MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 plasmid pKRAD01

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009806	GC	3	6	369	374	0 %	0 %	50 %	50 %	157283829
2	NC_009806	GC	3	6	1623	1628	0 %	0 %	50 %	50 %	157283831
3	NC_009806	CA	3	6	1992	1997	50 %	0 %	0 %	50 %	157283832
4	NC_009806	GC	4	8	2415	2422	0 %	0 %	50 %	50 %	157283833
5	NC_009806	GT	3	6	3640	3645	0 %	50 %	50 %	0 %	157283833
6	NC_009806	TC	3	6	3883	3888	0 %	50 %	0 %	50 %	157283833
7	NC_009806	CT	3	6	4176	4181	0 %	50 %	0 %	50 %	157283834
8	NC_009806	CG	3	6	4423	4428	0 %	0 %	50 %	50 %	157283834
9	NC_009806	CT	3	6	6402	6407	0 %	50 %	0 %	50 %	157283836
10	NC_009806	TC	3	6	7328	7333	0 %	50 %	0 %	50 %	157283837
11	NC_009806	CG	3	6	8226	8231	0 %	0 %	50 %	50 %	157283838
12	NC_009806	GC	3	6	8440	8445	0 %	0 %	50 %	50 %	157283838
13	NC_009806	CG	3	6	8663	8668	0 %	0 %	50 %	50 %	157283838
14	NC_009806	GC	3	6	9108	9113	0 %	0 %	50 %	50 %	157283839
15	NC_009806	CT	3	6	9464	9469	0 %	50 %	0 %	50 %	157283839
16	NC_009806	CG	3	6	10177	10182	0 %	0 %	50 %	50 %	157283840
17	NC_009806	CG	3	6	10560	10565	0 %	0 %	50 %	50 %	157283841
18	NC_009806	GT	3	6	11255	11260	0 %	50 %	50 %	0 %	157283842
19	NC_009806	CG	3	6	12193	12198	0 %	0 %	50 %	50 %	157283844
20	NC_009806	GA	3	6	12388	12393	50 %	0 %	50 %	0 %	157283844
21	NC_009806	GC	3	6	14625	14630	0 %	0 %	50 %	50 %	157283846
22	NC_009806	CG	3	6	16029	16034	0 %	0 %	50 %	50 %	157283847
23	NC_009806	GT	3	6	16914	16919	0 %	50 %	50 %	0 %	157283848
24	NC_009806	CT	3	6	17665	17670	0 %	50 %	0 %	50 %	157283849
25	NC_009806	CG	3	6	17911	17916	0 %	0 %	50 %	50 %	157283849
26	NC_009806	GC	3	6	18422	18427	0 %	0 %	50 %	50 %	157283850
27	NC_009806	CA	3	6	18895	18900	50 %	0 %	0 %	50 %	157283850
28	NC_009806	GC	3	6	19365	19370	0 %	0 %	50 %	50 %	157283851
29	NC_009806	CT	3	6	20224	20229	0 %	50 %	0 %	50 %	157283852
30	NC_009806	GC	3	6	20647	20652	0 %	0 %	50 %	50 %	157283852
31	NC_009806	CG	3	6	22842	22847	0 %	0 %	50 %	50 %	157283854
32	NC_009806	GC	3	6	23670	23675	0 %	0 %	50 %	50 %	157283854
33	NC_009806	CA	3	6	23884	23889	50 %	0 %	0 %	50 %	157283854
34	NC_009806	GC	3	6	25269	25274	0 %	0 %	50 %	50 %	157283854
35	NC_009806	CG	3	6	25275	25280	0 %	0 %	50 %	50 %	157283854
36	NC_009806	CT	3	6	26051	26056	0 %	50 %	0 %	50 %	157283855
37	NC_009806	GC	3	6	26753	26758	0 %	0 %	50 %	50 %	157283856
38	NC_009806	GT	3	6	27592	27597	0 %	50 %	50 %	0 %	157283856
39	NC_009806	GC	3	6	30514	30519	0 %	0 %	50 %	50 %	157283859
40	NC_009806	GC	3	6	30604	30609	0 %	0 %	50 %	50 %	157283859
41	NC_009806	GC	3	6	30636	30641	0 %	0 %	50 %	50 %	157283859
42	NC_009806	GC	3	6	30816	30821	0 %	0 %	50 %	50 %	157283859
43	NC_009806	CG	4	8	33624	33631	0 %	0 %	50 %	50 %	157283862
44	NC_009806	GC	3	6	33657	33662	0 %	0 %	50 %	50 %	157283862
45	NC_009806	CG	3	6	34233	34238	0 %	0 %	50 %	50 %	157283862
46	NC_009806	AC	3	6	34434	34439	50 %	0 %	0 %	50 %	157283862
47	NC_009806	CG	3	6	35580	35585	0 %	0 %	50 %	50 %	157283863
48	NC_009806	GC	4	8	38166	38173	0 %	0 %	50 %	50 %	157283867
49	NC_009806	CG	3	6	38603	38608	0 %	0 %	50 %	50 %	157283867
50	NC_009806	AG	3	6	39446	39451	50 %	0 %	50 %	0 %	157283868
51	NC_009806	GC	3	6	40055	40060	0 %	0 %	50 %	50 %	157283869
52	NC_009806	GC	3	6	40686	40691	0 %	0 %	50 %	50 %	157283869
53	NC_009806	CG	3	6	41751	41756	0 %	0 %	50 %	50 %	157283870
54	NC_009806	GC	3	6	43721	43726	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
55	NC_009806	GC	3	6	43826	43831	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
56	NC_009806	CA	3	6	44614	44619	50 %	0 %	0 %	50 %	157283873
57	NC_009806	GC	3	6	44837	44842	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
58	NC_009806	CG	3	6	45254	45259	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
59	NC_009806	GC	3	6	45387	45392	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
60	NC_009806	CG	3	6	45463	45468	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
61	NC_009806	GC	3	6	45738	45743	0 %	0 %	50 %	50 %	157283873
62	NC_009806	CG	3	6	46542	46547	0 %	0 %	50 %	50 %	157283874
63	NC_009806	GC	3	6	47294	47299	0 %	0 %	50 %	50 %	157283875
64	NC_009806	GC	3	6	48538	48543	0 %	0 %	50 %	50 %	157283875
65	NC_009806	AG	3	6	49004	49009	50 %	0 %	50 %	0 %	157283876
66	NC_009806	GA	3	6	49129	49134	50 %	0 %	50 %	0 %	157283876
67	NC_009806	CG	3	6	49775	49780	0 %	0 %	50 %	50 %	157283876
68	NC_009806	CG	4	8	49959	49966	0 %	0 %	50 %	50 %	157283876
69	NC_009806	CG	3	6	50356	50361	0 %	0 %	50 %	50 %	157283876
70	NC_009806	GC	3	6	50897	50902	0 %	0 %	50 %	50 %	157283877
71	NC_009806	GC	3	6	50990	50995	0 %	0 %	50 %	50 %	157283877
72	NC_009806	GC	3	6	51086	51091	0 %	0 %	50 %	50 %	157283877
73	NC_009806	GC	3	6	51123	51128	0 %	0 %	50 %	50 %	157283877
74	NC_009806	CG	3	6	51791	51796	0 %	0 %	50 %	50 %	157283878
75	NC_009806	CG	3	6	51855	51860	0 %	0 %	50 %	50 %	157283878
76	NC_009806	GA	3	6	52807	52812	50 %	0 %	50 %	0 %	157283880
77	NC_009806	GC	3	6	53983	53988	0 %	0 %	50 %	50 %	157283881
78	NC_009806	GC	3	6	54626	54631	0 %	0 %	50 %	50 %	157283881
79	NC_009806	GC	3	6	55023	55028	0 %	0 %	50 %	50 %	157283881
80	NC_009806	CG	3	6	56159	56164	0 %	0 %	50 %	50 %	157283883
81	NC_009806	GC	3	6	56827	56832	0 %	0 %	50 %	50 %	157283884
82	NC_009806	CG	3	6	57872	57877	0 %	0 %	50 %	50 %	157283885
83	NC_009806	GC	3	6	57973	57978	0 %	0 %	50 %	50 %	157283885
84	NC_009806	GC	3	6	59359	59364	0 %	0 %	50 %	50 %	157283887
85	NC_009806	GC	3	6	61249	61254	0 %	0 %	50 %	50 %	157283889
86	NC_009806	CG	3	6	61683	61688	0 %	0 %	50 %	50 %	157283889
87	NC_009806	CG	3	6	61953	61958	0 %	0 %	50 %	50 %	157283889
88	NC_009806	GT	3	6	62431	62436	0 %	50 %	50 %	0 %	157283890
89	NC_009806	GC	3	6	67239	67244	0 %	0 %	50 %	50 %	157283895
90	NC_009806	CG	3	6	67611	67616	0 %	0 %	50 %	50 %	157283896
91	NC_009806	CG	3	6	67671	67676	0 %	0 %	50 %	50 %	157283896
92	NC_009806	CT	3	6	67718	67723	0 %	50 %	0 %	50 %	157283896
93	NC_009806	TG	4	8	68110	68117	0 %	50 %	50 %	0 %	157283896
94	NC_009806	CG	3	6	68726	68731	0 %	0 %	50 %	50 %	157283898
95	NC_009806	GC	3	6	69477	69482	0 %	0 %	50 %	50 %	157283899
96	NC_009806	GC	3	6	72924	72929	0 %	0 %	50 %	50 %	157283903
97	NC_009806	GC	3	6	74252	74257	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
98	NC_009806	GC	3	6	74513	74518	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
99	NC_009806	GC	3	6	74556	74561	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
100	NC_009806	GC	3	6	74746	74751	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
101	NC_009806	CG	3	6	75411	75416	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
102	NC_009806	GC	3	6	75629	75634	0 %	0 %	50 %	50 %	157283904
103	NC_009806	GC	3	6	76498	76503	0 %	0 %	50 %	50 %	157283905
104	NC_009806	CG	3	6	78261	78266	0 %	0 %	50 %	50 %	157283907
105	NC_009806	CG	3	6	78777	78782	0 %	0 %	50 %	50 %	157283907
106	NC_009806	CG	3	6	79000	79005	0 %	0 %	50 %	50 %	157283908
107	NC_009806	CG	4	8	79031	79038	0 %	0 %	50 %	50 %	157283908
108	NC_009806	GC	3	6	80748	80753	0 %	0 %	50 %	50 %	157283913
109	NC_009806	CG	3	6	80766	80771	0 %	0 %	50 %	50 %	157283913
110	NC_009806	AG	3	6	80807	80812	50 %	0 %	50 %	0 %	157283913
111	NC_009806	GC	4	8	81221	81228	0 %	0 %	50 %	50 %	157283913
112	NC_009806	GC	4	8	81944	81951	0 %	0 %	50 %	50 %	157283913
113	NC_009806	GC	3	6	83312	83317	0 %	0 %	50 %	50 %	157283913
114	NC_009806	GC	3	6	83486	83491	0 %	0 %	50 %	50 %	157283913
115	NC_009806	TC	3	6	83706	83711	0 %	50 %	0 %	50 %	157283913
116	NC_009806	CA	3	6	83966	83971	50 %	0 %	0 %	50 %	157283913
117	NC_009806	GC	3	6	84614	84619	0 %	0 %	50 %	50 %	157283914
118	NC_009806	GC	3	6	85468	85473	0 %	0 %	50 %	50 %	157283915
119	NC_009806	GC	4	8	85682	85689	0 %	0 %	50 %	50 %	157283915
120	NC_009806	GC	3	6	86286	86291	0 %	0 %	50 %	50 %	157283916
121	NC_009806	AG	3	6	86302	86307	50 %	0 %	50 %	0 %	157283916
122	NC_009806	CG	3	6	86798	86803	0 %	0 %	50 %	50 %	157283916
123	NC_009806	GC	3	6	87938	87943	0 %	0 %	50 %	50 %	157283916
124	NC_009806	GC	3	6	88138	88143	0 %	0 %	50 %	50 %	157283916
125	NC_009806	CG	3	6	88256	88261	0 %	0 %	50 %	50 %	157283916
126	NC_009806	GC	3	6	88262	88267	0 %	0 %	50 %	50 %	157283916
127	NC_009806	CG	4	8	88653	88660	0 %	0 %	50 %	50 %	157283916
128	NC_009806	CG	3	6	90701	90706	0 %	0 %	50 %	50 %	157283919
129	NC_009806	GC	3	6	91104	91109	0 %	0 %	50 %	50 %	157283919
130	NC_009806	AG	3	6	91110	91115	50 %	0 %	50 %	0 %	157283919
131	NC_009806	CG	3	6	91650	91655	0 %	0 %	50 %	50 %	157283919
132	NC_009806	GC	3	6	92599	92604	0 %	0 %	50 %	50 %	157283920
133	NC_009806	CG	3	6	93888	93893	0 %	0 %	50 %	50 %	157283921
134	NC_009806	GC	3	6	94526	94531	0 %	0 %	50 %	50 %	157283922
135	NC_009806	CA	3	6	94638	94643	50 %	0 %	0 %	50 %	157283922
136	NC_009806	CG	3	6	95947	95952	0 %	0 %	50 %	50 %	157283923
137	NC_009806	GC	3	6	96487	96492	0 %	0 %	50 %	50 %	157283924
138	NC_009806	GC	4	8	97007	97014	0 %	0 %	50 %	50 %	157283924
139	NC_009806	CG	3	6	97698	97703	0 %	0 %	50 %	50 %	157283924
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141	NC_009806	GC	3	6	99789	99794	0 %	0 %	50 %	50 %	157283927
142	NC_009806	CG	3	6	100124	100129	0 %	0 %	50 %	50 %	157283927
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281	NC_009806	CG	3	6	178453	178458	0 %	0 %	50 %	50 %	157284006
282	NC_009806	CG	4	8	180352	180359	0 %	0 %	50 %	50 %	157284010
283	NC_009806	GC	3	6	180459	180464	0 %	0 %	50 %	50 %	157284010
284	NC_009806	CA	3	6	180567	180572	50 %	0 %	0 %	50 %	157284010
285	NC_009806	GC	3	6	181792	181797	0 %	0 %	50 %	50 %	157284012

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.