MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN5

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009651	CAGG	2	8	743	750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009651	GGCG	2	8	1287	1294	0 %	0 %	75 %	25 %	152973734
3	NC_009651	CAGC	2	8	1604	1611	25 %	0 %	25 %	50 %	152973734
4	NC_009651	CAGC	2	8	2159	2166	25 %	0 %	25 %	50 %	152973735
5	NC_009651	CGGG	2	8	2978	2985	0 %	0 %	75 %	25 %	152973736
6	NC_009651	CCGC	2	8	3385	3392	0 %	0 %	25 %	75 %	152973736
7	NC_009651	TCCT	2	8	3710	3717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009651	CATC	2	8	5855	5862	25 %	25 %	0 %	50 %	152973740
9	NC_009651	AGGG	2	8	7633	7640	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009651	GACG	2	8	7976	7983	25 %	0 %	50 %	25 %	152973743
11	NC_009651	GAGG	2	8	8042	8049	25 %	0 %	75 %	0 %	152973743
12	NC_009651	AGGC	2	8	8108	8115	25 %	0 %	50 %	25 %	152973743
13	NC_009651	CAGC	2	8	8131	8138	25 %	0 %	25 %	50 %	152973743
14	NC_009651	AGCC	2	8	8310	8317	25 %	0 %	25 %	50 %	152973743
15	NC_009651	GCCA	2	8	8362	8369	25 %	0 %	25 %	50 %	152973743
16	NC_009651	CATC	2	8	8964	8971	25 %	25 %	0 %	50 %	152973745
17	NC_009651	CGTC	2	8	9695	9702	0 %	25 %	25 %	50 %	229269517
18	NC_009651	TCTG	2	8	9716	9723	0 %	50 %	25 %	25 %	229269517
19	NC_009651	GAAT	2	8	9824	9831	50 %	25 %	25 %	0 %	229269517
20	NC_009651	CCGT	2	8	9956	9963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009651	GCGG	2	8	10108	10115	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009651	GGCG	2	8	10946	10953	0 %	0 %	75 %	25 %	152973748
23	NC_009651	CAGC	2	8	11263	11270	25 %	0 %	25 %	50 %	152973748
24	NC_009651	CTGC	2	8	11694	11701	0 %	25 %	25 %	50 %	152973749
25	NC_009651	TCTG	2	8	12501	12508	0 %	50 %	25 %	25 %	152973750
26	NC_009651	GGCT	2	8	13578	13585	0 %	25 %	50 %	25 %	152973751
27	NC_009651	CTGC	2	8	13975	13982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009651	CTGG	2	8	14127	14134	0 %	25 %	50 %	25 %	152973752
29	NC_009651	CGGT	2	8	14239	14246	0 %	25 %	50 %	25 %	152973752
30	NC_009651	CGCC	2	8	14294	14301	0 %	0 %	25 %	75 %	152973752
31	NC_009651	CCGA	2	8	14809	14816	25 %	0 %	25 %	50 %	152973752
32	NC_009651	TTTA	2	8	16482	16489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009651	CTCC	2	8	16502	16509	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_009651	ATGC	2	8	16972	16979	25 %	25 %	25 %	25 %	152973753
35	NC_009651	TCAT	2	8	17586	17593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009651	CAAG	2	8	17759	17766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009651	ATCA	2	8	18049	18056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009651	GCAG	2	8	18930	18937	25 %	0 %	50 %	25 %	152973754
39	NC_009651	TCTG	2	8	19149	19156	0 %	50 %	25 %	25 %	152973754
40	NC_009651	GAAA	2	8	19320	19327	75 %	0 %	25 %	0 %	152973754
41	NC_009651	GTCA	2	8	19908	19915	25 %	25 %	25 %	25 %	152973756
42	NC_009651	CGTG	2	8	20325	20332	0 %	25 %	50 %	25 %	152973756
43	NC_009651	ACCC	2	8	20710	20717	25 %	0 %	0 %	75 %	152973756
44	NC_009651	CACC	2	8	20968	20975	25 %	0 %	0 %	75 %	152973756
45	NC_009651	TACA	2	8	21429	21436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009651	TGCC	2	8	21478	21485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009651	GCCA	2	8	21499	21506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009651	CGAG	2	8	22829	22836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009651	GGCG	2	8	23400	23407	0 %	0 %	75 %	25 %	152973759
50	NC_009651	CAGC	2	8	23717	23724	25 %	0 %	25 %	50 %	152973759
51	NC_009651	GGCG	2	8	24035	24042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009651	CAGC	2	8	24352	24359	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009651	CAAT	2	8	25068	25075	50 %	25 %	0 %	25 %	152973761
54	NC_009651	CTTT	2	8	25243	25250	0 %	75 %	0 %	25 %	152973761
55	NC_009651	ATAA	2	8	25312	25319	75 %	25 %	0 %	0 %	152973761
56	NC_009651	AATA	2	8	25583	25590	75 %	25 %	0 %	0 %	152973762
57	NC_009651	AATG	2	8	25633	25640	50 %	25 %	25 %	0 %	152973762
58	NC_009651	GCAG	2	8	25954	25961	25 %	0 %	50 %	25 %	152973762
59	NC_009651	ATTT	2	8	26165	26172	25 %	75 %	0 %	0 %	152973762
60	NC_009651	GGCG	2	8	26342	26349	0 %	0 %	75 %	25 %	152973763
61	NC_009651	GGCT	2	8	27000	27007	0 %	25 %	50 %	25 %	152973764
62	NC_009651	ACTA	2	8	27282	27289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009651	TTTC	2	8	27562	27569	0 %	75 %	0 %	25 %	152973765
64	NC_009651	GCCA	2	8	27586	27593	25 %	0 %	25 %	50 %	152973765
65	NC_009651	ATTC	2	8	27635	27642	25 %	50 %	0 %	25 %	152973765
66	NC_009651	GGCG	2	8	28524	28531	0 %	0 %	75 %	25 %	152973766
67	NC_009651	CAGC	2	8	28841	28848	25 %	0 %	25 %	50 %	152973766
68	NC_009651	ATTG	2	8	29296	29303	25 %	50 %	25 %	0 %	152973767
69	NC_009651	TATG	2	8	29338	29345	25 %	50 %	25 %	0 %	152973767
70	NC_009651	AAGT	2	8	29918	29925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009651	GACA	2	8	30099	30106	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009651	TTTA	2	8	30421	30428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009651	TTGA	2	8	30473	30480	25 %	50 %	25 %	0 %	152973768
74	NC_009651	AATA	2	8	30822	30829	75 %	25 %	0 %	0 %	152973768
75	NC_009651	TTCT	2	8	31185	31192	0 %	75 %	0 %	25 %	152973769
76	NC_009651	TGAT	2	8	31489	31496	25 %	50 %	25 %	0 %	152973769
77	NC_009651	AATA	2	8	31872	31879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009651	AGCG	2	8	32971	32978	25 %	0 %	50 %	25 %	152973770
79	NC_009651	GAGC	2	8	32998	33005	25 %	0 %	50 %	25 %	152973770
80	NC_009651	TTGC	2	8	33050	33057	0 %	50 %	25 %	25 %	152973770
81	NC_009651	GTTT	2	8	33620	33627	0 %	75 %	25 %	0 %	152973770
82	NC_009651	CTTT	2	8	33989	33996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009651	GCGG	2	8	34053	34060	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009651	CGGC	2	8	34737	34744	0 %	0 %	50 %	50 %	152973771
85	NC_009651	TGGC	2	8	34766	34773	0 %	25 %	50 %	25 %	152973771
86	NC_009651	GGAT	2	8	35093	35100	25 %	25 %	50 %	0 %	152973772
87	NC_009651	AGAA	2	8	35112	35119	75 %	0 %	25 %	0 %	152973772
88	NC_009651	AGCC	2	8	35242	35249	25 %	0 %	25 %	50 %	152973772
89	NC_009651	CCGA	2	8	35377	35384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009651	AGAC	2	8	35540	35547	50 %	0 %	25 %	25 %	152973773
91	NC_009651	GCAA	2	8	35817	35824	50 %	0 %	25 %	25 %	152973773
92	NC_009651	TGCC	2	8	35976	35983	0 %	25 %	25 %	50 %	152973773
93	NC_009651	TGAA	2	8	36950	36957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009651	GCTG	2	8	37201	37208	0 %	25 %	50 %	25 %	152973774
95	NC_009651	TCAA	2	8	37273	37280	50 %	25 %	0 %	25 %	152973774
96	NC_009651	CCGC	2	8	37370	37377	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_009651	CGCC	2	8	38001	38008	0 %	0 %	25 %	75 %	152973775
98	NC_009651	ATCG	2	8	38105	38112	25 %	25 %	25 %	25 %	152973775
99	NC_009651	CTGG	2	8	38543	38550	0 %	25 %	50 %	25 %	152973776
100	NC_009651	TTTG	2	8	39583	39590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009651	GGCG	2	8	39954	39961	0 %	0 %	75 %	25 %	152973777
102	NC_009651	CAGC	2	8	40271	40278	25 %	0 %	25 %	50 %	152973777
103	NC_009651	GCCT	2	8	41109	41116	0 %	25 %	25 %	50 %	152973778
104	NC_009651	TAAT	2	8	41318	41325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009651	TTAT	2	8	41735	41742	25 %	75 %	0 %	0 %	152973779
106	NC_009651	CTGA	2	8	43221	43228	25 %	25 %	25 %	25 %	152973780
107	NC_009651	ACTT	2	8	43783	43790	25 %	50 %	0 %	25 %	152973781
108	NC_009651	GACT	2	8	45130	45137	25 %	25 %	25 %	25 %	152973782
109	NC_009651	AACG	2	8	45302	45309	50 %	0 %	25 %	25 %	152973782
110	NC_009651	CGTT	2	8	45532	45539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009651	TTTG	2	8	45622	45629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009651	AGCC	2	8	45917	45924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009651	TATC	2	8	45947	45954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009651	GGAA	2	8	46283	46290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009651	TAAG	2	8	46359	46366	50 %	25 %	25 %	0 %	152973783
116	NC_009651	GGCT	2	8	46401	46408	0 %	25 %	50 %	25 %	152973783
117	NC_009651	CCTG	2	8	46410	46417	0 %	25 %	25 %	50 %	152973783
118	NC_009651	GCTG	2	8	46878	46885	0 %	25 %	50 %	25 %	152973783
119	NC_009651	ACCG	2	8	47882	47889	25 %	0 %	25 %	50 %	152973783
120	NC_009651	CTGC	2	8	47910	47917	0 %	25 %	25 %	50 %	152973783
121	NC_009651	CCCG	2	8	48021	48028	0 %	0 %	25 %	75 %	152973783
122	NC_009651	CGGG	2	8	48690	48697	0 %	0 %	75 %	25 %	152973784
123	NC_009651	TCCA	2	8	49181	49188	25 %	25 %	0 %	50 %	152973784
124	NC_009651	GCAC	2	8	49556	49563	25 %	0 %	25 %	50 %	152973784
125	NC_009651	GCTG	2	8	49605	49612	0 %	25 %	50 %	25 %	152973784
126	NC_009651	TGTT	2	8	49632	49639	0 %	75 %	25 %	0 %	152973784
127	NC_009651	GCCT	2	8	49755	49762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009651	TCCC	2	8	49888	49895	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_009651	AAGG	2	8	50172	50179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009651	GGCG	2	8	50364	50371	0 %	0 %	75 %	25 %	152973785
131	NC_009651	GCTG	2	8	50537	50544	0 %	25 %	50 %	25 %	152973785
132	NC_009651	GTCA	2	8	50930	50937	25 %	25 %	25 %	25 %	152973785
133	NC_009651	GCTG	2	8	50992	50999	0 %	25 %	50 %	25 %	152973785
134	NC_009651	TGGC	2	8	51752	51759	0 %	25 %	50 %	25 %	152973787
135	NC_009651	TGAA	2	8	52689	52696	50 %	25 %	25 %	0 %	152973789
136	NC_009651	AGTC	2	8	53240	53247	25 %	25 %	25 %	25 %	152973789
137	NC_009651	CCAC	2	8	53437	53444	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_009651	TTTG	2	8	53504	53511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009651	CTGG	2	8	53528	53535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009651	CGGC	2	8	53928	53935	0 %	0 %	50 %	50 %	152973790
141	NC_009651	CAGC	2	8	53995	54002	25 %	0 %	25 %	50 %	152973790
142	NC_009651	TGGG	2	8	55586	55593	0 %	25 %	75 %	0 %	152973792
143	NC_009651	TGGC	2	8	55955	55962	0 %	25 %	50 %	25 %	152973792
144	NC_009651	ATTT	2	8	56348	56355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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226	NC_009651	AAGT	2	8	88031	88038	50 %	25 %	25 %	0 %	152973829

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.