MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN3

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009649	CT	3	6	1117	1122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009649	TA	3	6	1325	1330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009649	TG	3	6	1462	1467	0 %	50 %	50 %	0 %	152973419
4	NC_009649	TG	3	6	4387	4392	0 %	50 %	50 %	0 %	152973421
5	NC_009649	CT	3	6	5031	5036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009649	CG	3	6	6272	6277	0 %	0 %	50 %	50 %	152973423
7	NC_009649	CG	3	6	6475	6480	0 %	0 %	50 %	50 %	152973423
8	NC_009649	CG	3	6	6586	6591	0 %	0 %	50 %	50 %	152973423
9	NC_009649	AG	4	8	7043	7050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009649	AT	3	6	7846	7851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009649	TA	3	6	8035	8040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009649	CA	3	6	9413	9418	50 %	0 %	0 %	50 %	152973424
13	NC_009649	AG	3	6	12231	12236	50 %	0 %	50 %	0 %	152973426
14	NC_009649	AT	3	6	12754	12759	50 %	50 %	0 %	0 %	152973426
15	NC_009649	GT	3	6	12859	12864	0 %	50 %	50 %	0 %	152973426
16	NC_009649	AG	3	6	13398	13403	50 %	0 %	50 %	0 %	152973426
17	NC_009649	AT	3	6	13899	13904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009649	GC	3	6	14829	14834	0 %	0 %	50 %	50 %	152973427
19	NC_009649	GC	3	6	15251	15256	0 %	0 %	50 %	50 %	152973427
20	NC_009649	AT	3	6	15846	15851	50 %	50 %	0 %	0 %	152973428
21	NC_009649	CA	3	6	16393	16398	50 %	0 %	0 %	50 %	152973428
22	NC_009649	CG	4	8	16425	16432	0 %	0 %	50 %	50 %	152973428
23	NC_009649	TC	3	6	18391	18396	0 %	50 %	0 %	50 %	152973429
24	NC_009649	CG	4	8	18463	18470	0 %	0 %	50 %	50 %	152973429
25	NC_009649	TG	3	6	19992	19997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009649	GA	3	6	20261	20266	50 %	0 %	50 %	0 %	152973430
27	NC_009649	GC	3	6	20419	20424	0 %	0 %	50 %	50 %	152973430
28	NC_009649	CT	3	6	21205	21210	0 %	50 %	0 %	50 %	152973430
29	NC_009649	CT	3	6	22822	22827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009649	TC	3	6	24634	24639	0 %	50 %	0 %	50 %	152973433
31	NC_009649	CG	3	6	24752	24757	0 %	0 %	50 %	50 %	152973433
32	NC_009649	AC	3	6	28107	28112	50 %	0 %	0 %	50 %	152973437
33	NC_009649	AT	3	6	28602	28607	50 %	50 %	0 %	0 %	152973437
34	NC_009649	TA	3	6	29087	29092	50 %	50 %	0 %	0 %	152973438
35	NC_009649	TA	3	6	29351	29356	50 %	50 %	0 %	0 %	152973438
36	NC_009649	AT	3	6	30072	30077	50 %	50 %	0 %	0 %	152973440
37	NC_009649	TA	4	8	32357	32364	50 %	50 %	0 %	0 %	152973443
38	NC_009649	TC	4	8	32590	32597	0 %	50 %	0 %	50 %	152973443
39	NC_009649	GT	3	6	32951	32956	0 %	50 %	50 %	0 %	152973443
40	NC_009649	TC	3	6	33732	33737	0 %	50 %	0 %	50 %	152973445
41	NC_009649	CG	3	6	33850	33855	0 %	0 %	50 %	50 %	152973445
42	NC_009649	CT	3	6	34711	34716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009649	TC	3	6	35109	35114	0 %	50 %	0 %	50 %	152973447
44	NC_009649	CG	3	6	35463	35468	0 %	0 %	50 %	50 %	152973447
45	NC_009649	GC	3	6	37001	37006	0 %	0 %	50 %	50 %	152973449
46	NC_009649	CG	3	6	37613	37618	0 %	0 %	50 %	50 %	152973450
47	NC_009649	GC	3	6	37727	37732	0 %	0 %	50 %	50 %	152973450
48	NC_009649	CG	3	6	38317	38322	0 %	0 %	50 %	50 %	152973450
49	NC_009649	GC	3	6	38400	38405	0 %	0 %	50 %	50 %	152973450
50	NC_009649	GC	3	6	38464	38469	0 %	0 %	50 %	50 %	152973450
51	NC_009649	GC	3	6	39253	39258	0 %	0 %	50 %	50 %	152973451
52	NC_009649	GT	3	6	40400	40405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009649	TC	3	6	40601	40606	0 %	50 %	0 %	50 %	152973453
54	NC_009649	GC	3	6	42536	42541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009649	GC	3	6	42810	42815	0 %	0 %	50 %	50 %	152973455
56	NC_009649	GT	3	6	43086	43091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009649	GC	3	6	43229	43234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009649	GC	3	6	44404	44409	0 %	0 %	50 %	50 %	152973456
59	NC_009649	CG	3	6	45364	45369	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
60	NC_009649	GC	3	6	45384	45389	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
61	NC_009649	CG	3	6	45417	45422	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
62	NC_009649	GC	3	6	45786	45791	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
63	NC_009649	GC	3	6	46023	46028	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
64	NC_009649	CG	4	8	46070	46077	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
65	NC_009649	CG	3	6	46166	46171	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
66	NC_009649	GC	3	6	46636	46641	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
67	NC_009649	GC	3	6	46884	46889	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
68	NC_009649	GC	3	6	47055	47060	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
69	NC_009649	GC	3	6	47196	47201	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
70	NC_009649	GT	3	6	47870	47875	0 %	50 %	50 %	0 %	152973459
71	NC_009649	GC	3	6	47970	47975	0 %	0 %	50 %	50 %	152973459
72	NC_009649	GC	3	6	48562	48567	0 %	0 %	50 %	50 %	152973460
73	NC_009649	GC	3	6	49285	49290	0 %	0 %	50 %	50 %	152973461
74	NC_009649	AG	3	6	49665	49670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009649	CG	3	6	49710	49715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009649	AG	4	8	50954	50961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009649	AT	3	6	51677	51682	50 %	50 %	0 %	0 %	152973464
78	NC_009649	GC	3	6	51930	51935	0 %	0 %	50 %	50 %	152973464
79	NC_009649	CG	3	6	52109	52114	0 %	0 %	50 %	50 %	152973464
80	NC_009649	TC	3	6	52845	52850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009649	GA	3	6	53277	53282	50 %	0 %	50 %	0 %	152973465
82	NC_009649	AT	3	6	53900	53905	50 %	50 %	0 %	0 %	152973466
83	NC_009649	CT	3	6	55553	55558	0 %	50 %	0 %	50 %	152973468
84	NC_009649	TC	3	6	55583	55588	0 %	50 %	0 %	50 %	152973468
85	NC_009649	CT	3	6	55858	55863	0 %	50 %	0 %	50 %	152973469
86	NC_009649	AC	3	6	55907	55912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009649	CT	3	6	55913	55918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009649	AC	3	6	56396	56401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009649	AT	3	6	57006	57011	50 %	50 %	0 %	0 %	152973472
90	NC_009649	TA	3	6	57047	57052	50 %	50 %	0 %	0 %	152973472
91	NC_009649	TA	3	6	57338	57343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009649	TG	3	6	57879	57884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009649	GC	4	8	58251	58258	0 %	0 %	50 %	50 %	152973474
94	NC_009649	GC	3	6	58489	58494	0 %	0 %	50 %	50 %	152973475
95	NC_009649	AT	3	6	58772	58777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009649	AC	3	6	58937	58942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009649	CA	3	6	59003	59008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009649	AT	3	6	59022	59027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009649	CT	3	6	60804	60809	0 %	50 %	0 %	50 %	152973478
100	NC_009649	AC	3	6	61217	61222	50 %	0 %	0 %	50 %	152973478
101	NC_009649	GA	3	6	61258	61263	50 %	0 %	50 %	0 %	152973478
102	NC_009649	AG	3	6	61596	61601	50 %	0 %	50 %	0 %	152973478
103	NC_009649	TC	3	6	62932	62937	0 %	50 %	0 %	50 %	152973479
104	NC_009649	GA	3	6	63752	63757	50 %	0 %	50 %	0 %	152973481
105	NC_009649	AC	3	6	63983	63988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009649	CT	3	6	64946	64951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009649	AG	3	6	65248	65253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009649	GT	3	6	65384	65389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009649	AG	3	6	65759	65764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009649	GC	3	6	66698	66703	0 %	0 %	50 %	50 %	152973483
111	NC_009649	AT	3	6	67927	67932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009649	AT	4	8	68044	68051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009649	GA	3	6	68663	68668	50 %	0 %	50 %	0 %	152973486
114	NC_009649	CG	3	6	69375	69380	0 %	0 %	50 %	50 %	152973488
115	NC_009649	CT	3	6	70241	70246	0 %	50 %	0 %	50 %	152973489
116	NC_009649	CG	3	6	71052	71057	0 %	0 %	50 %	50 %	152973490
117	NC_009649	CA	3	6	72297	72302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009649	AC	3	6	73362	73367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009649	CT	3	6	75559	75564	0 %	50 %	0 %	50 %	152973496
120	NC_009649	AT	3	6	75827	75832	50 %	50 %	0 %	0 %	152973496
121	NC_009649	CG	3	6	75972	75977	0 %	0 %	50 %	50 %	152973497
122	NC_009649	TA	3	6	76446	76451	50 %	50 %	0 %	0 %	152973498
123	NC_009649	TG	3	6	77366	77371	0 %	50 %	50 %	0 %	152973499
124	NC_009649	GA	3	6	77692	77697	50 %	0 %	50 %	0 %	152973499
125	NC_009649	TC	3	6	78006	78011	0 %	50 %	0 %	50 %	152973499
126	NC_009649	AG	3	6	79001	79006	50 %	0 %	50 %	0 %	152973499
127	NC_009649	AT	3	6	79236	79241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009649	AT	3	6	79289	79294	50 %	50 %	0 %	0 %	152973500
129	NC_009649	GC	3	6	82096	82101	0 %	0 %	50 %	50 %	152973503
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131	NC_009649	CA	3	6	83142	83147	50 %	0 %	0 %	50 %	152973503
132	NC_009649	TC	3	6	83385	83390	0 %	50 %	0 %	50 %	152973503
133	NC_009649	TA	3	6	83733	83738	50 %	50 %	0 %	0 %	152973504
134	NC_009649	TC	4	8	84924	84931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009649	GA	3	6	85536	85541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009649	CG	3	6	86384	86389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009649	AG	3	6	86803	86808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009649	GC	3	6	87375	87380	0 %	0 %	50 %	50 %	152973505
139	NC_009649	GC	3	6	88177	88182	0 %	0 %	50 %	50 %	152973505
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142	NC_009649	AG	3	6	92531	92536	50 %	0 %	50 %	0 %	152973509
143	NC_009649	CT	3	6	93755	93760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009649	AT	3	6	94867	94872	50 %	50 %	0 %	0 %	152973513
145	NC_009649	GA	3	6	95862	95867	50 %	0 %	50 %	0 %	152973514
146	NC_009649	GC	3	6	96047	96052	0 %	0 %	50 %	50 %	152973514
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.