ACAAT	2	10	219759	219768	60 %	20 %	0 %	20 %	397660949
89	NC_018107	TTACT	2	10	247566	247575	20 %	60 %	0 %	20 %	397660954
90	NC_018107	TCATA	2	10	257203	257212	40 %	40 %	0 %	20 %	397660955
91	NC_018107	AAAGG	2	10	261408	261417	60 %	0 %	40 %	0 %	397660957
92	NC_018107	TCGCT	2	10	263946	263955	0 %	40 %	20 %	40 %	397660958
93	NC_018107	AAAGA	2	10	264453	264462	80 %	0 %	20 %	0 %	397660958
94	NC_018107	GTCTG	2	10	268032	268041	0 %	40 %	40 %	20 %	397660959
95	NC_018107	TCGCA	2	10	272054	272063	20 %	20 %	20 %	40 %	397660960
96	NC_018107	GAACA	2	10	272971	272980	60 %	0 %	20 %	20 %	397660960
97	NC_018107	CAGAC	2	10	274863	274872	40 %	0 %	20 %	40 %	397660961
98	NC_018107	ACAAA	2	10	278645	278654	80 %	0 %	0 %	20 %	397660962
99	NC_018107	CTGTT	2	10	296365	296374	0 %	60 %	20 %	20 %	397660969
100	NC_018107	ATGCG	2	10	297282	297291	20 %	20 %	40 %	20 %	397660969
101	NC_018107	GGCCT	2	10	308018	308027	0 %	20 %	40 %	40 %	397660973
102	NC_018107	GAGCA	2	10	308207	308216	40 %	0 %	40 %	20 %	397660973
103	NC_018107	TGCTC	2	10	312409	312418	0 %	40 %	20 %	40 %	397660975
104	NC_018107	AGGCC	2	10	312598	312607	20 %	0 %	40 %	40 %	397660975
105	NC_018107	TTTTC	2	10	313829	313838	0 %	80 %	0 %	20 %	397660977
106	NC_018107	TGCTC	2	10	315726	315735	0 %	40 %	20 %	40 %	397660980
107	NC_018107	AGGCC	2	10	315915	315924	20 %	0 %	40 %	40 %	397660980
108	NC_018107	GCGCC	2	10	319593	319602	0 %	0 %	40 %	60 %	397660982
109	NC_018107	TGCTC	2	10	321007	321016	0 %	40 %	20 %	40 %	397660983
110	NC_018107	AGGCC	2	10	321196	321205	20 %	0 %	40 %	40 %	397660983
111	NC_018107	TGGCT	2	10	322035	322044	0 %	40 %	40 %	20 %	397660984
112	NC_018107	CGCGC	2	10	322438	322447	0 %	0 %	40 %	60 %	397660984
113	NC_018107	GGGAG	2	10	326727	326736	20 %	0 %	80 %	0 %	397660989
114	NC_018107	CAGCG	2	10	327886	327895	20 %	0 %	40 %	40 %	397660990
115	NC_018107	TGCCA	2	10	327903	327912	20 %	20 %	20 %	40 %	397660990
116	NC_018107	CCTGG	2	10	328322	328331	0 %	20 %	40 %	40 %	397660990
117	NC_018107	TGAAG	2	10	330145	330154	40 %	20 %	40 %	0 %	397660992
118	NC_018107	GGCCT	2	10	333417	333426	0 %	20 %	40 %	40 %	397660995
119	NC_018107	GAGCA	2	10	333606	333615	40 %	0 %	40 %	20 %	397660995
120	NC_018107	GTTCG	2	10	338059	338068	0 %	40 %	40 %	20 %	397660999
121	NC_018107	CGAAG	2	10	339923	339932	40 %	0 %	40 %	20 %	397661001
122	NC_018107	CGGCG	2	10	339951	339960	0 %	0 %	60 %	40 %	397661001
123	NC_018107	ATTTT	2	10	340731	340740	20 %	80 %	0 %	0 %	397661002
124	NC_018107	CAGCG	2	10	341323	341332	20 %	0 %	40 %	40 %	397661003
125	NC_018107	GGGAT	2	10	341466	341475	20 %	20 %	60 %	0 %	397661003
126	NC_018107	CTTTC	2	10	342568	342577	0 %	60 %	0 %	40 %	397661004
127	NC_018107	CATCG	2	10	342872	342881	20 %	20 %	20 %	40 %	397661004
128	NC_018107	TAAAA	2	10	346538	346547	80 %	20 %	0 %	0 %	397661007
129	NC_018107	CTCAC	2	10	351630	351639	20 %	20 %	0 %	60 %	397661011
130	NC_018107	GGAAG	2	10	352156	352165	40 %	0 %	60 %	0 %	397661011

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.