MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS4

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016840	AGC	2	6	7	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016840	CGG	2	6	21	26	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016840	GGT	2	6	73	78	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016840	CGC	2	6	85	90	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016840	TCG	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976147
6	NC_016840	GGA	2	6	419	424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378976147
7	NC_016840	AAT	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976147
8	NC_016840	TGA	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976147
9	NC_016840	TTC	2	6	529	534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976147
10	NC_016840	GTG	2	6	565	570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378976147
11	NC_016840	CGG	2	6	625	630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976147
12	NC_016840	TCG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016840	TGG	2	6	766	771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378976148
14	NC_016840	GCT	2	6	905	910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976148
15	NC_016840	CGG	2	6	1081	1086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976148
16	NC_016840	ATG	2	6	1109	1114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976148
17	NC_016840	ATG	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976148
18	NC_016840	ACG	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976148
19	NC_016840	TGA	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976148
20	NC_016840	CAT	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976148
21	NC_016840	ATG	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976148
22	NC_016840	AGA	2	6	1677	1682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976149
23	NC_016840	ACA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378976149
24	NC_016840	GCG	2	6	2119	2124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976149
25	NC_016840	TGA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016840	TGT	2	6	2510	2515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016840	GAA	2	6	2657	2662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976150
28	NC_016840	GAT	2	6	2690	2695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976150
29	NC_016840	CTT	2	6	2735	2740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976150
30	NC_016840	CAG	2	6	2753	2758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976150
31	NC_016840	CGT	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976150
32	NC_016840	GCA	2	6	3407	3412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976150
33	NC_016840	ACG	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976150
34	NC_016840	CGT	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976150
35	NC_016840	AGC	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976150
36	NC_016840	AAT	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976150
37	NC_016840	AAG	2	6	3659	3664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016840	GGT	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.