MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS2

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016846	ACCC	2	8	25	32	25 %	0 %	0 %	75 %	378975986
2	NC_016846	GCTG	2	8	1605	1612	0 %	25 %	50 %	25 %	378975989
3	NC_016846	CGGC	2	8	1670	1677	0 %	0 %	50 %	50 %	378975989
4	NC_016846	AGCC	2	8	2070	2077	25 %	0 %	25 %	50 %	378975990
5	NC_016846	CAAA	2	8	2096	2103	75 %	0 %	0 %	25 %	378975990
6	NC_016846	GTGG	2	8	2163	2170	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016846	GACT	2	8	2360	2367	25 %	25 %	25 %	25 %	378975991
8	NC_016846	ATTC	2	8	2910	2917	25 %	50 %	0 %	25 %	378975991
9	NC_016846	CATC	2	8	3692	3699	25 %	25 %	0 %	50 %	378975993
10	NC_016846	GCCA	2	8	3848	3855	25 %	0 %	25 %	50 %	378975993
11	NC_016846	TCAT	2	8	4479	4486	25 %	50 %	0 %	25 %	378975995
12	NC_016846	CAGC	2	8	4608	4615	25 %	0 %	25 %	50 %	378975995
13	NC_016846	TGAC	2	8	4670	4677	25 %	25 %	25 %	25 %	378975995
14	NC_016846	CAGC	2	8	5063	5070	25 %	0 %	25 %	50 %	378975995
15	NC_016846	CGCC	2	8	5236	5243	0 %	0 %	25 %	75 %	378975995
16	NC_016846	TCCT	2	8	5427	5434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016846	GAGC	2	8	6079	6086	25 %	0 %	50 %	25 %	378975998
18	NC_016846	TCAG	2	8	6690	6697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016846	GGCA	2	8	7019	7026	25 %	0 %	50 %	25 %	378976000
20	NC_016846	GCGT	2	8	7401	7408	0 %	25 %	50 %	25 %	378976000
21	NC_016846	AAGG	2	8	7482	7489	50 %	0 %	50 %	0 %	378976000
22	NC_016846	TGAG	2	8	8330	8337	25 %	25 %	50 %	0 %	378976001
23	NC_016846	CCCA	2	8	8529	8536	25 %	0 %	0 %	75 %	378976001
24	NC_016846	ATTT	2	8	9244	9251	25 %	75 %	0 %	0 %	378976001
25	NC_016846	CAGT	2	8	9810	9817	25 %	25 %	25 %	25 %	378976003
26	NC_016846	GCTG	2	8	9907	9914	0 %	25 %	50 %	25 %	378976004
27	NC_016846	GACG	2	8	10034	10041	25 %	0 %	50 %	25 %	378976004
28	NC_016846	CTGG	2	8	10392	10399	0 %	25 %	50 %	25 %	378976005
29	NC_016846	GCTT	2	8	10614	10621	0 %	50 %	25 %	25 %	378976005
30	NC_016846	ATGA	2	8	10788	10795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016846	GCAT	2	8	11402	11409	25 %	25 %	25 %	25 %	378976006
32	NC_016846	TAAA	2	8	11892	11899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016846	GGTT	2	8	13287	13294	0 %	50 %	50 %	0 %	378976010
34	NC_016846	CCGC	2	8	14185	14192	0 %	0 %	25 %	75 %	378976012
35	NC_016846	GCCA	2	8	14553	14560	25 %	0 %	25 %	50 %	378976012
36	NC_016846	CGGC	2	8	14815	14822	0 %	0 %	50 %	50 %	378976012
37	NC_016846	GCCG	2	8	14879	14886	0 %	0 %	50 %	50 %	378976012
38	NC_016846	GCAG	2	8	15071	15078	25 %	0 %	50 %	25 %	378976012
39	NC_016846	CCTT	2	8	15767	15774	0 %	50 %	0 %	50 %	378976014
40	NC_016846	GTTC	2	8	15816	15823	0 %	50 %	25 %	25 %	378976014
41	NC_016846	GCCA	2	8	16173	16180	25 %	0 %	25 %	50 %	378976015
42	NC_016846	CCTG	2	8	16366	16373	0 %	25 %	25 %	50 %	378976015
43	NC_016846	GCGG	2	8	16466	16473	0 %	0 %	75 %	25 %	378976015
44	NC_016846	CAGC	2	8	16558	16565	25 %	0 %	25 %	50 %	378976015
45	NC_016846	GCTG	2	8	18062	18069	0 %	25 %	50 %	25 %	378976017
46	NC_016846	ACCG	2	8	19925	19932	25 %	0 %	25 %	50 %	378976019
47	NC_016846	GCTG	2	8	20604	20611	0 %	25 %	50 %	25 %	378976021
48	NC_016846	CAGC	2	8	20802	20809	25 %	0 %	25 %	50 %	378976021
49	NC_016846	GCGG	2	8	21479	21486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016846	ACCA	2	8	21495	21502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016846	CGGC	2	8	22515	22522	0 %	0 %	50 %	50 %	378976022
52	NC_016846	GGTT	2	8	22756	22763	0 %	50 %	50 %	0 %	378976023
53	NC_016846	TCAA	2	8	23058	23065	50 %	25 %	0 %	25 %	378976024
54	NC_016846	CGTA	2	8	24273	24280	25 %	25 %	25 %	25 %	378976027
55	NC_016846	TCAC	2	8	24624	24631	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016846	GGGA	2	8	24708	24715	25 %	0 %	75 %	0 %	378976028
57	NC_016846	TGTT	2	8	25152	25159	0 %	75 %	25 %	0 %	378976028
58	NC_016846	TCGC	2	8	25207	25214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016846	GCAA	2	8	25441	25448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016846	CAGG	2	8	25500	25507	25 %	0 %	50 %	25 %	378976029
61	NC_016846	AGCG	2	8	26121	26128	25 %	0 %	50 %	25 %	378976030
62	NC_016846	CGGC	2	8	26130	26137	0 %	0 %	50 %	50 %	378976030
63	NC_016846	CTGC	2	8	26383	26390	0 %	25 %	25 %	50 %	378976031
64	NC_016846	ACCT	2	8	26543	26550	25 %	25 %	0 %	50 %	378976031
65	NC_016846	CCGG	2	8	27331	27338	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
66	NC_016846	GCCG	2	8	27433	27440	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
67	NC_016846	GCCG	2	8	27505	27512	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
68	NC_016846	CCAG	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	378976031
69	NC_016846	CGGC	2	8	28479	28486	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
70	NC_016846	CGTG	2	8	28642	28649	0 %	25 %	50 %	25 %	378976031
71	NC_016846	CGTT	2	8	29611	29618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016846	ACTC	2	8	29691	29698	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016846	CATC	2	8	30535	30542	25 %	25 %	0 %	50 %	378976034
74	NC_016846	GATT	2	8	30833	30840	25 %	50 %	25 %	0 %	378976035
75	NC_016846	TTCT	2	8	30916	30923	0 %	75 %	0 %	25 %	378976035
76	NC_016846	TTAA	2	8	31971	31978	50 %	50 %	0 %	0 %	378976037
77	NC_016846	TATT	2	8	32571	32578	25 %	75 %	0 %	0 %	378976037
78	NC_016846	TTGC	2	8	32631	32638	0 %	50 %	25 %	25 %	378976037
79	NC_016846	CTAC	2	8	32874	32881	25 %	25 %	0 %	50 %	378976038
80	NC_016846	ATGG	2	8	33288	33295	25 %	25 %	50 %	0 %	378976038
81	NC_016846	TGGT	2	8	33430	33437	0 %	50 %	50 %	0 %	378976038
82	NC_016846	TATT	2	8	34954	34961	25 %	75 %	0 %	0 %	378976039
83	NC_016846	GAAT	2	8	35080	35087	50 %	25 %	25 %	0 %	378976039
84	NC_016846	TTTC	2	8	35119	35126	0 %	75 %	0 %	25 %	378976039
85	NC_016846	TCAT	2	8	35361	35368	25 %	50 %	0 %	25 %	378976039
86	NC_016846	CTGA	2	8	37028	37035	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016846	CTGG	2	8	37703	37710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016846	GGGC	2	8	37847	37854	0 %	0 %	75 %	25 %	378976042
89	NC_016846	GCCG	2	8	38194	38201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016846	AAGG	2	8	38210	38217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016846	ACGC	2	8	38366	38373	25 %	0 %	25 %	50 %	378976044
92	NC_016846	CACG	2	8	38473	38480	25 %	0 %	25 %	50 %	378976044
93	NC_016846	TCGG	2	8	38640	38647	0 %	25 %	50 %	25 %	378976044
94	NC_016846	CTGA	2	8	38736	38743	25 %	25 %	25 %	25 %	378976044
95	NC_016846	CAGT	2	8	39784	39791	25 %	25 %	25 %	25 %	378976046
96	NC_016846	TGCC	2	8	40039	40046	0 %	25 %	25 %	50 %	378976046
97	NC_016846	TTCC	2	8	40205	40212	0 %	50 %	0 %	50 %	378976046
98	NC_016846	AAGT	2	8	40417	40424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016846	GGCG	2	8	40761	40768	0 %	0 %	75 %	25 %	378976047
100	NC_016846	CAGC	2	8	41078	41085	25 %	0 %	25 %	50 %	378976047
101	NC_016846	ACTT	2	8	42123	42130	25 %	50 %	0 %	25 %	378976049
102	NC_016846	TGAA	2	8	42222	42229	50 %	25 %	25 %	0 %	378976049
103	NC_016846	TGGA	2	8	42344	42351	25 %	25 %	50 %	0 %	378976049
104	NC_016846	GGCT	2	8	42394	42401	0 %	25 %	50 %	25 %	378976049
105	NC_016846	GATT	2	8	42616	42623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016846	TTTC	2	8	43126	43133	0 %	75 %	0 %	25 %	378976051
107	NC_016846	GCCT	2	8	43275	43282	0 %	25 %	25 %	50 %	378976051
108	NC_016846	ACCC	2	8	43586	43593	25 %	0 %	0 %	75 %	378976051
109	NC_016846	CTTT	2	8	43793	43800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016846	TAAA	2	8	45024	45031	75 %	25 %	0 %	0 %	378976053
111	NC_016846	TCTG	2	8	45130	45137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016846	CTTT	2	8	45727	45734	0 %	75 %	0 %	25 %	378976054
113	NC_016846	TCAC	2	8	46097	46104	25 %	25 %	0 %	50 %	378976055
114	NC_016846	GGCT	2	8	46298	46305	0 %	25 %	50 %	25 %	378976055
115	NC_016846	ATTC	2	8	46462	46469	25 %	50 %	0 %	25 %	378976055
116	NC_016846	GTCA	2	8	46555	46562	25 %	25 %	25 %	25 %	378976055
117	NC_016846	CTGT	2	8	46637	46644	0 %	50 %	25 %	25 %	378976055
118	NC_016846	CCGG	2	8	46915	46922	0 %	0 %	50 %	50 %	378976056
119	NC_016846	CCGT	2	8	47363	47370	0 %	25 %	25 %	50 %	378976056
120	NC_016846	GCCC	2	8	47556	47563	0 %	0 %	25 %	75 %	378976056
121	NC_016846	CTGT	2	8	48084	48091	0 %	50 %	25 %	25 %	378976056
122	NC_016846	GTCC	2	8	48360	48367	0 %	25 %	25 %	50 %	378976056
123	NC_016846	GCGG	2	8	48955	48962	0 %	0 %	75 %	25 %	378976056
124	NC_016846	CACG	2	8	50233	50240	25 %	0 %	25 %	50 %	378976056
125	NC_016846	CGTG	2	8	50981	50988	0 %	25 %	50 %	25 %	378976056
126	NC_016846	TCTT	2	8	51630	51637	0 %	75 %	0 %	25 %	378976056
127	NC_016846	GCCA	2	8	52118	52125	25 %	0 %	25 %	50 %	378976057
128	NC_016846	GCCG	2	8	52171	52178	0 %	0 %	50 %	50 %	378976057
129	NC_016846	CTGT	2	8	52442	52449	0 %	50 %	25 %	25 %	378976057
130	NC_016846	TTTC	2	8	52716	52723	0 %	75 %	0 %	25 %	378976057
131	NC_016846	GGTC	2	8	53159	53166	0 %	25 %	50 %	25 %	378976057
132	NC_016846	GCAC	2	8	53660	53667	25 %	0 %	25 %	50 %	378976057
133	NC_016846	GCAG	2	8	54552	54559	25 %	0 %	50 %	25 %	378976058
134	NC_016846	TAAC	2	8	54948	54955	50 %	25 %	0 %	25 %	378976058
135	NC_016846	ATAA	2	8	55106	55113	75 %	25 %	0 %	0 %	378976058
136	NC_016846	AAAT	2	8	55174	55181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016846	GAAT	2	8	55229	55236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016846	CGAT	2	8	55314	55321	25 %	25 %	25 %	25 %	378976059
139	NC_016846	CCAG	2	8	55896	55903	25 %	0 %	25 %	50 %	378976059
140	NC_016846	CTTT	2	8	56849	56856	0 %	75 %	0 %	25 %	378976061
141	NC_016846	ATCC	2	8	58096	58103	25 %	25 %	0 %	50 %	378976061
142	NC_016846	TGTC	2	8	59684	59691	0 %	50 %	25 %	25 %	378976062
143	NC_016846	CAAG	2	8	59697	59704	50 %	0 %	25 %	25 %	378976062
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.