MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 plasmid pKRAD01

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009806	CACCC	2	10	1489	1498	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_009806	CCACG	2	10	2643	2652	20 %	0 %	20 %	60 %	157283833
3	NC_009806	GCGCA	2	10	2699	2708	20 %	0 %	40 %	40 %	157283833
4	NC_009806	GCGAC	2	10	4973	4982	20 %	0 %	40 %	40 %	157283834
5	NC_009806	CAGGT	2	10	6107	6116	20 %	20 %	40 %	20 %	157283836
6	NC_009806	CGTGC	2	10	7862	7871	0 %	20 %	40 %	40 %	157283837
7	NC_009806	GCTTC	2	10	8415	8424	0 %	40 %	20 %	40 %	157283838
8	NC_009806	ATGGG	2	10	13153	13162	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009806	CGCAG	2	10	13170	13179	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009806	GCACC	2	10	14512	14521	20 %	0 %	20 %	60 %	157283846
11	NC_009806	CGGTG	2	10	18049	18058	0 %	20 %	60 %	20 %	157283849
12	NC_009806	GTTCT	2	10	18448	18457	0 %	60 %	20 %	20 %	157283850
13	NC_009806	AGTCG	2	10	19122	19131	20 %	20 %	40 %	20 %	157283851
14	NC_009806	GACAC	2	10	19587	19596	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009806	GCCAG	2	10	19773	19782	20 %	0 %	40 %	40 %	157283852
16	NC_009806	GCCCG	2	10	24175	24184	0 %	0 %	40 %	60 %	157283854
17	NC_009806	ACGCC	2	10	24359	24368	20 %	0 %	20 %	60 %	157283854
18	NC_009806	CCAGC	2	10	24542	24551	20 %	0 %	20 %	60 %	157283854
19	NC_009806	CCGCG	2	10	25179	25188	0 %	0 %	40 %	60 %	157283854
20	NC_009806	GGATC	2	10	25768	25777	20 %	20 %	40 %	20 %	157283855
21	NC_009806	ACCGG	2	10	27151	27160	20 %	0 %	40 %	40 %	157283856
22	NC_009806	CTGCG	2	10	27348	27357	0 %	20 %	40 %	40 %	157283856
23	NC_009806	GCGGT	2	10	27391	27400	0 %	20 %	60 %	20 %	157283856
24	NC_009806	GCTCG	2	10	28113	28122	0 %	20 %	40 %	40 %	157283856
25	NC_009806	GGGTG	2	10	28439	28448	0 %	20 %	80 %	0 %	157283856
26	NC_009806	TCCGA	2	10	28912	28921	20 %	20 %	20 %	40 %	157283857
27	NC_009806	GCCGA	2	10	30300	30309	20 %	0 %	40 %	40 %	157283859
28	NC_009806	CGCCA	2	10	31020	31029	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_009806	TCCCT	2	10	34377	34386	0 %	40 %	0 %	60 %	157283862
30	NC_009806	TGGAC	2	10	34415	34424	20 %	20 %	40 %	20 %	157283862
31	NC_009806	CAGCG	2	10	34948	34957	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009806	CCCAC	2	10	35462	35471	20 %	0 %	0 %	80 %	157283863
33	NC_009806	CGCGG	2	10	36062	36071	0 %	0 %	60 %	40 %	157283864
34	NC_009806	AGCGC	2	10	36627	36636	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009806	CCGAC	2	10	37837	37846	20 %	0 %	20 %	60 %	157283866
36	NC_009806	CCCAC	2	10	38145	38154	20 %	0 %	0 %	80 %	157283867
37	NC_009806	GTGGC	2	10	38381	38390	0 %	20 %	60 %	20 %	157283867
38	NC_009806	TCGGC	2	10	39529	39538	0 %	20 %	40 %	40 %	157283868
39	NC_009806	CCCCG	2	10	40531	40540	0 %	0 %	20 %	80 %	157283869
40	NC_009806	GCCGC	2	10	41923	41932	0 %	0 %	40 %	60 %	157283870
41	NC_009806	CAAGC	2	10	42999	43008	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009806	GTCAG	2	10	43076	43085	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009806	AGCGG	2	10	45200	45209	20 %	0 %	60 %	20 %	157283873
44	NC_009806	CGGGG	2	10	45507	45516	0 %	0 %	80 %	20 %	157283873
45	NC_009806	GGCTC	2	10	46430	46439	0 %	20 %	40 %	40 %	157283874
46	NC_009806	CCGGG	2	10	48486	48495	0 %	0 %	60 %	40 %	157283875
47	NC_009806	CAGGC	2	10	50204	50213	20 %	0 %	40 %	40 %	157283876
48	NC_009806	CCAGC	2	10	54018	54027	20 %	0 %	20 %	60 %	157283881
49	NC_009806	CAGCA	2	10	54183	54192	40 %	0 %	20 %	40 %	157283881
50	NC_009806	CGCTG	2	10	54291	54300	0 %	20 %	40 %	40 %	157283881
51	NC_009806	CGGGG	2	10	56014	56023	0 %	0 %	80 %	20 %	157283883
52	NC_009806	GCTGG	2	10	56583	56592	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009806	CGTAC	2	10	60221	60230	20 %	20 %	20 %	40 %	157283888
54	NC_009806	CACCG	2	10	60354	60363	20 %	0 %	20 %	60 %	157283888
55	NC_009806	CGCGG	2	10	61002	61011	0 %	0 %	60 %	40 %	157283889
56	NC_009806	CCGGC	2	10	61451	61460	0 %	0 %	40 %	60 %	157283889
57	NC_009806	GCGCC	2	10	61755	61764	0 %	0 %	40 %	60 %	157283889
58	NC_009806	GACCC	2	10	61913	61922	20 %	0 %	20 %	60 %	157283889
59	NC_009806	CCCCG	2	10	62415	62424	0 %	0 %	20 %	80 %	157283890
60	NC_009806	CCTCA	2	10	62571	62580	20 %	20 %	0 %	60 %	157283890
61	NC_009806	CACAA	2	10	63690	63699	60 %	0 %	0 %	40 %	157283891
62	NC_009806	CACCG	2	10	64375	64384	20 %	0 %	20 %	60 %	157283892
63	NC_009806	GCCCC	2	10	66339	66348	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_009806	GATCG	2	10	68016	68025	20 %	20 %	40 %	20 %	157283896
65	NC_009806	CAGCC	2	10	68689	68698	20 %	0 %	20 %	60 %	157283898
66	NC_009806	TCACG	2	10	70195	70204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009806	CGTGG	2	10	70890	70899	0 %	20 %	60 %	20 %	157283900
68	NC_009806	GCCCG	2	10	71900	71909	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_009806	GCACC	2	10	73215	73224	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_009806	GCTGC	2	10	74244	74253	0 %	20 %	40 %	40 %	157283904
71	NC_009806	CACTG	2	10	76189	76198	20 %	20 %	20 %	40 %	157283905
72	NC_009806	GCGCT	2	10	76882	76891	0 %	20 %	40 %	40 %	157283906
73	NC_009806	TCCGG	2	10	77115	77124	0 %	20 %	40 %	40 %	157283906
74	NC_009806	AGCTC	2	10	77965	77974	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_009806	CCTGT	2	10	78741	78750	0 %	40 %	20 %	40 %	157283907
76	NC_009806	CGCTG	2	10	79471	79480	0 %	20 %	40 %	40 %	157283909
77	NC_009806	CGTGG	2	10	79818	79827	0 %	20 %	60 %	20 %	157283910
78	NC_009806	CACCG	2	10	80018	80027	20 %	0 %	20 %	60 %	157283911
79	NC_009806	GGCCG	2	10	81236	81245	0 %	0 %	60 %	40 %	157283913
80	NC_009806	GGCCA	2	10	82105	82114	20 %	0 %	40 %	40 %	157283913
81	NC_009806	CGTGG	2	10	82423	82432	0 %	20 %	60 %	20 %	157283913
82	NC_009806	GCACC	2	10	82461	82470	20 %	0 %	20 %	60 %	157283913
83	NC_009806	CCGCG	2	10	83064	83073	0 %	0 %	40 %	60 %	157283913
84	NC_009806	CCCCA	2	10	83588	83597	20 %	0 %	0 %	80 %	157283913
85	NC_009806	GGTCC	2	10	86407	86416	0 %	20 %	40 %	40 %	157283916
86	NC_009806	TCGGC	2	10	87865	87874	0 %	20 %	40 %	40 %	157283916
87	NC_009806	CGAGC	2	10	88472	88481	20 %	0 %	40 %	40 %	157283916
88	NC_009806	CTCGA	2	10	88664	88673	20 %	20 %	20 %	40 %	157283916
89	NC_009806	CCACC	2	10	89365	89374	20 %	0 %	0 %	80 %	157283917
90	NC_009806	TGGGG	2	10	92052	92061	0 %	20 %	80 %	0 %	157283919
91	NC_009806	GTCCA	2	10	95866	95875	20 %	20 %	20 %	40 %	157283923
92	NC_009806	CGGGC	2	10	97266	97275	0 %	0 %	60 %	40 %	157283924
93	NC_009806	CCCCG	2	10	97690	97699	0 %	0 %	20 %	80 %	157283924
94	NC_009806	GCACC	2	10	99950	99959	20 %	0 %	20 %	60 %	157283927
95	NC_009806	GCGCC	2	10	100424	100433	0 %	0 %	40 %	60 %	157283927
96	NC_009806	GCCGG	2	10	100998	101007	0 %	0 %	60 %	40 %	157283927
97	NC_009806	CGGAC	2	10	101266	101275	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_009806	GGGTG	2	10	101517	101526	0 %	20 %	80 %	0 %	157283928
99	NC_009806	TCCAG	2	10	102147	102156	20 %	20 %	20 %	40 %	157283929
100	NC_009806	GCCCA	2	10	102344	102353	20 %	0 %	20 %	60 %	157283929
101	NC_009806	CCCGT	2	10	104686	104695	0 %	20 %	20 %	60 %	157283931
102	NC_009806	CTGCG	2	10	106457	106466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_009806	TCCTG	2	10	107745	107754	0 %	40 %	20 %	40 %	157283933
104	NC_009806	GTTGC	2	10	107820	107829	0 %	40 %	40 %	20 %	157283933
105	NC_009806	CGGCG	2	10	110474	110483	0 %	0 %	60 %	40 %	157283937
106	NC_009806	GTCGT	2	10	111093	111102	0 %	40 %	40 %	20 %	157283937
107	NC_009806	GAGGG	2	10	112426	112435	20 %	0 %	80 %	0 %	157283937
108	NC_009806	GGCGG	2	10	113420	113429	0 %	0 %	80 %	20 %	157283938
109	NC_009806	GGCGT	2	10	113502	113511	0 %	20 %	60 %	20 %	157283938
110	NC_009806	GGGCG	2	10	115120	115129	0 %	0 %	80 %	20 %	157283939
111	NC_009806	CTGGC	2	10	115800	115809	0 %	20 %	40 %	40 %	157283940
112	NC_009806	GGGAC	2	10	116075	116084	20 %	0 %	60 %	20 %	157283940
113	NC_009806	CGCGC	2	10	118123	118132	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_009806	CACGG	2	10	123169	123178	20 %	0 %	40 %	40 %	157283944
115	NC_009806	GCGGT	2	10	123227	123236	0 %	20 %	60 %	20 %	157283944
116	NC_009806	CGGGT	2	10	126404	126413	0 %	20 %	60 %	20 %	157283946
117	NC_009806	GGCGG	2	10	126429	126438	0 %	0 %	80 %	20 %	157283946
118	NC_009806	CTCCA	2	10	127414	127423	20 %	20 %	0 %	60 %	157283946
119	NC_009806	GGATG	2	10	129086	129095	20 %	20 %	60 %	0 %	157283946
120	NC_009806	CGCCT	2	10	129442	129451	0 %	20 %	20 %	60 %	157283947
121	NC_009806	GATGC	2	10	129944	129953	20 %	20 %	40 %	20 %	157283947
122	NC_009806	GCCGG	2	10	130449	130458	0 %	0 %	60 %	40 %	157283949
123	NC_009806	GCGCG	2	10	137186	137195	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_009806	TCGGC	2	10	139088	139097	0 %	20 %	40 %	40 %	157283957
125	NC_009806	CCCGT	2	10	143194	143203	0 %	20 %	20 %	60 %	157283960
126	NC_009806	CCGGC	2	10	143790	143799	0 %	0 %	40 %	60 %	157283961
127	NC_009806	CACGA	3	15	144322	144336	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_009806	GTCCC	2	10	144939	144948	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_009806	ACGCG	2	10	144995	145004	20 %	0 %	40 %	40 %	157283963
130	NC_009806	CCGCG	2	10	145022	145031	0 %	0 %	40 %	60 %	157283963
131	NC_009806	GCGCG	2	10	146322	146331	0 %	0 %	60 %	40 %	157283965
132	NC_009806	CGCAC	2	10	147843	147852	20 %	0 %	20 %	60 %	157283966
133	NC_009806	ACCTC	2	10	148850	148859	20 %	20 %	0 %	60 %	157283966
134	NC_009806	CGAGC	2	10	149725	149734	20 %	0 %	40 %	40 %	157283966
135	NC_009806	CTGCT	2	10	150733	150742	0 %	40 %	20 %	40 %	157283967
136	NC_009806	CGGCA	2	10	151598	151607	20 %	0 %	40 %	40 %	157283968
137	NC_009806	GGGCC	2	10	154206	154215	0 %	0 %	60 %	40 %	157283970
138	NC_009806	GCCTC	2	10	156234	156243	0 %	20 %	20 %	60 %	157283973
139	NC_009806	CTGTC	2	10	157114	157123	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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141	NC_009806	GTGCG	2	10	157755	157764	0 %	20 %	60 %	20 %	157283974
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145	NC_009806	CTCGT	2	10	161291	161300	0 %	40 %	20 %	40 %	157283980
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147	NC_009806	GGGAG	2	10	162888	162897	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009806	CCTGA	2	10	163185	163194	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_009806	TGGCG	2	10	163504	163513	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_009806	CGGGC	2	10	165895	165904	0 %	0 %	60 %	40 %	157283987
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156	NC_009806	GTCCA	2	10	167161	167170	20 %	20 %	20 %	40 %	157283988
157	NC_009806	CCCAT	2	10	167644	167653	20 %	20 %	0 %	60 %	157283988
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159	NC_009806	GGCTG	2	10	169108	169117	0 %	20 %	60 %	20 %	157283990
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161	NC_009806	GGTGC	2	10	171401	171410	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
162	NC_009806	CGGCG	2	10	171432	171441	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
163	NC_009806	TCGTC	2	10	172144	172153	0 %	40 %	20 %	40 %	157283996
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165	NC_009806	TCGTG	2	10	173765	173774	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
166	NC_009806	CGGGG	2	10	173822	173831	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
167	NC_009806	CGCGG	2	10	173940	173949	0 %	0 %	60 %	40 %	157283999
168	NC_009806	CCAGG	2	10	173997	174006	20 %	0 %	40 %	40 %	157283999
169	NC_009806	TGCGC	2	10	174029	174038	0 %	20 %	40 %	40 %	157283999
170	NC_009806	GGGGT	2	10	176025	176034	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009806	ACGCC	2	10	179844	179853	20 %	0 %	20 %	60 %	157284009
172	NC_009806	CGTGC	2	10	181026	181035	0 %	20 %	40 %	40 %	157284011
173	NC_009806	GGGGT	2	10	181432	181441	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.