MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Krokinobacter sp. 4H-3-7-5 chromosome

Total Repeats: 72866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015496	TAT	2	6	24419	24424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290669
502	NC_015496	TA	3	6	24426	24431	50 %	50 %	0 %	0 %	332290669
503	NC_015496	TCC	2	6	24453	24458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290669
504	NC_015496	GTA	2	6	24473	24478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290669
505	NC_015496	TACT	2	8	24611	24618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_015496	TA	3	6	24621	24626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015496	ATG	2	6	24778	24783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290670
508	NC_015496	ATA	2	6	24805	24810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290670
509	NC_015496	AAG	2	6	24937	24942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290670
510	NC_015496	CTT	2	6	24954	24959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290670
511	NC_015496	CAT	2	6	24980	24985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290670
512	NC_015496	TG	3	6	25106	25111	0 %	50 %	50 %	0 %	332290670
513	NC_015496	TGG	2	6	25139	25144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332290670
514	NC_015496	TAC	2	6	25213	25218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290670
515	NC_015496	GAAT	2	8	25237	25244	50 %	25 %	25 %	0 %	332290670
516	NC_015496	ATT	2	6	25316	25321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290670
517	NC_015496	TGC	2	6	25325	25330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290670
518	NC_015496	AAG	2	6	25390	25395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290670
519	NC_015496	GA	3	6	25426	25431	50 %	0 %	50 %	0 %	332290670
520	NC_015496	AAAC	2	8	25554	25561	75 %	0 %	0 %	25 %	332290670
521	NC_015496	GA	3	6	25667	25672	50 %	0 %	50 %	0 %	332290670
522	NC_015496	AT	3	6	25694	25699	50 %	50 %	0 %	0 %	332290670
523	NC_015496	CGT	2	6	25728	25733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290670
524	NC_015496	GCAA	2	8	25800	25807	50 %	0 %	25 %	25 %	332290670
525	NC_015496	T	6	6	25967	25972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015496	CAT	2	6	26055	26060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290671
527	NC_015496	A	6	6	26068	26073	100 %	0 %	0 %	0 %	332290671
528	NC_015496	A	6	6	26105	26110	100 %	0 %	0 %	0 %	332290671
529	NC_015496	ACT	2	6	26242	26247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290671
530	NC_015496	AC	3	6	26289	26294	50 %	0 %	0 %	50 %	332290671
531	NC_015496	AT	3	6	26296	26301	50 %	50 %	0 %	0 %	332290671
532	NC_015496	ACA	2	6	26379	26384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290671
533	NC_015496	TAA	2	6	26416	26421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290671
534	NC_015496	ACA	2	6	26445	26450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290671
535	NC_015496	AGA	2	6	26530	26535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290671
536	NC_015496	A	6	6	26548	26553	100 %	0 %	0 %	0 %	332290671
537	NC_015496	CAAAGG	2	12	26599	26610	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332290671
538	NC_015496	AT	3	6	26611	26616	50 %	50 %	0 %	0 %	332290671
539	NC_015496	AGA	2	6	26617	26622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290671
540	NC_015496	GAA	2	6	26633	26638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290671
541	NC_015496	ACT	2	6	26664	26669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290671
542	NC_015496	AGC	2	6	26682	26687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290671
543	NC_015496	GCA	2	6	26729	26734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290671
544	NC_015496	GAA	2	6	26753	26758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290671
545	NC_015496	AG	3	6	26798	26803	50 %	0 %	50 %	0 %	332290671
546	NC_015496	TAT	2	6	26825	26830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290671
547	NC_015496	AT	3	6	26852	26857	50 %	50 %	0 %	0 %	332290671
548	NC_015496	A	6	6	26866	26871	100 %	0 %	0 %	0 %	332290671
549	NC_015496	TAA	2	6	26899	26904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290671
550	NC_015496	TTG	2	6	26946	26951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290671
551	NC_015496	CT	3	6	26978	26983	0 %	50 %	0 %	50 %	332290671
552	NC_015496	ATG	2	6	27018	27023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290671
553	NC_015496	GCA	2	6	27142	27147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_015496	AATT	2	8	27178	27185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015496	TAA	2	6	27231	27236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290672
556	NC_015496	CAC	2	6	27240	27245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290672
557	NC_015496	GCA	2	6	27260	27265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290672
558	NC_015496	AGA	2	6	27303	27308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290672
559	NC_015496	AAT	2	6	27346	27351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290672
560	NC_015496	AAG	2	6	27458	27463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290672
561	NC_015496	TCT	2	6	27477	27482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290672
562	NC_015496	ATG	2	6	27487	27492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290672
563	NC_015496	AGA	2	6	27498	27503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290672
564	NC_015496	AGA	3	9	27543	27551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290672
565	NC_015496	ATT	2	6	27562	27567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290672
566	NC_015496	A	6	6	27762	27767	100 %	0 %	0 %	0 %	332290672
567	NC_015496	ACTCT	2	10	27778	27787	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
568	NC_015496	A	6	6	27803	27808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015496	T	9	9	27829	27837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015496	TTGC	2	8	27887	27894	0 %	50 %	25 %	25 %	332290673
571	NC_015496	CTG	2	6	27929	27934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290673
572	NC_015496	TGCACG	2	12	28017	28028	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332290673
573	NC_015496	TAA	2	6	28032	28037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290673
574	NC_015496	GTA	2	6	28066	28071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290673
575	NC_015496	TA	3	6	28070	28075	50 %	50 %	0 %	0 %	332290673
576	NC_015496	T	6	6	28102	28107	0 %	100 %	0 %	0 %	332290673
577	NC_015496	TCCT	2	8	28152	28159	0 %	50 %	0 %	50 %	332290673
578	NC_015496	TGA	2	6	28189	28194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290673
579	NC_015496	TTC	2	6	28203	28208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290673
580	NC_015496	TGC	2	6	28212	28217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290673
581	NC_015496	TGC	2	6	28260	28265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290673
582	NC_015496	ACC	2	6	28290	28295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290673
583	NC_015496	TGT	2	6	28350	28355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290673
584	NC_015496	CT	3	6	28362	28367	0 %	50 %	0 %	50 %	332290673
585	NC_015496	ACC	2	6	28377	28382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290673
586	NC_015496	CTT	2	6	28421	28426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290673
587	NC_015496	ACT	2	6	28449	28454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290673
588	NC_015496	ACA	2	6	28456	28461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290673
589	NC_015496	CAC	2	6	28464	28469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290673
590	NC_015496	CTT	2	6	28482	28487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290673
591	NC_015496	CTA	2	6	28550	28555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290673
592	NC_015496	TTA	2	6	28615	28620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290673
593	NC_015496	T	6	6	28626	28631	0 %	100 %	0 %	0 %	332290673
594	NC_015496	GCT	2	6	28675	28680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290673
595	NC_015496	T	6	6	28868	28873	0 %	100 %	0 %	0 %	332290674
596	NC_015496	TTG	2	6	28901	28906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290674
597	NC_015496	TCT	2	6	28927	28932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290674
598	NC_015496	AATACT	2	12	28983	28994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332290674
599	NC_015496	TGC	2	6	29084	29089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290674
600	NC_015496	CAT	2	6	29165	29170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290674
601	NC_015496	TGCC	2	8	29195	29202	0 %	25 %	25 %	50 %	332290674
602	NC_015496	AGCT	2	8	29206	29213	25 %	25 %	25 %	25 %	332290674
603	NC_015496	ATT	2	6	29226	29231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290674
604	NC_015496	ATT	2	6	29252	29257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290674
605	NC_015496	TGT	2	6	29258	29263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290674
606	NC_015496	TAC	2	6	29350	29355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290674
607	NC_015496	GC	3	6	29422	29427	0 %	0 %	50 %	50 %	332290674
608	NC_015496	AGT	2	6	29513	29518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290674
609	NC_015496	CCAT	2	8	29523	29530	25 %	25 %	0 %	50 %	332290674
610	NC_015496	TATT	2	8	29587	29594	25 %	75 %	0 %	0 %	332290674
611	NC_015496	TTC	2	6	29645	29650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290674
612	NC_015496	TCT	2	6	29673	29678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290674
613	NC_015496	AGC	2	6	29696	29701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290674
614	NC_015496	ATT	3	9	29867	29875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290674
615	NC_015496	AG	3	6	29954	29959	50 %	0 %	50 %	0 %	332290674
616	NC_015496	CTTGT	2	10	30052	30061	0 %	60 %	20 %	20 %	332290674
617	NC_015496	TA	3	6	30083	30088	50 %	50 %	0 %	0 %	332290674
618	NC_015496	TG	3	6	30285	30290	0 %	50 %	50 %	0 %	332290674
619	NC_015496	A	6	6	30341	30346	100 %	0 %	0 %	0 %	332290674
620	NC_015496	CTG	2	6	30359	30364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290674
621	NC_015496	AGT	2	6	30402	30407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015496	AAG	2	6	30423	30428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015496	TAAGC	2	10	30430	30439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
624	NC_015496	ATG	2	6	30497	30502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290675
625	NC_015496	TACA	2	8	30554	30561	50 %	25 %	0 %	25 %	332290675
626	NC_015496	TCT	3	9	30681	30689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290675
627	NC_015496	T	6	6	30726	30731	0 %	100 %	0 %	0 %	332290675
628	NC_015496	ACC	2	6	30861	30866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290675
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630	NC_015496	ACC	2	6	30947	30952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290675
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760	NC_015496	GGT	3	9	37314	37322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332290680
761	NC_015496	TAT	2	6	37430	37435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290680
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764	NC_015496	AGC	2	6	37734	37739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290681
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772	NC_015496	T	6	6	38124	38129	0 %	100 %	0 %	0 %	332290681
773	NC_015496	TAA	2	6	38171	38176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290681
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784	NC_015496	A	7	7	38844	38850	100 %	0 %	0 %	0 %	332290682
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790	NC_015496	T	6	6	39283	39288	0 %	100 %	0 %	0 %	332290683
791	NC_015496	CTT	2	6	39362	39367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290683
792	NC_015496	AAGT	2	8	39404	39411	50 %	25 %	25 %	0 %	332290683
793	NC_015496	TA	4	8	39423	39430	50 %	50 %	0 %	0 %	332290683
794	NC_015496	T	6	6	39432	39437	0 %	100 %	0 %	0 %	332290683
795	NC_015496	CAT	2	6	39438	39443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290683
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797	NC_015496	CTT	2	6	39526	39531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290684
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883	NC_015496	ACC	2	6	43257	43262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290686
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885	NC_015496	ATC	2	6	43284	43289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290686
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