MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP12

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014626	CGATG	2	10	832	841	20 %	20 %	40 %	20 %	310830142
2	NC_014626	GCCCC	2	10	1380	1389	0 %	0 %	20 %	80 %	310830144
3	NC_014626	CATCG	2	10	1644	1653	20 %	20 %	20 %	40 %	310830144
4	NC_014626	TCGCC	2	10	2815	2824	0 %	20 %	20 %	60 %	310830145
5	NC_014626	GCCGC	2	10	2961	2970	0 %	0 %	40 %	60 %	310830145
6	NC_014626	CATCG	2	10	3359	3368	20 %	20 %	20 %	40 %	310830145
7	NC_014626	CCCCG	2	10	4922	4931	0 %	0 %	20 %	80 %	310830147
8	NC_014626	CCGGG	2	10	8731	8740	0 %	0 %	60 %	40 %	310830149
9	NC_014626	CAGCG	2	10	9158	9167	20 %	0 %	40 %	40 %	310830149
10	NC_014626	TACTT	2	10	10855	10864	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014626	GTGAA	2	10	14432	14441	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014626	CCATG	2	10	18043	18052	20 %	20 %	20 %	40 %	310830158
13	NC_014626	TGATC	2	10	20684	20693	20 %	40 %	20 %	20 %	310830161
14	NC_014626	GCCCC	2	10	22770	22779	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_014626	GGCGC	2	10	28022	28031	0 %	0 %	60 %	40 %	310830167
16	NC_014626	ATTTC	2	10	30079	30088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014626	GAGCT	2	10	31064	31073	20 %	20 %	40 %	20 %	310830169
18	NC_014626	TATGG	2	10	31448	31457	20 %	40 %	40 %	0 %	310830170
19	NC_014626	TCGGC	2	10	33099	33108	0 %	20 %	40 %	40 %	310830172
20	NC_014626	CGCGC	2	10	33202	33211	0 %	0 %	40 %	60 %	310830172
21	NC_014626	TCGCG	2	10	33357	33366	0 %	20 %	40 %	40 %	310830173
22	NC_014626	GGCGC	2	10	34230	34239	0 %	0 %	60 %	40 %	310830174
23	NC_014626	GCCGC	2	10	35497	35506	0 %	0 %	40 %	60 %	310830175
24	NC_014626	GGCGA	2	10	36010	36019	20 %	0 %	60 %	20 %	310830176
25	NC_014626	ACTGG	2	10	41143	41152	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014626	AGCGC	2	10	42304	42313	20 %	0 %	40 %	40 %	310830183
27	NC_014626	GCGCG	2	10	47437	47446	0 %	0 %	60 %	40 %	310830189
28	NC_014626	CGCGG	3	15	49741	49755	0 %	0 %	60 %	40 %	310830192
29	NC_014626	GCGCC	2	10	49977	49986	0 %	0 %	40 %	60 %	310830192
30	NC_014626	CGCTT	2	10	49990	49999	0 %	40 %	20 %	40 %	310830192
31	NC_014626	TGCCC	2	10	51286	51295	0 %	20 %	20 %	60 %	310830193
32	NC_014626	GCTTG	2	10	51409	51418	0 %	40 %	40 %	20 %	310830193
33	NC_014626	GATCA	2	10	53109	53118	40 %	20 %	20 %	20 %	310830194
34	NC_014626	GGCGG	3	15	54347	54361	0 %	0 %	80 %	20 %	310830195
35	NC_014626	GGCGA	2	10	54479	54488	20 %	0 %	60 %	20 %	310830195
36	NC_014626	GGGCG	2	10	54865	54874	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014626	CCGGG	2	10	55014	55023	0 %	0 %	60 %	40 %	310830196
38	NC_014626	GCAGG	2	10	55260	55269	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014626	GGGCA	2	10	57223	57232	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014626	CCCGC	2	10	58401	58410	0 %	0 %	20 %	80 %	310830200
41	NC_014626	GATCG	2	10	58446	58455	20 %	20 %	40 %	20 %	310830200
42	NC_014626	GGCCG	2	10	58873	58882	0 %	0 %	60 %	40 %	310830200
43	NC_014626	TGCCG	2	10	59198	59207	0 %	20 %	40 %	40 %	310830200
44	NC_014626	GCCTC	2	10	59922	59931	0 %	20 %	20 %	60 %	310830201
45	NC_014626	CCAAG	2	10	61026	61035	40 %	0 %	20 %	40 %	310830203
46	NC_014626	TCGCC	2	10	61798	61807	0 %	20 %	20 %	60 %	310830204
47	NC_014626	AGGGC	2	10	63116	63125	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014626	GCCGC	2	10	63779	63788	0 %	0 %	40 %	60 %	310830206
49	NC_014626	GGAAA	2	10	64251	64260	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014626	TCGCC	2	10	64687	64696	0 %	20 %	20 %	60 %	310830207
51	NC_014626	CGGTG	2	10	65366	65375	0 %	20 %	60 %	20 %	310830207
52	NC_014626	GCGCG	2	10	67822	67831	0 %	0 %	60 %	40 %	310830210
53	NC_014626	GCCGC	2	10	68324	68333	0 %	0 %	40 %	60 %	310830210
54	NC_014626	GGGGC	2	10	68485	68494	0 %	0 %	80 %	20 %	310830210
55	NC_014626	TGCCG	2	10	69139	69148	0 %	20 %	40 %	40 %	310830210
56	NC_014626	ATCGC	2	10	71901	71910	20 %	20 %	20 %	40 %	310830213
57	NC_014626	TCAGG	2	10	72190	72199	20 %	20 %	40 %	20 %	310830213
58	NC_014626	TGGCA	2	10	72571	72580	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014626	GGCGA	2	10	74192	74201	20 %	0 %	60 %	20 %	310830215
60	NC_014626	ATCGG	2	10	74238	74247	20 %	20 %	40 %	20 %	310830215
61	NC_014626	ATGCG	2	10	74732	74741	20 %	20 %	40 %	20 %	310830216
62	NC_014626	GCGCC	2	10	75854	75863	0 %	0 %	40 %	60 %	310830217
63	NC_014626	GACCT	2	10	77547	77556	20 %	20 %	20 %	40 %	310830218
64	NC_014626	GGTCA	2	10	77787	77796	20 %	20 %	40 %	20 %	310830218
65	NC_014626	CCTCG	2	10	79508	79517	0 %	20 %	20 %	60 %	310830220
66	NC_014626	TGACC	2	10	80410	80419	20 %	20 %	20 %	40 %	310830220
67	NC_014626	CGGAT	2	10	80511	80520	20 %	20 %	40 %	20 %	310830220
68	NC_014626	GGCCG	2	10	82032	82041	0 %	0 %	60 %	40 %	310830221
69	NC_014626	TCGAA	2	10	83469	83478	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014626	TCTGT	2	10	93199	93208	0 %	60 %	20 %	20 %	310830230
71	NC_014626	CACCG	2	10	93363	93372	20 %	0 %	20 %	60 %	310830230
72	NC_014626	CGGGC	2	10	94552	94561	0 %	0 %	60 %	40 %	310830232
73	NC_014626	GATCA	2	10	95272	95281	40 %	20 %	20 %	20 %	310830233
74	NC_014626	GCCGC	2	10	95562	95571	0 %	0 %	40 %	60 %	310830233
75	NC_014626	AGCTG	2	10	98395	98404	20 %	20 %	40 %	20 %	310830235
76	NC_014626	GCGTT	2	10	98674	98683	0 %	40 %	40 %	20 %	310830235
77	NC_014626	CGCAT	2	10	98946	98955	20 %	20 %	20 %	40 %	310830235
78	NC_014626	TTGCC	2	10	99049	99058	0 %	40 %	20 %	40 %	310830235
79	NC_014626	CAAGC	2	10	99106	99115	40 %	0 %	20 %	40 %	310830235
80	NC_014626	GGCCG	2	10	99161	99170	0 %	0 %	60 %	40 %	310830235
81	NC_014626	CGATC	2	10	99245	99254	20 %	20 %	20 %	40 %	310830235
82	NC_014626	GCCGC	2	10	99992	100001	0 %	0 %	40 %	60 %	310830235
83	NC_014626	GGCGC	2	10	100665	100674	0 %	0 %	60 %	40 %	310830236
84	NC_014626	GGCGC	2	10	101193	101202	0 %	0 %	60 %	40 %	310830236
85	NC_014626	GGCGA	2	10	103913	103922	20 %	0 %	60 %	20 %	310830239
86	NC_014626	CCAGA	2	10	104017	104026	40 %	0 %	20 %	40 %	310830239
87	NC_014626	GAACC	2	10	105467	105476	40 %	0 %	20 %	40 %	310830240
88	NC_014626	GATCG	2	10	106011	106020	20 %	20 %	40 %	20 %	310830240
89	NC_014626	CCGAT	2	10	106713	106722	20 %	20 %	20 %	40 %	310830241
90	NC_014626	CGGCG	2	10	109332	109341	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014626	CCGCG	2	10	109698	109707	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_014626	TATGA	2	10	110162	110171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014626	TGTCG	2	10	110494	110503	0 %	40 %	40 %	20 %	310830245
94	NC_014626	CCGCG	2	10	111701	111710	0 %	0 %	40 %	60 %	310830246
95	NC_014626	TCTTT	2	10	113651	113660	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014626	TGCGC	2	10	114201	114210	0 %	20 %	40 %	40 %	310830248
97	NC_014626	GGGGC	2	10	115776	115785	0 %	0 %	80 %	20 %	310830250
98	NC_014626	CACCG	2	10	116044	116053	20 %	0 %	20 %	60 %	310830250
99	NC_014626	CGCGG	2	10	117153	117162	0 %	0 %	60 %	40 %	310830251
100	NC_014626	CAGTA	2	10	118297	118306	40 %	20 %	20 %	20 %	310830252
101	NC_014626	CGGAT	2	10	119456	119465	20 %	20 %	40 %	20 %	310830253
102	NC_014626	GCCGC	2	10	119651	119660	0 %	0 %	40 %	60 %	310830253
103	NC_014626	GGTCG	2	10	121045	121054	0 %	20 %	60 %	20 %	310830255
104	NC_014626	CGGCG	2	10	121535	121544	0 %	0 %	60 %	40 %	310830255
105	NC_014626	CGGCG	2	10	125409	125418	0 %	0 %	60 %	40 %	310830259
106	NC_014626	CACGG	2	10	125421	125430	20 %	0 %	40 %	40 %	310830259
107	NC_014626	CTGCC	2	10	125506	125515	0 %	20 %	20 %	60 %	310830259
108	NC_014626	CGGCG	2	10	126251	126260	0 %	0 %	60 %	40 %	310830260
109	NC_014626	GGCCG	2	10	126489	126498	0 %	0 %	60 %	40 %	310830261
110	NC_014626	GCGCC	2	10	126783	126792	0 %	0 %	40 %	60 %	310830261
111	NC_014626	CGCGC	2	10	126883	126892	0 %	0 %	40 %	60 %	310830261
112	NC_014626	ACCGC	2	10	128125	128134	20 %	0 %	20 %	60 %	310830262
113	NC_014626	TGATC	2	10	128663	128672	20 %	40 %	20 %	20 %	310830263
114	NC_014626	GCGAT	2	10	129316	129325	20 %	20 %	40 %	20 %	310830263
115	NC_014626	GGGTC	2	10	131398	131407	0 %	20 %	60 %	20 %	310830266
116	NC_014626	CGCTG	2	10	133275	133284	0 %	20 %	40 %	40 %	310830267
117	NC_014626	CTGGC	2	10	135908	135917	0 %	20 %	40 %	40 %	310830271
118	NC_014626	GCTGC	2	10	136353	136362	0 %	20 %	40 %	40 %	310830272
119	NC_014626	GGCGC	2	10	136779	136788	0 %	0 %	60 %	40 %	310830272
120	NC_014626	TCGGC	2	10	137731	137740	0 %	20 %	40 %	40 %	310830273
121	NC_014626	GTTGG	2	10	140888	140897	0 %	40 %	60 %	0 %	310830277
122	NC_014626	CCGGG	2	10	142952	142961	0 %	0 %	60 %	40 %	310830281
123	NC_014626	AGCGC	2	10	144091	144100	20 %	0 %	40 %	40 %	310830281
124	NC_014626	GACCG	2	10	145975	145984	20 %	0 %	40 %	40 %	310830283
125	NC_014626	GGCCG	2	10	145998	146007	0 %	0 %	60 %	40 %	310830283
126	NC_014626	TGGAA	2	10	146663	146672	40 %	20 %	40 %	0 %	310830283
127	NC_014626	CCCGC	2	10	147431	147440	0 %	0 %	20 %	80 %	310830284
128	NC_014626	GGTTC	2	10	149643	149652	0 %	40 %	40 %	20 %	310830284
129	NC_014626	GCGCG	2	10	151139	151148	0 %	0 %	60 %	40 %	310830285
130	NC_014626	AAGGT	2	10	151381	151390	40 %	20 %	40 %	0 %	310830285
131	NC_014626	TGCGC	2	10	151935	151944	0 %	20 %	40 %	40 %	310830285
132	NC_014626	CCCTC	2	10	152544	152553	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
133	NC_014626	CCGGA	2	10	153493	153502	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014626	AGCGC	3	15	155041	155055	20 %	0 %	40 %	40 %	310830288
135	NC_014626	GGCAA	2	10	157046	157055	40 %	0 %	40 %	20 %	310830288
136	NC_014626	GCACG	2	10	158039	158048	20 %	0 %	40 %	40 %	310830289
137	NC_014626	GAGCG	2	10	159631	159640	20 %	0 %	60 %	20 %	310830290
138	NC_014626	AGGCG	2	10	160528	160537	20 %	0 %	60 %	20 %	310830292
139	NC_014626	CGGCG	2	10	161063	161072	0 %	0 %	60 %	40 %	310830293
140	NC_014626	TGCGC	2	10	161352	161361	0 %	20 %	40 %	40 %	310830293
141	NC_014626	CGCAG	2	10	162549	162558	20 %	0 %	40 %	40 %	310830294
142	NC_014626	CGCGC	2	10	164703	164712	0 %	0 %	40 %	60 %	310830296
143	NC_014626	GACCT	2	10	165337	165346	20 %	20 %	20 %	40 %	310830297
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146	NC_014626	ATGCG	2	10	166224	166233	20 %	20 %	40 %	20 %	310830298
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151	NC_014626	GTTCT	2	10	173033	173042	0 %	60 %	20 %	20 %	310830308
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155	NC_014626	GCGCC	2	10	177123	177132	0 %	0 %	40 %	60 %	310830312
156	NC_014626	CGCCC	2	10	178048	178057	0 %	0 %	20 %	80 %	310830312
157	NC_014626	CCCGC	2	10	178102	178111	0 %	0 %	20 %	80 %	310830312
158	NC_014626	GCCTG	2	10	178335	178344	0 %	20 %	40 %	40 %	310830312
159	NC_014626	GGGTG	2	10	178817	178826	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014626	CGCGC	2	10	179183	179192	0 %	0 %	40 %	60 %	310830313
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166	NC_014626	GGGCC	2	10	181173	181182	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
167	NC_014626	AGGCG	2	10	181506	181515	20 %	0 %	60 %	20 %	310830314
168	NC_014626	TGCCG	2	10	182957	182966	0 %	20 %	40 %	40 %	310830315
169	NC_014626	CCTCG	2	10	183221	183230	0 %	20 %	20 %	60 %	310830315
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171	NC_014626	CGCGC	2	10	183930	183939	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
172	NC_014626	GCCCT	2	10	184969	184978	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
173	NC_014626	GGCGC	2	10	185017	185026	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
174	NC_014626	GCCGC	2	10	186538	186547	0 %	0 %	40 %	60 %	310830316
175	NC_014626	CATGG	2	10	187534	187543	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
176	NC_014626	CGCTG	2	10	188978	188987	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
177	NC_014626	GCGCC	2	10	189147	189156	0 %	0 %	40 %	60 %	310830317
178	NC_014626	GCCGG	2	10	189660	189669	0 %	0 %	60 %	40 %	310830317
179	NC_014626	GCCTT	2	10	191043	191052	0 %	40 %	20 %	40 %	310830318
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182	NC_014626	TGGCA	2	10	194174	194183	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
183	NC_014626	TTGGG	2	10	194231	194240	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014626	TGCGC	2	10	194724	194733	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
185	NC_014626	CGATG	2	10	195344	195353	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
186	NC_014626	GGACC	2	10	198458	198467	20 %	0 %	40 %	40 %	310830324
187	NC_014626	GACGG	2	10	199411	199420	20 %	0 %	60 %	20 %	310830324
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217	NC_014626	ATCCG	2	10	235921	235930	20 %	20 %	20 %	40 %	310830355
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226	NC_014626	TCGCC	2	10	242775	242784	0 %	20 %	20 %	60 %	310830361
227	NC_014626	AAATG	2	10	243633	243642	60 %	20 %	20 %	0 %	310830361

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.