MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Kosmotoga olearia TBF 19.5.1

Total Repeats: 689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012785	TTTCGG	2	12	1686	1697	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	239616413
2	NC_012785	GCTGTA	2	12	8253	8264	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	239616420
3	NC_012785	GAAAGA	2	12	9573	9584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239616420
4	NC_012785	AAGTAA	2	12	11755	11766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239616422
5	NC_012785	TATTAC	2	12	20368	20379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	239616425
6	NC_012785	GGTAAG	2	12	22103	22114	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	239616427
7	NC_012785	TTATCT	2	12	29745	29756	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239616432
8	NC_012785	ACTGTA	2	12	31182	31193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239616433
9	NC_012785	AGCTAC	2	12	34550	34561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239616436
10	NC_012785	TGAGGT	2	12	35751	35762	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	239616438
11	NC_012785	GAAAGA	2	12	37453	37464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239616440
12	NC_012785	CTTCAC	2	12	40072	40083	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	239616442
13	NC_012785	CTTTAT	2	12	44888	44899	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239616449
14	NC_012785	TGTTCC	2	12	51887	51898	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239616456
15	NC_012785	TCAACC	2	12	56515	56526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	239616458
16	NC_012785	TCCAGC	2	12	64477	64488	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239616464
17	NC_012785	AGAAAA	2	12	64882	64893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	239616464
18	NC_012785	AAAAAC	2	12	70216	70227	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	239616467
19	NC_012785	TTTACC	2	12	71506	71517	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	239616469
20	NC_012785	TAAAGA	2	12	76006	76017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239616472
21	NC_012785	TTCTAC	2	12	77317	77328	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	239616473
22	NC_012785	TCTTTT	2	12	80216	80227	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239616477
23	NC_012785	TCTTTT	2	12	81183	81194	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239616478
24	NC_012785	TATTTT	2	12	81229	81240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	239616478
25	NC_012785	TATTTT	2	12	82408	82419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012785	TATTCT	2	12	85155	85166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239616481
27	NC_012785	TATTTT	2	12	88206	88217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012785	GTGGAA	2	12	91319	91330	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	239616487
29	NC_012785	CGATTC	2	12	92449	92460	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	239616488
30	NC_012785	TCAAAG	2	12	94122	94133	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239616489
31	NC_012785	GGATTT	2	12	95535	95546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	239616490
32	NC_012785	GAGGCT	2	12	97583	97594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012785	GAGGCT	2	12	98735	98746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012785	AGGGAA	2	12	100551	100562	50 %	0 %	50 %	0 %	239616495
35	NC_012785	GAAGAT	2	12	107919	107930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	239616503
36	NC_012785	AGAAAA	2	12	109958	109969	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	239616505
37	NC_012785	AAAATG	2	12	111197	111208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239616506
38	NC_012785	CTTTTT	2	12	113386	113397	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012785	TATTTT	2	12	113408	113419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012785	GGATCA	2	12	120064	120075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239616513
41	NC_012785	CTTTTT	2	12	120992	121003	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239616515
42	NC_012785	TACATT	2	12	127233	127244	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	239616520
43	NC_012785	CTGACA	2	12	137104	137115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239616529
44	NC_012785	AATAGC	2	12	151353	151364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239616542
45	NC_012785	AATCGC	2	12	151875	151886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239616542
46	NC_012785	TGGTAA	2	12	152339	152350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239616543
47	NC_012785	TGCTGT	2	12	152901	152912	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	239616543
48	NC_012785	TTTTCT	2	12	156224	156235	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239616546
49	NC_012785	AGCCTC	2	12	160248	160259	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012785	ATCGAA	2	12	161075	161086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239616551
51	NC_012785	GGAATT	2	12	161431	161442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239616551
52	NC_012785	AACACA	2	12	168988	168999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239616559
53	NC_012785	AAATTA	2	12	173576	173587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012785	CCTTTC	2	12	176061	176072	0 %	50 %	0 %	50 %	239616567
55	NC_012785	TGAATG	2	12	180301	180312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239616571
56	NC_012785	TAAATG	2	12	180502	180513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616571
57	NC_012785	ACTTTT	2	12	181675	181686	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239616573
58	NC_012785	CAGGAA	2	12	195326	195337	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	239616581
59	NC_012785	GCCAAA	2	12	196913	196924	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	239616582
60	NC_012785	TCAAGT	2	12	201876	201887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239616587
61	NC_012785	GGTGCC	2	12	203962	203973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239616590
62	NC_012785	GTGGCT	2	12	209644	209655	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	239616595
63	NC_012785	GGAATG	2	12	210346	210357	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	239616595
64	NC_012785	TTCAAG	2	12	210389	210400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239616595
65	NC_012785	TCTTTC	2	12	212314	212325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239616597
66	NC_012785	CATTAT	2	12	217971	217982	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	239616600
67	NC_012785	AAAAAC	2	12	220867	220878	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012785	CGTGAA	2	12	224019	224030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239616606
69	NC_012785	GTCTCT	2	12	224712	224723	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239616607
70	NC_012785	TCACCG	2	12	228098	228109	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239616609
71	NC_012785	GATCTG	2	12	250950	250961	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	239616628
72	NC_012785	TTTTCC	2	12	251511	251522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239616629
73	NC_012785	GAAAAG	2	12	253022	253033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012785	GAGTTC	2	12	254744	254755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	239616633
75	NC_012785	AAAAAG	2	12	256253	256264	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	239616633
76	NC_012785	TGCGGC	2	12	256773	256784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239616635
77	NC_012785	TTTCTT	2	12	258048	258059	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239616636
78	NC_012785	GAGGCT	2	12	258751	258762	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012785	TTTCGA	2	12	265868	265879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	239616645
80	NC_012785	TATAAT	2	12	267989	268000	50 %	50 %	0 %	0 %	239616647
81	NC_012785	TCACAC	2	12	272268	272279	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	239616650
82	NC_012785	GCAACT	2	12	276018	276029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239616654
83	NC_012785	TTTTGA	2	12	276526	276537	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	239616654
84	NC_012785	AACATA	2	12	281976	281987	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	239616660
85	NC_012785	TTCTCT	2	12	284994	285005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239616665
86	NC_012785	AGATTA	2	12	285105	285116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012785	ATTGAA	2	12	285794	285805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616666
88	NC_012785	GATCTC	2	12	300133	300144	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	239616681
89	NC_012785	CACAGA	2	12	301264	301275	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	239616681
90	NC_012785	TGCCTT	2	12	305603	305614	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239616684
91	NC_012785	GGAAAG	2	12	308483	308494	50 %	0 %	50 %	0 %	239616689
92	NC_012785	AAAGGA	2	12	308717	308728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239616689
93	NC_012785	ACGATA	2	12	317055	317066	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239616698
94	NC_012785	TGAAAA	2	12	320217	320228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239616701
95	NC_012785	TCAAAA	2	12	327056	327067	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	239616707
96	NC_012785	GTACAT	2	12	328514	328525	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239616709
97	NC_012785	AATATG	2	12	329238	329249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616709
98	NC_012785	CTTCAA	2	12	332630	332641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239616713
99	NC_012785	TCAAAC	2	12	339162	339173	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	239616723
100	NC_012785	CCTCAA	2	12	342890	342901	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	239616729
101	NC_012785	CTTTTA	2	12	344669	344680	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239616731
102	NC_012785	CCAAAA	2	12	346771	346782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239616733
103	NC_012785	TCTCCA	2	12	349076	349087	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	239616735
104	NC_012785	CAAAAA	2	12	349266	349277	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	239616736
105	NC_012785	AAAAAG	2	12	350790	350801	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	239616736
106	NC_012785	ATTGAA	2	12	352127	352138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616738
107	NC_012785	GAGGTG	2	12	359352	359363	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	239616745
108	NC_012785	AAAAAC	2	12	363453	363464	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	239616750
109	NC_012785	GATTAA	2	12	366687	366698	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616755
110	NC_012785	CGGTGT	2	12	368802	368813	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	239616758
111	NC_012785	CAACTT	2	12	371084	371095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239616760
112	NC_012785	TTGGTG	2	12	372340	372351	0 %	50 %	50 %	0 %	239616761
113	NC_012785	ATAGGT	2	12	372972	372983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239616761
114	NC_012785	TAGATA	2	12	376645	376656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616765
115	NC_012785	ACTTCT	2	12	384052	384063	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	239616773
116	NC_012785	GATGGC	2	12	386266	386277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239616775
117	NC_012785	GTTATT	2	12	388069	388080	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	239616777
118	NC_012785	AAAAAC	2	12	388557	388568	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	239616777
119	NC_012785	GGTTGT	2	12	390001	390012	0 %	50 %	50 %	0 %	239616778
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234	NC_012785	CGGAAG	2	12	826437	826448	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	239617166
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236	NC_012785	TGTATC	2	12	846056	846067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	239617191
237	NC_012785	ATCTTG	2	12	846591	846602	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	239617191
238	NC_012785	GATTAA	2	12	854153	854164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239617195
239	NC_012785	CCACTT	2	12	856399	856410	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	239617198
240	NC_012785	TTTCCC	2	12	863623	863634	0 %	50 %	0 %	50 %	239617205
241	NC_012785	TTGCCT	2	12	875123	875134	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239617219
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331	NC_012785	ATTGCA	2	12	1126628	1126639	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239617443
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334	NC_012785	TGATCT	2	12	1144604	1144615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	239617460
335	NC_012785	CGAGAT	2	12	1145638	1145649	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239617461
336	NC_012785	TACCTG	2	12	1146324	1146335	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	239617462
337	NC_012785	GAAGCT	2	12	1146511	1146522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239617462
338	NC_012785	ATAAAT	2	12	1147043	1147054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239617462
339	NC_012785	ACAGTC	2	12	1150642	1150653	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239617465
340	NC_012785	ATCTTC	2	12	1158955	1158966	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	239617474
341	NC_012785	TTTTCG	2	12	1161829	1161840	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	239617478
342	NC_012785	AAAGGC	2	12	1163597	1163608	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	239617479
343	NC_012785	TATGAT	2	12	1165607	1165618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	239617482
344	NC_012785	AATTCC	2	12	1169574	1169585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239617485
345	NC_012785	CTTTTG	2	12	1172349	1172360	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	239617487
346	NC_012785	GTTCGA	2	12	1180878	1180889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	239617496
347	NC_012785	GCCACC	2	12	1181385	1181396	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	239617497
348	NC_012785	TTTCAA	2	12	1188265	1188276	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
349	NC_012785	ATTTTC	2	12	1188486	1188497	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239617503
350	NC_012785	TCTTTT	2	12	1196129	1196140	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239617513
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462	NC_012785	CGTCTT	2	12	1542577	1542588	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239617815
463	NC_012785	CTAATT	2	12	1543107	1543118	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	239617817
464	NC_012785	TCAACG	2	12	1543994	1544005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239617818
465	NC_012785	ATGAAA	2	12	1545143	1545154	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239617819
466	NC_012785	CTTTTG	2	12	1548025	1548036	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	239617822
467	NC_012785	AAGTAC	2	12	1548774	1548785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239617823
468	NC_012785	GAAAAG	2	12	1548786	1548797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239617823
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470	NC_012785	CTATTA	2	12	1553152	1553163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	239617829
471	NC_012785	GAAAAA	2	12	1558061	1558072	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	239617832
472	NC_012785	TTTACG	2	12	1563558	1563569	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	239617837
473	NC_012785	GGAAAG	2	12	1565445	1565456	50 %	0 %	50 %	0 %	239617840
474	NC_012785	AAGATA	2	12	1566232	1566243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239617841
475	NC_012785	ATGCTG	2	12	1568860	1568871	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	239617845
476	NC_012785	GGTCAG	2	12	1570568	1570579	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239617846
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480	NC_012785	CTTTGG	2	12	1582956	1582967	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	239617856
481	NC_012785	TTGATG	2	12	1586777	1586788	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	239617859
482	NC_012785	AAGTAT	2	12	1588039	1588050	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239617860
483	NC_012785	CTAACG	2	12	1589749	1589760	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239617862
484	NC_012785	TAATCG	2	12	1593980	1593991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239617866
485	NC_012785	GGGTTC	2	12	1596299	1596310	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	239617867
486	NC_012785	AGATCG	2	12	1600972	1600983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239617869
487	NC_012785	GTAATT	2	12	1602007	1602018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	239617869
488	NC_012785	ATCTTC	2	12	1604703	1604714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	239617869
489	NC_012785	TACCGA	2	12	1609073	1609084	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239617873
490	NC_012785	AAAATA	2	12	1612219	1612230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_012785	AATCTG	2	12	1619174	1619185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239617882
492	NC_012785	CCATGA	2	12	1619268	1619279	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239617882
493	NC_012785	CTTTGC	2	12	1622457	1622468	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239617884
494	NC_012785	GAGGCT	2	12	1626809	1626820	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
495	NC_012785	ATGGAT	2	12	1627527	1627538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239617888
496	NC_012785	GCCTTT	2	12	1629158	1629169	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239617889
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498	NC_012785	CTGTTT	2	12	1645933	1645944	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	239617907
499	NC_012785	GAGGAA	2	12	1646585	1646596	50 %	0 %	50 %	0 %	239617908
500	NC_012785	GATACG	2	12	1647412	1647423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239617909

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