MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN5

Total Repeats: 1775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009651	CCA	2	6	77402	77407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973817
1502	NC_009651	AGGCC	2	10	77442	77451	20 %	0 %	40 %	40 %	152973817
1503	NC_009651	TAT	2	6	77461	77466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973817
1504	NC_009651	TGC	2	6	77580	77585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973818
1505	NC_009651	CTGG	2	8	77605	77612	0 %	25 %	50 %	25 %	152973818
1506	NC_009651	GTG	2	6	77622	77627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973818
1507	NC_009651	TCGCGC	2	12	77649	77660	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152973818
1508	NC_009651	CAT	2	6	77686	77691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973818
1509	NC_009651	CGG	2	6	77758	77763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973818
1510	NC_009651	GCT	3	9	77803	77811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973818
1511	NC_009651	CTG	2	6	77846	77851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973818
1512	NC_009651	GGC	2	6	77884	77889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973818
1513	NC_009651	GGT	2	6	77935	77940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973818
1514	NC_009651	CAT	2	6	78046	78051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973818
1515	NC_009651	CGC	2	6	78087	78092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973818
1516	NC_009651	CAT	2	6	78100	78105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973818
1517	NC_009651	TGA	2	6	78228	78233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973818
1518	NC_009651	GTG	2	6	78263	78268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973818
1519	NC_009651	GCT	2	6	78271	78276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973818
1520	NC_009651	GAT	2	6	78283	78288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973818
1521	NC_009651	CCA	2	6	78294	78299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973818
1522	NC_009651	GAC	2	6	78305	78310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973818
1523	NC_009651	CCT	2	6	78375	78380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973818
1524	NC_009651	CGG	2	6	78385	78390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973818
1525	NC_009651	GAT	2	6	78406	78411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973818
1526	NC_009651	CGGG	2	8	78438	78445	0 %	0 %	75 %	25 %	152973818
1527	NC_009651	GGC	2	6	78450	78455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973818
1528	NC_009651	CCG	2	6	78468	78473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973818
1529	NC_009651	GTG	2	6	78476	78481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973818
1530	NC_009651	CTG	3	9	78482	78490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973818
1531	NC_009651	TGG	2	6	78492	78497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973818
1532	NC_009651	GGC	2	6	78532	78537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973818
1533	NC_009651	TGG	2	6	78540	78545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973818
1534	NC_009651	TGA	2	6	78549	78554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973818
1535	NC_009651	GTG	2	6	78626	78631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973818
1536	NC_009651	GTG	5	15	78644	78658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973818
1537	NC_009651	CCA	2	6	78720	78725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973818
1538	NC_009651	GAC	2	6	78764	78769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973818
1539	NC_009651	GTG	2	6	78860	78865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973818
1540	NC_009651	ACGC	2	8	78875	78882	25 %	0 %	25 %	50 %	152973818
1541	NC_009651	GC	3	6	78909	78914	0 %	0 %	50 %	50 %	152973818
1542	NC_009651	GGT	2	6	78922	78927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973818
1543	NC_009651	ATGA	2	8	78971	78978	50 %	25 %	25 %	0 %	152973818
1544	NC_009651	GAA	2	6	79025	79030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973818
1545	NC_009651	CAT	2	6	79072	79077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973819
1546	NC_009651	CCGG	2	8	79120	79127	0 %	0 %	50 %	50 %	152973819
1547	NC_009651	TGC	2	6	79138	79143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1548	NC_009651	GC	3	6	79164	79169	0 %	0 %	50 %	50 %	152973819
1549	NC_009651	GCT	2	6	79177	79182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1550	NC_009651	CCG	2	6	79209	79214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973819
1551	NC_009651	CTGAC	2	10	79218	79227	20 %	20 %	20 %	40 %	152973819
1552	NC_009651	AGC	2	6	79254	79259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1553	NC_009651	GCT	2	6	79300	79305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1554	NC_009651	GCT	2	6	79378	79383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1555	NC_009651	CGC	2	6	79542	79547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973819
1556	NC_009651	ACG	2	6	79569	79574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1557	NC_009651	GCA	2	6	79575	79580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1558	NC_009651	GCT	2	6	79621	79626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1559	NC_009651	TTC	2	6	79695	79700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973819
1560	NC_009651	CTG	2	6	79730	79735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1561	NC_009651	CAC	2	6	79852	79857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973819
1562	NC_009651	CTG	2	6	79886	79891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1563	NC_009651	TGC	2	6	79893	79898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973819
1564	NC_009651	GCG	2	6	79980	79985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973820
1565	NC_009651	CAG	2	6	80008	80013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973820
1566	NC_009651	TATC	2	8	80073	80080	25 %	50 %	0 %	25 %	152973820
1567	NC_009651	CCG	2	6	80136	80141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973820
1568	NC_009651	CGA	2	6	80215	80220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973820
1569	NC_009651	GCA	2	6	80316	80321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973820
1570	NC_009651	GTG	2	6	80328	80333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973820
1571	NC_009651	CAG	2	6	80362	80367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973820
1572	NC_009651	CCAC	2	8	80409	80416	25 %	0 %	0 %	75 %	152973820
1573	NC_009651	TGG	2	6	80453	80458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973820
1574	NC_009651	AAG	3	9	80459	80467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973820
1575	NC_009651	GGT	2	6	80470	80475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973820
1576	NC_009651	CAG	3	9	80509	80517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973820
1577	NC_009651	TTTC	2	8	80547	80554	0 %	75 %	0 %	25 %	152973820
1578	NC_009651	CAA	2	6	80634	80639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973820
1579	NC_009651	GC	3	6	80666	80671	0 %	0 %	50 %	50 %	152973820
1580	NC_009651	GC	3	6	80682	80687	0 %	0 %	50 %	50 %	152973820
1581	NC_009651	GC	3	6	80782	80787	0 %	0 %	50 %	50 %	152973820
1582	NC_009651	GCC	2	6	80824	80829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973820
1583	NC_009651	CGC	2	6	80866	80871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973820
1584	NC_009651	CAG	2	6	80887	80892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973820
1585	NC_009651	AGC	2	6	80903	80908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973820
1586	NC_009651	GCG	2	6	80932	80937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973820
1587	NC_009651	GTG	2	6	80942	80947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973820
1588	NC_009651	TCA	2	6	80988	80993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973820
1589	NC_009651	GCC	2	6	81013	81018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973820
1590	NC_009651	CCG	2	6	81023	81028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973820
1591	NC_009651	TGA	2	6	81140	81145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973820
1592	NC_009651	CCG	2	6	81198	81203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_009651	ACG	2	6	81211	81216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_009651	GCT	2	6	81228	81233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_009651	GA	3	6	81310	81315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_009651	CT	3	6	81350	81355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_009651	TGC	2	6	81422	81427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_009651	CTC	2	6	81474	81479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_009651	CGC	2	6	81485	81490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_009651	GCG	2	6	81554	81559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_009651	TGA	2	6	81604	81609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_009651	GCC	2	6	81648	81653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_009651	ATC	2	6	81658	81663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_009651	TGG	2	6	81726	81731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973821
1605	NC_009651	GCTG	2	8	81736	81743	0 %	25 %	50 %	25 %	152973821
1606	NC_009651	GCTG	2	8	81752	81759	0 %	25 %	50 %	25 %	152973821
1607	NC_009651	GCGG	2	8	81823	81830	0 %	0 %	75 %	25 %	152973821
1608	NC_009651	ATT	2	6	81980	81985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973821
1609	NC_009651	CTG	2	6	82003	82008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973821
1610	NC_009651	TGA	2	6	82031	82036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973821
1611	NC_009651	T	7	7	82047	82053	0 %	100 %	0 %	0 %	152973821
1612	NC_009651	GTC	2	6	82054	82059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973821
1613	NC_009651	GCT	2	6	82065	82070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973821
1614	NC_009651	TGA	2	6	82084	82089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_009651	CTGC	2	8	82105	82112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_009651	AATT	2	8	82203	82210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_009651	T	6	6	82217	82222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_009651	T	8	8	82291	82298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_009651	AGGG	2	8	82305	82312	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_009651	GT	3	6	82314	82319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_009651	CAGA	2	8	82329	82336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_009651	CGG	2	6	82390	82395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973822
1623	NC_009651	TCA	2	6	82404	82409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973822
1624	NC_009651	CAG	2	6	82416	82421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973822
1625	NC_009651	ATC	2	6	82427	82432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973822
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1627	NC_009651	CGC	2	6	82483	82488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973822
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.