MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016838	GCAG	2	8	1283	1290	25 %	0 %	50 %	25 %	378975691
2	NC_016838	AACC	2	8	2084	2091	50 %	0 %	0 %	50 %	378975693
3	NC_016838	TACT	2	8	2777	2784	25 %	50 %	0 %	25 %	378975694
4	NC_016838	AATC	2	8	4113	4120	50 %	25 %	0 %	25 %	378975695
5	NC_016838	GCCG	2	8	4355	4362	0 %	0 %	50 %	50 %	378975696
6	NC_016838	TGGG	2	8	4602	4609	0 %	25 %	75 %	0 %	378975697
7	NC_016838	AGGC	2	8	4900	4907	25 %	0 %	50 %	25 %	378975697
8	NC_016838	GTTG	2	8	5042	5049	0 %	50 %	50 %	0 %	378975697
9	NC_016838	AGCG	2	8	6201	6208	25 %	0 %	50 %	25 %	378975698
10	NC_016838	GCAC	2	8	6238	6245	25 %	0 %	25 %	50 %	378975698
11	NC_016838	TACT	3	12	6582	6593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016838	GGGT	2	8	6611	6618	0 %	25 %	75 %	0 %	378975699
13	NC_016838	CAAA	2	8	7160	7167	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016838	TCCT	2	8	8624	8631	0 %	50 %	0 %	50 %	378975703
15	NC_016838	GATC	2	8	9201	9208	25 %	25 %	25 %	25 %	378975704
16	NC_016838	TGAG	2	8	9628	9635	25 %	25 %	50 %	0 %	378975704
17	NC_016838	GTTT	2	8	10024	10031	0 %	75 %	25 %	0 %	378975704
18	NC_016838	CTGA	2	8	10116	10123	25 %	25 %	25 %	25 %	378975704
19	NC_016838	AGCC	2	8	12000	12007	25 %	0 %	25 %	50 %	378975704
20	NC_016838	TTGG	2	8	12417	12424	0 %	50 %	50 %	0 %	378975705
21	NC_016838	GTTC	2	8	12598	12605	0 %	50 %	25 %	25 %	378975705
22	NC_016838	CTGG	2	8	12738	12745	0 %	25 %	50 %	25 %	378975705
23	NC_016838	ACGC	2	8	14183	14190	25 %	0 %	25 %	50 %	378975707
24	NC_016838	TCAT	2	8	14234	14241	25 %	50 %	0 %	25 %	378975707
25	NC_016838	GGAC	2	8	14833	14840	25 %	0 %	50 %	25 %	378975707
26	NC_016838	TACT	2	8	15014	15021	25 %	50 %	0 %	25 %	378975707
27	NC_016838	GTTG	2	8	15368	15375	0 %	50 %	50 %	0 %	378975707
28	NC_016838	ATGG	2	8	15710	15717	25 %	25 %	50 %	0 %	378975707
29	NC_016838	AGTC	2	8	16560	16567	25 %	25 %	25 %	25 %	378975709
30	NC_016838	CAAT	2	8	17270	17277	50 %	25 %	0 %	25 %	378975710
31	NC_016838	CGTC	2	8	17507	17514	0 %	25 %	25 %	50 %	378975710
32	NC_016838	TTAC	2	8	17719	17726	25 %	50 %	0 %	25 %	378975710
33	NC_016838	GACC	2	8	17868	17875	25 %	0 %	25 %	50 %	378975710
34	NC_016838	CATC	2	8	17879	17886	25 %	25 %	0 %	50 %	378975710
35	NC_016838	GTTT	2	8	18148	18155	0 %	75 %	25 %	0 %	378975711
36	NC_016838	CTGA	2	8	18911	18918	25 %	25 %	25 %	25 %	378975711
37	NC_016838	TCCA	2	8	19230	19237	25 %	25 %	0 %	50 %	378975711
38	NC_016838	TTCT	2	8	19337	19344	0 %	75 %	0 %	25 %	378975711
39	NC_016838	TGGC	2	8	19762	19769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016838	TACC	2	8	19984	19991	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016838	TTGT	2	8	20056	20063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016838	ATGA	2	8	20310	20317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016838	TGCC	2	8	20514	20521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016838	CTTG	2	8	20847	20854	0 %	50 %	25 %	25 %	378975712
45	NC_016838	AGTA	2	8	20971	20978	50 %	25 %	25 %	0 %	378975712
46	NC_016838	ATTC	2	8	22111	22118	25 %	50 %	0 %	25 %	378975714
47	NC_016838	GGAA	2	8	22564	22571	50 %	0 %	50 %	0 %	378975715
48	NC_016838	CAGC	2	8	22681	22688	25 %	0 %	25 %	50 %	378975715
49	NC_016838	GTTT	2	8	22907	22914	0 %	75 %	25 %	0 %	378975715
50	NC_016838	TACC	2	8	22985	22992	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016838	TTTG	2	8	23839	23846	0 %	75 %	25 %	0 %	378975716
52	NC_016838	TCGT	2	8	23869	23876	0 %	50 %	25 %	25 %	378975716
53	NC_016838	GCTT	2	8	24001	24008	0 %	50 %	25 %	25 %	378975716
54	NC_016838	CTTA	2	8	24676	24683	25 %	50 %	0 %	25 %	378975716
55	NC_016838	TTAA	2	8	24754	24761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016838	TTCA	2	8	25287	25294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016838	ATCC	2	8	26060	26067	25 %	25 %	0 %	50 %	378975718
58	NC_016838	TATT	2	8	26247	26254	25 %	75 %	0 %	0 %	378975718
59	NC_016838	CGAC	2	8	26269	26276	25 %	0 %	25 %	50 %	378975718
60	NC_016838	CAAC	2	8	26284	26291	50 %	0 %	0 %	50 %	378975718
61	NC_016838	ATTA	2	8	26459	26466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016838	GCAC	2	8	27059	27066	25 %	0 %	25 %	50 %	378975719
63	NC_016838	GCCG	2	8	27223	27230	0 %	0 %	50 %	50 %	378975719
64	NC_016838	CTGG	2	8	27778	27785	0 %	25 %	50 %	25 %	378975719
65	NC_016838	CGGC	2	8	28014	28021	0 %	0 %	50 %	50 %	378975719
66	NC_016838	CGGC	2	8	28197	28204	0 %	0 %	50 %	50 %	378975719
67	NC_016838	CGGC	2	8	28269	28276	0 %	0 %	50 %	50 %	378975719
68	NC_016838	CCGG	2	8	28371	28378	0 %	0 %	50 %	50 %	378975719
69	NC_016838	AGGT	2	8	29159	29166	25 %	25 %	50 %	0 %	378975719
70	NC_016838	CCAC	2	8	29253	29260	25 %	0 %	0 %	75 %	378975719
71	NC_016838	GCCG	2	8	29572	29579	0 %	0 %	50 %	50 %	378975720
72	NC_016838	TCGC	2	8	29580	29587	0 %	25 %	25 %	50 %	378975720
73	NC_016838	CCTG	2	8	30202	30209	0 %	25 %	25 %	50 %	378975721
74	NC_016838	CTTG	2	8	30260	30267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016838	ACGT	2	8	30454	30461	25 %	25 %	25 %	25 %	378975722
76	NC_016838	ATGG	2	8	30597	30604	25 %	25 %	50 %	0 %	378975722
77	NC_016838	ACGC	2	8	30849	30856	25 %	0 %	25 %	50 %	378975723
78	NC_016838	CCAG	2	8	31679	31686	25 %	0 %	25 %	50 %	378975723
79	NC_016838	GCTG	2	8	32050	32057	0 %	25 %	50 %	25 %	378975724
80	NC_016838	CAAT	2	8	32292	32299	50 %	25 %	0 %	25 %	378975724
81	NC_016838	ATAC	2	8	33066	33073	50 %	25 %	0 %	25 %	378975727
82	NC_016838	CTGT	2	8	33097	33104	0 %	50 %	25 %	25 %	378975727
83	NC_016838	CTTT	2	8	33368	33375	0 %	75 %	0 %	25 %	378975727
84	NC_016838	TTAA	2	8	33533	33540	50 %	50 %	0 %	0 %	378975727
85	NC_016838	TTTC	2	8	34321	34328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016838	AGCG	2	8	35134	35141	25 %	0 %	50 %	25 %	378975728
87	NC_016838	ACTT	2	8	35489	35496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016838	CGTT	2	8	37410	37417	0 %	50 %	25 %	25 %	378975731
89	NC_016838	TAGA	2	8	37588	37595	50 %	25 %	25 %	0 %	378975732
90	NC_016838	TTTC	2	8	37636	37643	0 %	75 %	0 %	25 %	378975732
91	NC_016838	TACT	3	12	37958	37969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016838	ATTC	2	8	38868	38875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016838	ATTT	2	8	39197	39204	25 %	75 %	0 %	0 %	378975734
94	NC_016838	TTAC	2	8	39898	39905	25 %	50 %	0 %	25 %	378975734
95	NC_016838	GCTG	2	8	40275	40282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016838	GCTT	2	8	40514	40521	0 %	50 %	25 %	25 %	378975735
97	NC_016838	TGCC	2	8	40900	40907	0 %	25 %	25 %	50 %	378975735
98	NC_016838	TAGA	2	8	41882	41889	50 %	25 %	25 %	0 %	378975736
99	NC_016838	TTGG	2	8	42790	42797	0 %	50 %	50 %	0 %	378975736
100	NC_016838	AGAA	2	8	43319	43326	75 %	0 %	25 %	0 %	378975737
101	NC_016838	CAGG	2	8	43526	43533	25 %	0 %	50 %	25 %	378975737
102	NC_016838	TACT	3	12	43734	43745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016838	CATT	2	8	43894	43901	25 %	50 %	0 %	25 %	378975738
104	NC_016838	TTAA	2	8	44903	44910	50 %	50 %	0 %	0 %	378975740
105	NC_016838	GGAC	2	8	45410	45417	25 %	0 %	50 %	25 %	378975741
106	NC_016838	TCAT	2	8	45760	45767	25 %	50 %	0 %	25 %	378975742
107	NC_016838	CTTT	2	8	46064	46071	0 %	75 %	0 %	25 %	378975742
108	NC_016838	TGCT	2	8	46471	46478	0 %	50 %	25 %	25 %	378975743
109	NC_016838	CCTG	2	8	47394	47401	0 %	25 %	25 %	50 %	378975746
110	NC_016838	TTTC	2	8	47587	47594	0 %	75 %	0 %	25 %	378975746
111	NC_016838	CTTA	2	8	48324	48331	25 %	50 %	0 %	25 %	378975747
112	NC_016838	AATT	2	8	48468	48475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016838	TACA	2	8	48489	48496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016838	CGGT	2	8	50423	50430	0 %	25 %	50 %	25 %	378975749
115	NC_016838	TTTC	2	8	51864	51871	0 %	75 %	0 %	25 %	378975749
116	NC_016838	CTGG	2	8	51985	51992	0 %	25 %	50 %	25 %	378975749
117	NC_016838	GTCG	2	8	52264	52271	0 %	25 %	50 %	25 %	378975749
118	NC_016838	TACC	2	8	53431	53438	25 %	25 %	0 %	50 %	378975750
119	NC_016838	CTGG	2	8	53618	53625	0 %	25 %	50 %	25 %	378975750
120	NC_016838	CAGT	2	8	54180	54187	25 %	25 %	25 %	25 %	378975750
121	NC_016838	TGCG	2	8	54496	54503	0 %	25 %	50 %	25 %	378975750
122	NC_016838	TGGC	2	8	54523	54530	0 %	25 %	50 %	25 %	378975750
123	NC_016838	CACT	2	8	55794	55801	25 %	25 %	0 %	50 %	378975750
124	NC_016838	CGCC	2	8	56038	56045	0 %	0 %	25 %	75 %	378975750
125	NC_016838	CTGG	2	8	56162	56169	0 %	25 %	50 %	25 %	378975750
126	NC_016838	CCAG	2	8	56471	56478	25 %	0 %	25 %	50 %	378975750
127	NC_016838	ATCG	2	8	56691	56698	25 %	25 %	25 %	25 %	378975751
128	NC_016838	TGGC	2	8	57011	57018	0 %	25 %	50 %	25 %	378975751
129	NC_016838	CTGG	2	8	57438	57445	0 %	25 %	50 %	25 %	378975751
130	NC_016838	CGGA	2	8	57780	57787	25 %	0 %	50 %	25 %	378975751
131	NC_016838	CTTG	2	8	58371	58378	0 %	50 %	25 %	25 %	378975751
132	NC_016838	GTCG	2	8	58669	58676	0 %	25 %	50 %	25 %	378975751
133	NC_016838	ATCG	2	8	58953	58960	25 %	25 %	25 %	25 %	378975751
134	NC_016838	CAGC	2	8	59007	59014	25 %	0 %	25 %	50 %	378975751
135	NC_016838	GTTT	2	8	59780	59787	0 %	75 %	25 %	0 %	378975751
136	NC_016838	GTGA	2	8	59835	59842	25 %	25 %	50 %	0 %	378975751
137	NC_016838	TGAT	2	8	60595	60602	25 %	50 %	25 %	0 %	378975751
138	NC_016838	TTGT	2	8	60942	60949	0 %	75 %	25 %	0 %	378975751
139	NC_016838	ACGG	2	8	60970	60977	25 %	0 %	50 %	25 %	378975751
140	NC_016838	AGAT	2	8	62045	62052	50 %	25 %	25 %	0 %	378975751
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142	NC_016838	TCAA	2	8	62753	62760	50 %	25 %	0 %	25 %	378975752
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282	NC_016838	GCAG	2	8	111113	111120	25 %	0 %	50 %	25 %	378975818
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302	NC_016838	TGAG	2	8	119886	119893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.