MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN5

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009651	GGCCT	2	10	881	890	0 %	20 %	40 %	40 %	152973733
2	NC_009651	GGCCT	2	10	1074	1083	0 %	20 %	40 %	40 %	152973734
3	NC_009651	GAGCA	2	10	1263	1272	40 %	0 %	40 %	20 %	152973734
4	NC_009651	GGTCA	2	10	4974	4983	20 %	20 %	40 %	20 %	152973738
5	NC_009651	CTGTA	2	10	5009	5018	20 %	40 %	20 %	20 %	152973738
6	NC_009651	GTGAT	2	10	6601	6610	20 %	40 %	40 %	0 %	152973742
7	NC_009651	TGCCG	2	10	7028	7037	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009651	CGCAG	2	10	7087	7096	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009651	GGCAC	2	10	7248	7257	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009651	GGCAC	2	10	7492	7501	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009651	CACGG	2	10	7510	7519	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009651	CCGGG	2	10	7559	7568	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009651	CCCCT	2	10	7643	7652	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_009651	CCGGA	2	10	7736	7745	20 %	0 %	40 %	40 %	152973743
15	NC_009651	CACGG	2	10	9777	9786	20 %	0 %	40 %	40 %	229269517
16	NC_009651	CATCA	2	10	9801	9810	40 %	20 %	0 %	40 %	229269517
17	NC_009651	CCCGT	2	10	10072	10081	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_009651	GGCCT	2	10	10733	10742	0 %	20 %	40 %	40 %	152973748
19	NC_009651	GAGCA	2	10	10922	10931	40 %	0 %	40 %	20 %	152973748
20	NC_009651	GCCTT	2	10	12986	12995	0 %	40 %	20 %	40 %	152973750
21	NC_009651	GGGAG	2	10	13218	13227	20 %	0 %	80 %	0 %	152973751
22	NC_009651	TGGCT	2	10	15422	15431	0 %	40 %	40 %	20 %	152973752
23	NC_009651	CGCGC	2	10	15825	15834	0 %	0 %	40 %	60 %	152973752
24	NC_009651	TCGTG	2	10	19559	19568	0 %	40 %	40 %	20 %	152973755
25	NC_009651	CAGGG	2	10	22642	22651	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009651	GGCCT	2	10	23187	23196	0 %	20 %	40 %	40 %	152973759
27	NC_009651	GAGCA	2	10	23376	23385	40 %	0 %	40 %	20 %	152973759
28	NC_009651	GAGCA	2	10	24011	24020	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009651	GCCGG	2	10	26206	26215	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009651	CGAAA	2	10	26261	26270	60 %	0 %	20 %	20 %	152973763
31	NC_009651	TTGCC	2	10	26479	26488	0 %	40 %	20 %	40 %	152973763
32	NC_009651	CATCT	2	10	27899	27908	20 %	40 %	0 %	40 %	152973765
33	NC_009651	GGCCT	2	10	28311	28320	0 %	20 %	40 %	40 %	152973766
34	NC_009651	GAGCA	2	10	28500	28509	40 %	0 %	40 %	20 %	152973766
35	NC_009651	TCATG	2	10	31556	31565	20 %	40 %	20 %	20 %	152973769
36	NC_009651	GGAAA	2	10	33280	33289	60 %	0 %	40 %	0 %	152973770
37	NC_009651	ATCCC	2	10	34383	34392	20 %	20 %	0 %	60 %	152973771
38	NC_009651	CGCTG	2	10	34526	34535	0 %	20 %	40 %	40 %	152973771
39	NC_009651	GCCGC	2	10	37631	37640	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_009651	CGAAC	2	10	38439	38448	40 %	0 %	20 %	40 %	152973776
41	NC_009651	GGCCT	2	10	39741	39750	0 %	20 %	40 %	40 %	152973777
42	NC_009651	GAGCA	2	10	39930	39939	40 %	0 %	40 %	20 %	152973777
43	NC_009651	ATGAA	2	10	42530	42539	60 %	20 %	20 %	0 %	152973779
44	NC_009651	GCAAG	2	10	45372	45381	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009651	GGCAG	2	10	46096	46105	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009651	GCAGC	2	10	48547	48556	20 %	0 %	40 %	40 %	152973784
47	NC_009651	TCCAG	2	10	48993	49002	20 %	20 %	20 %	40 %	152973784
48	NC_009651	GCCAG	2	10	49257	49266	20 %	0 %	40 %	40 %	152973784
49	NC_009651	GAACA	2	10	51167	51176	60 %	0 %	20 %	20 %	152973786
50	NC_009651	GCGAC	2	10	51401	51410	20 %	0 %	40 %	40 %	152973786
51	NC_009651	CGTTT	2	10	52208	52217	0 %	60 %	20 %	20 %	152973788
52	NC_009651	ACCGT	2	10	54096	54105	20 %	20 %	20 %	40 %	152973790
53	NC_009651	AGTTC	2	10	55490	55499	20 %	40 %	20 %	20 %	152973792
54	NC_009651	GAAAA	2	10	58667	58676	80 %	0 %	20 %	0 %	152973795
55	NC_009651	TCAGC	2	10	59343	59352	20 %	20 %	20 %	40 %	152973795
56	NC_009651	CCCCG	2	10	59803	59812	0 %	0 %	20 %	80 %	152973796
57	NC_009651	CAGTT	2	10	60292	60301	20 %	40 %	20 %	20 %	152973796
58	NC_009651	CTTTC	2	10	60909	60918	0 %	60 %	0 %	40 %	152973796
59	NC_009651	AGGGC	2	10	62045	62054	20 %	0 %	60 %	20 %	152973798
60	NC_009651	GGCCT	2	10	62526	62535	0 %	20 %	40 %	40 %	152973798
61	NC_009651	TGCTC	2	10	63759	63768	0 %	40 %	20 %	40 %	152973800
62	NC_009651	AGGCC	2	10	63948	63957	20 %	0 %	40 %	40 %	152973800
63	NC_009651	GCCGC	2	10	64704	64713	0 %	0 %	40 %	60 %	152973801
64	NC_009651	CTGGC	2	10	65743	65752	0 %	20 %	40 %	40 %	152973804
65	NC_009651	CCCTG	2	10	66115	66124	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_009651	CGCCC	2	10	66242	66251	0 %	0 %	20 %	80 %	152973805
67	NC_009651	GGCCT	2	10	67171	67180	0 %	20 %	40 %	40 %	152973806
68	NC_009651	GAGCA	2	10	67360	67369	40 %	0 %	40 %	20 %	152973806
69	NC_009651	TTTGG	2	10	70756	70765	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009651	AGCGA	2	10	70987	70996	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009651	TGCTC	2	10	72106	72115	0 %	40 %	20 %	40 %	152973811
72	NC_009651	AGGCC	2	10	72295	72304	20 %	0 %	40 %	40 %	152973811
73	NC_009651	CGTGT	2	10	73665	73674	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009651	TCCAC	2	10	73822	73831	20 %	20 %	0 %	60 %	152973813
75	NC_009651	GGCCC	2	10	75887	75896	0 %	0 %	40 %	60 %	152973815
76	NC_009651	TGCTC	2	10	77253	77262	0 %	40 %	20 %	40 %	152973817
77	NC_009651	AGGCC	2	10	77442	77451	20 %	0 %	40 %	40 %	152973817
78	NC_009651	CTGAC	2	10	79218	79227	20 %	20 %	20 %	40 %	152973819
79	NC_009651	GGCCT	2	10	84512	84521	0 %	20 %	40 %	40 %	152973824
80	NC_009651	GAGCA	2	10	84701	84710	40 %	0 %	40 %	20 %	152973824
81	NC_009651	GCCGG	2	10	86343	86352	0 %	0 %	60 %	40 %	152973827
82	NC_009651	ACGGT	2	10	87001	87010	20 %	20 %	40 %	20 %	152973827
83	NC_009651	GGCAC	2	10	87021	87030	20 %	0 %	40 %	40 %	152973827
84	NC_009651	TTAAA	2	10	87516	87525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.