MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 plasmid pKRAD01

Total Repeats: 433

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009806	CGCC	2	8	180	187	0 %	0 %	25 %	75 %	157283829
2	NC_009806	CGCC	2	8	222	229	0 %	0 %	25 %	75 %	157283829
3	NC_009806	ACGC	2	8	794	801	25 %	0 %	25 %	50 %	157283830
4	NC_009806	TGCC	2	8	905	912	0 %	25 %	25 %	50 %	157283830
5	NC_009806	GCCG	2	8	1215	1222	0 %	0 %	50 %	50 %	157283830
6	NC_009806	CACC	2	8	1614	1621	25 %	0 %	0 %	75 %	157283831
7	NC_009806	CGCC	2	8	1734	1741	0 %	0 %	25 %	75 %	157283831
8	NC_009806	GCCA	2	8	1798	1805	25 %	0 %	25 %	50 %	157283831
9	NC_009806	GCTG	2	8	1979	1986	0 %	25 %	50 %	25 %	157283832
10	NC_009806	CACC	2	8	2033	2040	25 %	0 %	0 %	75 %	157283832
11	NC_009806	CACC	2	8	2050	2057	25 %	0 %	0 %	75 %	157283832
12	NC_009806	AGGC	2	8	2110	2117	25 %	0 %	50 %	25 %	157283832
13	NC_009806	CTCG	2	8	2316	2323	0 %	25 %	25 %	50 %	157283833
14	NC_009806	TGCG	2	8	2898	2905	0 %	25 %	50 %	25 %	157283833
15	NC_009806	GGCT	2	8	3115	3122	0 %	25 %	50 %	25 %	157283833
16	NC_009806	TCCA	2	8	3210	3217	25 %	25 %	0 %	50 %	157283833
17	NC_009806	CGGC	2	8	3473	3480	0 %	0 %	50 %	50 %	157283833
18	NC_009806	CGCC	2	8	4436	4443	0 %	0 %	25 %	75 %	157283834
19	NC_009806	GCTG	2	8	5321	5328	0 %	25 %	50 %	25 %	157283834
20	NC_009806	GGGC	2	8	5681	5688	0 %	0 %	75 %	25 %	157283835
21	NC_009806	GGGC	2	8	6123	6130	0 %	0 %	75 %	25 %	157283836
22	NC_009806	GAGC	2	8	6451	6458	25 %	0 %	50 %	25 %	157283836
23	NC_009806	TGGC	2	8	7140	7147	0 %	25 %	50 %	25 %	157283837
24	NC_009806	CGGC	2	8	7702	7709	0 %	0 %	50 %	50 %	157283837
25	NC_009806	AGCC	2	8	8046	8053	25 %	0 %	25 %	50 %	157283837
26	NC_009806	AGCC	2	8	8067	8074	25 %	0 %	25 %	50 %	157283837
27	NC_009806	AGCG	2	8	8447	8454	25 %	0 %	50 %	25 %	157283838
28	NC_009806	CGTC	2	8	9585	9592	0 %	25 %	25 %	50 %	157283839
29	NC_009806	GGCC	2	8	9705	9712	0 %	0 %	50 %	50 %	157283839
30	NC_009806	CAGC	2	8	10791	10798	25 %	0 %	25 %	50 %	157283841
31	NC_009806	GTCC	2	8	10837	10844	0 %	25 %	25 %	50 %	157283841
32	NC_009806	CGGG	2	8	11517	11524	0 %	0 %	75 %	25 %	157283842
33	NC_009806	CCAC	2	8	11633	11640	25 %	0 %	0 %	75 %	157283842
34	NC_009806	GGTC	2	8	12262	12269	0 %	25 %	50 %	25 %	157283844
35	NC_009806	GGCC	2	8	12315	12322	0 %	0 %	50 %	50 %	157283844
36	NC_009806	CACC	2	8	12656	12663	25 %	0 %	0 %	75 %	157283844
37	NC_009806	GGTG	2	8	12692	12699	0 %	25 %	75 %	0 %	157283844
38	NC_009806	GCTG	2	8	13429	13436	0 %	25 %	50 %	25 %	157283845
39	NC_009806	AGCC	2	8	14438	14445	25 %	0 %	25 %	50 %	157283846
40	NC_009806	TGGG	2	8	14461	14468	0 %	25 %	75 %	0 %	157283846
41	NC_009806	CGAG	2	8	15226	15233	25 %	0 %	50 %	25 %	157283846
42	NC_009806	TGGG	2	8	15963	15970	0 %	25 %	75 %	0 %	157283847
43	NC_009806	GGCC	2	8	17728	17735	0 %	0 %	50 %	50 %	157283849
44	NC_009806	ACCA	2	8	17783	17790	50 %	0 %	0 %	50 %	157283849
45	NC_009806	GTCC	2	8	20251	20258	0 %	25 %	25 %	50 %	157283852
46	NC_009806	GCAC	2	8	21136	21143	25 %	0 %	25 %	50 %	157283852
47	NC_009806	CTTG	2	8	21803	21810	0 %	50 %	25 %	25 %	157283853
48	NC_009806	AGGT	2	8	23014	23021	25 %	25 %	50 %	0 %	157283854
49	NC_009806	GGTG	2	8	23210	23217	0 %	25 %	75 %	0 %	157283854
50	NC_009806	GGGC	2	8	23243	23250	0 %	0 %	75 %	25 %	157283854
51	NC_009806	CCGG	2	8	23459	23466	0 %	0 %	50 %	50 %	157283854
52	NC_009806	CCCG	2	8	23529	23536	0 %	0 %	25 %	75 %	157283854
53	NC_009806	AGGA	2	8	23593	23600	50 %	0 %	50 %	0 %	157283854
54	NC_009806	GCCC	2	8	23753	23760	0 %	0 %	25 %	75 %	157283854
55	NC_009806	CGGG	2	8	23937	23944	0 %	0 %	75 %	25 %	157283854
56	NC_009806	CCCA	2	8	24079	24086	25 %	0 %	0 %	75 %	157283854
57	NC_009806	GGTG	2	8	24288	24295	0 %	25 %	75 %	0 %	157283854
58	NC_009806	GCAG	2	8	24607	24614	25 %	0 %	50 %	25 %	157283854
59	NC_009806	CTCG	2	8	25694	25701	0 %	25 %	25 %	50 %	157283855
60	NC_009806	AGCC	2	8	26060	26067	25 %	0 %	25 %	50 %	157283855
61	NC_009806	GGGC	2	8	26747	26754	0 %	0 %	75 %	25 %	157283856
62	NC_009806	GGTA	2	8	26891	26898	25 %	25 %	50 %	0 %	157283856
63	NC_009806	GCTG	2	8	27821	27828	0 %	25 %	50 %	25 %	157283856
64	NC_009806	GCTG	2	8	28974	28981	0 %	25 %	50 %	25 %	157283857
65	NC_009806	GCCT	2	8	29023	29030	0 %	25 %	25 %	50 %	157283857
66	NC_009806	CCCG	2	8	29442	29449	0 %	0 %	25 %	75 %	157283858
67	NC_009806	GCAC	2	8	29752	29759	25 %	0 %	25 %	50 %	157283858
68	NC_009806	GCCA	2	8	30782	30789	25 %	0 %	25 %	50 %	157283859
69	NC_009806	GCGT	2	8	30887	30894	0 %	25 %	50 %	25 %	157283859
70	NC_009806	GGCG	2	8	30967	30974	0 %	0 %	75 %	25 %	157283859
71	NC_009806	CCAG	2	8	31772	31779	25 %	0 %	25 %	50 %	157283860
72	NC_009806	CCTC	2	8	33203	33210	0 %	25 %	0 %	75 %	157283862
73	NC_009806	CCGG	2	8	33373	33380	0 %	0 %	50 %	50 %	157283862
74	NC_009806	GGCT	2	8	36910	36917	0 %	25 %	50 %	25 %	157283865
75	NC_009806	GGCG	2	8	37052	37059	0 %	0 %	75 %	25 %	157283865
76	NC_009806	CATC	2	8	37308	37315	25 %	25 %	0 %	50 %	157283865
77	NC_009806	GCCT	2	8	37947	37954	0 %	25 %	25 %	50 %	157283866
78	NC_009806	CGTG	2	8	38497	38504	0 %	25 %	50 %	25 %	157283867
79	NC_009806	ACCT	2	8	38666	38673	25 %	25 %	0 %	50 %	157283867
80	NC_009806	CGCC	2	8	38910	38917	0 %	0 %	25 %	75 %	157283867
81	NC_009806	ACTG	2	8	38938	38945	25 %	25 %	25 %	25 %	157283867
82	NC_009806	TCAG	2	8	39301	39308	25 %	25 %	25 %	25 %	157283868
83	NC_009806	GACC	2	8	40093	40100	25 %	0 %	25 %	50 %	157283869
84	NC_009806	CCGC	2	8	40134	40141	0 %	0 %	25 %	75 %	157283869
85	NC_009806	GCCC	2	8	40462	40469	0 %	0 %	25 %	75 %	157283869
86	NC_009806	GCCC	2	8	40480	40487	0 %	0 %	25 %	75 %	157283869
87	NC_009806	CGGG	2	8	40762	40769	0 %	0 %	75 %	25 %	157283869
88	NC_009806	AGGG	2	8	41248	41255	25 %	0 %	75 %	0 %	157283870
89	NC_009806	AGGT	2	8	41350	41357	25 %	25 %	50 %	0 %	157283870
90	NC_009806	GGTG	2	8	41546	41553	0 %	25 %	75 %	0 %	157283870
91	NC_009806	GGGC	2	8	41579	41586	0 %	0 %	75 %	25 %	157283870
92	NC_009806	GCCG	2	8	41798	41805	0 %	0 %	50 %	50 %	157283870
93	NC_009806	CAGG	2	8	42543	42550	25 %	0 %	50 %	25 %	157283871
94	NC_009806	ATGT	2	8	42641	42648	25 %	50 %	25 %	0 %	157283871
95	NC_009806	GACC	2	8	44053	44060	25 %	0 %	25 %	50 %	157283873
96	NC_009806	CGGT	2	8	44340	44347	0 %	25 %	50 %	25 %	157283873
97	NC_009806	CCGC	2	8	44413	44420	0 %	0 %	25 %	75 %	157283873
98	NC_009806	CCTG	2	8	44769	44776	0 %	25 %	25 %	50 %	157283873
99	NC_009806	ACCC	2	8	45825	45832	25 %	0 %	0 %	75 %	157283873
100	NC_009806	GCCC	2	8	47209	47216	0 %	0 %	25 %	75 %	157283875
101	NC_009806	CCGC	2	8	47219	47226	0 %	0 %	25 %	75 %	157283875
102	NC_009806	CCGC	2	8	47231	47238	0 %	0 %	25 %	75 %	157283875
103	NC_009806	GAGG	2	8	47420	47427	25 %	0 %	75 %	0 %	157283875
104	NC_009806	CGGC	2	8	47601	47608	0 %	0 %	50 %	50 %	157283875
105	NC_009806	CGGC	2	8	47752	47759	0 %	0 %	50 %	50 %	157283875
106	NC_009806	TGGC	2	8	48072	48079	0 %	25 %	50 %	25 %	157283875
107	NC_009806	CGCC	2	8	48680	48687	0 %	0 %	25 %	75 %	157283875
108	NC_009806	CTGC	2	8	48698	48705	0 %	25 %	25 %	50 %	157283875
109	NC_009806	TGGT	2	8	49761	49768	0 %	50 %	50 %	0 %	157283876
110	NC_009806	GGCA	3	12	49917	49928	25 %	0 %	50 %	25 %	157283876
111	NC_009806	AGCC	2	8	50261	50268	25 %	0 %	25 %	50 %	157283876
112	NC_009806	CCAT	2	8	50452	50459	25 %	25 %	0 %	50 %	157283876
113	NC_009806	GGGC	2	8	51105	51112	0 %	0 %	75 %	25 %	157283877
114	NC_009806	CAGC	2	8	51455	51462	25 %	0 %	25 %	50 %	157283877
115	NC_009806	GCGA	2	8	51526	51533	25 %	0 %	50 %	25 %	157283877
116	NC_009806	GCTC	2	8	52436	52443	0 %	25 %	25 %	50 %	157283879
117	NC_009806	GCCC	2	8	53671	53678	0 %	0 %	25 %	75 %	157283881
118	NC_009806	GCCC	2	8	53959	53966	0 %	0 %	25 %	75 %	157283881
119	NC_009806	GCCA	2	8	54231	54238	25 %	0 %	25 %	50 %	157283881
120	NC_009806	CAGC	2	8	54356	54363	25 %	0 %	25 %	50 %	157283881
121	NC_009806	CGAC	2	8	54450	54457	25 %	0 %	25 %	50 %	157283881
122	NC_009806	CTCG	2	8	54650	54657	0 %	25 %	25 %	50 %	157283881
123	NC_009806	CGCC	2	8	54893	54900	0 %	0 %	25 %	75 %	157283881
124	NC_009806	CCGC	2	8	55479	55486	0 %	0 %	25 %	75 %	157283882
125	NC_009806	GTCG	2	8	57030	57037	0 %	25 %	50 %	25 %	157283884
126	NC_009806	CCCA	2	8	57201	57208	25 %	0 %	0 %	75 %	157283884
127	NC_009806	GAGG	2	8	58107	58114	25 %	0 %	75 %	0 %	157283885
128	NC_009806	CGGT	2	8	58295	58302	0 %	25 %	50 %	25 %	157283885
129	NC_009806	GGCC	2	8	58343	58350	0 %	0 %	50 %	50 %	157283885
130	NC_009806	CGGG	2	8	59488	59495	0 %	0 %	75 %	25 %	157283887
131	NC_009806	TGGG	2	8	60238	60245	0 %	25 %	75 %	0 %	157283888
132	NC_009806	CGAC	2	8	62709	62716	25 %	0 %	25 %	50 %	157283890
133	NC_009806	CAGT	2	8	63318	63325	25 %	25 %	25 %	25 %	157283891
134	NC_009806	CACG	2	8	63475	63482	25 %	0 %	25 %	50 %	157283891
135	NC_009806	CTCA	2	8	63629	63636	25 %	25 %	0 %	50 %	157283891
136	NC_009806	ACCA	2	8	63656	63663	50 %	0 %	0 %	50 %	157283891
137	NC_009806	CTGC	2	8	64528	64535	0 %	25 %	25 %	50 %	157283892
138	NC_009806	GGGC	2	8	64568	64575	0 %	0 %	75 %	25 %	157283892
139	NC_009806	CTGG	2	8	65634	65641	0 %	25 %	50 %	25 %	157283893
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431	NC_009806	GGTG	2	8	182150	182157	0 %	25 %	75 %	0 %	157284012
432	NC_009806	GGCC	2	8	182341	182348	0 %	0 %	50 %	50 %	157284012
433	NC_009806	GAGT	2	8	182359	182366	25 %	25 %	50 %	0 %	157284012

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.