MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae 342 plasmid pKP187

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011282	TGAG	2	8	197	204	25 %	25 %	50 %	0 %	206575669
2	NC_011282	GACA	2	8	1134	1141	50 %	0 %	25 %	25 %	206575669
3	NC_011282	TTAT	2	8	1441	1448	25 %	75 %	0 %	0 %	206575521
4	NC_011282	GGCG	2	8	2086	2093	0 %	0 %	75 %	25 %	206575657
5	NC_011282	TTGA	2	8	2397	2404	25 %	50 %	25 %	0 %	206575657
6	NC_011282	CCCA	2	8	2486	2493	25 %	0 %	0 %	75 %	206575657
7	NC_011282	TCAG	2	8	2551	2558	25 %	25 %	25 %	25 %	206575657
8	NC_011282	TTTG	2	8	3751	3758	0 %	75 %	25 %	0 %	206575513
9	NC_011282	TGCG	2	8	3918	3925	0 %	25 %	50 %	25 %	206575622
10	NC_011282	GATA	2	8	4289	4296	50 %	25 %	25 %	0 %	206575622
11	NC_011282	AGCA	2	8	4334	4341	50 %	0 %	25 %	25 %	206575622
12	NC_011282	CAGA	2	8	4484	4491	50 %	0 %	25 %	25 %	206575622
13	NC_011282	ATGA	2	8	5018	5025	50 %	25 %	25 %	0 %	206575604
14	NC_011282	CACC	2	8	5206	5213	25 %	0 %	0 %	75 %	206575604
15	NC_011282	AAAC	2	8	5575	5582	75 %	0 %	0 %	25 %	206575550
16	NC_011282	CAGG	2	8	5611	5618	25 %	0 %	50 %	25 %	206575550
17	NC_011282	CCAG	2	8	5674	5681	25 %	0 %	25 %	50 %	206575550
18	NC_011282	TTTC	2	8	6028	6035	0 %	75 %	0 %	25 %	206575507
19	NC_011282	CCCT	2	8	6335	6342	0 %	25 %	0 %	75 %	206575507
20	NC_011282	CAGA	2	8	8837	8844	50 %	0 %	25 %	25 %	206575577
21	NC_011282	ATCA	2	8	9361	9368	50 %	25 %	0 %	25 %	206575709
22	NC_011282	AGGA	2	8	9804	9811	50 %	0 %	50 %	0 %	206575623
23	NC_011282	AAAT	2	8	9938	9945	75 %	25 %	0 %	0 %	206575496
24	NC_011282	GCAG	2	8	9992	9999	25 %	0 %	50 %	25 %	206575496
25	NC_011282	CGGG	2	8	10708	10715	0 %	0 %	75 %	25 %	206575697
26	NC_011282	CTGA	2	8	10772	10779	25 %	25 %	25 %	25 %	206575697
27	NC_011282	CGCA	2	8	10840	10847	25 %	0 %	25 %	50 %	206575697
28	NC_011282	GACA	2	8	11641	11648	50 %	0 %	25 %	25 %	206575596
29	NC_011282	TGAT	2	8	13972	13979	25 %	50 %	25 %	0 %	206575574
30	NC_011282	CCGG	2	8	14046	14053	0 %	0 %	50 %	50 %	206575574
31	NC_011282	TCGT	2	8	15298	15305	0 %	50 %	25 %	25 %	206575644
32	NC_011282	GGAA	2	8	15572	15579	50 %	0 %	50 %	0 %	206575644
33	NC_011282	ACTT	2	8	15772	15779	25 %	50 %	0 %	25 %	206575644
34	NC_011282	GCTC	2	8	16446	16453	0 %	25 %	25 %	50 %	206575529
35	NC_011282	CGGA	2	8	16608	16615	25 %	0 %	50 %	25 %	206575529
36	NC_011282	GCCG	2	8	16766	16773	0 %	0 %	50 %	50 %	206575607
37	NC_011282	AATC	2	8	20441	20448	50 %	25 %	0 %	25 %	206575646
38	NC_011282	ATAG	2	8	21782	21789	50 %	25 %	25 %	0 %	206575690
39	NC_011282	TAAA	2	8	21965	21972	75 %	25 %	0 %	0 %	206575690
40	NC_011282	AATT	2	8	22475	22482	50 %	50 %	0 %	0 %	206575690
41	NC_011282	ATTG	2	8	22662	22669	25 %	50 %	25 %	0 %	206575690
42	NC_011282	CTGA	2	8	23792	23799	25 %	25 %	25 %	25 %	206575617
43	NC_011282	ACGG	2	8	24305	24312	25 %	0 %	50 %	25 %	206575617
44	NC_011282	ATTC	2	8	25530	25537	25 %	50 %	0 %	25 %	206575634
45	NC_011282	CTTT	2	8	25742	25749	0 %	75 %	0 %	25 %	206575634
46	NC_011282	ATTC	2	8	25934	25941	25 %	50 %	0 %	25 %	206575634
47	NC_011282	AATC	2	8	26241	26248	50 %	25 %	0 %	25 %	206575634
48	NC_011282	ATTC	2	8	26759	26766	25 %	50 %	0 %	25 %	206575649
49	NC_011282	AATA	2	8	27235	27242	75 %	25 %	0 %	0 %	206575649
50	NC_011282	TAAT	2	8	27428	27435	50 %	50 %	0 %	0 %	206575598
51	NC_011282	ACGC	2	8	27491	27498	25 %	0 %	25 %	50 %	206575598
52	NC_011282	AATT	2	8	27504	27511	50 %	50 %	0 %	0 %	206575598
53	NC_011282	ATCT	2	8	27516	27523	25 %	50 %	0 %	25 %	206575598
54	NC_011282	GGTA	2	8	27704	27711	25 %	25 %	50 %	0 %	206575598
55	NC_011282	CCAG	2	8	29749	29756	25 %	0 %	25 %	50 %	206575636
56	NC_011282	ACTG	2	8	29860	29867	25 %	25 %	25 %	25 %	206575636
57	NC_011282	TTTG	2	8	30009	30016	0 %	75 %	25 %	0 %	206575636
58	NC_011282	GAAC	2	8	30048	30055	50 %	0 %	25 %	25 %	206575636
59	NC_011282	AGTG	2	8	30992	30999	25 %	25 %	50 %	0 %	206575696
60	NC_011282	TGAT	2	8	32075	32082	25 %	50 %	25 %	0 %	206575485
61	NC_011282	TTTA	2	8	32177	32184	25 %	75 %	0 %	0 %	206575485
62	NC_011282	GAGG	2	8	32427	32434	25 %	0 %	75 %	0 %	206575608
63	NC_011282	AGCC	2	8	32570	32577	25 %	0 %	25 %	50 %	206575608
64	NC_011282	AAAG	2	8	33100	33107	75 %	0 %	25 %	0 %	206575586
65	NC_011282	AAAG	2	8	33166	33173	75 %	0 %	25 %	0 %	206575586
66	NC_011282	AACT	2	8	33293	33300	50 %	25 %	0 %	25 %	206575710
67	NC_011282	TTCC	2	8	33515	33522	0 %	50 %	0 %	50 %	206575710
68	NC_011282	CTTC	2	8	34853	34860	0 %	50 %	0 %	50 %	206575620
69	NC_011282	TGGT	2	8	34911	34918	0 %	50 %	50 %	0 %	206575620
70	NC_011282	TCGC	2	8	35031	35038	0 %	25 %	25 %	50 %	206575620
71	NC_011282	ACCG	2	8	37251	37258	25 %	0 %	25 %	50 %	206575565
72	NC_011282	GACC	2	8	39188	39195	25 %	0 %	25 %	50 %	206575671
73	NC_011282	GCCA	2	8	39943	39950	25 %	0 %	25 %	50 %	206575671
74	NC_011282	TGCC	2	8	40177	40184	0 %	25 %	25 %	50 %	206575606
75	NC_011282	AGGG	2	8	40214	40221	25 %	0 %	75 %	0 %	206575606
76	NC_011282	TTTC	2	8	40576	40583	0 %	75 %	0 %	25 %	206575683
77	NC_011282	TCAA	2	8	40686	40693	50 %	25 %	0 %	25 %	206575683
78	NC_011282	CAGG	2	8	40729	40736	25 %	0 %	50 %	25 %	206575683
79	NC_011282	TTCG	2	8	41109	41116	0 %	50 %	25 %	25 %	206575635
80	NC_011282	AAGA	2	8	44250	44257	75 %	0 %	25 %	0 %	206575573
81	NC_011282	TAAC	2	8	44747	44754	50 %	25 %	0 %	25 %	206575677
82	NC_011282	CGTT	2	8	45099	45106	0 %	50 %	25 %	25 %	206575528
83	NC_011282	GTCT	2	8	45280	45287	0 %	50 %	25 %	25 %	206575528
84	NC_011282	ATTG	2	8	45763	45770	25 %	50 %	25 %	0 %	206575686
85	NC_011282	GTTG	2	8	45875	45882	0 %	50 %	50 %	0 %	206575686
86	NC_011282	GACA	2	8	47288	47295	50 %	0 %	25 %	25 %	206575546
87	NC_011282	GCTG	2	8	47937	47944	0 %	25 %	50 %	25 %	206575564
88	NC_011282	GCAG	2	8	48449	48456	25 %	0 %	50 %	25 %	206575631
89	NC_011282	GAAA	2	8	48802	48809	75 %	0 %	25 %	0 %	206575536
90	NC_011282	ATTG	2	8	48945	48952	25 %	50 %	25 %	0 %	206575536
91	NC_011282	GAAT	2	8	49304	49311	50 %	25 %	25 %	0 %	206575536
92	NC_011282	TTAC	2	8	49774	49781	25 %	50 %	0 %	25 %	206575536
93	NC_011282	TTAT	2	8	49792	49799	25 %	75 %	0 %	0 %	206575536
94	NC_011282	CAAA	2	8	50308	50315	75 %	0 %	0 %	25 %	206575536
95	NC_011282	CCAT	2	8	51025	51032	25 %	25 %	0 %	50 %	206575543
96	NC_011282	CTGG	2	8	51600	51607	0 %	25 %	50 %	25 %	206575651
97	NC_011282	ATTC	2	8	51791	51798	25 %	50 %	0 %	25 %	206575527
98	NC_011282	AACA	2	8	52543	52550	75 %	0 %	0 %	25 %	206575527
99	NC_011282	ATGA	2	8	52573	52580	50 %	25 %	25 %	0 %	206575527
100	NC_011282	GGTT	2	8	52725	52732	0 %	50 %	50 %	0 %	206575527
101	NC_011282	ACTC	2	8	52797	52804	25 %	25 %	0 %	50 %	206575527
102	NC_011282	CGGA	2	8	53474	53481	25 %	0 %	50 %	25 %	206575527
103	NC_011282	GTCA	2	8	54009	54016	25 %	25 %	25 %	25 %	206575508
104	NC_011282	GGAT	2	8	54286	54293	25 %	25 %	50 %	0 %	206575508
105	NC_011282	ACGA	2	8	54298	54305	50 %	0 %	25 %	25 %	206575508
106	NC_011282	GCGG	2	8	54432	54439	0 %	0 %	75 %	25 %	206575508
107	NC_011282	GTCT	2	8	54448	54455	0 %	50 %	25 %	25 %	206575508
108	NC_011282	CGCA	2	8	55110	55117	25 %	0 %	25 %	50 %	206575500
109	NC_011282	ATTT	2	8	55582	55589	25 %	75 %	0 %	0 %	206575640
110	NC_011282	ATTT	2	8	55663	55670	25 %	75 %	0 %	0 %	206575640
111	NC_011282	ATTT	2	8	55693	55700	25 %	75 %	0 %	0 %	206575640
112	NC_011282	CAGG	2	8	58696	58703	25 %	0 %	50 %	25 %	206575483
113	NC_011282	CTTT	2	8	59063	59070	0 %	75 %	0 %	25 %	206575693
114	NC_011282	CAGA	2	8	60012	60019	50 %	0 %	25 %	25 %	206575569
115	NC_011282	TGAA	2	8	60963	60970	50 %	25 %	25 %	0 %	206575585
116	NC_011282	CCGC	2	8	61422	61429	0 %	0 %	25 %	75 %	206575645
117	NC_011282	CAGG	2	8	61608	61615	25 %	0 %	50 %	25 %	206575534
118	NC_011282	ACGC	2	8	61970	61977	25 %	0 %	25 %	50 %	206575584
119	NC_011282	ATAA	2	8	62102	62109	75 %	25 %	0 %	0 %	206575584
120	NC_011282	GCGG	2	8	63778	63785	0 %	0 %	75 %	25 %	206575653
121	NC_011282	CTGG	2	8	63860	63867	0 %	25 %	50 %	25 %	206575653
122	NC_011282	GATT	2	8	64428	64435	25 %	50 %	25 %	0 %	206575653
123	NC_011282	CCGG	2	8	64968	64975	0 %	0 %	50 %	50 %	206575653
124	NC_011282	ATCA	2	8	65024	65031	50 %	25 %	0 %	25 %	206575653
125	NC_011282	GGCG	2	8	65099	65106	0 %	0 %	75 %	25 %	206575653
126	NC_011282	GGCG	2	8	65554	65561	0 %	0 %	75 %	25 %	206575653
127	NC_011282	AATT	2	8	66351	66358	50 %	50 %	0 %	0 %	206575570
128	NC_011282	TTCA	2	8	66703	66710	25 %	50 %	0 %	25 %	206575570
129	NC_011282	GCGG	2	8	66847	66854	0 %	0 %	75 %	25 %	206575570
130	NC_011282	ATTA	2	8	67036	67043	50 %	50 %	0 %	0 %	206575689
131	NC_011282	TCGT	2	8	67896	67903	0 %	50 %	25 %	25 %	206575533
132	NC_011282	CAGC	2	8	69174	69181	25 %	0 %	25 %	50 %	206575614
133	NC_011282	CCGA	2	8	69223	69230	25 %	0 %	25 %	50 %	206575614
134	NC_011282	GACC	2	8	69414	69421	25 %	0 %	25 %	50 %	206575614
135	NC_011282	CTGC	2	8	69633	69640	0 %	25 %	25 %	50 %	206575614
136	NC_011282	TCTG	2	8	70666	70673	0 %	50 %	25 %	25 %	206575614
137	NC_011282	CAGC	2	8	71413	71420	25 %	0 %	25 %	50 %	206575545
138	NC_011282	GCTG	2	8	71517	71524	0 %	25 %	50 %	25 %	206575545
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140	NC_011282	GGCA	2	8	71872	71879	25 %	0 %	50 %	25 %	206575545
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.