MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 2224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009650	TAG	2	6	96277	96282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973724
2002	NC_009650	T	7	7	96325	96331	0 %	100 %	0 %	0 %	152973724
2003	NC_009650	TA	3	6	96365	96370	50 %	50 %	0 %	0 %	152973724
2004	NC_009650	TAT	2	6	96379	96384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973724
2005	NC_009650	TTTG	2	8	96400	96407	0 %	75 %	25 %	0 %	152973724
2006	NC_009650	TAA	2	6	96692	96697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973725
2007	NC_009650	TGA	2	6	96700	96705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973725
2008	NC_009650	CTGG	2	8	96812	96819	0 %	25 %	50 %	25 %	152973725
2009	NC_009650	ATA	2	6	96829	96834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973725
2010	NC_009650	GTC	2	6	96930	96935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973725
2011	NC_009650	CGG	2	6	96949	96954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973725
2012	NC_009650	GGTT	2	8	97014	97021	0 %	50 %	50 %	0 %	152973725
2013	NC_009650	TGG	2	6	97132	97137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973725
2014	NC_009650	GGC	2	6	97142	97147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973725
2015	NC_009650	TGG	2	6	97156	97161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973725
2016	NC_009650	CGT	2	6	97319	97324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973725
2017	NC_009650	TAA	2	6	97334	97339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973725
2018	NC_009650	ATCG	2	8	97394	97401	25 %	25 %	25 %	25 %	152973725
2019	NC_009650	ATTC	2	8	97479	97486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2020	NC_009650	AAT	2	6	97491	97496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_009650	ATTT	2	8	97534	97541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_009650	GCC	2	6	97560	97565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2023	NC_009650	CGG	2	6	97568	97573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_009650	TTAT	2	8	97601	97608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_009650	TC	3	6	97721	97726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2026	NC_009650	GTTA	2	8	97759	97766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_009650	TTC	2	6	97767	97772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2029	NC_009650	TG	3	6	97910	97915	0 %	50 %	50 %	0 %	152973726
2030	NC_009650	CT	3	6	97951	97956	0 %	50 %	0 %	50 %	152973726
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2035	NC_009650	TTTAT	2	10	98524	98533	20 %	80 %	0 %	0 %	152973727
2036	NC_009650	CTGATG	2	12	98551	98562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973727
2037	NC_009650	TGG	2	6	98605	98610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973727
2038	NC_009650	ACG	2	6	98614	98619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973727
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2041	NC_009650	TGC	2	6	98766	98771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973727
2042	NC_009650	TTC	2	6	98803	98808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973727
2043	NC_009650	GCC	2	6	98828	98833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973727
2044	NC_009650	CAG	2	6	98842	98847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973727
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2047	NC_009650	CGTG	2	8	99048	99055	0 %	25 %	50 %	25 %	152973727
2048	NC_009650	CAT	2	6	99072	99077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973727
2049	NC_009650	ACA	2	6	99206	99211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973727
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2051	NC_009650	GAC	2	6	99310	99315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973727
2052	NC_009650	GC	3	6	99372	99377	0 %	0 %	50 %	50 %	152973727
2053	NC_009650	GAA	2	6	99498	99503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973727
2054	NC_009650	GCG	2	6	99536	99541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973727
2055	NC_009650	GACC	2	8	99550	99557	25 %	0 %	25 %	50 %	152973727
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2057	NC_009650	TCC	2	6	99577	99582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973727
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2059	NC_009650	GT	3	6	99680	99685	0 %	50 %	50 %	0 %	152973727
2060	NC_009650	TCC	2	6	99740	99745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973727
2061	NC_009650	TGG	2	6	99762	99767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973727
2062	NC_009650	GCC	2	6	99829	99834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973727
2063	NC_009650	TGA	2	6	99848	99853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973727
2064	NC_009650	CTT	2	6	99864	99869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973727
2065	NC_009650	TGC	2	6	99900	99905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973727
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2067	NC_009650	CCTGT	2	10	100050	100059	0 %	40 %	20 %	40 %	152973727
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2089	NC_009650	TGACC	2	10	100979	100988	20 %	20 %	20 %	40 %	152973728
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2092	NC_009650	CACGA	2	10	101175	101184	40 %	0 %	20 %	40 %	152973728
2093	NC_009650	AC	3	6	101207	101212	50 %	0 %	0 %	50 %	152973728
2094	NC_009650	CGT	2	6	101219	101224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973728
2095	NC_009650	TC	3	6	101259	101264	0 %	50 %	0 %	50 %	152973728
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2104	NC_009650	GCC	2	6	101829	101834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973728
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2108	NC_009650	GGC	2	6	102140	102145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973728
2109	NC_009650	GGACG	2	10	102224	102233	20 %	0 %	60 %	20 %	152973728
2110	NC_009650	GCG	2	6	102400	102405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973728
2111	NC_009650	GGC	2	6	102426	102431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973728
2112	NC_009650	CAT	2	6	102449	102454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973728
2113	NC_009650	AGG	2	6	102601	102606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973728
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2119	NC_009650	GCG	2	6	103200	103205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973728
2120	NC_009650	ACG	2	6	103209	103214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973728
2121	NC_009650	AGC	2	6	103255	103260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973728
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2124	NC_009650	GACCT	2	10	103377	103386	20 %	20 %	20 %	40 %	152973728
2125	NC_009650	GCT	2	6	103400	103405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973728
2126	NC_009650	CTG	2	6	103530	103535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973728
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2128	NC_009650	C	6	6	103606	103611	0 %	0 %	0 %	100 %	152973728
2129	NC_009650	TGA	2	6	103636	103641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973728
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2224	NC_009650	GAG	2	6	107566	107571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.