MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae KCTC 2242 plasmid pKCTC2242

Total Repeats: 3170

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017541	CAG	2	6	190153	190158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037921
3002	NC_017541	TGCC	2	8	190194	190201	0 %	25 %	25 %	50 %	386037921
3003	NC_017541	CGT	2	6	190206	190211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037921
3004	NC_017541	CAG	2	6	190228	190233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037921
3005	NC_017541	CAG	2	6	190249	190254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037921
3006	NC_017541	CTA	2	6	190272	190277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037921
3007	NC_017541	GAT	2	6	190282	190287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037921
3008	NC_017541	CCG	2	6	190582	190587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386037922
3009	NC_017541	GCC	2	6	190655	190660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386037922
3010	NC_017541	GAT	2	6	190670	190675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037922
3011	NC_017541	ACA	2	6	190692	190697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037922
3012	NC_017541	GCC	2	6	190784	190789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386037922
3013	NC_017541	ATG	2	6	190790	190795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037922
3014	NC_017541	AGCG	2	8	190866	190873	25 %	0 %	50 %	25 %	386037922
3015	NC_017541	CAG	2	6	191000	191005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037922
3016	NC_017541	CCA	2	6	191030	191035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037922
3017	NC_017541	CGC	2	6	191050	191055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386037922
3018	NC_017541	AAT	2	6	191081	191086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037922
3019	NC_017541	CGT	2	6	191095	191100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037922
3020	NC_017541	ATGCTC	2	12	191109	191120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386037922
3021	NC_017541	CG	3	6	191149	191154	0 %	0 %	50 %	50 %	386037922
3022	NC_017541	GAT	2	6	191176	191181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037922
3023	NC_017541	GAT	2	6	191312	191317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037922
3024	NC_017541	GCC	2	6	191326	191331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386037922
3025	NC_017541	CCA	2	6	191347	191352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037922
3026	NC_017541	GGT	2	6	191353	191358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386037922
3027	NC_017541	GAA	2	6	191375	191380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386037922
3028	NC_017541	CTTT	2	8	191412	191419	0 %	75 %	0 %	25 %	386037922
3029	NC_017541	GGC	2	6	191434	191439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386037922
3030	NC_017541	CCA	2	6	191482	191487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037922
3031	NC_017541	CTG	2	6	191497	191502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037922
3032	NC_017541	T	6	6	191504	191509	0 %	100 %	0 %	0 %	386037922
3033	NC_017541	TCC	2	6	191519	191524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386037922
3034	NC_017541	AG	3	6	191599	191604	50 %	0 %	50 %	0 %	386037922
3035	NC_017541	TAAA	2	8	191614	191621	75 %	25 %	0 %	0 %	386037922
3036	NC_017541	AGC	2	6	192189	192194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037923
3037	NC_017541	TGCG	2	8	192197	192204	0 %	25 %	50 %	25 %	386037923
3038	NC_017541	TC	3	6	192216	192221	0 %	50 %	0 %	50 %	386037923
3039	NC_017541	CAGC	2	8	192243	192250	25 %	0 %	25 %	50 %	386037923
3040	NC_017541	CCA	3	9	192308	192316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037923
3041	NC_017541	TCT	2	6	192331	192336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037923
3042	NC_017541	ACC	3	9	192340	192348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037923
3043	NC_017541	TG	3	6	192352	192357	0 %	50 %	50 %	0 %	386037923
3044	NC_017541	CAG	2	6	192384	192389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037923
3045	NC_017541	TCT	2	6	192392	192397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037923
3046	NC_017541	CCA	2	6	192434	192439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037923
3047	NC_017541	CA	3	6	192462	192467	50 %	0 %	0 %	50 %	386037923
3048	NC_017541	GCA	2	6	192503	192508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037923
3049	NC_017541	GAT	2	6	192518	192523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037923
3050	NC_017541	TCT	2	6	192541	192546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037923
3051	NC_017541	CTGA	2	8	192558	192565	25 %	25 %	25 %	25 %	386037923
3052	NC_017541	AAT	2	6	192576	192581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037923
3053	NC_017541	ACCTCC	2	12	192592	192603	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386037923
3054	NC_017541	TCCTT	2	10	192631	192640	0 %	60 %	0 %	40 %	386037924
3055	NC_017541	TCG	2	6	192737	192742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037924
3056	NC_017541	CAG	2	6	192884	192889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037924
3057	NC_017541	TGA	2	6	192915	192920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037924
3058	NC_017541	CAC	2	6	192982	192987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037924
3059	NC_017541	CA	3	6	193009	193014	50 %	0 %	0 %	50 %	386037924
3060	NC_017541	TA	3	6	193171	193176	50 %	50 %	0 %	0 %	386037924
3061	NC_017541	GTA	2	6	193220	193225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037924
3062	NC_017541	ATC	2	6	193259	193264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037924
3063	NC_017541	AAG	2	6	193372	193377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386037924
3064	NC_017541	TTC	2	6	193394	193399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037924
3065	NC_017541	GA	3	6	193516	193521	50 %	0 %	50 %	0 %	386037924
3066	NC_017541	TCT	2	6	193594	193599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037924
3067	NC_017541	ACC	2	6	193718	193723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037924
3068	NC_017541	ACAG	2	8	193736	193743	50 %	0 %	25 %	25 %	386037924
3069	NC_017541	AAC	2	6	193758	193763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037924
3070	NC_017541	T	6	6	193813	193818	0 %	100 %	0 %	0 %	386037924
3071	NC_017541	CTC	2	6	193846	193851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386037925
3072	NC_017541	CAG	2	6	193877	193882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037925
3073	NC_017541	AT	3	6	193885	193890	50 %	50 %	0 %	0 %	386037925
3074	NC_017541	AG	3	6	193906	193911	50 %	0 %	50 %	0 %	386037925
3075	NC_017541	TCT	2	6	194029	194034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037925
3076	NC_017541	TTC	2	6	194043	194048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037925
3077	NC_017541	AG	3	6	194139	194144	50 %	0 %	50 %	0 %	386037925
3078	NC_017541	TTCATA	2	12	194330	194341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386037926
3079	NC_017541	TG	3	6	194363	194368	0 %	50 %	50 %	0 %	386037926
3080	NC_017541	GTA	2	6	194384	194389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037926
3081	NC_017541	CAT	2	6	194414	194419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037926
3082	NC_017541	CCAC	2	8	194439	194446	25 %	0 %	0 %	75 %	386037926
3083	NC_017541	GCTG	2	8	194805	194812	0 %	25 %	50 %	25 %	386037927
3084	NC_017541	CAA	2	6	194881	194886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037927
3085	NC_017541	CGA	2	6	194895	194900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037927
3086	NC_017541	CCG	2	6	194959	194964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386037927
3087	NC_017541	TCAGT	2	10	195177	195186	20 %	40 %	20 %	20 %	386037927
3088	NC_017541	A	6	6	195187	195192	100 %	0 %	0 %	0 %	386037927
3089	NC_017541	CTG	2	6	195221	195226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037927
3090	NC_017541	GCG	2	6	195317	195322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386037928
3091	NC_017541	GCA	2	6	195336	195341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037928
3092	NC_017541	CAGC	2	8	195417	195424	25 %	0 %	25 %	50 %	386037928
3093	NC_017541	TGC	2	6	195458	195463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037928
3094	NC_017541	CGT	2	6	195481	195486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037928
3095	NC_017541	CTG	2	6	195502	195507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037928
3096	NC_017541	TGC	2	6	195509	195514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037928
3097	NC_017541	GCG	2	6	195524	195529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386037928
3098	NC_017541	CG	3	6	195568	195573	0 %	0 %	50 %	50 %	386037928
3099	NC_017541	GCT	2	6	195609	195614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037928
3100	NC_017541	AGA	2	6	195615	195620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386037928
3101	NC_017541	AC	3	6	195641	195646	50 %	0 %	0 %	50 %	386037928
3102	NC_017541	GC	3	6	195681	195686	0 %	0 %	50 %	50 %	386037928
3103	NC_017541	CAC	2	6	195717	195722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037928
3104	NC_017541	CAG	2	6	195736	195741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037928
3105	NC_017541	TGA	2	6	195755	195760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037928
3106	NC_017541	GAC	2	6	196289	196294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037929
3107	NC_017541	ACA	2	6	196314	196319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037929
3108	NC_017541	CTG	2	6	196347	196352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037929
3109	NC_017541	GTTATC	2	12	196364	196375	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386037929
3110	NC_017541	AGA	2	6	196421	196426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386037929
3111	NC_017541	GTG	2	6	196437	196442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386037929
3112	NC_017541	GC	3	6	196461	196466	0 %	0 %	50 %	50 %	386037929
3113	NC_017541	ACG	2	6	196471	196476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037929
3114	NC_017541	GC	3	6	196492	196497	0 %	0 %	50 %	50 %	386037929
3115	NC_017541	CCG	2	6	196508	196513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386037929
3116	NC_017541	CGA	2	6	196537	196542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037929
3117	NC_017541	AAC	2	6	196590	196595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037929
3118	NC_017541	GCCA	2	8	196711	196718	25 %	0 %	25 %	50 %	386037929
3119	NC_017541	CGG	2	6	196775	196780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386037929
3120	NC_017541	GGTGC	2	10	196782	196791	0 %	20 %	60 %	20 %	386037929
3121	NC_017541	GTG	2	6	196818	196823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386037929
3122	NC_017541	TGG	2	6	196933	196938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386037929
3123	NC_017541	CGG	2	6	196945	196950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386037929
3124	NC_017541	CGA	2	6	197027	197032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037929
3125	NC_017541	CTG	2	6	197085	197090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037929
3126	NC_017541	TAC	2	6	197094	197099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037929
3127	NC_017541	CGG	2	6	197120	197125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386037929
3128	NC_017541	CG	3	6	197133	197138	0 %	0 %	50 %	50 %	386037929
3129	NC_017541	GCTG	2	8	197155	197162	0 %	25 %	50 %	25 %	386037929
3130	NC_017541	CAGC	2	8	197234	197241	25 %	0 %	25 %	50 %	386037929
3131	NC_017541	ACT	2	6	197329	197334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037929
3132	NC_017541	TGAA	2	8	197419	197426	50 %	25 %	25 %	0 %	386037929
3133	NC_017541	CACG	2	8	197429	197436	25 %	0 %	25 %	50 %	386037929
3134	NC_017541	TAC	2	6	197445	197450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037929
3135	NC_017541	CCA	2	6	197455	197460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037929
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3137	NC_017541	GTACA	2	10	197739	197748	40 %	20 %	20 %	20 %	386037929
3138	NC_017541	GC	3	6	197833	197838	0 %	0 %	50 %	50 %	386037929
3139	NC_017541	TAA	2	6	197873	197878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037929
3140	NC_017541	CGTA	2	8	198019	198026	25 %	25 %	25 %	25 %	386037929
3141	NC_017541	TCCAG	2	10	198151	198160	20 %	20 %	20 %	40 %	386037929
3142	NC_017541	AG	3	6	198191	198196	50 %	0 %	50 %	0 %	386037929
3143	NC_017541	ATT	2	6	198322	198327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386037929
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3146	NC_017541	AC	3	6	198492	198497	50 %	0 %	0 %	50 %	386037930
3147	NC_017541	CTG	3	9	198521	198529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037930
3148	NC_017541	TGT	2	6	198805	198810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386037931
3149	NC_017541	ACA	2	6	198877	198882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037931
3150	NC_017541	C	6	6	198994	198999	0 %	0 %	0 %	100 %	386037931
3151	NC_017541	TGA	2	6	199424	199429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037933
3152	NC_017541	AGGCAA	2	12	199490	199501	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386037933
3153	NC_017541	AG	3	6	199546	199551	50 %	0 %	50 %	0 %	386037933
3154	NC_017541	CT	3	6	199557	199562	0 %	50 %	0 %	50 %	386037933
3155	NC_017541	CCAG	2	8	199738	199745	25 %	0 %	25 %	50 %	386037934
3156	NC_017541	AAT	2	6	199777	199782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037934
3157	NC_017541	ACTG	2	8	199849	199856	25 %	25 %	25 %	25 %	386037934
3158	NC_017541	TTTG	2	8	199998	200005	0 %	75 %	25 %	0 %	386037934
3159	NC_017541	GAAC	2	8	200037	200044	50 %	0 %	25 %	25 %	386037934
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3161	NC_017541	TGG	2	6	200222	200227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386037935
3162	NC_017541	TGA	2	6	200360	200365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037935
3163	NC_017541	TGA	2	6	200411	200416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037935
3164	NC_017541	GTC	2	6	200596	200601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037935
3165	NC_017541	TGATGT	2	12	201132	201143	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386037936
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3169	NC_017541	TTC	2	6	202037	202042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037938
3170	NC_017541	AGTG	2	8	202127	202134	25 %	25 %	50 %	0 %	386037938

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.