MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016838	CG	3	6	563	568	0 %	0 %	50 %	50 %	378975691
2	NC_016838	CT	3	6	653	658	0 %	50 %	0 %	50 %	378975691
3	NC_016838	GC	3	6	1082	1087	0 %	0 %	50 %	50 %	378975691
4	NC_016838	GA	3	6	2224	2229	50 %	0 %	50 %	0 %	378975693
5	NC_016838	GC	3	6	2279	2284	0 %	0 %	50 %	50 %	378975693
6	NC_016838	AG	3	6	2374	2379	50 %	0 %	50 %	0 %	378975693
7	NC_016838	GC	3	6	3601	3606	0 %	0 %	50 %	50 %	378975695
8	NC_016838	GA	3	6	4294	4299	50 %	0 %	50 %	0 %	378975696
9	NC_016838	GC	3	6	6155	6160	0 %	0 %	50 %	50 %	378975698
10	NC_016838	CA	3	6	6228	6233	50 %	0 %	0 %	50 %	378975698
11	NC_016838	GA	3	6	6695	6700	50 %	0 %	50 %	0 %	378975699
12	NC_016838	CG	4	8	6915	6922	0 %	0 %	50 %	50 %	378975699
13	NC_016838	GT	3	6	7962	7967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016838	TG	3	6	8046	8051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016838	CG	3	6	8368	8373	0 %	0 %	50 %	50 %	378975702
16	NC_016838	AC	3	6	8876	8881	50 %	0 %	0 %	50 %	378975703
17	NC_016838	CT	3	6	9285	9290	0 %	50 %	0 %	50 %	378975704
18	NC_016838	CG	3	6	9814	9819	0 %	0 %	50 %	50 %	378975704
19	NC_016838	AC	3	6	10239	10244	50 %	0 %	0 %	50 %	378975704
20	NC_016838	CT	3	6	10328	10333	0 %	50 %	0 %	50 %	378975704
21	NC_016838	CG	3	6	10442	10447	0 %	0 %	50 %	50 %	378975704
22	NC_016838	GC	3	6	11595	11600	0 %	0 %	50 %	50 %	378975704
23	NC_016838	GA	3	6	12573	12578	50 %	0 %	50 %	0 %	378975705
24	NC_016838	GC	3	6	12936	12941	0 %	0 %	50 %	50 %	378975705
25	NC_016838	CA	3	6	13921	13926	50 %	0 %	0 %	50 %	378975707
26	NC_016838	GT	3	6	14109	14114	0 %	50 %	50 %	0 %	378975707
27	NC_016838	CG	3	6	14323	14328	0 %	0 %	50 %	50 %	378975707
28	NC_016838	TC	3	6	14374	14379	0 %	50 %	0 %	50 %	378975707
29	NC_016838	GC	3	6	14471	14476	0 %	0 %	50 %	50 %	378975707
30	NC_016838	AG	3	6	16023	16028	50 %	0 %	50 %	0 %	378975708
31	NC_016838	CG	3	6	16091	16096	0 %	0 %	50 %	50 %	378975708
32	NC_016838	GT	3	6	16152	16157	0 %	50 %	50 %	0 %	378975708
33	NC_016838	GT	3	6	18224	18229	0 %	50 %	50 %	0 %	378975711
34	NC_016838	TG	3	6	19417	19422	0 %	50 %	50 %	0 %	378975711
35	NC_016838	TA	3	6	19913	19918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016838	GT	3	6	20479	20484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016838	TG	3	6	20727	20732	0 %	50 %	50 %	0 %	378975712
38	NC_016838	CT	3	6	21446	21451	0 %	50 %	0 %	50 %	378975713
39	NC_016838	TC	3	6	22021	22026	0 %	50 %	0 %	50 %	378975714
40	NC_016838	AT	3	6	24051	24056	50 %	50 %	0 %	0 %	378975716
41	NC_016838	AT	3	6	24389	24394	50 %	50 %	0 %	0 %	378975716
42	NC_016838	AC	3	6	24596	24601	50 %	0 %	0 %	50 %	378975716
43	NC_016838	GT	3	6	25696	25701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016838	CA	3	6	26045	26050	50 %	0 %	0 %	50 %	378975718
45	NC_016838	GC	3	6	26836	26841	0 %	0 %	50 %	50 %	378975719
46	NC_016838	CG	3	6	27433	27438	0 %	0 %	50 %	50 %	378975719
47	NC_016838	GC	3	6	29696	29701	0 %	0 %	50 %	50 %	378975720
48	NC_016838	GC	3	6	31127	31132	0 %	0 %	50 %	50 %	378975723
49	NC_016838	GC	3	6	31549	31554	0 %	0 %	50 %	50 %	378975723
50	NC_016838	CT	3	6	31895	31900	0 %	50 %	0 %	50 %	378975724
51	NC_016838	TC	3	6	32174	32179	0 %	50 %	0 %	50 %	378975724
52	NC_016838	CG	3	6	32248	32253	0 %	0 %	50 %	50 %	378975724
53	NC_016838	CT	3	6	32703	32708	0 %	50 %	0 %	50 %	378975725
54	NC_016838	GT	3	6	32773	32778	0 %	50 %	50 %	0 %	378975725
55	NC_016838	CA	3	6	32830	32835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016838	TA	3	6	33278	33283	50 %	50 %	0 %	0 %	378975727
57	NC_016838	AT	3	6	34274	34279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016838	TC	4	8	34469	34476	0 %	50 %	0 %	50 %	378975728
59	NC_016838	AC	3	6	34652	34657	50 %	0 %	0 %	50 %	378975728
60	NC_016838	CA	3	6	34851	34856	50 %	0 %	0 %	50 %	378975728
61	NC_016838	CG	3	6	35015	35020	0 %	0 %	50 %	50 %	378975728
62	NC_016838	CA	3	6	35084	35089	50 %	0 %	0 %	50 %	378975728
63	NC_016838	TC	3	6	35964	35969	0 %	50 %	0 %	50 %	378975729
64	NC_016838	TC	3	6	36507	36512	0 %	50 %	0 %	50 %	378975731
65	NC_016838	GA	3	6	36889	36894	50 %	0 %	50 %	0 %	378975731
66	NC_016838	CA	3	6	37179	37184	50 %	0 %	0 %	50 %	378975731
67	NC_016838	CT	3	6	37604	37609	0 %	50 %	0 %	50 %	378975732
68	NC_016838	CG	3	6	38522	38527	0 %	0 %	50 %	50 %	378975733
69	NC_016838	AT	3	6	38685	38690	50 %	50 %	0 %	0 %	378975733
70	NC_016838	AT	3	6	39002	39007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016838	AT	3	6	39631	39636	50 %	50 %	0 %	0 %	378975734
72	NC_016838	AT	3	6	39917	39922	50 %	50 %	0 %	0 %	378975734
73	NC_016838	GC	3	6	40685	40690	0 %	0 %	50 %	50 %	378975735
74	NC_016838	AG	3	6	41862	41867	50 %	0 %	50 %	0 %	378975736
75	NC_016838	GA	3	6	42167	42172	50 %	0 %	50 %	0 %	378975736
76	NC_016838	GA	3	6	42190	42195	50 %	0 %	50 %	0 %	378975736
77	NC_016838	AG	3	6	42601	42606	50 %	0 %	50 %	0 %	378975736
78	NC_016838	CT	3	6	42621	42626	0 %	50 %	0 %	50 %	378975736
79	NC_016838	GC	3	6	42720	42725	0 %	0 %	50 %	50 %	378975736
80	NC_016838	GC	3	6	43307	43312	0 %	0 %	50 %	50 %	378975737
81	NC_016838	AG	3	6	43387	43392	50 %	0 %	50 %	0 %	378975737
82	NC_016838	GC	3	6	43503	43508	0 %	0 %	50 %	50 %	378975737
83	NC_016838	GT	3	6	43798	43803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016838	TA	3	6	43865	43870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016838	TA	3	6	44196	44201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016838	CT	6	12	44914	44925	0 %	50 %	0 %	50 %	378975740
87	NC_016838	GC	3	6	45699	45704	0 %	0 %	50 %	50 %	378975742
88	NC_016838	CT	3	6	46789	46794	0 %	50 %	0 %	50 %	378975743
89	NC_016838	CG	3	6	46967	46972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016838	TC	3	6	47248	47253	0 %	50 %	0 %	50 %	378975745
91	NC_016838	AT	3	6	47817	47822	50 %	50 %	0 %	0 %	378975746
92	NC_016838	AC	3	6	49103	49108	50 %	0 %	0 %	50 %	378975748
93	NC_016838	AG	3	6	50069	50074	50 %	0 %	50 %	0 %	378975749
94	NC_016838	AG	3	6	51020	51025	50 %	0 %	50 %	0 %	378975749
95	NC_016838	GC	3	6	54340	54345	0 %	0 %	50 %	50 %	378975750
96	NC_016838	AG	3	6	55049	55054	50 %	0 %	50 %	0 %	378975750
97	NC_016838	AG	3	6	55419	55424	50 %	0 %	50 %	0 %	378975750
98	NC_016838	GC	3	6	56980	56985	0 %	0 %	50 %	50 %	378975751
99	NC_016838	GA	3	6	57684	57689	50 %	0 %	50 %	0 %	378975751
100	NC_016838	GC	3	6	58590	58595	0 %	0 %	50 %	50 %	378975751
101	NC_016838	AG	3	6	59098	59103	50 %	0 %	50 %	0 %	378975751
102	NC_016838	CG	3	6	59146	59151	0 %	0 %	50 %	50 %	378975751
103	NC_016838	CG	3	6	60443	60448	0 %	0 %	50 %	50 %	378975751
104	NC_016838	AG	3	6	60631	60636	50 %	0 %	50 %	0 %	378975751
105	NC_016838	CG	3	6	60796	60801	0 %	0 %	50 %	50 %	378975751
106	NC_016838	TG	3	6	61903	61908	0 %	50 %	50 %	0 %	378975751
107	NC_016838	AC	3	6	62433	62438	50 %	0 %	0 %	50 %	378975752
108	NC_016838	AC	3	6	63215	63220	50 %	0 %	0 %	50 %	378975753
109	NC_016838	TG	3	6	63535	63540	0 %	50 %	50 %	0 %	378975753
110	NC_016838	GT	3	6	63910	63915	0 %	50 %	50 %	0 %	378975754
111	NC_016838	TA	3	6	64380	64385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016838	GA	3	6	64614	64619	50 %	0 %	50 %	0 %	378975755
113	NC_016838	AC	3	6	65568	65573	50 %	0 %	0 %	50 %	378975756
114	NC_016838	TC	3	6	66991	66996	0 %	50 %	0 %	50 %	378975757
115	NC_016838	GC	3	6	67368	67373	0 %	0 %	50 %	50 %	378975757
116	NC_016838	AG	3	6	67953	67958	50 %	0 %	50 %	0 %	378975757
117	NC_016838	AG	3	6	69198	69203	50 %	0 %	50 %	0 %	378975757
118	NC_016838	AC	3	6	70865	70870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016838	TA	3	6	70880	70885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016838	AT	3	6	71757	71762	50 %	50 %	0 %	0 %	378975762
121	NC_016838	TG	3	6	72104	72109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016838	GA	3	6	73286	73291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016838	AC	3	6	73753	73758	50 %	0 %	0 %	50 %	378975767
124	NC_016838	AT	3	6	73932	73937	50 %	50 %	0 %	0 %	378975767
125	NC_016838	AG	3	6	74064	74069	50 %	0 %	50 %	0 %	378975768
126	NC_016838	CT	3	6	75894	75899	0 %	50 %	0 %	50 %	378975770
127	NC_016838	GC	3	6	76867	76872	0 %	0 %	50 %	50 %	378975771
128	NC_016838	CG	3	6	77107	77112	0 %	0 %	50 %	50 %	378975771
129	NC_016838	GC	3	6	78254	78259	0 %	0 %	50 %	50 %	378975772
130	NC_016838	GC	3	6	78498	78503	0 %	0 %	50 %	50 %	378975772
131	NC_016838	TC	3	6	78543	78548	0 %	50 %	0 %	50 %	378975772
132	NC_016838	GC	3	6	78960	78965	0 %	0 %	50 %	50 %	378975773
133	NC_016838	GC	3	6	79116	79121	0 %	0 %	50 %	50 %	378975773
134	NC_016838	GA	3	6	79139	79144	50 %	0 %	50 %	0 %	378975773
135	NC_016838	AC	4	8	79359	79366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016838	TA	3	6	79451	79456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016838	TA	4	8	79478	79485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016838	GC	4	8	79643	79650	0 %	0 %	50 %	50 %	378975774
139	NC_016838	GT	3	6	79862	79867	0 %	50 %	50 %	0 %	378975775
140	NC_016838	GC	3	6	80171	80176	0 %	0 %	50 %	50 %	378975775
141	NC_016838	CG	3	6	81058	81063	0 %	0 %	50 %	50 %	378975777
142	NC_016838	CT	3	6	81635	81640	0 %	50 %	0 %	50 %	378975779
143	NC_016838	CG	3	6	82777	82782	0 %	0 %	50 %	50 %	378975780
144	NC_016838	AG	3	6	84172	84177	50 %	0 %	50 %	0 %	378975781
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.