MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae 342 plasmid pKP187

Total Repeats: 3692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011282	ACA	2	6	176423	176428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_011282	TCA	2	6	176453	176458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_011282	CTG	2	6	176477	176482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_011282	CA	3	6	176530	176535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_011282	GACA	2	8	176550	176557	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_011282	CAGC	2	8	176667	176674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_011282	GT	3	6	176760	176765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_011282	CATC	2	8	176768	176775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_011282	TG	3	6	176815	176820	0 %	50 %	50 %	0 %	206575501
3510	NC_011282	CCAG	2	8	177026	177033	25 %	0 %	25 %	50 %	206575501
3511	NC_011282	TGT	2	6	177039	177044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206575501
3512	NC_011282	GA	3	6	177075	177080	50 %	0 %	50 %	0 %	206575501
3513	NC_011282	TTC	2	6	177095	177100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206575501
3514	NC_011282	A	6	6	177135	177140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_011282	GCC	2	6	177389	177394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206575581
3516	NC_011282	ATA	2	6	177410	177415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206575581
3517	NC_011282	AT	3	6	177494	177499	50 %	50 %	0 %	0 %	206575581
3518	NC_011282	TCCT	2	8	177712	177719	0 %	50 %	0 %	50 %	206575581
3519	NC_011282	TTC	2	6	177725	177730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206575581
3520	NC_011282	AGG	2	6	177750	177755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206575581
3521	NC_011282	ATA	2	6	177761	177766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206575581
3522	NC_011282	CTTT	2	8	177790	177797	0 %	75 %	0 %	25 %	206575581
3523	NC_011282	CTG	2	6	177812	177817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206575581
3524	NC_011282	TCA	2	6	177918	177923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206575581
3525	NC_011282	CCACCT	2	12	178205	178216	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_011282	T	6	6	178482	178487	0 %	100 %	0 %	0 %	206575561
3527	NC_011282	GCAC	2	8	178531	178538	25 %	0 %	25 %	50 %	206575561
3528	NC_011282	AT	3	6	178594	178599	50 %	50 %	0 %	0 %	206575561
3529	NC_011282	CGT	2	6	178684	178689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206575561
3530	NC_011282	GCC	2	6	178701	178706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206575561
3531	NC_011282	TGAGC	2	10	178756	178765	20 %	20 %	40 %	20 %	206575561
3532	NC_011282	ATA	2	6	178844	178849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206575493
3533	NC_011282	TCA	2	6	178909	178914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206575493
3534	NC_011282	AAG	2	6	178929	178934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206575493
3535	NC_011282	TGT	2	6	178963	178968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206575493
3536	NC_011282	ACG	2	6	179079	179084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206575493
3537	NC_011282	AGT	2	6	179132	179137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206575493
3538	NC_011282	GAC	2	6	179169	179174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206575493
3539	NC_011282	TTC	2	6	179203	179208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206575493
3540	NC_011282	TTC	2	6	179218	179223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206575493
3541	NC_011282	AGAA	2	8	179232	179239	75 %	0 %	25 %	0 %	206575493
3542	NC_011282	ACA	2	6	179250	179255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206575493
3543	NC_011282	TGT	2	6	179267	179272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206575493
3544	NC_011282	TCA	2	6	179323	179328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206575621
3545	NC_011282	ATC	2	6	179402	179407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206575621
3546	NC_011282	CAG	2	6	179408	179413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206575621
3547	NC_011282	AT	3	6	179622	179627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_011282	GAT	2	6	179680	179685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_011282	CTA	2	6	179694	179699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_011282	ATT	2	6	180088	180093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206575515
3551	NC_011282	TAC	2	6	180183	180188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206575515
3552	NC_011282	C	6	6	180199	180204	0 %	0 %	0 %	100 %	206575515
3553	NC_011282	AG	3	6	180207	180212	50 %	0 %	50 %	0 %	206575515
3554	NC_011282	T	7	7	180257	180263	0 %	100 %	0 %	0 %	206575515
3555	NC_011282	TCA	2	6	180272	180277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206575515
3556	NC_011282	GA	3	6	180331	180336	50 %	0 %	50 %	0 %	206575515
3557	NC_011282	GCT	2	6	180364	180369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206575515
3558	NC_011282	AAC	2	6	180421	180426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206575515
3559	NC_011282	AGC	2	6	180436	180441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_011282	TCCT	2	8	180454	180461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_011282	TTAG	2	8	180498	180505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_011282	CCAT	2	8	180525	180532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_011282	ATT	2	6	180540	180545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_011282	C	6	6	180550	180555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3565	NC_011282	GGA	2	6	180573	180578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_011282	TGC	2	6	180595	180600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_011282	GC	3	6	180599	180604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_011282	TGC	2	6	180704	180709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206575688
3569	NC_011282	GCA	2	6	180712	180717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206575688
3570	NC_011282	ACA	2	6	180734	180739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206575688
3571	NC_011282	CGC	2	6	180783	180788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206575688
3572	NC_011282	A	7	7	180796	180802	100 %	0 %	0 %	0 %	206575688
3573	NC_011282	A	6	6	180806	180811	100 %	0 %	0 %	0 %	206575688
3574	NC_011282	A	9	9	180813	180821	100 %	0 %	0 %	0 %	206575688
3575	NC_011282	A	7	7	180823	180829	100 %	0 %	0 %	0 %	206575688
3576	NC_011282	TGT	2	6	180911	180916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206575688
3577	NC_011282	CCA	2	6	180945	180950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_011282	CCG	2	6	180967	180972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_011282	CTG	2	6	181011	181016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_011282	TGA	2	6	181018	181023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_011282	AAT	2	6	181026	181031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_011282	TCCG	2	8	181032	181039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_011282	ACC	2	6	181112	181117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_011282	CAG	2	6	181143	181148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_011282	GAT	2	6	181184	181189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_011282	GCC	2	6	181230	181235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_011282	CG	3	6	181250	181255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_011282	CTC	2	6	181294	181299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_011282	AAG	2	6	181374	181379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_011282	TAA	2	6	181412	181417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_011282	AAT	2	6	181574	181579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206575684
3592	NC_011282	GAAA	2	8	181639	181646	75 %	0 %	25 %	0 %	206575684
3593	NC_011282	CCA	2	6	181754	181759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_011282	TG	4	8	181769	181776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_011282	A	6	6	181781	181786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011282	TGG	2	6	181921	181926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_011282	GCC	2	6	182061	182066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206575665
3598	NC_011282	GCG	2	6	182079	182084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206575665
3599	NC_011282	T	6	6	182104	182109	0 %	100 %	0 %	0 %	206575665
3600	NC_011282	TGC	2	6	182142	182147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206575665
3601	NC_011282	GCC	2	6	182218	182223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206575665
3602	NC_011282	GCG	2	6	182233	182238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206575665
3603	NC_011282	TGG	2	6	182266	182271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206575665
3604	NC_011282	GCA	2	6	182284	182289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206575665
3605	NC_011282	GCC	2	6	182319	182324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206575665
3606	NC_011282	GCG	2	6	182341	182346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206575665
3607	NC_011282	GTC	2	6	182357	182362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206575665
3608	NC_011282	AG	3	6	182381	182386	50 %	0 %	50 %	0 %	206575665
3609	NC_011282	GTT	2	6	182401	182406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206575665
3610	NC_011282	C	6	6	182424	182429	0 %	0 %	0 %	100 %	206575665
3611	NC_011282	CTTC	2	8	182446	182453	0 %	50 %	0 %	50 %	206575665
3612	NC_011282	CAA	2	6	182525	182530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_011282	GGT	2	6	182653	182658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_011282	GTA	2	6	182664	182669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_011282	TAA	2	6	182706	182711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_011282	TCC	2	6	182726	182731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_011282	GATG	2	8	182740	182747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_011282	TGC	2	6	182754	182759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_011282	T	6	6	182777	182782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_011282	TCT	2	6	182795	182800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_011282	TCC	2	6	182916	182921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_011282	T	6	6	182931	182936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_011282	CGG	2	6	182992	182997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206575691
3624	NC_011282	AAT	2	6	183038	183043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206575691
3625	NC_011282	TCCC	2	8	183049	183056	0 %	25 %	0 %	75 %	206575691
3626	NC_011282	CCT	2	6	183061	183066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206575691
3627	NC_011282	GTC	2	6	183159	183164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206575691
3628	NC_011282	CAG	2	6	183334	183339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206575691
3629	NC_011282	ACC	2	6	183380	183385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206575691
3630	NC_011282	GATT	2	8	183540	183547	25 %	50 %	25 %	0 %	206575691
3631	NC_011282	GTC	2	6	183566	183571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206575691
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3659	NC_011282	GTT	2	6	185425	185430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206575571
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3668	NC_011282	CCGT	2	8	186178	186185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3669	NC_011282	CAGCA	2	10	186192	186201	40 %	0 %	20 %	40 %	206575562
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3675	NC_011282	CAT	2	6	186643	186648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3677	NC_011282	CTT	2	6	186672	186677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3678	NC_011282	GT	3	6	186782	186787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3683	NC_011282	CCTT	2	8	186932	186939	0 %	50 %	0 %	50 %	206575703
3684	NC_011282	TCC	2	6	186968	186973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206575703
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3692	NC_011282	AT	3	6	187860	187865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.