MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN5

Total Repeats: 1775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009651	ATT	2	6	2	7	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009651	TGA	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973732
3	NC_009651	TGA	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973732
4	NC_009651	ACG	2	6	145	150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973732
5	NC_009651	TCC	2	6	233	238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973732
6	NC_009651	ACC	2	6	274	279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973732
7	NC_009651	TCA	2	6	313	318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973732
8	NC_009651	CTT	2	6	402	407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973732
9	NC_009651	TCC	2	6	427	432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973732
10	NC_009651	CTG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973732
11	NC_009651	TAT	2	6	636	641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009651	CAGG	2	8	743	750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009651	ATA	2	6	866	871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973733
14	NC_009651	GGCCT	2	10	881	890	0 %	20 %	40 %	40 %	152973733
15	NC_009651	TGG	2	6	925	930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973733
16	NC_009651	ATA	2	6	1059	1064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973734
17	NC_009651	GGCCT	2	10	1074	1083	0 %	20 %	40 %	40 %	152973734
18	NC_009651	TGG	2	6	1118	1123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973734
19	NC_009651	GTT	2	6	1203	1208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973734
20	NC_009651	GAGCA	2	10	1263	1272	40 %	0 %	40 %	20 %	152973734
21	NC_009651	GC	3	6	1274	1279	0 %	0 %	50 %	50 %	152973734
22	NC_009651	GGCG	2	8	1287	1294	0 %	0 %	75 %	25 %	152973734
23	NC_009651	TGA	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973734
24	NC_009651	CTT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973734
25	NC_009651	GTT	2	6	1338	1343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973734
26	NC_009651	ACG	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973734
27	NC_009651	GGA	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973734
28	NC_009651	GA	3	6	1393	1398	50 %	0 %	50 %	0 %	152973734
29	NC_009651	CAGC	2	8	1604	1611	25 %	0 %	25 %	50 %	152973734
30	NC_009651	ATG	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973734
31	NC_009651	GAT	2	6	1736	1741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009651	CAC	2	6	1750	1755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973735
33	NC_009651	CCG	2	6	1899	1904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973735
34	NC_009651	ATC	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973735
35	NC_009651	CGG	2	6	1935	1940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973735
36	NC_009651	GAT	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973735
37	NC_009651	CAGC	2	8	2159	2166	25 %	0 %	25 %	50 %	152973735
38	NC_009651	GC	3	6	2239	2244	0 %	0 %	50 %	50 %	152973735
39	NC_009651	ATG	2	6	2289	2294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973735
40	NC_009651	T	6	6	2348	2353	0 %	100 %	0 %	0 %	152973736
41	NC_009651	GT	3	6	2441	2446	0 %	50 %	50 %	0 %	152973736
42	NC_009651	GCA	2	6	2457	2462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973736
43	NC_009651	CGC	2	6	2561	2566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973736
44	NC_009651	TTC	2	6	2568	2573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973736
45	NC_009651	CCT	2	6	2584	2589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973736
46	NC_009651	CG	3	6	2807	2812	0 %	0 %	50 %	50 %	152973736
47	NC_009651	TGG	2	6	2856	2861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973736
48	NC_009651	TAA	2	6	2914	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973736
49	NC_009651	GA	3	6	2942	2947	50 %	0 %	50 %	0 %	152973736
50	NC_009651	CGGG	2	8	2978	2985	0 %	0 %	75 %	25 %	152973736
51	NC_009651	T	7	7	3136	3142	0 %	100 %	0 %	0 %	152973736
52	NC_009651	CGG	2	6	3147	3152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973736
53	NC_009651	AG	3	6	3192	3197	50 %	0 %	50 %	0 %	152973736
54	NC_009651	GC	4	8	3202	3209	0 %	0 %	50 %	50 %	152973736
55	NC_009651	GC	3	6	3225	3230	0 %	0 %	50 %	50 %	152973736
56	NC_009651	GC	4	8	3284	3291	0 %	0 %	50 %	50 %	152973736
57	NC_009651	TGG	2	6	3303	3308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973736
58	NC_009651	CCGC	2	8	3385	3392	0 %	0 %	25 %	75 %	152973736
59	NC_009651	GC	3	6	3420	3425	0 %	0 %	50 %	50 %	152973736
60	NC_009651	GTCCTC	2	12	3452	3463	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152973736
61	NC_009651	TCC	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973736
62	NC_009651	TTG	2	6	3561	3566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973736
63	NC_009651	TTC	2	6	3581	3586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973736
64	NC_009651	ATG	2	6	3598	3603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973736
65	NC_009651	TAT	2	6	3619	3624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973736
66	NC_009651	TCCT	2	8	3710	3717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009651	GCC	2	6	3724	3729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009651	GGC	2	6	3738	3743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009651	TCA	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009651	GC	3	6	3912	3917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009651	GAC	2	6	3931	3936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009651	A	6	6	3964	3969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009651	T	6	6	4069	4074	0 %	100 %	0 %	0 %	152973737
74	NC_009651	CTT	3	9	4097	4105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973737
75	NC_009651	CCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973737
76	NC_009651	TTTTTC	2	12	4301	4312	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152973737
77	NC_009651	CTG	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009651	CGC	2	6	4426	4431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009651	T	7	7	4484	4490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009651	CGC	2	6	4643	4648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009651	ACG	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009651	GCG	2	6	4722	4727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009651	GCA	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009651	GCC	2	6	4787	4792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009651	CGG	2	6	4817	4822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009651	CGA	2	6	4861	4866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009651	TG	3	6	4915	4920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009651	AGC	3	9	4950	4958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009651	GGTCA	2	10	4974	4983	20 %	20 %	40 %	20 %	152973738
90	NC_009651	CTGTA	2	10	5009	5018	20 %	40 %	20 %	20 %	152973738
91	NC_009651	ATG	3	9	5111	5119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973738
92	NC_009651	C	6	6	5208	5213	0 %	0 %	0 %	100 %	152973738
93	NC_009651	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	152973738
94	NC_009651	TCC	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_009651	AC	3	6	5318	5323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009651	CTG	2	6	5342	5347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973739
97	NC_009651	TAT	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973739
98	NC_009651	GC	3	6	5382	5387	0 %	0 %	50 %	50 %	152973739
99	NC_009651	GCT	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973739
100	NC_009651	CAA	2	6	5467	5472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973739
101	NC_009651	ACG	2	6	5481	5486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973739
102	NC_009651	CAG	2	6	5515	5520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973739
103	NC_009651	CTC	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973739
104	NC_009651	AGA	2	6	5607	5612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009651	CG	3	6	5733	5738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009651	C	6	6	5758	5763	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_009651	C	6	6	5788	5793	0 %	0 %	0 %	100 %	152973740
108	NC_009651	GAA	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973740
109	NC_009651	GCC	2	6	5808	5813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973740
110	NC_009651	CATC	2	8	5855	5862	25 %	25 %	0 %	50 %	152973740
111	NC_009651	CGG	3	9	5899	5907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973740
112	NC_009651	CGG	2	6	5983	5988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009651	CCG	2	6	5995	6000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009651	GCT	2	6	6048	6053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973741
115	NC_009651	TCC	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973741
116	NC_009651	TCA	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973741
117	NC_009651	CGG	2	6	6368	6373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973741
118	NC_009651	TTCGTC	2	12	6402	6413	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	152973741
119	NC_009651	GCC	2	6	6453	6458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973741
120	NC_009651	TGA	2	6	6504	6509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973741
121	NC_009651	GCG	2	6	6568	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973742
122	NC_009651	GTGAT	2	10	6601	6610	20 %	40 %	40 %	0 %	152973742
123	NC_009651	GCA	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973742
124	NC_009651	CTG	2	6	6661	6666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973742
125	NC_009651	ATG	2	6	6669	6674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973742
126	NC_009651	GCC	2	6	6676	6681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973742
127	NC_009651	AAT	2	6	6711	6716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973742
128	NC_009651	CGC	2	6	6720	6725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973742
129	NC_009651	CAT	2	6	6792	6797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973742
130	NC_009651	GCC	2	6	6801	6806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973742
131	NC_009651	C	6	6	6805	6810	0 %	0 %	0 %	100 %	152973742
132	NC_009651	GCC	2	6	6837	6842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973742
133	NC_009651	T	6	6	6861	6866	0 %	100 %	0 %	0 %	152973742
134	NC_009651	CTC	2	6	6945	6950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973742
135	NC_009651	TGCCG	2	10	7028	7037	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_009651	CGCAG	2	10	7087	7096	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009651	ACG	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009651	GAA	2	6	7156	7161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009651	CAT	2	6	7169	7174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009651	A	7	7	7175	7181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009651	GGC	2	6	7200	7205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009651	GGCAC	2	10	7248	7257	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_009651	AGG	2	6	7273	7278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009651	TC	3	6	7293	7298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009651	ACC	2	6	7311	7316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_009651	CGG	2	6	7404	7409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009651	GGC	2	6	7444	7449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009651	GGCAC	2	10	7492	7501	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_009651	CACGG	2	10	7510	7519	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_009651	CCGGG	2	10	7559	7568	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
151	NC_009651	CAC	2	6	7603	7608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_009651	AGGG	2	8	7633	7640	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009651	CCCCT	2	10	7643	7652	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
155	NC_009651	CTG	2	6	7680	7685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973743
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157	NC_009651	CCGGA	2	10	7736	7745	20 %	0 %	40 %	40 %	152973743
158	NC_009651	TCC	2	6	7797	7802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973743
159	NC_009651	TTCGTC	2	12	7889	7900	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	152973743
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163	NC_009651	CAG	2	6	8063	8068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973743
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177	NC_009651	CTG	2	6	8482	8487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_009651	GGC	2	6	8529	8534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973744
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184	NC_009651	CATC	2	8	8964	8971	25 %	25 %	0 %	50 %	152973745
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268	NC_009651	CT	3	6	13290	13295	0 %	50 %	0 %	50 %	152973751
269	NC_009651	GC	3	6	13437	13442	0 %	0 %	50 %	50 %	152973751
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273	NC_009651	CAT	2	6	13559	13564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973751
274	NC_009651	GGCT	2	8	13578	13585	0 %	25 %	50 %	25 %	152973751
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397	NC_009651	AGC	2	6	19928	19933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973756
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402	NC_009651	CGTG	2	8	20325	20332	0 %	25 %	50 %	25 %	152973756
403	NC_009651	GCC	2	6	20374	20379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973756
404	NC_009651	CCG	2	6	20409	20414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973756
405	NC_009651	GGC	2	6	20415	20420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973756
406	NC_009651	CTT	2	6	20446	20451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973756
407	NC_009651	GCC	2	6	20468	20473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973756
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420	NC_009651	GCC	2	6	21204	21209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
421	NC_009651	TTC	2	6	21223	21228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_009651	ATCCCG	2	12	21361	21372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
423	NC_009651	GCC	2	6	21386	21391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
424	NC_009651	TACA	2	8	21429	21436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
425	NC_009651	TGCC	2	8	21478	21485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
426	NC_009651	GCCA	2	8	21499	21506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
427	NC_009651	CA	3	6	21539	21544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
428	NC_009651	ACA	2	6	21558	21563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_009651	GGC	2	6	21743	21748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973757
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448	NC_009651	GCC	2	6	22654	22659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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451	NC_009651	CCG	2	6	22735	22740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
452	NC_009651	TCG	2	6	22755	22760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_009651	TGC	2	6	22771	22776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_009651	GTC	2	6	22797	22802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_009651	TCG	2	6	22809	22814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_009651	GCG	2	6	22818	22823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
457	NC_009651	CGAG	2	8	22829	22836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
458	NC_009651	A	8	8	22840	22847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_009651	GGC	2	6	22866	22871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_009651	GAA	2	6	22895	22900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
461	NC_009651	GGA	2	6	22918	22923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_009651	CG	3	6	22928	22933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
463	NC_009651	CCG	2	6	22993	22998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
464	NC_009651	GCT	2	6	23004	23009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_009651	CTG	2	6	23014	23019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_009651	TGC	3	9	23051	23059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_009651	CG	3	6	23064	23069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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489	NC_009651	GGCG	2	8	24035	24042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
490	NC_009651	TGA	2	6	24055	24060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
491	NC_009651	CTT	2	6	24077	24082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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496	NC_009651	CAGC	2	8	24352	24359	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_009651	ATG	2	6	24420	24425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
498	NC_009651	GAT	2	6	24484	24489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
499	NC_009651	CAC	2	6	24498	24503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
500	NC_009651	GCT	2	6	24554	24559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973760

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