MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS2

Total Repeats: 2324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016846	GTCCTC	2	12	94492	94503	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378976120
2002	NC_016846	TCC	2	6	94532	94537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378976120
2003	NC_016846	TTG	2	6	94601	94606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378976120
2004	NC_016846	TTC	2	6	94621	94626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976120
2005	NC_016846	ATG	2	6	94638	94643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976120
2006	NC_016846	TAT	2	6	94659	94664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378976120
2007	NC_016846	TCCT	2	8	94750	94757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_016846	GCC	2	6	94764	94769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2009	NC_016846	GGC	2	6	94778	94783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_016846	TCA	2	6	94789	94794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976121
2011	NC_016846	GC	3	6	94952	94957	0 %	0 %	50 %	50 %	378976121
2012	NC_016846	GAC	2	6	94971	94976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976121
2013	NC_016846	A	6	6	95004	95009	100 %	0 %	0 %	0 %	378976121
2014	NC_016846	T	6	6	95109	95114	0 %	100 %	0 %	0 %	378976122
2015	NC_016846	CTT	3	9	95137	95145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976122
2016	NC_016846	CCT	2	6	95146	95151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378976122
2017	NC_016846	TTTTTC	2	12	95341	95352	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378976122
2018	NC_016846	CTG	2	6	95417	95422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976123
2019	NC_016846	CGC	2	6	95466	95471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378976123
2020	NC_016846	T	7	7	95524	95530	0 %	100 %	0 %	0 %	378976123
2021	NC_016846	CGC	2	6	95683	95688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378976123
2022	NC_016846	ACG	2	6	95690	95695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976123
2023	NC_016846	GCG	2	6	95762	95767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976123
2024	NC_016846	GCA	2	6	95782	95787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976123
2025	NC_016846	GCC	2	6	95827	95832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2026	NC_016846	CGG	2	6	95857	95862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_016846	CGA	2	6	95901	95906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2028	NC_016846	TG	3	6	95955	95960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_016846	AGC	3	9	95990	95998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_016846	GGTCA	2	10	96014	96023	20 %	20 %	40 %	20 %	378976124
2031	NC_016846	CTGTA	2	10	96049	96058	20 %	40 %	20 %	20 %	378976124
2032	NC_016846	ATG	3	9	96151	96159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976124
2033	NC_016846	C	6	6	96248	96253	0 %	0 %	0 %	100 %	378976124
2034	NC_016846	A	6	6	96282	96287	100 %	0 %	0 %	0 %	378976124
2035	NC_016846	TCC	2	6	96348	96353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2036	NC_016846	AC	3	6	96358	96363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_016846	CTG	2	6	96382	96387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976125
2038	NC_016846	TAT	2	6	96402	96407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378976125
2039	NC_016846	GC	3	6	96422	96427	0 %	0 %	50 %	50 %	378976125
2040	NC_016846	GCT	2	6	96432	96437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976125
2041	NC_016846	CAA	2	6	96507	96512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378976125
2042	NC_016846	ACG	2	6	96521	96526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976125
2043	NC_016846	CAG	3	9	96555	96563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976125
2044	NC_016846	CTC	2	6	96592	96597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378976125
2045	NC_016846	ATA	2	6	96668	96673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_016846	GGAGA	2	10	96705	96714	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_016846	GCG	2	6	96719	96724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2048	NC_016846	GCG	2	6	96733	96738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2049	NC_016846	TC	4	8	96742	96749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2050	NC_016846	CG	3	6	96776	96781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2051	NC_016846	C	6	6	96801	96806	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2052	NC_016846	C	6	6	96831	96836	0 %	0 %	0 %	100 %	378976126
2053	NC_016846	GAA	2	6	96838	96843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976126
2054	NC_016846	GCC	2	6	96851	96856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378976126
2055	NC_016846	CATC	2	8	96898	96905	25 %	25 %	0 %	50 %	378976126
2056	NC_016846	CGG	3	9	96942	96950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976126
2057	NC_016846	CGG	2	6	97026	97031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_016846	CCG	2	6	97038	97043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2059	NC_016846	TCA	2	6	97049	97054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976127
2060	NC_016846	GCT	2	6	97091	97096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976127
2061	NC_016846	CG	3	6	97107	97112	0 %	0 %	50 %	50 %	378976127
2062	NC_016846	TCC	2	6	97173	97178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378976127
2063	NC_016846	TCC	2	6	97197	97202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378976127
2064	NC_016846	TCA	2	6	97230	97235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976127
2065	NC_016846	CGG	2	6	97411	97416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976127
2066	NC_016846	TTCGTC	2	12	97445	97456	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378976127
2067	NC_016846	GCC	2	6	97496	97501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378976127
2068	NC_016846	TGA	2	6	97547	97552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976127
2069	NC_016846	GCG	2	6	97611	97616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976128
2070	NC_016846	GTGAT	2	10	97644	97653	20 %	40 %	40 %	0 %	378976128
2071	NC_016846	GCA	2	6	97672	97677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976128
2072	NC_016846	CTG	2	6	97704	97709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976128
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2079	NC_016846	C	6	6	97848	97853	0 %	0 %	0 %	100 %	378976128
2080	NC_016846	GCC	2	6	97880	97885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378976128
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2084	NC_016846	CGCAG	2	10	98130	98139	20 %	0 %	40 %	40 %	378976128
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2088	NC_016846	A	6	6	98218	98223	100 %	0 %	0 %	0 %	378976128
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2092	NC_016846	TC	3	6	98336	98341	0 %	50 %	0 %	50 %	378976129
2093	NC_016846	ACC	2	6	98354	98359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378976129
2094	NC_016846	TAA	2	6	98402	98407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976129
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2097	NC_016846	GGCAC	2	10	98535	98544	20 %	0 %	40 %	40 %	378976129
2098	NC_016846	CACGG	2	10	98553	98562	20 %	0 %	40 %	40 %	378976129
2099	NC_016846	CCGGG	2	10	98602	98611	0 %	0 %	60 %	40 %	378976129
2100	NC_016846	CAC	2	6	98646	98651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2101	NC_016846	CCT	2	6	98653	98658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2102	NC_016846	AGGG	2	8	98676	98683	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_016846	CCCCT	2	10	98686	98695	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2104	NC_016846	CTG	2	6	98723	98728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976130
2105	NC_016846	CT	3	6	98737	98742	0 %	50 %	0 %	50 %	378976130
2106	NC_016846	CCGGA	2	10	98779	98788	20 %	0 %	40 %	40 %	378976130
2107	NC_016846	TCC	2	6	98840	98845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378976130
2108	NC_016846	TTCGTC	2	12	98932	98943	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378976130
2109	NC_016846	GACG	2	8	99019	99026	25 %	0 %	50 %	25 %	378976130
2110	NC_016846	GCG	3	9	99035	99043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976130
2111	NC_016846	GAGG	2	8	99085	99092	25 %	0 %	75 %	0 %	378976130
2112	NC_016846	CAG	2	6	99106	99111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976130
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2115	NC_016846	CAGC	2	8	99174	99181	25 %	0 %	25 %	50 %	378976130
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2117	NC_016846	CAA	2	6	99262	99267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378976130
2118	NC_016846	GA	3	6	99334	99339	50 %	0 %	50 %	0 %	378976130
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2121	NC_016846	GCCA	2	8	99405	99412	25 %	0 %	25 %	50 %	378976130
2122	NC_016846	GCA	2	6	99420	99425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976130
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2124	NC_016846	CAT	2	6	99472	99477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976130
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2126	NC_016846	CTG	2	6	99525	99530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_016846	GGC	2	6	99572	99577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976131
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2129	NC_016846	CAG	2	6	99657	99662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976131
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.