MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 plasmid pKRAD01

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009806	CCCACC	2	12	1189	1200	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	157283830
2	NC_009806	CGACCT	2	12	1878	1889	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157283831
3	NC_009806	GCCACC	2	12	2456	2467	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	157283833
4	NC_009806	TGCTGA	2	12	2514	2525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157283833
5	NC_009806	ATGAGC	2	12	2990	3001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157283833
6	NC_009806	CTCGAC	3	18	4374	4391	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157283834
7	NC_009806	TGCCCC	2	12	5563	5574	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009806	CTGACC	2	12	6849	6860	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157283837
9	NC_009806	TGCAGG	2	12	8162	8173	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157283838
10	NC_009806	CGGCAG	2	12	13556	13567	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157283845
11	NC_009806	GGTGCT	2	12	13857	13868	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157283845
12	NC_009806	CAGCCG	2	12	14102	14113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157283846
13	NC_009806	GCCACC	2	12	17586	17597	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	157283849
14	NC_009806	GGCGGT	2	12	18208	18219	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157283849
15	NC_009806	GCCCCC	2	12	18754	18765	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	157283850
16	NC_009806	CCACGA	2	12	19284	19295	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	157283851
17	NC_009806	GCACCG	2	12	20337	20348	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157283852
18	NC_009806	CGCCGG	2	12	24212	24223	0 %	0 %	50 %	50 %	157283854
19	NC_009806	ACCGGC	3	18	25399	25416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157283854
20	NC_009806	ATCGGC	2	12	25417	25428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009806	TGCACC	2	12	28360	28371	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157283856
22	NC_009806	GCACCG	2	12	28420	28431	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157283856
23	NC_009806	TGGCCG	2	12	29485	29496	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157283858
24	NC_009806	CGTCAC	2	12	30127	30138	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157283859
25	NC_009806	CCTGGA	2	12	30712	30723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283859
26	NC_009806	GACCTG	2	12	31642	31653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283860
27	NC_009806	CCTGGC	2	12	33456	33467	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157283862
28	NC_009806	CGAAGG	2	12	34038	34049	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	157283862
29	NC_009806	CCGGCG	2	12	34337	34348	0 %	0 %	50 %	50 %	157283862
30	NC_009806	GTCACC	2	12	35347	35358	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157283863
31	NC_009806	CCACCC	2	12	35560	35571	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	157283863
32	NC_009806	GCCGGC	2	12	37068	37079	0 %	0 %	50 %	50 %	157283865
33	NC_009806	CGGGGA	2	12	38512	38523	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	157283867
34	NC_009806	GGTCTG	2	12	38693	38704	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157283867
35	NC_009806	GCCCCC	2	12	40511	40522	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	157283869
36	NC_009806	ACCGGC	2	12	43406	43417	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009806	GTGGCC	2	12	43859	43870	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157283873
38	NC_009806	GTGGCG	2	12	43871	43882	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157283873
39	NC_009806	CGGTGG	2	12	47768	47779	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157283875
40	NC_009806	CACCGC	2	12	50396	50407	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	157283876
41	NC_009806	GGGAAC	2	12	52789	52800	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	157283880
42	NC_009806	GCGGTG	2	12	55710	55721	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157283882
43	NC_009806	GCCTCG	2	12	56239	56250	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157283883
44	NC_009806	TCGTTC	2	12	59247	59258	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	157283887
45	NC_009806	ACGCCA	2	12	59532	59543	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	157283887
46	NC_009806	GGCCTG	2	12	59771	59782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157283887
47	NC_009806	GCTCCA	2	12	61202	61213	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157283889
48	NC_009806	CACAGC	2	12	63488	63499	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	157283891
49	NC_009806	ATGACG	2	12	65164	65175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009806	CTGGCC	2	12	67129	67140	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157283895
51	NC_009806	ACGGCA	2	12	67145	67156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157283895
52	NC_009806	CCTGGA	2	12	67395	67406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283895
53	NC_009806	CCTCAA	2	12	70378	70389	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009806	CCCCGG	2	12	70473	70484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009806	CCGGGC	2	12	70521	70532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009806	CACCCT	2	12	71057	71068	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	157283901
57	NC_009806	CACCGG	5	30	71069	71098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157283901
58	NC_009806	GCATCG	2	12	74314	74325	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283904
59	NC_009806	CATCGT	2	12	74636	74647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157283904
60	NC_009806	GCCGGT	2	12	74682	74693	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157283904
61	NC_009806	GCCTGC	2	12	75820	75831	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157283904
62	NC_009806	GCACCA	2	12	76034	76045	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	157283905
63	NC_009806	TGGCCT	2	12	76504	76515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157283905
64	NC_009806	GCCGGT	9	54	76734	76787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009806	CCGCTG	2	12	78523	78534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157283907
66	NC_009806	GGCCGC	2	12	79089	79100	0 %	0 %	50 %	50 %	157283908
67	NC_009806	GACCCA	2	12	79268	79279	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	157283908
68	NC_009806	CGAGGA	2	12	79418	79429	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	157283909
69	NC_009806	ACCGGC	2	12	79551	79562	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157283909
70	NC_009806	CCGGCG	2	12	80498	80509	0 %	0 %	50 %	50 %	157283912
71	NC_009806	TGCAGC	2	12	80738	80749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283913
72	NC_009806	GACGTC	2	12	80968	80979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283913
73	NC_009806	CCTCGA	2	12	82047	82058	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157283913
74	NC_009806	GGTCGA	2	12	84882	84893	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157283914
75	NC_009806	GCAGCT	2	12	85548	85559	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283915
76	NC_009806	GTCGTG	2	12	87125	87136	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157283916
77	NC_009806	GTTCCA	2	12	89208	89219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157283917
78	NC_009806	ACCCTG	2	12	89696	89707	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157283917
79	NC_009806	GGATGA	2	12	92903	92914	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	157283920
80	NC_009806	CGGCAG	2	12	94930	94941	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157283922
81	NC_009806	CCCCCT	2	12	97672	97683	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	157283924
82	NC_009806	CGCCCG	2	12	100178	100189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157283927
83	NC_009806	GGCCCA	2	12	100445	100456	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157283927
84	NC_009806	TGCGCG	2	12	101324	101335	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157283928
85	NC_009806	CGCTGG	2	12	101427	101438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157283928
86	NC_009806	TCGGGT	2	12	102182	102193	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157283929
87	NC_009806	CGGTGA	2	12	106157	106168	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157283931
88	NC_009806	GATGGT	2	12	108886	108897	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009806	ACCTCC	2	12	111117	111128	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	157283937
90	NC_009806	CCTCGG	2	12	111247	111258	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157283937
91	NC_009806	TGGTCT	2	12	112134	112145	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	157283937
92	NC_009806	GTTGTC	2	12	112658	112669	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	157283938
93	NC_009806	CCTTGC	2	12	113473	113484	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	157283938
94	NC_009806	GACGGT	2	12	114314	114325	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157283938
95	NC_009806	AGCCGC	2	12	114560	114571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157283938
96	NC_009806	AGCAGG	2	12	114876	114887	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	157283939
97	NC_009806	GCGACC	2	12	114894	114905	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157283939
98	NC_009806	CCGCGG	2	12	116295	116306	0 %	0 %	50 %	50 %	157283940
99	NC_009806	TACCGG	2	12	116851	116862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283940
100	NC_009806	CCCAGC	2	12	118879	118890	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	157283941
101	NC_009806	CGGGCG	2	12	120802	120813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157283942
102	NC_009806	CTCCGT	2	12	122008	122019	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	157283943
103	NC_009806	GGCGTA	2	12	122707	122718	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157283944
104	NC_009806	CGCCGT	2	12	123105	123116	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157283944
105	NC_009806	GGCCGC	2	12	123400	123411	0 %	0 %	50 %	50 %	157283944
106	NC_009806	GAAGCG	2	12	123703	123714	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	157283945
107	NC_009806	CGGCGA	2	12	127604	127615	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157283946
108	NC_009806	CCGCGC	2	12	129696	129707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157283947
109	NC_009806	GGCCGC	2	12	129778	129789	0 %	0 %	50 %	50 %	157283947
110	NC_009806	CAACAG	2	12	131462	131473	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	157283949
111	NC_009806	CGGCGA	2	12	131913	131924	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157283950
112	NC_009806	GGTGCG	2	12	133123	133134	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157283951
113	NC_009806	CGTCCT	2	12	133228	133239	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	157283951
114	NC_009806	CCCCGA	2	12	137423	137434	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	157283955
115	NC_009806	CGCCGA	2	12	139461	139472	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157283957
116	NC_009806	CCTGGC	2	12	143960	143971	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157283961
117	NC_009806	GCAGGA	2	12	144763	144774	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	157283962
118	NC_009806	CCGCGG	2	12	145232	145243	0 %	0 %	50 %	50 %	157283963
119	NC_009806	GGCCGC	2	12	145784	145795	0 %	0 %	50 %	50 %	157283964
120	NC_009806	CAACCA	2	12	147276	147287	50 %	0 %	0 %	50 %	157283966
121	NC_009806	GCGGAC	2	12	147505	147516	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157283966
122	NC_009806	GCGGCC	2	12	147853	147864	0 %	0 %	50 %	50 %	157283966
123	NC_009806	AGCTGC	2	12	148406	148417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283966
124	NC_009806	TGGGCT	2	12	154079	154090	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157283970
125	NC_009806	CGATGA	2	12	156471	156482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157283973
126	NC_009806	GCGCTC	2	12	159038	159049	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157283977
127	NC_009806	GGGGGT	2	12	159248	159259	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	157283977
128	NC_009806	GCTGAC	2	12	160494	160505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283979
129	NC_009806	GTAGAC	2	12	161806	161817	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157283981
130	NC_009806	CTCGGT	2	12	162603	162614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157283981
131	NC_009806	CGGGGT	2	12	163610	163621	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_009806	GGTGAG	2	12	163951	163962	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	157283983
133	NC_009806	TCGTCC	2	12	166156	166167	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	157283987
134	NC_009806	CACGAT	2	12	169516	169527	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157283990
135	NC_009806	GTGGGG	2	12	169640	169651	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	157283990
136	NC_009806	CGCGGA	2	12	170475	170486	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009806	TGGTGA	2	12	170981	170992	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157283993
138	NC_009806	CTGGAG	2	12	171505	171516	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157283995
139	NC_009806	GCCGGT	2	12	172058	172069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157283996
140	NC_009806	TCGCCT	2	12	173873	173884	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	157283999
141	NC_009806	GGCCAG	2	12	173928	173939	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157283999
142	NC_009806	GCGACT	2	12	174445	174456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157283999
143	NC_009806	CCTCGA	2	12	177019	177030	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157284003

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.