MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ketogulonigenium vulgarum WSH-001 plasmid 2

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017385	TGCCC	2	10	284	293	0 %	20 %	20 %	60 %	385235091
2	NC_017385	GCTTG	2	10	407	416	0 %	40 %	40 %	20 %	385235091
3	NC_017385	GATCA	2	10	2107	2116	40 %	20 %	20 %	20 %	385235092
4	NC_017385	GGCGG	3	15	3345	3359	0 %	0 %	80 %	20 %	385235093
5	NC_017385	GGCGA	2	10	3477	3486	20 %	0 %	60 %	20 %	385235093
6	NC_017385	CCGGG	2	10	4012	4021	0 %	0 %	60 %	40 %	385235094
7	NC_017385	CCCGC	2	10	7399	7408	0 %	0 %	20 %	80 %	385235098
8	NC_017385	GATCG	2	10	7444	7453	20 %	20 %	40 %	20 %	385235098
9	NC_017385	GGCCG	2	10	7871	7880	0 %	0 %	60 %	40 %	385235098
10	NC_017385	TGCCG	2	10	8196	8205	0 %	20 %	40 %	40 %	385235098
11	NC_017385	GCCTC	2	10	8920	8929	0 %	20 %	20 %	60 %	385235099
12	NC_017385	CCAAG	2	10	10024	10033	40 %	0 %	20 %	40 %	385235101
13	NC_017385	TCGCC	2	10	10796	10805	0 %	20 %	20 %	60 %	385235102
14	NC_017385	GCCGC	2	10	12777	12786	0 %	0 %	40 %	60 %	385235104
15	NC_017385	TCGCC	2	10	13685	13694	0 %	20 %	20 %	60 %	385235105
16	NC_017385	CGGTG	2	10	14364	14373	0 %	20 %	60 %	20 %	385235105
17	NC_017385	GCGCG	2	10	16805	16814	0 %	0 %	60 %	40 %	385235108
18	NC_017385	GCCGC	2	10	17307	17316	0 %	0 %	40 %	60 %	385235108
19	NC_017385	GGGGC	2	10	17468	17477	0 %	0 %	80 %	20 %	385235108
20	NC_017385	TGCCG	2	10	18122	18131	0 %	20 %	40 %	40 %	385235108
21	NC_017385	ATCGC	2	10	20827	20836	20 %	20 %	20 %	40 %	385235111
22	NC_017385	TCAGG	2	10	21116	21125	20 %	20 %	40 %	20 %	385235111
23	NC_017385	TGGCA	2	10	21497	21506	20 %	20 %	40 %	20 %	385235111
24	NC_017385	GGCGA	2	10	23099	23108	20 %	0 %	60 %	20 %	385235113
25	NC_017385	ATCGG	2	10	23145	23154	20 %	20 %	40 %	20 %	385235113
26	NC_017385	ATGCG	2	10	23639	23648	20 %	20 %	40 %	20 %	385235114
27	NC_017385	GCGCC	2	10	24761	24770	0 %	0 %	40 %	60 %	385235115
28	NC_017385	GACCT	2	10	26454	26463	20 %	20 %	20 %	40 %	385235116
29	NC_017385	GGTCA	2	10	26694	26703	20 %	20 %	40 %	20 %	385235116
30	NC_017385	CCTCG	2	10	28415	28424	0 %	20 %	20 %	60 %	385235118
31	NC_017385	TGACC	2	10	29317	29326	20 %	20 %	20 %	40 %	385235118
32	NC_017385	CGGAT	2	10	29418	29427	20 %	20 %	40 %	20 %	385235118
33	NC_017385	GGCCG	2	10	30939	30948	0 %	0 %	60 %	40 %	385235119
34	NC_017385	TCTGT	2	10	42040	42049	0 %	60 %	20 %	20 %	385235127
35	NC_017385	CACCG	2	10	42204	42213	20 %	0 %	20 %	60 %	385235127
36	NC_017385	CGGGC	2	10	43393	43402	0 %	0 %	60 %	40 %	385235129
37	NC_017385	GATCA	2	10	44112	44121	40 %	20 %	20 %	20 %	385235131
38	NC_017385	GCCGC	2	10	44402	44411	0 %	0 %	40 %	60 %	385235131
39	NC_017385	AGCTG	2	10	47235	47244	20 %	20 %	40 %	20 %	385235133
40	NC_017385	GCGTT	2	10	47514	47523	0 %	40 %	40 %	20 %	385235133
41	NC_017385	CGCAT	2	10	47756	47765	20 %	20 %	20 %	40 %	385235133
42	NC_017385	TTGCC	2	10	47859	47868	0 %	40 %	20 %	40 %	385235133
43	NC_017385	CAAGC	2	10	47916	47925	40 %	0 %	20 %	40 %	385235133
44	NC_017385	GGCCG	2	10	47971	47980	0 %	0 %	60 %	40 %	385235133
45	NC_017385	CGATC	2	10	48055	48064	20 %	20 %	20 %	40 %	385235133
46	NC_017385	GCCGC	2	10	48802	48811	0 %	0 %	40 %	60 %	385235133
47	NC_017385	GGCGC	2	10	49475	49484	0 %	0 %	60 %	40 %	385235134
48	NC_017385	GGCGC	2	10	50003	50012	0 %	0 %	60 %	40 %	385235134
49	NC_017385	GGCGA	2	10	52723	52732	20 %	0 %	60 %	20 %	385235137
50	NC_017385	CCAGA	2	10	52827	52836	40 %	0 %	20 %	40 %	385235137
51	NC_017385	GAACC	2	10	54255	54264	40 %	0 %	20 %	40 %	385235139
52	NC_017385	GATCG	2	10	54799	54808	20 %	20 %	40 %	20 %	385235139
53	NC_017385	CCGAT	2	10	55501	55510	20 %	20 %	20 %	40 %	385235140
54	NC_017385	TATGA	2	10	58950	58959	40 %	40 %	20 %	0 %	385235144
55	NC_017385	TGTCG	2	10	59282	59291	0 %	40 %	40 %	20 %	385235144
56	NC_017385	CCGCG	2	10	60489	60498	0 %	0 %	40 %	60 %	385235145
57	NC_017385	TGCGC	2	10	62989	62998	0 %	20 %	40 %	40 %	385235147
58	NC_017385	GGGGC	2	10	64564	64573	0 %	0 %	80 %	20 %	385235149
59	NC_017385	CACCG	2	10	64832	64841	20 %	0 %	20 %	60 %	385235149
60	NC_017385	CGCGG	2	10	65941	65950	0 %	0 %	60 %	40 %	385235150
61	NC_017385	CAGTA	2	10	67085	67094	40 %	20 %	20 %	20 %	385235151
62	NC_017385	CGGAT	2	10	68244	68253	20 %	20 %	40 %	20 %	385235152
63	NC_017385	GCCGC	2	10	68439	68448	0 %	0 %	40 %	60 %	385235152
64	NC_017385	GGTCG	2	10	69833	69842	0 %	20 %	60 %	20 %	385235154
65	NC_017385	CGGCG	2	10	70323	70332	0 %	0 %	60 %	40 %	385235154
66	NC_017385	CGGCG	2	10	74159	74168	0 %	0 %	60 %	40 %	385235157
67	NC_017385	CACGG	2	10	74171	74180	20 %	0 %	40 %	40 %	385235157
68	NC_017385	CTGCC	2	10	74256	74265	0 %	20 %	20 %	60 %	385235157
69	NC_017385	CGGCG	2	10	75001	75010	0 %	0 %	60 %	40 %	385235158
70	NC_017385	GGCCG	2	10	75239	75248	0 %	0 %	60 %	40 %	385235159
71	NC_017385	GCGCC	2	10	75533	75542	0 %	0 %	40 %	60 %	385235159
72	NC_017385	CGCGC	2	10	75633	75642	0 %	0 %	40 %	60 %	385235159
73	NC_017385	ACCGC	2	10	76814	76823	20 %	0 %	20 %	60 %	385235160
74	NC_017385	TGATC	2	10	77354	77363	20 %	40 %	20 %	20 %	385235160
75	NC_017385	GCGAT	2	10	78007	78016	20 %	20 %	40 %	20 %	385235160
76	NC_017385	GGGTC	2	10	80036	80045	0 %	20 %	60 %	20 %	385235162
77	NC_017385	CGCTG	2	10	81908	81917	0 %	20 %	40 %	40 %	385235162
78	NC_017385	CTGGC	2	10	84529	84538	0 %	20 %	40 %	40 %	385235166
79	NC_017385	GCTGC	2	10	84974	84983	0 %	20 %	40 %	40 %	385235167
80	NC_017385	GGCGC	2	10	85400	85409	0 %	0 %	60 %	40 %	385235167
81	NC_017385	TCGGC	2	10	86352	86361	0 %	20 %	40 %	40 %	385235168
82	NC_017385	GTTGG	2	10	89509	89518	0 %	40 %	60 %	0 %	385235172
83	NC_017385	CCGGG	2	10	91560	91569	0 %	0 %	60 %	40 %	385235175
84	NC_017385	AGCGC	2	10	92699	92708	20 %	0 %	40 %	40 %	385235175
85	NC_017385	GACCG	2	10	94583	94592	20 %	0 %	40 %	40 %	385235177
86	NC_017385	GGCCG	2	10	94606	94615	0 %	0 %	60 %	40 %	385235177
87	NC_017385	TGGAA	2	10	95271	95280	40 %	20 %	40 %	0 %	385235177
88	NC_017385	CCCGC	2	10	96039	96048	0 %	0 %	20 %	80 %	385235178
89	NC_017385	GGTTC	2	10	98251	98260	0 %	40 %	40 %	20 %	385235178
90	NC_017385	GCGCG	2	10	99747	99756	0 %	0 %	60 %	40 %	385235179
91	NC_017385	AAGGT	2	10	99989	99998	40 %	20 %	40 %	0 %	385235179
92	NC_017385	TGCGC	2	10	100543	100552	0 %	20 %	40 %	40 %	385235179
93	NC_017385	AGCGC	3	15	103649	103663	20 %	0 %	40 %	40 %	385235182
94	NC_017385	GGCAA	2	10	105633	105642	40 %	0 %	40 %	20 %	385235182
95	NC_017385	GCACG	2	10	106626	106635	20 %	0 %	40 %	40 %	385235183
96	NC_017385	GAGCG	2	10	108218	108227	20 %	0 %	60 %	20 %	385235184
97	NC_017385	AGGCG	2	10	109113	109122	20 %	0 %	60 %	20 %	385235185
98	NC_017385	CGGCG	2	10	109648	109657	0 %	0 %	60 %	40 %	385235186
99	NC_017385	TGCGC	2	10	109937	109946	0 %	20 %	40 %	40 %	385235186
100	NC_017385	CGCAG	2	10	111134	111143	20 %	0 %	40 %	40 %	385235187
101	NC_017385	CGCGC	2	10	113242	113251	0 %	0 %	40 %	60 %	385235190
102	NC_017385	GACCT	2	10	113876	113885	20 %	20 %	20 %	40 %	385235191
103	NC_017385	ATTGA	2	10	114221	114230	40 %	40 %	20 %	0 %	385235191
104	NC_017385	CCCCG	2	10	114416	114425	0 %	0 %	20 %	80 %	385235192
105	NC_017385	ATGCG	2	10	114763	114772	20 %	20 %	40 %	20 %	385235192
106	NC_017385	GGCCC	2	10	118184	118193	0 %	0 %	40 %	60 %	385235195
107	NC_017385	AACGC	2	10	119265	119274	40 %	0 %	20 %	40 %	385235197
108	NC_017385	ATCGC	2	10	120341	120350	20 %	20 %	20 %	40 %	385235199
109	NC_017385	GATCT	2	10	121154	121163	20 %	40 %	20 %	20 %	385235201
110	NC_017385	GTTCT	2	10	121572	121581	0 %	60 %	20 %	20 %	385235202
111	NC_017385	TGAAG	2	10	122744	122753	40 %	20 %	40 %	0 %	385235204
112	NC_017385	CTCGG	2	10	122871	122880	0 %	20 %	40 %	40 %	385235204
113	NC_017385	CCGCA	2	10	124726	124735	20 %	0 %	20 %	60 %	385235205
114	NC_017385	GCGCC	2	10	125634	125643	0 %	0 %	40 %	60 %	385235206
115	NC_017385	CGCCC	2	10	126559	126568	0 %	0 %	20 %	80 %	385235206
116	NC_017385	CCCGC	2	10	126613	126622	0 %	0 %	20 %	80 %	385235206
117	NC_017385	GCCTG	2	10	126846	126855	0 %	20 %	40 %	40 %	385235206
118	NC_017385	CGCGC	2	10	127694	127703	0 %	0 %	40 %	60 %	385235207
119	NC_017385	TGATC	2	10	127819	127828	20 %	40 %	20 %	20 %	385235207
120	NC_017385	AGCAC	2	10	128674	128683	40 %	0 %	20 %	40 %	385235207
121	NC_017385	ATCAC	2	10	128883	128892	40 %	20 %	0 %	40 %	385235207
122	NC_017385	TGATC	2	10	129076	129085	20 %	40 %	20 %	20 %	385235207
123	NC_017385	CGGGG	2	10	129586	129595	0 %	0 %	80 %	20 %	385235207
124	NC_017385	AGGCG	2	10	130001	130010	20 %	0 %	60 %	20 %	385235208
125	NC_017385	TGCCG	2	10	131452	131461	0 %	20 %	40 %	40 %	385235209
126	NC_017385	CCTCG	2	10	131716	131725	0 %	20 %	20 %	60 %	385235209
127	NC_017385	GTTTC	2	10	131754	131763	0 %	60 %	20 %	20 %	385235209
128	NC_017385	GCCCT	2	10	133463	133472	0 %	20 %	20 %	60 %	385235210
129	NC_017385	GGCGC	2	10	133511	133520	0 %	0 %	60 %	40 %	385235210
130	NC_017385	GCCGC	2	10	135031	135040	0 %	0 %	40 %	60 %	385235211
131	NC_017385	CATGG	2	10	136027	136036	20 %	20 %	40 %	20 %	385235212
132	NC_017385	CGCTG	2	10	137458	137467	0 %	20 %	40 %	40 %	385235212
133	NC_017385	GCGCC	2	10	137627	137636	0 %	0 %	40 %	60 %	385235213
134	NC_017385	GCCGG	2	10	138140	138149	0 %	0 %	60 %	40 %	385235213
135	NC_017385	GCCTT	2	10	139523	139532	0 %	40 %	20 %	40 %	385235214
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187	NC_017385	CATCG	2	10	195234	195243	20 %	20 %	20 %	40 %	385235259
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.