MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS3

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016839	AATA	2	8	160	167	75 %	25 %	0 %	0 %	378975833
2	NC_016839	GATC	2	8	432	439	25 %	25 %	25 %	25 %	378975834
3	NC_016839	AACG	2	8	474	481	50 %	0 %	25 %	25 %	378975834
4	NC_016839	ACTC	2	8	542	549	25 %	25 %	0 %	50 %	378975834
5	NC_016839	ATCC	2	8	666	673	25 %	25 %	0 %	50 %	378975834
6	NC_016839	ATCA	2	8	766	773	50 %	25 %	0 %	25 %	378975835
7	NC_016839	ATCC	2	8	2243	2250	25 %	25 %	0 %	50 %	378975837
8	NC_016839	TTGG	2	8	3052	3059	0 %	50 %	50 %	0 %	378975838
9	NC_016839	ATCC	2	8	3749	3756	25 %	25 %	0 %	50 %	378975839
10	NC_016839	TGGT	2	8	3884	3891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016839	TGGC	2	8	4517	4524	0 %	25 %	50 %	25 %	378975841
12	NC_016839	TCCA	2	8	5824	5831	25 %	25 %	0 %	50 %	378975843
13	NC_016839	TGAT	2	8	6335	6342	25 %	50 %	25 %	0 %	378975843
14	NC_016839	CAAA	2	8	6915	6922	75 %	0 %	0 %	25 %	378975844
15	NC_016839	TGGT	2	8	7550	7557	0 %	50 %	50 %	0 %	378975845
16	NC_016839	TGCC	2	8	8509	8516	0 %	25 %	25 %	50 %	378975847
17	NC_016839	CTAT	2	8	9182	9189	25 %	50 %	0 %	25 %	378975848
18	NC_016839	TCAT	2	8	9524	9531	25 %	50 %	0 %	25 %	378975850
19	NC_016839	GTTC	2	8	9594	9601	0 %	50 %	25 %	25 %	378975850
20	NC_016839	ATGG	2	8	9697	9704	25 %	25 %	50 %	0 %	378975850
21	NC_016839	TGCT	2	8	10069	10076	0 %	50 %	25 %	25 %	378975850
22	NC_016839	GAAG	2	8	10339	10346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016839	TGGA	2	8	10507	10514	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016839	CTGA	2	8	10656	10663	25 %	25 %	25 %	25 %	378975852
25	NC_016839	AAAC	2	8	11088	11095	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016839	GAAC	2	8	11599	11606	50 %	0 %	25 %	25 %	378975854
27	NC_016839	CTTA	2	8	12452	12459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016839	AGTA	2	8	12532	12539	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016839	TGAA	2	8	12603	12610	50 %	25 %	25 %	0 %	378975857
30	NC_016839	TGGC	2	8	13298	13305	0 %	25 %	50 %	25 %	378975858
31	NC_016839	GAGC	2	8	14021	14028	25 %	0 %	50 %	25 %	378975860
32	NC_016839	GCAA	2	8	14321	14328	50 %	0 %	25 %	25 %	378975861
33	NC_016839	TTCA	2	8	14958	14965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016839	GGAG	2	8	15146	15153	25 %	0 %	75 %	0 %	378975863
35	NC_016839	CGAC	2	8	15189	15196	25 %	0 %	25 %	50 %	378975863
36	NC_016839	GGAT	2	8	15880	15887	25 %	25 %	50 %	0 %	378975864
37	NC_016839	CTTT	2	8	16003	16010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016839	TCAA	2	8	16206	16213	50 %	25 %	0 %	25 %	378975865
39	NC_016839	CCAG	2	8	16224	16231	25 %	0 %	25 %	50 %	378975865
40	NC_016839	AAAG	2	8	16486	16493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016839	AAGC	2	8	16807	16814	50 %	0 %	25 %	25 %	378975866
42	NC_016839	TGAC	2	8	16994	17001	25 %	25 %	25 %	25 %	378975866
43	NC_016839	GTCA	2	8	17412	17419	25 %	25 %	25 %	25 %	378975866
44	NC_016839	ATTT	2	8	17517	17524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016839	AAAG	2	8	17656	17663	75 %	0 %	25 %	0 %	378975867
46	NC_016839	CTTT	2	8	17778	17785	0 %	75 %	0 %	25 %	378975867
47	NC_016839	AACG	2	8	18005	18012	50 %	0 %	25 %	25 %	378975867
48	NC_016839	TTGA	2	8	18452	18459	25 %	50 %	25 %	0 %	378975867
49	NC_016839	GAGC	2	8	19097	19104	25 %	0 %	50 %	25 %	378975868
50	NC_016839	ACAA	2	8	19160	19167	75 %	0 %	0 %	25 %	378975869
51	NC_016839	GGAG	2	8	19558	19565	25 %	0 %	75 %	0 %	378975870
52	NC_016839	TGGT	2	8	20159	20166	0 %	50 %	50 %	0 %	378975871
53	NC_016839	TTTG	2	8	20386	20393	0 %	75 %	25 %	0 %	378975871
54	NC_016839	GCCA	2	8	20666	20673	25 %	0 %	25 %	50 %	378975872
55	NC_016839	CCTC	2	8	21155	21162	0 %	25 %	0 %	75 %	378975872
56	NC_016839	ACAA	2	8	21614	21621	75 %	0 %	0 %	25 %	378975873
57	NC_016839	TGAG	2	8	22082	22089	25 %	25 %	50 %	0 %	378975874
58	NC_016839	GTTG	2	8	22739	22746	0 %	50 %	50 %	0 %	378975876
59	NC_016839	CTTG	2	8	22967	22974	0 %	50 %	25 %	25 %	378975876
60	NC_016839	AGCG	2	8	24361	24368	25 %	0 %	50 %	25 %	378975879
61	NC_016839	TGAT	2	8	25019	25026	25 %	50 %	25 %	0 %	378975879
62	NC_016839	GAAC	2	8	25151	25158	50 %	0 %	25 %	25 %	378975879
63	NC_016839	CCTG	2	8	25721	25728	0 %	25 %	25 %	50 %	378975880
64	NC_016839	TCTG	2	8	25747	25754	0 %	50 %	25 %	25 %	378975880
65	NC_016839	ACGC	2	8	26286	26293	25 %	0 %	25 %	50 %	378975880
66	NC_016839	ATTT	2	8	26442	26449	25 %	75 %	0 %	0 %	378975880
67	NC_016839	GAAG	2	8	26591	26598	50 %	0 %	50 %	0 %	378975881
68	NC_016839	GCTG	2	8	28098	28105	0 %	25 %	50 %	25 %	378975884
69	NC_016839	CCTG	2	8	28852	28859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016839	ACTT	2	8	30146	30153	25 %	50 %	0 %	25 %	378975886
71	NC_016839	TGAA	2	8	30245	30252	50 %	25 %	25 %	0 %	378975886
72	NC_016839	TGGA	2	8	30367	30374	25 %	25 %	50 %	0 %	378975886
73	NC_016839	GGCT	2	8	30417	30424	0 %	25 %	50 %	25 %	378975886
74	NC_016839	GATT	2	8	30639	30646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016839	CTGA	2	8	30857	30864	25 %	25 %	25 %	25 %	378975887
76	NC_016839	GCAC	2	8	30908	30915	25 %	0 %	25 %	50 %	378975887
77	NC_016839	GGCG	2	8	31400	31407	0 %	0 %	75 %	25 %	378975887
78	NC_016839	CACC	2	8	31938	31945	25 %	0 %	0 %	75 %	378975888
79	NC_016839	GCCG	2	8	32183	32190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016839	CGCT	2	8	32965	32972	0 %	25 %	25 %	50 %	378975891
81	NC_016839	GGCT	2	8	33545	33552	0 %	25 %	50 %	25 %	378975892
82	NC_016839	ATGG	2	8	33608	33615	25 %	25 %	50 %	0 %	378975892
83	NC_016839	GCTG	2	8	33662	33669	0 %	25 %	50 %	25 %	378975892
84	NC_016839	TGCG	2	8	34017	34024	0 %	25 %	50 %	25 %	378975892
85	NC_016839	GCCG	2	8	34877	34884	0 %	0 %	50 %	50 %	378975893
86	NC_016839	CTTG	2	8	35419	35426	0 %	50 %	25 %	25 %	378975895
87	NC_016839	CCAT	2	8	35512	35519	25 %	25 %	0 %	50 %	378975895
88	NC_016839	GCCC	2	8	35990	35997	0 %	0 %	25 %	75 %	378975895
89	NC_016839	AGCG	2	8	36658	36665	25 %	0 %	50 %	25 %	378975896
90	NC_016839	CGCT	2	8	36711	36718	0 %	25 %	25 %	50 %	378975896
91	NC_016839	CGAC	2	8	36825	36832	25 %	0 %	25 %	50 %	378975896
92	NC_016839	GTCA	2	8	36924	36931	25 %	25 %	25 %	25 %	378975896
93	NC_016839	AGCA	2	8	37009	37016	50 %	0 %	25 %	25 %	378975896
94	NC_016839	GCTT	2	8	37330	37337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016839	GCGA	2	8	38019	38026	25 %	0 %	50 %	25 %	378975898
96	NC_016839	ATGG	2	8	38415	38422	25 %	25 %	50 %	0 %	378975898
97	NC_016839	CGGC	2	8	39574	39581	0 %	0 %	50 %	50 %	378975899
98	NC_016839	TGGC	2	8	39603	39610	0 %	25 %	50 %	25 %	378975899
99	NC_016839	GGAT	2	8	39930	39937	25 %	25 %	50 %	0 %	378975900
100	NC_016839	AGAA	2	8	39949	39956	75 %	0 %	25 %	0 %	378975900
101	NC_016839	AGCC	2	8	40079	40086	25 %	0 %	25 %	50 %	378975900
102	NC_016839	GCTT	2	8	40359	40366	0 %	50 %	25 %	25 %	378975901
103	NC_016839	TGGC	2	8	40672	40679	0 %	25 %	50 %	25 %	378975901
104	NC_016839	CCGC	2	8	41639	41646	0 %	0 %	25 %	75 %	378975904
105	NC_016839	CTGG	2	8	42291	42298	0 %	25 %	50 %	25 %	378975905
106	NC_016839	GGCG	2	8	43661	43668	0 %	0 %	75 %	25 %	378975907
107	NC_016839	CAGC	2	8	43978	43985	25 %	0 %	25 %	50 %	378975907
108	NC_016839	GCTG	2	8	44364	44371	0 %	25 %	50 %	25 %	378975908
109	NC_016839	GTTC	2	8	44433	44440	0 %	50 %	25 %	25 %	378975908
110	NC_016839	GGTG	2	8	44534	44541	0 %	25 %	75 %	0 %	378975908
111	NC_016839	AGCG	2	8	45000	45007	25 %	0 %	50 %	25 %	378975909
112	NC_016839	CTGA	2	8	45124	45131	25 %	25 %	25 %	25 %	378975909
113	NC_016839	AAGG	2	8	46365	46372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016839	GCAA	2	8	46562	46569	50 %	0 %	25 %	25 %	378975912
115	NC_016839	TCTT	2	8	47332	47339	0 %	75 %	0 %	25 %	378975912
116	NC_016839	AGCG	2	8	47607	47614	25 %	0 %	50 %	25 %	378975913
117	NC_016839	GCTG	2	8	48192	48199	0 %	25 %	50 %	25 %	378975914
118	NC_016839	CGAA	2	8	48825	48832	50 %	0 %	25 %	25 %	378975914
119	NC_016839	ACTT	2	8	50220	50227	25 %	50 %	0 %	25 %	378975916
120	NC_016839	TGAA	2	8	50319	50326	50 %	25 %	25 %	0 %	378975916
121	NC_016839	TGGA	2	8	50441	50448	25 %	25 %	50 %	0 %	378975916
122	NC_016839	GGCT	2	8	50491	50498	0 %	25 %	50 %	25 %	378975916
123	NC_016839	GATT	2	8	50713	50720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016839	CCAG	2	8	51373	51380	25 %	0 %	25 %	50 %	378975918
125	NC_016839	CAGA	2	8	52452	52459	50 %	0 %	25 %	25 %	378975919
126	NC_016839	TTTC	2	8	52812	52819	0 %	75 %	0 %	25 %	378975920
127	NC_016839	ACAG	2	8	52982	52989	50 %	0 %	25 %	25 %	378975920
128	NC_016839	CTGC	2	8	53202	53209	0 %	25 %	25 %	50 %	378975920
129	NC_016839	CGAG	2	8	53358	53365	25 %	0 %	50 %	25 %	378975920
130	NC_016839	GTTT	2	8	54280	54287	0 %	75 %	25 %	0 %	378975922
131	NC_016839	AAAG	2	8	54497	54504	75 %	0 %	25 %	0 %	378975923
132	NC_016839	ATGG	2	8	54519	54526	25 %	25 %	50 %	0 %	378975923
133	NC_016839	TCAT	2	8	54676	54683	25 %	50 %	0 %	25 %	378975923
134	NC_016839	TGAT	2	8	54793	54800	25 %	50 %	25 %	0 %	378975923
135	NC_016839	TGAA	2	8	55759	55766	50 %	25 %	25 %	0 %	378975924
136	NC_016839	ACTG	2	8	55880	55887	25 %	25 %	25 %	25 %	378975924
137	NC_016839	GACC	2	8	56252	56259	25 %	0 %	25 %	50 %	378975924
138	NC_016839	GAAT	2	8	56572	56579	50 %	25 %	25 %	0 %	378975925
139	NC_016839	TCCA	2	8	56984	56991	25 %	25 %	0 %	50 %	378975926
140	NC_016839	CCTG	2	8	57459	57466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016839	TTAT	2	8	57685	57692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016839	AGCA	2	8	57942	57949	50 %	0 %	25 %	25 %	378975928
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.