MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis strain SB3432

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021231	ATTT	2	8	186	193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021231	AACG	2	8	426	433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021231	CCAA	2	8	467	474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021231	CGTC	2	8	654	661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021231	CTGG	2	8	1424	1431	0 %	25 %	50 %	25 %	529974881
6	NC_021231	GTCA	2	8	1471	1478	25 %	25 %	25 %	25 %	529974881
7	NC_021231	GGCA	2	8	1662	1669	25 %	0 %	50 %	25 %	529974882
8	NC_021231	CTGG	2	8	1782	1789	0 %	25 %	50 %	25 %	529974882
9	NC_021231	AGCC	2	8	2048	2055	25 %	0 %	25 %	50 %	529974882
10	NC_021231	CAAA	2	8	2110	2117	75 %	0 %	0 %	25 %	529974882
11	NC_021231	AGAA	2	8	3033	3040	75 %	0 %	25 %	0 %	529974883
12	NC_021231	GTCA	2	8	3134	3141	25 %	25 %	25 %	25 %	529974883
13	NC_021231	CTCA	2	8	3548	3555	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021231	CAGC	2	8	3904	3911	25 %	0 %	25 %	50 %	529974884
15	NC_021231	TTCC	2	8	4389	4396	0 %	50 %	0 %	50 %	529974885
16	NC_021231	CAGC	2	8	4552	4559	25 %	0 %	25 %	50 %	529974885
17	NC_021231	AGGA	2	8	4911	4918	50 %	0 %	50 %	0 %	529974885
18	NC_021231	CCAG	2	8	5505	5512	25 %	0 %	25 %	50 %	529974885
19	NC_021231	CGAA	2	8	5590	5597	50 %	0 %	25 %	25 %	529974885
20	NC_021231	GGCA	2	8	5630	5637	25 %	0 %	50 %	25 %	529974885
21	NC_021231	AACT	2	8	6104	6111	50 %	25 %	0 %	25 %	529974886
22	NC_021231	TGAT	2	8	6827	6834	25 %	50 %	25 %	0 %	529974886
23	NC_021231	GAAT	2	8	7021	7028	50 %	25 %	25 %	0 %	529974886
24	NC_021231	CAGT	2	8	7537	7544	25 %	25 %	25 %	25 %	529974886
25	NC_021231	AATA	2	8	8170	8177	75 %	25 %	0 %	0 %	529974887
26	NC_021231	GTAA	2	8	8356	8363	50 %	25 %	25 %	0 %	529974887
27	NC_021231	CAGG	2	8	8526	8533	25 %	0 %	50 %	25 %	529974887
28	NC_021231	CGCC	2	8	8623	8630	0 %	0 %	25 %	75 %	529974887
29	NC_021231	GTCA	2	8	8637	8644	25 %	25 %	25 %	25 %	529974887
30	NC_021231	CTGG	2	8	8793	8800	0 %	25 %	50 %	25 %	529974887
31	NC_021231	TGAA	2	8	9675	9682	50 %	25 %	25 %	0 %	529974888
32	NC_021231	GACA	2	8	10333	10340	50 %	0 %	25 %	25 %	529974889
33	NC_021231	CCAT	2	8	10632	10639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021231	TAAT	2	8	10640	10647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021231	TCGT	2	8	11189	11196	0 %	50 %	25 %	25 %	529974890
36	NC_021231	GCTG	2	8	11442	11449	0 %	25 %	50 %	25 %	529974890
37	NC_021231	GGCA	2	8	11473	11480	25 %	0 %	50 %	25 %	529974890
38	NC_021231	GCAG	2	8	11688	11695	25 %	0 %	50 %	25 %	529974891
39	NC_021231	AGGC	2	8	11820	11827	25 %	0 %	50 %	25 %	529974891
40	NC_021231	GCCA	2	8	12033	12040	25 %	0 %	25 %	50 %	529974892
41	NC_021231	CCGG	2	8	12193	12200	0 %	0 %	50 %	50 %	529974892
42	NC_021231	GCCA	2	8	12437	12444	25 %	0 %	25 %	50 %	529974892
43	NC_021231	AAGA	2	8	12451	12458	75 %	0 %	25 %	0 %	529974892
44	NC_021231	TCTG	2	8	12492	12499	0 %	50 %	25 %	25 %	529974892
45	NC_021231	TCCT	2	8	12912	12919	0 %	50 %	0 %	50 %	529974894
46	NC_021231	GCGG	2	8	12924	12931	0 %	0 %	75 %	25 %	529974894
47	NC_021231	TGCC	2	8	13067	13074	0 %	25 %	25 %	50 %	529974894
48	NC_021231	CGGC	2	8	13573	13580	0 %	0 %	50 %	50 %	529974894
49	NC_021231	GGAT	2	8	13855	13862	25 %	25 %	50 %	0 %	529974894
50	NC_021231	ATGA	2	8	14458	14465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021231	GAAG	2	8	14688	14695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021231	TTCA	2	8	14876	14883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021231	CCGG	2	8	14956	14963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021231	TCAG	2	8	14999	15006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021231	AGCC	2	8	15137	15144	25 %	0 %	25 %	50 %	529974895
56	NC_021231	ATTC	2	8	15151	15158	25 %	50 %	0 %	25 %	529974895
57	NC_021231	AACG	2	8	15204	15211	50 %	0 %	25 %	25 %	529974895
58	NC_021231	AAAG	2	8	15257	15264	75 %	0 %	25 %	0 %	529974895
59	NC_021231	ATTA	2	8	15891	15898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021231	AATT	2	8	15914	15921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021231	GCTG	2	8	16740	16747	0 %	25 %	50 %	25 %	529974897
62	NC_021231	GGCA	2	8	18558	18565	25 %	0 %	50 %	25 %	529974898
63	NC_021231	ATTT	2	8	19624	19631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021231	TCAC	2	8	20050	20057	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021231	TGCT	2	8	20155	20162	0 %	50 %	25 %	25 %	529974900
66	NC_021231	ACTG	2	8	20499	20506	25 %	25 %	25 %	25 %	529974900
67	NC_021231	GCCA	2	8	20531	20538	25 %	0 %	25 %	50 %	529974900
68	NC_021231	ATCA	2	8	20640	20647	50 %	25 %	0 %	25 %	529974900
69	NC_021231	TTGA	2	8	20952	20959	25 %	50 %	25 %	0 %	529974900
70	NC_021231	CAGA	2	8	21093	21100	50 %	0 %	25 %	25 %	529974900
71	NC_021231	TGAT	2	8	21307	21314	25 %	50 %	25 %	0 %	529974900
72	NC_021231	GGTG	2	8	21365	21372	0 %	25 %	75 %	0 %	529974900
73	NC_021231	AAAC	2	8	21759	21766	75 %	0 %	0 %	25 %	529974900
74	NC_021231	GCCA	2	8	21984	21991	25 %	0 %	25 %	50 %	529974900
75	NC_021231	CTGA	2	8	23168	23175	25 %	25 %	25 %	25 %	529974901
76	NC_021231	TGAC	2	8	23494	23501	25 %	25 %	25 %	25 %	529974901
77	NC_021231	TGCC	2	8	23684	23691	0 %	25 %	25 %	50 %	529974901
78	NC_021231	GACG	2	8	24997	25004	25 %	0 %	50 %	25 %	529974901
79	NC_021231	ATGA	2	8	25527	25534	50 %	25 %	25 %	0 %	529974902
80	NC_021231	TGGT	2	8	26649	26656	0 %	50 %	50 %	0 %	529974903
81	NC_021231	TCCC	2	8	26898	26905	0 %	25 %	0 %	75 %	529974903
82	NC_021231	GCGG	2	8	27085	27092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021231	TGAG	2	8	27644	27651	25 %	25 %	50 %	0 %	529974904
84	NC_021231	GCCA	2	8	28210	28217	25 %	0 %	25 %	50 %	529974904
85	NC_021231	GCTG	2	8	28648	28655	0 %	25 %	50 %	25 %	529974905
86	NC_021231	TATT	2	8	29326	29333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021231	AGCG	2	8	29694	29701	25 %	0 %	50 %	25 %	529974906
88	NC_021231	CCGC	2	8	29806	29813	0 %	0 %	25 %	75 %	529974906
89	NC_021231	TTCC	2	8	30054	30061	0 %	50 %	0 %	50 %	529974907
90	NC_021231	CCGG	2	8	30449	30456	0 %	0 %	50 %	50 %	529974908
91	NC_021231	GTCA	2	8	31180	31187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021231	GCAT	2	8	31273	31280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021231	CTGC	2	8	32286	32293	0 %	25 %	25 %	50 %	529974912
94	NC_021231	GCTG	2	8	32369	32376	0 %	25 %	50 %	25 %	529974912
95	NC_021231	AATG	2	8	33254	33261	50 %	25 %	25 %	0 %	529974912
96	NC_021231	ATTG	2	8	34058	34065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021231	TGGT	2	8	34636	34643	0 %	50 %	50 %	0 %	529974914
98	NC_021231	TCCC	2	8	34885	34892	0 %	25 %	0 %	75 %	529974914
99	NC_021231	GGCG	2	8	35067	35074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021231	TATT	2	8	35120	35127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021231	AAGT	2	8	35957	35964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021231	CGGA	2	8	36007	36014	25 %	0 %	50 %	25 %	529974916
103	NC_021231	CGGC	2	8	36346	36353	0 %	0 %	50 %	50 %	529974916
104	NC_021231	AGTA	2	8	36524	36531	50 %	25 %	25 %	0 %	529974916
105	NC_021231	CTCC	2	8	36800	36807	0 %	25 %	0 %	75 %	529974917
106	NC_021231	CCCT	2	8	37027	37034	0 %	25 %	0 %	75 %	529974917
107	NC_021231	CAGC	2	8	37128	37135	25 %	0 %	25 %	50 %	529974917
108	NC_021231	AGAA	2	8	37187	37194	75 %	0 %	25 %	0 %	529974917
109	NC_021231	TTTC	2	8	37198	37205	0 %	75 %	0 %	25 %	529974917
110	NC_021231	CAGA	2	8	37579	37586	50 %	0 %	25 %	25 %	529974917
111	NC_021231	TAAC	2	8	37808	37815	50 %	25 %	0 %	25 %	529974918
112	NC_021231	ATTG	2	8	37831	37838	25 %	50 %	25 %	0 %	529974918
113	NC_021231	AGCC	2	8	38577	38584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021231	AATT	2	8	38666	38673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021231	TCCT	2	8	39450	39457	0 %	50 %	0 %	50 %	529974920
116	NC_021231	GCGG	2	8	39462	39469	0 %	0 %	75 %	25 %	529974920
117	NC_021231	TGCC	2	8	39605	39612	0 %	25 %	25 %	50 %	529974920
118	NC_021231	CGGC	2	8	40111	40118	0 %	0 %	50 %	50 %	529974920
119	NC_021231	GGAT	2	8	40393	40400	25 %	25 %	50 %	0 %	529974920
120	NC_021231	TCGT	2	8	41022	41029	0 %	50 %	25 %	25 %	529974921
121	NC_021231	GCTG	2	8	41275	41282	0 %	25 %	50 %	25 %	529974921
122	NC_021231	GGCA	2	8	41306	41313	25 %	0 %	50 %	25 %	529974921
123	NC_021231	GCAG	2	8	41522	41529	25 %	0 %	50 %	25 %	529974921
124	NC_021231	AGGC	2	8	41654	41661	25 %	0 %	50 %	25 %	529974921
125	NC_021231	GCCA	2	8	41878	41885	25 %	0 %	25 %	50 %	529974922
126	NC_021231	CCGG	2	8	42038	42045	0 %	0 %	50 %	50 %	529974922
127	NC_021231	GCCA	2	8	42282	42289	25 %	0 %	25 %	50 %	529974922
128	NC_021231	AAGA	2	8	42296	42303	75 %	0 %	25 %	0 %	529974922
129	NC_021231	TCTG	2	8	42337	42344	0 %	50 %	25 %	25 %	529974922
130	NC_021231	ATCC	2	8	43628	43635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021231	TTAA	2	8	44329	44336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021231	GGTG	2	8	44367	44374	0 %	25 %	75 %	0 %	529974924
133	NC_021231	CAGC	2	8	44474	44481	25 %	0 %	25 %	50 %	529974924
134	NC_021231	AGGC	2	8	44510	44517	25 %	0 %	50 %	25 %	529974924
135	NC_021231	CCAG	2	8	44992	44999	25 %	0 %	25 %	50 %	529974924
136	NC_021231	CCGG	2	8	45025	45032	0 %	0 %	50 %	50 %	529974924
137	NC_021231	CGGA	2	8	45188	45195	25 %	0 %	50 %	25 %	529974924
138	NC_021231	ATTA	2	8	45654	45661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021231	TCGC	2	8	45853	45860	0 %	25 %	25 %	50 %	529974926
140	NC_021231	GACT	2	8	46006	46013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021231	GAAC	2	8	46210	46217	50 %	0 %	25 %	25 %	529974927
142	NC_021231	TTCC	2	8	46509	46516	0 %	50 %	0 %	50 %	529974927
143	NC_021231	GGCA	2	8	46592	46599	25 %	0 %	50 %	25 %	529974927
144	NC_021231	GCCT	2	8	47183	47190	0 %	25 %	25 %	50 %	529974929
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321	NC_021231	TCAT	2	8	112495	112502	25 %	50 %	0 %	25 %	529975009
322	NC_021231	CCAT	2	8	113560	113567	25 %	25 %	0 %	50 %	529975010

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.