MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Jannaschia sp. CCS1 chromosome

Total Repeats: 7560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007802	CG	3	6	350746	350751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_007802	CG	3	6	350780	350785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_007802	ATG	2	6	350829	350834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_007802	TCA	2	6	350888	350893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_007802	TCA	2	6	351495	351500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_007802	CG	4	8	352446	352453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_007802	GTT	2	6	352454	352459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007802	ATG	2	6	352924	352929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007802	AAGC	2	8	352964	352971	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_007802	CAC	2	6	353073	353078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_007802	CGC	2	6	353942	353947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_007802	TGA	2	6	353979	353984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_007802	CG	3	6	354304	354309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_007802	CGGGC	2	10	357410	357419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
515	NC_007802	GCG	2	6	357460	357465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_007802	CTGC	2	8	357483	357490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
517	NC_007802	TAT	2	6	357500	357505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_007802	CGGG	2	8	357549	357556	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
519	NC_007802	CAC	2	6	357612	357617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_007802	CGT	2	6	358821	358826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_007802	AGG	2	6	361865	361870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_007802	GCCC	2	8	361884	361891	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
523	NC_007802	ATC	2	6	361951	361956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_007802	CG	3	6	363530	363535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_007802	CTC	2	6	363547	363552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_007802	GCA	2	6	364044	364049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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528	NC_007802	AGG	2	6	364101	364106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_007802	AGG	2	6	364213	364218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_007802	GGTC	2	8	365075	365082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
531	NC_007802	GGT	2	6	365114	365119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007802	CG	3	6	365586	365591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_007802	TCGCCG	2	12	365627	365638	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
534	NC_007802	CG	3	6	367813	367818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_007802	TGT	2	6	367833	367838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_007802	TG	3	6	367858	367863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007802	ATC	2	6	370143	370148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_007802	TCC	2	6	370544	370549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_007802	GCCGC	2	10	370693	370702	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
540	NC_007802	AAT	2	6	370727	370732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007802	AC	3	6	370784	370789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_007802	GCGG	2	8	371821	371828	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
543	NC_007802	C	6	6	373849	373854	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
544	NC_007802	AACCA	2	10	375101	375110	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
545	NC_007802	C	6	6	375125	375130	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
546	NC_007802	TCGGG	2	10	376001	376010	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
547	NC_007802	CAG	2	6	376029	376034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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551	NC_007802	CAA	2	6	377951	377956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_007802	A	7	7	377961	377967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_007802	AAAAC	2	10	377970	377979	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
554	NC_007802	ACA	2	6	377984	377989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_007802	TGC	2	6	381483	381488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_007802	CGG	2	6	381577	381582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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558	NC_007802	GCG	2	6	382800	382805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_007802	GCGG	2	8	382811	382818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
560	NC_007802	GTC	2	6	382864	382869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_007802	CGT	2	6	382930	382935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_007802	GAG	2	6	382977	382982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007802	G	6	6	383145	383150	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007802	AGGC	2	8	383695	383702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_007802	GTC	2	6	384262	384267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_007802	GGC	2	6	384299	384304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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568	NC_007802	GAC	2	6	387034	387039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_007802	TGC	2	6	390866	390871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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571	NC_007802	TGACCA	2	12	390891	390902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_007802	GCC	2	6	393304	393309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_007802	CG	4	8	393337	393344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_007802	GTT	2	6	393382	393387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007802	GCG	2	6	393406	393411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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581	NC_007802	GGGCG	2	10	394136	394145	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
582	NC_007802	GCC	2	6	394164	394169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_007802	TGT	2	6	394172	394177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_007802	GCC	2	6	396133	396138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_007802	GGA	2	6	396159	396164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_007802	CTAT	2	8	396178	396185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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599	NC_007802	A	7	7	396988	396994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_007802	TG	3	6	399201	399206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007802	TCG	2	6	403728	403733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_007802	CTCG	2	8	403753	403760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_007802	TGG	2	6	403919	403924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_007802	GA	3	6	404119	404124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007802	CCA	2	6	404130	404135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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614	NC_007802	GTG	2	6	404318	404323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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625	NC_007802	GCCGC	2	10	416262	416271	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
626	NC_007802	G	6	6	416336	416341	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_007802	GT	3	6	416409	416414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_007802	CTTTT	2	10	417713	417722	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
632	NC_007802	CCTG	2	8	417729	417736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_007802	CGG	2	6	418420	418425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_007802	GC	4	8	419048	419055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_007802	CCA	3	9	419076	419084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_007802	CCA	2	6	419147	419152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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638	NC_007802	GAT	2	6	419215	419220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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