MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis strain SB3432

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021231	GGTTG	2	10	410	419	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021231	AAGGT	2	10	1025	1034	40 %	20 %	40 %	0 %	529974881
3	NC_021231	CACGC	2	10	1450	1459	20 %	0 %	20 %	60 %	529974881
4	NC_021231	CGACT	2	10	2928	2937	20 %	20 %	20 %	40 %	529974883
5	NC_021231	TAACA	2	10	3566	3575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021231	GCCCA	2	10	4435	4444	20 %	0 %	20 %	60 %	529974885
7	NC_021231	CAGCG	2	10	4615	4624	20 %	0 %	40 %	40 %	529974885
8	NC_021231	CCGTG	2	10	4845	4854	0 %	20 %	40 %	40 %	529974885
9	NC_021231	AACGC	2	10	4985	4994	40 %	0 %	20 %	40 %	529974885
10	NC_021231	TCACG	2	10	6724	6733	20 %	20 %	20 %	40 %	529974886
11	NC_021231	TTTGG	2	10	7215	7224	0 %	60 %	40 %	0 %	529974886
12	NC_021231	GATTT	2	10	9114	9123	20 %	60 %	20 %	0 %	529974888
13	NC_021231	GCTGA	2	10	10117	10126	20 %	20 %	40 %	20 %	529974889
14	NC_021231	ATAAC	2	10	10551	10560	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021231	ATGGA	2	10	14894	14903	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021231	CGTTT	2	10	15769	15778	0 %	60 %	20 %	20 %	529974895
17	NC_021231	GACAG	2	10	16205	16214	40 %	0 %	40 %	20 %	529974896
18	NC_021231	ATTTC	2	10	16502	16511	20 %	60 %	0 %	20 %	529974896
19	NC_021231	TCAAC	2	10	17885	17894	40 %	20 %	0 %	40 %	529974898
20	NC_021231	CCCTG	2	10	19885	19894	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_021231	AATCA	2	10	21639	21648	60 %	20 %	0 %	20 %	529974900
22	NC_021231	CGTTA	2	10	22020	22029	20 %	40 %	20 %	20 %	529974900
23	NC_021231	GCCCG	2	10	24736	24745	0 %	0 %	40 %	60 %	529974901
24	NC_021231	GTCAG	2	10	28792	28801	20 %	20 %	40 %	20 %	529974905
25	NC_021231	CTGGT	2	10	30613	30622	0 %	40 %	40 %	20 %	529974909
26	NC_021231	CGGGC	2	10	32117	32126	0 %	0 %	60 %	40 %	529974912
27	NC_021231	AGCTG	2	10	32990	32999	20 %	20 %	40 %	20 %	529974912
28	NC_021231	GAAAA	2	10	33360	33369	80 %	0 %	20 %	0 %	529974912
29	NC_021231	TTAAA	2	10	33691	33700	60 %	40 %	0 %	0 %	529974913
30	NC_021231	AAAAT	2	10	33874	33883	80 %	20 %	0 %	0 %	529974913
31	NC_021231	GCTTC	2	10	37681	37690	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_021231	GGTCG	2	10	38909	38918	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021231	TCATT	2	10	42816	42825	20 %	60 %	0 %	20 %	529974923
34	NC_021231	TAATT	2	10	43959	43968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021231	CGCGC	2	10	44541	44550	0 %	0 %	40 %	60 %	529974924
36	NC_021231	CCTGT	2	10	47709	47718	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_021231	AGTTC	2	10	49932	49941	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021231	CAGAC	2	10	50589	50598	40 %	0 %	20 %	40 %	529974932
39	NC_021231	GCCCG	2	10	51600	51609	0 %	0 %	40 %	60 %	529974933
40	NC_021231	TCCTT	2	10	52149	52158	0 %	60 %	0 %	40 %	529974933
41	NC_021231	CGCTG	2	10	52729	52738	0 %	20 %	40 %	40 %	529974933
42	NC_021231	AGGTC	2	10	53443	53452	20 %	20 %	40 %	20 %	529974933
43	NC_021231	CCGTC	2	10	54595	54604	0 %	20 %	20 %	60 %	529974933
44	NC_021231	TCCAC	2	10	55258	55267	20 %	20 %	0 %	60 %	529974933
45	NC_021231	TCGTG	2	10	55645	55654	0 %	40 %	40 %	20 %	529974933
46	NC_021231	AGGTC	2	10	55840	55849	20 %	20 %	40 %	20 %	529974933
47	NC_021231	TGTCC	2	10	56265	56274	0 %	40 %	20 %	40 %	529974934
48	NC_021231	ACGGT	2	10	56388	56397	20 %	20 %	40 %	20 %	529974934
49	NC_021231	ACAGG	2	10	56764	56773	40 %	0 %	40 %	20 %	529974934
50	NC_021231	GCACG	2	10	57369	57378	20 %	0 %	40 %	40 %	529974934
51	NC_021231	AATAA	2	10	58289	58298	80 %	20 %	0 %	0 %	529974934
52	NC_021231	CAGAG	2	10	60091	60100	40 %	0 %	40 %	20 %	529974936
53	NC_021231	CATCG	2	10	61151	61160	20 %	20 %	20 %	40 %	529974938
54	NC_021231	ACCCC	2	10	65194	65203	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
55	NC_021231	CCTTC	2	10	69208	69217	0 %	40 %	0 %	60 %	529974946
56	NC_021231	ACGGT	2	10	72303	72312	20 %	20 %	40 %	20 %	529974950
57	NC_021231	CCGAA	2	10	73309	73318	40 %	0 %	20 %	40 %	529974952
58	NC_021231	CATTT	2	10	76599	76608	20 %	60 %	0 %	20 %	529974954
59	NC_021231	GCACG	2	10	80980	80989	20 %	0 %	40 %	40 %	529974962
60	NC_021231	ACTGA	2	10	81351	81360	40 %	20 %	20 %	20 %	529974963
61	NC_021231	TCTTT	2	10	84095	84104	0 %	80 %	0 %	20 %	529974968
62	NC_021231	GTCAC	2	10	87687	87696	20 %	20 %	20 %	40 %	529974973
63	NC_021231	CTGGT	2	10	88379	88388	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021231	GGAAA	2	10	88963	88972	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021231	CCTTG	2	10	90440	90449	0 %	40 %	20 %	40 %	529974978
66	NC_021231	ACCAT	2	10	90950	90959	40 %	20 %	0 %	40 %	529974979
67	NC_021231	CCAGT	2	10	91544	91553	20 %	20 %	20 %	40 %	529974981
68	NC_021231	AACGC	2	10	93142	93151	40 %	0 %	20 %	40 %	529974983
69	NC_021231	TTCAT	2	10	93508	93517	20 %	60 %	0 %	20 %	529974983
70	NC_021231	CCACA	2	10	94400	94409	40 %	0 %	0 %	60 %	529974983
71	NC_021231	CTGCG	2	10	94902	94911	0 %	20 %	40 %	40 %	529974984
72	NC_021231	GGAGA	2	10	97052	97061	40 %	0 %	60 %	0 %	529974988
73	NC_021231	GTGAT	2	10	97995	98004	20 %	40 %	40 %	0 %	529974990
74	NC_021231	TGCCG	2	10	98422	98431	0 %	20 %	40 %	40 %	529974991
75	NC_021231	CGCAG	2	10	98481	98490	20 %	0 %	40 %	40 %	529974991
76	NC_021231	CATCA	2	10	100415	100424	40 %	20 %	0 %	40 %	529974995
77	NC_021231	GAACA	2	10	102012	102021	60 %	0 %	20 %	20 %	529974996
78	NC_021231	CAGTA	2	10	103267	103276	40 %	20 %	20 %	20 %	529974999
79	NC_021231	ATTGA	2	10	106426	106435	40 %	40 %	20 %	0 %	529975002
80	NC_021231	GGGCA	2	10	107588	107597	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021231	CGGCC	2	10	107835	107844	0 %	0 %	40 %	60 %	529975004
82	NC_021231	CTGGG	2	10	107953	107962	0 %	20 %	60 %	20 %	529975004
83	NC_021231	GGCAG	2	10	108167	108176	20 %	0 %	60 %	20 %	529975004
84	NC_021231	GCGCC	2	10	108253	108262	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_021231	TCGTT	2	10	108804	108813	0 %	60 %	20 %	20 %	529975005
86	NC_021231	TTTAA	2	10	109036	109045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021231	GCACT	2	10	109919	109928	20 %	20 %	20 %	40 %	529975007
88	NC_021231	TACTG	2	10	112226	112235	20 %	40 %	20 %	20 %	529975009

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.