MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	AAAAT	2	10	3780	3789	80 %	20 %	0 %	0 %	152973610
2	NC_009650	CTGGA	2	10	4587	4596	20 %	20 %	40 %	20 %	152973612
3	NC_009650	CCAAA	2	10	7693	7702	60 %	0 %	0 %	40 %	152973615
4	NC_009650	GGCCT	2	10	9342	9351	0 %	20 %	40 %	40 %	152973619
5	NC_009650	GAGCA	2	10	9531	9540	40 %	0 %	40 %	20 %	152973619
6	NC_009650	CGGCG	2	10	10944	10953	0 %	0 %	60 %	40 %	152973620
7	NC_009650	TGATC	2	10	16021	16030	20 %	40 %	20 %	20 %	152973626
8	NC_009650	TCAGA	2	10	18148	18157	40 %	20 %	20 %	20 %	152973627
9	NC_009650	CGGTT	2	10	18360	18369	0 %	40 %	40 %	20 %	152973627
10	NC_009650	GCTGC	2	10	25700	25709	0 %	20 %	40 %	40 %	152973636
11	NC_009650	TGGCG	2	10	27091	27100	0 %	20 %	60 %	20 %	152973637
12	NC_009650	GTCCG	2	10	27746	27755	0 %	20 %	40 %	40 %	229269515
13	NC_009650	AGGCC	2	10	27808	27817	20 %	0 %	40 %	40 %	229269515
14	NC_009650	GGCCG	2	10	27881	27890	0 %	0 %	60 %	40 %	229269515
15	NC_009650	TCAGG	2	10	29444	29453	20 %	20 %	40 %	20 %	152973641
16	NC_009650	CGGCG	2	10	29504	29513	0 %	0 %	60 %	40 %	152973641
17	NC_009650	GGACG	2	10	30329	30338	20 %	0 %	60 %	20 %	152973643
18	NC_009650	ATCCG	2	10	32182	32191	20 %	20 %	20 %	40 %	152973647
19	NC_009650	CCAGG	2	10	32806	32815	20 %	0 %	40 %	40 %	152973649
20	NC_009650	ATCGT	2	10	33149	33158	20 %	40 %	20 %	20 %	152973649
21	NC_009650	CGGCA	2	10	33500	33509	20 %	0 %	40 %	40 %	152973649
22	NC_009650	AACTC	2	10	36390	36399	40 %	20 %	0 %	40 %	152973652
23	NC_009650	GCCAT	2	10	37368	37377	20 %	20 %	20 %	40 %	152973653
24	NC_009650	TGCTC	2	10	37873	37882	0 %	40 %	20 %	40 %	152973653
25	NC_009650	CTTGC	2	10	38516	38525	0 %	40 %	20 %	40 %	152973653
26	NC_009650	GGCAA	2	10	43850	43859	40 %	0 %	40 %	20 %	152973657
27	NC_009650	CTGAA	2	10	44572	44581	40 %	20 %	20 %	20 %	152973659
28	NC_009650	TGGAA	2	10	45836	45845	40 %	20 %	40 %	0 %	152973660
29	NC_009650	CTGTA	2	10	46425	46434	20 %	40 %	20 %	20 %	152973660
30	NC_009650	TCCTT	2	10	47752	47761	0 %	60 %	0 %	40 %	152973661
31	NC_009650	AGGGC	2	10	50637	50646	20 %	0 %	60 %	20 %	152973663
32	NC_009650	GGCCT	2	10	51118	51127	0 %	20 %	40 %	40 %	152973663
33	NC_009650	TGATG	2	10	52642	52651	20 %	40 %	40 %	0 %	229269516
34	NC_009650	CCGTG	2	10	52666	52675	0 %	20 %	40 %	40 %	229269516
35	NC_009650	TCCGG	2	10	54707	54716	0 %	20 %	40 %	40 %	152973669
36	NC_009650	TGTCG	2	10	55406	55415	0 %	40 %	40 %	20 %	152973670
37	NC_009650	ATCAC	2	10	55841	55850	40 %	20 %	0 %	40 %	152973670
38	NC_009650	CACCG	2	10	58650	58659	20 %	0 %	20 %	60 %	152973682
39	NC_009650	TCTGG	2	10	61928	61937	0 %	40 %	40 %	20 %	152973678
40	NC_009650	TGAAC	2	10	63404	63413	40 %	20 %	20 %	20 %	152973680
41	NC_009650	GCTGG	2	10	64338	64347	0 %	20 %	60 %	20 %	152973680
42	NC_009650	CTGCA	2	10	65055	65064	20 %	20 %	20 %	40 %	152973683
43	NC_009650	CGCTG	2	10	65748	65757	0 %	20 %	40 %	40 %	152973684
44	NC_009650	GTGAC	2	10	68455	68464	20 %	20 %	40 %	20 %	152973688
45	NC_009650	CAGTG	2	10	69310	69319	20 %	20 %	40 %	20 %	152973689
46	NC_009650	CATTC	2	10	70554	70563	20 %	40 %	0 %	40 %	152973690
47	NC_009650	ATTCA	2	10	73344	73353	40 %	40 %	0 %	20 %	152973694
48	NC_009650	TTCAG	2	10	75627	75636	20 %	40 %	20 %	20 %	152973698
49	NC_009650	CGTGC	2	10	75999	76008	0 %	20 %	40 %	40 %	152973699
50	NC_009650	AAATG	2	10	80190	80199	60 %	20 %	20 %	0 %	152973705
51	NC_009650	TATTT	2	10	80807	80816	20 %	80 %	0 %	0 %	152973707
52	NC_009650	TACCG	2	10	83268	83277	20 %	20 %	20 %	40 %	152973708
53	NC_009650	TTCGG	2	10	83481	83490	0 %	40 %	40 %	20 %	152973708
54	NC_009650	ACCGT	2	10	84487	84496	20 %	20 %	20 %	40 %	152973710
55	NC_009650	TTCTG	2	10	85815	85824	0 %	60 %	20 %	20 %	152973712
56	NC_009650	AGTCC	2	10	85878	85887	20 %	20 %	20 %	40 %	152973712
57	NC_009650	GAAGG	2	10	87582	87591	40 %	0 %	60 %	0 %	152973714
58	NC_009650	TGGGG	2	10	91595	91604	0 %	20 %	80 %	0 %	152973721
59	NC_009650	GCGTG	2	10	93680	93689	0 %	20 %	60 %	20 %	152973723
60	NC_009650	GCAGC	2	10	95466	95475	20 %	0 %	40 %	40 %	152973723
61	NC_009650	TTTAT	2	10	98524	98533	20 %	80 %	0 %	0 %	152973727
62	NC_009650	CCTGT	2	10	100050	100059	0 %	40 %	20 %	40 %	152973727
63	NC_009650	ACCGT	2	10	100426	100435	20 %	20 %	20 %	40 %	152973727
64	NC_009650	TGACC	2	10	100979	100988	20 %	20 %	20 %	40 %	152973728
65	NC_009650	CACGA	2	10	101175	101184	40 %	0 %	20 %	40 %	152973728
66	NC_009650	GGACG	2	10	102224	102233	20 %	0 %	60 %	20 %	152973728
67	NC_009650	GACCT	2	10	103377	103386	20 %	20 %	20 %	40 %	152973728
68	NC_009650	AAGGA	2	10	104671	104680	60 %	0 %	40 %	0 %	152973728
69	NC_009650	CGGGC	2	10	105220	105229	0 %	0 %	60 %	40 %	152973728
70	NC_009650	TGGTG	2	10	107047	107056	0 %	40 %	60 %	0 %	152973730

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.