MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Jannaschia sp. CCS1 chromosome

Total Repeats: 7560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007802	CGATG	2	10	610628	610637	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_007802	GTT	2	6	610690	610695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_007802	GCG	2	6	610713	610718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_007802	G	6	6	610767	610772	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_007802	G	9	9	610812	610820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_007802	CCG	2	6	612400	612405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_007802	CAA	2	6	613927	613932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_007802	GAG	2	6	614550	614555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_007802	TA	4	8	614598	614605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_007802	TGA	2	6	618217	618222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_007802	CGG	2	6	618225	618230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_007802	TCC	2	6	618310	618315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_007802	CT	3	6	618333	618338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_007802	TTGA	2	8	618346	618353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_007802	CT	3	6	618365	618370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_007802	CGT	2	6	618420	618425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_007802	CG	3	6	618431	618436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_007802	GAA	2	6	618502	618507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_007802	CTG	2	6	619468	619473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_007802	GC	3	6	619541	619546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_007802	ATG	2	6	619559	619564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_007802	GCCCC	2	10	619572	619581	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1023	NC_007802	TTGT	2	8	620877	620884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_007802	GGC	2	6	620952	620957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_007802	CCG	2	6	620959	620964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_007802	GC	4	8	620974	620981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_007802	CG	3	6	621094	621099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_007802	TCC	2	6	621129	621134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_007802	GAC	2	6	621175	621180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_007802	CG	3	6	622400	622405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_007802	T	6	6	626231	626236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_007802	TTC	2	6	626262	626267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_007802	TCC	2	6	628081	628086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_007802	GGGA	2	8	628143	628150	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_007802	GAT	2	6	631491	631496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_007802	CGGA	2	8	631514	631521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_007802	AGG	2	6	631533	631538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_007802	TGACA	2	10	631559	631568	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_007802	GGA	2	6	631672	631677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_007802	CGG	2	6	632734	632739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_007802	GCC	2	6	635023	635028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_007802	TAT	2	6	642344	642349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_007802	CAT	2	6	642351	642356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_007802	GC	3	6	642370	642375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_007802	CGG	2	6	644039	644044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_007802	CCG	2	6	644068	644073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_007802	CGC	2	6	644110	644115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_007802	GGC	2	6	645596	645601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_007802	GGC	2	6	645604	645609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_007802	CA	3	6	645618	645623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_007802	GGGCCG	2	12	650734	650745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_007802	TGA	2	6	650786	650791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_007802	CCGTT	2	10	650905	650914	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1054	NC_007802	GCG	2	6	652563	652568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_007802	GCG	2	6	652582	652587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_007802	CGC	2	6	652636	652641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_007802	GC	3	6	652644	652649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_007802	TGA	2	6	653071	653076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_007802	C	6	6	653090	653095	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1060	NC_007802	GAA	2	6	653134	653139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_007802	CG	3	6	654215	654220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_007802	GAT	2	6	654249	654254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_007802	CGG	2	6	654286	654291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_007802	GCCTT	2	10	661081	661090	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1065	NC_007802	GA	3	6	661151	661156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_007802	TAT	2	6	662714	662719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_007802	ATG	2	6	662746	662751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_007802	GGA	2	6	662752	662757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_007802	C	6	6	664245	664250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1070	NC_007802	G	6	6	664256	664261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_007802	GCC	2	6	665858	665863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_007802	GC	3	6	665864	665869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_007802	CG	3	6	667257	667262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_007802	CGG	2	6	668199	668204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_007802	TCTG	2	8	668235	668242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_007802	GCC	2	6	668249	668254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_007802	GC	3	6	668283	668288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_007802	GGC	2	6	668300	668305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_007802	GGA	2	6	668329	668334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_007802	GCA	2	6	668811	668816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_007802	ATCC	2	8	668831	668838	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_007802	GTG	2	6	668854	668859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_007802	CCG	2	6	668872	668877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_007802	GTC	2	6	669833	669838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_007802	CGGG	2	8	671299	671306	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_007802	GCCT	2	8	671312	671319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_007802	CAA	2	6	671379	671384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_007802	GTT	2	6	671456	671461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_007802	CGC	2	6	671475	671480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_007802	CTTC	2	8	671494	671501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_007802	CG	3	6	671612	671617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_007802	GGC	2	6	672652	672657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_007802	CGT	2	6	672670	672675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_007802	TGGCG	2	10	672710	672719	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1095	NC_007802	AAT	2	6	674394	674399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_007802	GGGC	2	8	674427	674434	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_007802	GGC	2	6	675131	675136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_007802	GC	3	6	675135	675140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_007802	GCC	2	6	675152	675157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_007802	CG	3	6	678124	678129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_007802	CTC	2	6	678144	678149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_007802	ATT	2	6	678174	678179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_007802	GCG	2	6	680355	680360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_007802	GAT	2	6	681905	681910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_007802	CA	3	6	681912	681917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_007802	GCC	2	6	682684	682689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_007802	CCG	2	6	682704	682709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_007802	CAT	2	6	682730	682735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_007802	ACG	2	6	682786	682791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_007802	TCA	2	6	684706	684711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_007802	TAA	2	6	684718	684723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_007802	CG	4	8	685142	685149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_007802	CGG	2	6	687013	687018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_007802	T	7	7	687661	687667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_007802	GCG	2	6	687698	687703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_007802	T	6	6	688474	688479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_007802	A	6	6	688487	688492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_007802	T	6	6	688515	688520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_007802	GCC	2	6	688623	688628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_007802	CTT	2	6	688640	688645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_007802	CG	3	6	689362	689367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_007802	CAG	2	6	689458	689463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_007802	GGGCG	2	10	689507	689516	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_007802	CGG	2	6	689552	689557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_007802	CAT	2	6	690406	690411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_007802	ATC	2	6	690419	690424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_007802	G	8	8	690432	690439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_007802	CTT	2	6	690500	690505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_007802	GTCG	2	8	690559	690566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_007802	CG	3	6	690599	690604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_007802	GCCC	2	8	690661	690668	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1132	NC_007802	CG	3	6	690710	690715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_007802	GGA	2	6	690746	690751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_007802	CAGG	2	8	690753	690760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_007802	CTT	2	6	690776	690781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_007802	CAAAT	2	10	690895	690904	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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