MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 chromosome

Total Repeats: 115505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009664	CGG	2	6	1	6	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009664	CGC	2	6	34	39	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009664	GAA	2	6	68	73	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009664	ACT	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009664	CGA	2	6	292	297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966184
6	NC_009664	TCG	2	6	336	341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966184
7	NC_009664	CGC	2	6	403	408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966184
8	NC_009664	TGG	2	6	552	557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966184
9	NC_009664	GCG	3	9	570	578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966184
10	NC_009664	CCA	2	6	582	587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966184
11	NC_009664	CGC	2	6	589	594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966184
12	NC_009664	CAC	3	9	595	603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966184
13	NC_009664	CTG	2	6	674	679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966184
14	NC_009664	CTC	2	6	697	702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966184
15	NC_009664	CTG	2	6	710	715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966184
16	NC_009664	CTG	2	6	728	733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966184
17	NC_009664	CCA	2	6	777	782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966184
18	NC_009664	GGC	2	6	796	801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966184
19	NC_009664	GCC	2	6	878	883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966184
20	NC_009664	CCG	2	6	999	1004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966184
21	NC_009664	CGG	3	9	1030	1038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966184
22	NC_009664	AGC	2	6	1065	1070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966184
23	NC_009664	TGC	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966184
24	NC_009664	CGA	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009664	GTC	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009664	GCC	2	6	1230	1235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_009664	GCC	2	6	1248	1253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009664	CGC	2	6	1343	1348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966183
29	NC_009664	CAC	2	6	1426	1431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966183
30	NC_009664	CAC	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966183
31	NC_009664	CGA	2	6	1473	1478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966183
32	NC_009664	ACG	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966183
33	NC_009664	CGT	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966183
34	NC_009664	TCA	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152966183
35	NC_009664	CTG	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009664	GCG	2	6	1688	1693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009664	CGG	3	9	1697	1705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009664	CGG	2	6	1708	1713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009664	CGG	2	6	1716	1721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009664	GCC	2	6	1733	1738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009664	CGA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
42	NC_009664	GCA	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
43	NC_009664	GCC	2	6	1858	1863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966182
44	NC_009664	GAC	2	6	1873	1878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
45	NC_009664	GCG	2	6	1892	1897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966182
46	NC_009664	GGT	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966182
47	NC_009664	AGC	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
48	NC_009664	AGG	2	6	2024	2029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966182
49	NC_009664	GTG	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966182
50	NC_009664	GTC	2	6	2088	2093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966182
51	NC_009664	GCC	3	9	2147	2155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966182
52	NC_009664	CGG	2	6	2243	2248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966182
53	NC_009664	CAG	2	6	2332	2337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
54	NC_009664	CGG	2	6	2385	2390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966182
55	NC_009664	CCG	2	6	2391	2396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966182
56	NC_009664	CAG	2	6	2437	2442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
57	NC_009664	CGG	2	6	2448	2453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966182
58	NC_009664	TGG	2	6	2474	2479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966182
59	NC_009664	CCG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966182
60	NC_009664	CGT	2	6	2563	2568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009664	GAA	2	6	2616	2621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009664	CGG	2	6	2671	2676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009664	GAC	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009664	CGA	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009664	CGG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009664	GGC	2	6	3024	3029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009664	CAC	2	6	3060	3065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009664	GCC	2	6	3067	3072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009664	CAC	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009664	AGG	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009664	CTC	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966181
72	NC_009664	CGT	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
73	NC_009664	CCG	2	6	3313	3318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966181
74	NC_009664	GGT	2	6	3353	3358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966181
75	NC_009664	TGA	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152966181
76	NC_009664	CGT	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
77	NC_009664	ACC	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966181
78	NC_009664	GTC	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
79	NC_009664	GGC	2	6	3495	3500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966181
80	NC_009664	CGG	2	6	3524	3529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966181
81	NC_009664	TCG	2	6	3559	3564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
82	NC_009664	CGA	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966181
83	NC_009664	CGT	2	6	3665	3670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
84	NC_009664	TCG	2	6	3745	3750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
85	NC_009664	CGA	2	6	3785	3790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966181
86	NC_009664	CGA	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966181
87	NC_009664	GCC	2	6	3904	3909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966181
88	NC_009664	GGA	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966181
89	NC_009664	CCT	2	6	3971	3976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966181
90	NC_009664	CAG	2	6	3984	3989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966181
91	NC_009664	CTC	2	6	4044	4049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966181
92	NC_009664	GAG	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966181
93	NC_009664	TTC	2	6	4110	4115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152966180
94	NC_009664	GGT	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966180
95	NC_009664	GCC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966180
96	NC_009664	GCA	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966180
97	NC_009664	AGG	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966180
98	NC_009664	CAG	2	6	4331	4336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966180
99	NC_009664	GGT	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966180
100	NC_009664	CAG	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966180
101	NC_009664	GGC	2	6	4448	4453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966180
102	NC_009664	GGC	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966180
103	NC_009664	GGT	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966180
104	NC_009664	TGC	2	6	4494	4499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966180
105	NC_009664	ACC	2	6	4500	4505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966180
106	NC_009664	GCC	2	6	4726	4731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966179
107	NC_009664	CTG	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966179
108	NC_009664	ACG	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966179
109	NC_009664	CGG	2	6	4893	4898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966179
110	NC_009664	CCG	2	6	5033	5038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966179
111	NC_009664	GCC	2	6	5062	5067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966179
112	NC_009664	CCG	2	6	5135	5140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966179
113	NC_009664	CGG	2	6	5187	5192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966179
114	NC_009664	CGG	2	6	5256	5261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966179
115	NC_009664	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966179
116	NC_009664	CCG	3	9	5375	5383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966179
117	NC_009664	TCG	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966179
118	NC_009664	CCT	2	6	5508	5513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966179
119	NC_009664	CGC	2	6	5541	5546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966179
120	NC_009664	AGG	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966179
121	NC_009664	GCT	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009664	CCT	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009664	CCG	2	6	5722	5727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966178
124	NC_009664	TGC	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966178
125	NC_009664	TGG	2	6	5760	5765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966178
126	NC_009664	CGG	2	6	5768	5773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966178
127	NC_009664	GTG	3	9	5831	5839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966178
128	NC_009664	TGC	2	6	5922	5927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966178
129	NC_009664	CGT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966178
130	NC_009664	CGG	2	6	6129	6134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966178
131	NC_009664	TTG	2	6	6170	6175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152966178
132	NC_009664	AGT	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152966178
133	NC_009664	GCA	2	6	6209	6214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966178
134	NC_009664	GCC	2	6	6215	6220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966178
135	NC_009664	GCC	3	9	6269	6277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966178
136	NC_009664	CGC	2	6	6290	6295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966178
137	NC_009664	CGA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009664	CAC	2	6	6411	6416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966177
139	NC_009664	TCA	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152966177
140	NC_009664	CAA	2	6	6645	6650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152966177
141	NC_009664	GAT	2	6	6765	6770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152966177
142	NC_009664	CTC	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966177
143	NC_009664	CGC	2	6	6824	6829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966177
144	NC_009664	CCA	2	6	6851	6856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966177
145	NC_009664	ACT	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152966177
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147	NC_009664	AGG	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966177
148	NC_009664	GAT	2	6	7065	7070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152966177
149	NC_009664	TCA	2	6	7088	7093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152966177
150	NC_009664	GAC	2	6	7239	7244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966176
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152	NC_009664	CAC	2	6	7304	7309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966176
153	NC_009664	GGC	2	6	7409	7414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966176
154	NC_009664	TCG	2	6	7534	7539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966176
155	NC_009664	GGA	2	6	7592	7597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966176
156	NC_009664	TGC	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966176
157	NC_009664	GAC	2	6	7635	7640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966176
158	NC_009664	CGT	2	6	7695	7700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_009664	TCC	2	6	7831	7836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966175
160	NC_009664	ACG	2	6	7889	7894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966175
161	NC_009664	ACC	3	9	7925	7933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966175
162	NC_009664	ACC	2	6	7949	7954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966175
163	NC_009664	CGA	2	6	7974	7979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966175
164	NC_009664	CAA	2	6	8154	8159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009664	CGG	2	6	8209	8214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966174
166	NC_009664	TCC	2	6	8223	8228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966174
167	NC_009664	GCC	2	6	8285	8290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966174
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169	NC_009664	CGT	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966174
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172	NC_009664	CGG	2	6	8464	8469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966174
173	NC_009664	CGC	2	6	8470	8475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966174
174	NC_009664	CAC	2	6	8518	8523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966174
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180	NC_009664	ATC	2	6	8750	8755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152966174
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192	NC_009664	CGG	2	6	9195	9200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_009664	CGT	2	6	9257	9262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_009664	CGA	3	9	9296	9304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_009664	GCA	2	6	9332	9337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_009664	TCG	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_009664	CGA	2	6	9457	9462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_009664	GAG	2	6	9465	9470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
199	NC_009664	CTG	2	6	9573	9578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966173
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210	NC_009664	GAG	3	9	9910	9918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966173
211	NC_009664	GCC	2	6	9940	9945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
212	NC_009664	ACC	2	6	10023	10028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966172
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219	NC_009664	CCG	2	6	10508	10513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966172
220	NC_009664	CCG	3	9	10555	10563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966172
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223	NC_009664	CCT	2	6	10753	10758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966171
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245	NC_009664	CGG	2	6	11515	11520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966171
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248	NC_009664	CGG	2	6	11812	11817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_009664	CGG	2	6	11835	11840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_009664	ACG	2	6	11918	11923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_009664	ACG	2	6	11927	11932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_009664	GGT	2	6	11989	11994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966170
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255	NC_009664	GGT	2	6	12219	12224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966170
256	NC_009664	CCT	2	6	12228	12233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966170
257	NC_009664	GGC	2	6	12327	12332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966170
258	NC_009664	TGG	2	6	12341	12346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966170
259	NC_009664	CGG	2	6	12378	12383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966170
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261	NC_009664	CGG	2	6	12432	12437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966170
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