MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Krokinobacter sp. 4H-3-7-5 chromosome

Total Repeats: 2280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015496	TCCAC	2	10	2282	2291	20 %	20 %	0 %	60 %	332290653
2	NC_015496	TTTGA	2	10	5055	5064	20 %	60 %	20 %	0 %	332290654
3	NC_015496	AATTT	2	10	8936	8945	40 %	60 %	0 %	0 %	332290655
4	NC_015496	GTCTT	2	10	9859	9868	0 %	60 %	20 %	20 %	332290657
5	NC_015496	CTTAT	2	10	10458	10467	20 %	60 %	0 %	20 %	332290657
6	NC_015496	TCTAT	2	10	15329	15338	20 %	60 %	0 %	20 %	332290663
7	NC_015496	ACATT	2	10	15985	15994	40 %	40 %	0 %	20 %	332290664
8	NC_015496	TTTTG	2	10	19338	19347	0 %	80 %	20 %	0 %	332290666
9	NC_015496	AAGTT	2	10	21325	21334	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015496	CTTTT	2	10	21633	21642	0 %	80 %	0 %	20 %	332290667
11	NC_015496	CTGTA	2	10	23330	23339	20 %	40 %	20 %	20 %	332290668
12	NC_015496	TAACA	2	10	23619	23628	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015496	ATCAA	2	10	23672	23681	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015496	ACTCT	2	10	27778	27787	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015496	CTTGT	2	10	30052	30061	0 %	60 %	20 %	20 %	332290674
16	NC_015496	TAAGC	2	10	30430	30439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015496	ATATT	2	10	34049	34058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015496	ATTAT	2	10	35407	35416	40 %	60 %	0 %	0 %	332290678
19	NC_015496	GGTGA	2	10	38750	38759	20 %	20 %	60 %	0 %	332290682
20	NC_015496	CAATT	2	10	40320	40329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015496	GCTTT	2	10	43295	43304	0 %	60 %	20 %	20 %	332290686
22	NC_015496	TTTAC	2	10	45428	45437	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015496	TAATA	2	10	48378	48387	60 %	40 %	0 %	0 %	332290695
24	NC_015496	CAATT	2	10	48892	48901	40 %	40 %	0 %	20 %	332290695
25	NC_015496	GCAAT	2	10	50641	50650	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015496	AGCTT	2	10	50916	50925	20 %	40 %	20 %	20 %	332290697
27	NC_015496	TAAAG	2	10	54478	54487	60 %	20 %	20 %	0 %	332290700
28	NC_015496	TTTCG	2	10	54734	54743	0 %	60 %	20 %	20 %	332290701
29	NC_015496	AGAAC	2	10	56293	56302	60 %	0 %	20 %	20 %	332290701
30	NC_015496	TTTTA	2	10	56953	56962	20 %	80 %	0 %	0 %	332290702
31	NC_015496	GACTA	2	10	60108	60117	40 %	20 %	20 %	20 %	332290705
32	NC_015496	ATCTG	2	10	60445	60454	20 %	40 %	20 %	20 %	332290705
33	NC_015496	CTATC	2	10	62859	62868	20 %	40 %	0 %	40 %	332290708
34	NC_015496	TGATT	2	10	64819	64828	20 %	60 %	20 %	0 %	332290708
35	NC_015496	CCTTC	2	10	66067	66076	0 %	40 %	0 %	60 %	332290710
36	NC_015496	ACCTC	2	10	66412	66421	20 %	20 %	0 %	60 %	332290711
37	NC_015496	CATCA	2	10	66711	66720	40 %	20 %	0 %	40 %	332290711
38	NC_015496	CATTT	2	10	67434	67443	20 %	60 %	0 %	20 %	332290712
39	NC_015496	GCGAA	2	10	67729	67738	40 %	0 %	40 %	20 %	332290712
40	NC_015496	CTAGA	2	10	71123	71132	40 %	20 %	20 %	20 %	332290715
41	NC_015496	CATGT	2	10	78697	78706	20 %	40 %	20 %	20 %	332290721
42	NC_015496	GTTTG	2	10	83849	83858	0 %	60 %	40 %	0 %	332290726
43	NC_015496	CTTCC	2	10	86298	86307	0 %	40 %	0 %	60 %	332290728
44	NC_015496	AATTT	2	10	87670	87679	40 %	60 %	0 %	0 %	332290729
45	NC_015496	GTAAA	2	10	87853	87862	60 %	20 %	20 %	0 %	332290729
46	NC_015496	TATGA	2	10	93861	93870	40 %	40 %	20 %	0 %	332290734
47	NC_015496	TCTTT	2	10	94591	94600	0 %	80 %	0 %	20 %	332290735
48	NC_015496	AGGTA	2	10	97526	97535	40 %	20 %	40 %	0 %	332290739
49	NC_015496	GTTTT	2	10	98479	98488	0 %	80 %	20 %	0 %	332290739
50	NC_015496	GTAAG	2	10	99281	99290	40 %	20 %	40 %	0 %	332290739
51	NC_015496	GTGAT	2	10	100192	100201	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015496	AAAAT	2	10	102731	102740	80 %	20 %	0 %	0 %	332290743
53	NC_015496	GAAAA	2	10	103720	103729	80 %	0 %	20 %	0 %	332290744
54	NC_015496	AAACT	2	10	106037	106046	60 %	20 %	0 %	20 %	332290745
55	NC_015496	GGTAC	2	10	106405	106414	20 %	20 %	40 %	20 %	332290747
56	NC_015496	ACAAA	2	10	107768	107777	80 %	0 %	0 %	20 %	332290749
57	NC_015496	GAAAA	2	10	107784	107793	80 %	0 %	20 %	0 %	332290749
58	NC_015496	AAATT	2	10	108130	108139	60 %	40 %	0 %	0 %	332290749
59	NC_015496	GAAAT	2	10	108622	108631	60 %	20 %	20 %	0 %	332290750
60	NC_015496	ACATC	2	10	109467	109476	40 %	20 %	0 %	40 %	332290751
61	NC_015496	TAACA	2	10	109687	109696	60 %	20 %	0 %	20 %	332290751
62	NC_015496	CTAAA	2	10	111753	111762	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015496	CAAAG	2	10	111795	111804	60 %	0 %	20 %	20 %	332290754
64	NC_015496	CTTAA	2	10	111861	111870	40 %	40 %	0 %	20 %	332290754
65	NC_015496	CCTAC	2	10	113801	113810	20 %	20 %	0 %	60 %	332290755
66	NC_015496	TCATT	2	10	114741	114750	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015496	AGTAA	2	10	119645	119654	60 %	20 %	20 %	0 %	332290760
68	NC_015496	CAGTC	2	10	124833	124842	20 %	20 %	20 %	40 %	332290762
69	NC_015496	ACACA	2	10	129702	129711	60 %	0 %	0 %	40 %	332290762
70	NC_015496	TGCCT	2	10	130113	130122	0 %	40 %	20 %	40 %	332290762
71	NC_015496	AATTA	2	10	130371	130380	60 %	40 %	0 %	0 %	332290762
72	NC_015496	TAAAT	2	10	130566	130575	60 %	40 %	0 %	0 %	332290762
73	NC_015496	TTTTC	2	10	131613	131622	0 %	80 %	0 %	20 %	332290762
74	NC_015496	GGTTT	2	10	131687	131696	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015496	AATAG	2	10	131757	131766	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015496	AAATC	2	10	131995	132004	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015496	AGAGA	2	10	132805	132814	60 %	0 %	40 %	0 %	332290763
78	NC_015496	AATAC	2	10	133467	133476	60 %	20 %	0 %	20 %	332290763
79	NC_015496	TTACA	2	10	133655	133664	40 %	40 %	0 %	20 %	332290763
80	NC_015496	TAATG	2	10	135184	135193	40 %	40 %	20 %	0 %	332290764
81	NC_015496	ATGAT	2	10	135447	135456	40 %	40 %	20 %	0 %	332290765
82	NC_015496	GAATT	2	10	137238	137247	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015496	GCTAC	2	10	138504	138513	20 %	20 %	20 %	40 %	332290766
84	NC_015496	AAAAT	2	10	139536	139545	80 %	20 %	0 %	0 %	332290768
85	NC_015496	AAAAT	2	10	140233	140242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015496	AATAA	2	10	140428	140437	80 %	20 %	0 %	0 %	332290769
87	NC_015496	TTGAA	2	10	144216	144225	40 %	40 %	20 %	0 %	332290770
88	NC_015496	ATTGT	2	10	148270	148279	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015496	GAAAT	2	10	149071	149080	60 %	20 %	20 %	0 %	332290774
90	NC_015496	ATTTT	2	10	149644	149653	20 %	80 %	0 %	0 %	332290774
91	NC_015496	CTTGA	2	10	151777	151786	20 %	40 %	20 %	20 %	332290778
92	NC_015496	TGGGA	2	10	152071	152080	20 %	20 %	60 %	0 %	332290778
93	NC_015496	TATCT	2	10	152716	152725	20 %	60 %	0 %	20 %	332290779
94	NC_015496	GTACC	2	10	153657	153666	20 %	20 %	20 %	40 %	332290779
95	NC_015496	CATCC	2	10	154425	154434	20 %	20 %	0 %	60 %	332290779
96	NC_015496	GCACA	2	10	156943	156952	40 %	0 %	20 %	40 %	332290780
97	NC_015496	CTTGA	2	10	158395	158404	20 %	40 %	20 %	20 %	332290783
98	NC_015496	CATAT	2	10	159954	159963	40 %	40 %	0 %	20 %	332290785
99	NC_015496	ACCAT	2	10	163119	163128	40 %	20 %	0 %	40 %	332290788
100	NC_015496	CATCA	2	10	164912	164921	40 %	20 %	0 %	40 %	332290789
101	NC_015496	TTATT	2	10	167060	167069	20 %	80 %	0 %	0 %	332290789
102	NC_015496	CGCAG	2	10	167113	167122	20 %	0 %	40 %	40 %	332290789
103	NC_015496	AATTG	2	10	168808	168817	40 %	40 %	20 %	0 %	332290790
104	NC_015496	CTACT	2	10	171195	171204	20 %	40 %	0 %	40 %	332290793
105	NC_015496	GAAAA	2	10	171866	171875	80 %	0 %	20 %	0 %	332290793
106	NC_015496	TTTGA	2	10	173372	173381	20 %	60 %	20 %	0 %	332290795
107	NC_015496	TTAAA	2	10	174549	174558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015496	TAAAA	2	10	180845	180854	80 %	20 %	0 %	0 %	332290799
109	NC_015496	TAACA	2	10	182081	182090	60 %	20 %	0 %	20 %	332290800
110	NC_015496	AAAGG	2	10	182454	182463	60 %	0 %	40 %	0 %	332290801
111	NC_015496	CAAAT	2	10	191822	191831	60 %	20 %	0 %	20 %	332290810
112	NC_015496	ATAGA	2	10	192139	192148	60 %	20 %	20 %	0 %	332290810
113	NC_015496	AAAAG	2	10	192231	192240	80 %	0 %	20 %	0 %	332290810
114	NC_015496	GACCA	2	10	193639	193648	40 %	0 %	20 %	40 %	332290811
115	NC_015496	GACCA	2	10	194164	194173	40 %	0 %	20 %	40 %	332290811
116	NC_015496	ACTTC	2	10	197471	197480	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_015496	TATTG	2	10	198077	198086	20 %	60 %	20 %	0 %	332290812
118	NC_015496	TAACT	2	10	199663	199672	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015496	AAAGA	2	10	200012	200021	80 %	0 %	20 %	0 %	332290813
120	NC_015496	GAAAA	2	10	201019	201028	80 %	0 %	20 %	0 %	332290814
121	NC_015496	CATCC	2	10	203924	203933	20 %	20 %	0 %	60 %	332290817
122	NC_015496	GTATG	2	10	206975	206984	20 %	40 %	40 %	0 %	332290820
123	NC_015496	CAGAT	2	10	207810	207819	40 %	20 %	20 %	20 %	332290820
124	NC_015496	CCACA	2	10	208670	208679	40 %	0 %	0 %	60 %	332290821
125	NC_015496	ATATA	2	10	209433	209442	60 %	40 %	0 %	0 %	332290822
126	NC_015496	CTCTC	2	10	216010	216019	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_015496	TTGTG	2	10	217161	217170	0 %	60 %	40 %	0 %	332290829
128	NC_015496	TAATG	2	10	217888	217897	40 %	40 %	20 %	0 %	332290829
129	NC_015496	ATGTG	2	10	219047	219056	20 %	40 %	40 %	0 %	332290831
130	NC_015496	TTAAC	2	10	220157	220166	40 %	40 %	0 %	20 %	332290832
131	NC_015496	AATCA	2	10	220710	220719	60 %	20 %	0 %	20 %	332290832
132	NC_015496	AGCGC	2	10	221508	221517	20 %	0 %	40 %	40 %	332290833
133	NC_015496	CACAA	2	10	224597	224606	60 %	0 %	0 %	40 %	332290835
134	NC_015496	TACTT	2	10	225073	225082	20 %	60 %	0 %	20 %	332290836
135	NC_015496	AACTT	2	10	226512	226521	40 %	40 %	0 %	20 %	332290838
136	NC_015496	AAACT	2	10	227842	227851	60 %	20 %	0 %	20 %	332290839
137	NC_015496	TCTTT	2	10	229966	229975	0 %	80 %	0 %	20 %	332290841
138	NC_015496	GTTAC	2	10	230221	230230	20 %	40 %	20 %	20 %	332290841
139	NC_015496	AAATC	2	10	230239	230248	60 %	20 %	0 %	20 %	332290841
140	NC_015496	TGTGC	2	10	230770	230779	0 %	40 %	40 %	20 %	332290842
141	NC_015496	CCTGC	2	10	231684	231693	0 %	20 %	20 %	60 %	332290843
142	NC_015496	AACTT	2	10	235602	235611	40 %	40 %	0 %	20 %	332290847
143	NC_015496	TTAAA	2	10	236412	236421	60 %	40 %	0 %	0 %	332290848
144	NC_015496	ATATT	2	10	237881	237890	40 %	60 %	0 %	0 %	332290851
145	NC_015496	CTCCA	2	10	238858	238867	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_015496	GGAAA	2	10	240318	240327	60 %	0 %	40 %	0 %	332290855
147	NC_015496	TTATT	2	10	241659	241668	20 %	80 %	0 %	0 %	332290856
148	NC_015496	CTGGA	2	10	244351	244360	20 %	20 %	40 %	20 %	332290857
149	NC_015496	TACCT	2	10	246510	246519	20 %	40 %	0 %	40 %	332290859
150	NC_015496	ACAAA	2	10	246851	246860	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_015496	ACTCA	2	10	247681	247690	40 %	20 %	0 %	40 %	332290860
152	NC_015496	ACACT	2	10	250291	250300	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
153	NC_015496	GTGTT	2	10	251871	251880	0 %	60 %	40 %	0 %	332290863
154	NC_015496	AGTTT	2	10	252922	252931	20 %	60 %	20 %	0 %	332290865
155	NC_015496	ATAGT	2	10	253541	253550	40 %	40 %	20 %	0 %	332290865
156	NC_015496	GTTCC	2	10	253830	253839	0 %	40 %	20 %	40 %	332290865
157	NC_015496	TTATT	2	10	254431	254440	20 %	80 %	0 %	0 %	332290865
158	NC_015496	AGATA	2	10	255256	255265	60 %	20 %	20 %	0 %	332290866
159	NC_015496	TCAAA	2	10	256565	256574	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_015496	ACCAC	2	10	256674	256683	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
161	NC_015496	GCTCT	2	10	257802	257811	0 %	40 %	20 %	40 %	332290869
162	NC_015496	TGTGT	2	10	258327	258336	0 %	60 %	40 %	0 %	332290870
163	NC_015496	TTGCA	2	10	260839	260848	20 %	40 %	20 %	20 %	332290872
164	NC_015496	ACCAT	2	10	262952	262961	40 %	20 %	0 %	40 %	332290874
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167	NC_015496	TGCTT	2	10	268490	268499	0 %	60 %	20 %	20 %	332290878
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169	NC_015496	GTTAA	2	10	269571	269580	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015496	TAAAA	2	10	269776	269785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015496	TTTCC	2	10	270778	270787	0 %	60 %	0 %	40 %	332290879
172	NC_015496	ATTTT	2	10	273645	273654	20 %	80 %	0 %	0 %	332290882
173	NC_015496	ATGTC	2	10	277195	277204	20 %	40 %	20 %	20 %	332290885
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175	NC_015496	TCTTT	2	10	279276	279285	0 %	80 %	0 %	20 %	332290888
176	NC_015496	CTTCT	2	10	279471	279480	0 %	60 %	0 %	40 %	332290888
177	NC_015496	TACGC	2	10	280051	280060	20 %	20 %	20 %	40 %	332290889
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179	NC_015496	CTTTT	2	10	281841	281850	0 %	80 %	0 %	20 %	332290891
180	NC_015496	ACATC	2	10	282296	282305	40 %	20 %	0 %	40 %	332290891
181	NC_015496	TATCT	2	10	282388	282397	20 %	60 %	0 %	20 %	332290891
182	NC_015496	CGTGA	2	10	284325	284334	20 %	20 %	40 %	20 %	332290893
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184	NC_015496	AAATT	2	10	286122	286131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015496	AATGC	2	10	286420	286429	40 %	20 %	20 %	20 %	332290894
186	NC_015496	TCTTA	2	10	287326	287335	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_015496	AGCTT	2	10	287492	287501	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
188	NC_015496	TCATA	2	10	288667	288676	40 %	40 %	0 %	20 %	332290897
189	NC_015496	ATAAA	2	10	289390	289399	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015496	CAACC	2	10	290199	290208	40 %	0 %	0 %	60 %	332290898
191	NC_015496	TTTCA	2	10	291021	291030	20 %	60 %	0 %	20 %	332290899
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215	NC_015496	TCTTT	2	10	331951	331960	0 %	80 %	0 %	20 %	332290938
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220	NC_015496	AATTA	2	10	338630	338639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_015496	CCTAT	2	10	338999	339008	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
222	NC_015496	TATTT	2	10	339355	339364	20 %	80 %	0 %	0 %	332290945
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234	NC_015496	ATTAA	2	10	356703	356712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_015496	TTTGA	2	10	357353	357362	20 %	60 %	20 %	0 %	332290960
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238	NC_015496	TGTTT	2	10	359660	359669	0 %	80 %	20 %	0 %	332290961
239	NC_015496	TATAA	2	10	364373	364382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_015496	TCAAT	2	10	365751	365760	40 %	40 %	0 %	20 %	332290964
241	NC_015496	CAATA	2	10	366778	366787	60 %	20 %	0 %	20 %	332290967
242	NC_015496	ATTGA	2	10	368162	368171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_015496	AATAA	2	10	398540	398549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015496	GCGAT	2	10	400759	400768	20 %	20 %	40 %	20 %	332290986
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