MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Jonesia denitrificans DSM 20603 chromosome

Total Repeats: 54702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013174	GGT	2	6	25431	25436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256831278
502	NC_013174	GCT	2	6	25437	25442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256831278
503	NC_013174	ATGG	2	8	25453	25460	25 %	25 %	50 %	0 %	256831278
504	NC_013174	GAA	2	6	25471	25476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256831278
505	NC_013174	ACG	2	6	25559	25564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256831278
506	NC_013174	AGA	2	6	25593	25598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256831278
507	NC_013174	GGCA	2	8	25623	25630	25 %	0 %	50 %	25 %	256831278
508	NC_013174	GAA	2	6	25657	25662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256831278
509	NC_013174	CGG	3	9	25665	25673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256831278
510	NC_013174	GTT	2	6	25726	25731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256831278
511	NC_013174	C	6	6	25748	25753	0 %	0 %	0 %	100 %	256831278
512	NC_013174	CTCC	2	8	25770	25777	0 %	25 %	0 %	75 %	256831278
513	NC_013174	GGGC	2	8	25833	25840	0 %	0 %	75 %	25 %	256831278
514	NC_013174	CGT	2	6	25890	25895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256831278
515	NC_013174	CAA	2	6	25906	25911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256831278
516	NC_013174	TCA	2	6	25949	25954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256831278
517	NC_013174	A	6	6	25980	25985	100 %	0 %	0 %	0 %	256831278
518	NC_013174	CAT	2	6	25989	25994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256831278
519	NC_013174	CTC	2	6	25998	26003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256831278
520	NC_013174	CAC	2	6	26049	26054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256831278
521	NC_013174	GCG	2	6	26098	26103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256831278
522	NC_013174	TTG	2	6	26222	26227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256831278
523	NC_013174	GTT	2	6	26236	26241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256831278
524	NC_013174	GCT	2	6	26275	26280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256831278
525	NC_013174	TGG	2	6	26307	26312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256831278
526	NC_013174	GACA	2	8	26340	26347	50 %	0 %	25 %	25 %	256831278
527	NC_013174	ACCC	2	8	26409	26416	25 %	0 %	0 %	75 %	256831278
528	NC_013174	GAG	2	6	26423	26428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256831278
529	NC_013174	ACT	2	6	26504	26509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256831279
530	NC_013174	AAC	2	6	26524	26529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256831279
531	NC_013174	GCC	2	6	26545	26550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256831279
532	NC_013174	GGC	2	6	26638	26643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256831279
533	NC_013174	GCT	2	6	26827	26832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256831279
534	NC_013174	GTT	2	6	26865	26870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256831279
535	NC_013174	ACC	2	6	26875	26880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256831279
536	NC_013174	CTG	2	6	26898	26903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256831279
537	NC_013174	CAA	2	6	26913	26918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256831279
538	NC_013174	CAG	2	6	26925	26930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256831279
539	NC_013174	CCA	2	6	26941	26946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256831279
540	NC_013174	CGC	2	6	27052	27057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256831279
541	NC_013174	CAT	2	6	27206	27211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256831279
542	NC_013174	AGGA	2	8	27285	27292	50 %	0 %	50 %	0 %	256831279
543	NC_013174	C	6	6	27317	27322	0 %	0 %	0 %	100 %	256831279
544	NC_013174	TTC	2	6	27391	27396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256831279
545	NC_013174	CAA	2	6	27432	27437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256831279
546	NC_013174	CAG	2	6	27486	27491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256831279
547	NC_013174	C	6	6	27622	27627	0 %	0 %	0 %	100 %	256831279
548	NC_013174	CTGC	2	8	27665	27672	0 %	25 %	25 %	50 %	256831279
549	NC_013174	CGT	2	6	27693	27698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256831279
550	NC_013174	GAC	2	6	27700	27705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256831279
551	NC_013174	GCT	2	6	27791	27796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256831279
552	NC_013174	GC	3	6	27805	27810	0 %	0 %	50 %	50 %	256831279
553	NC_013174	CAA	2	6	27822	27827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256831279
554	NC_013174	GCGG	2	8	27893	27900	0 %	0 %	75 %	25 %	256831279
555	NC_013174	CGG	2	6	27929	27934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256831279
556	NC_013174	GGC	2	6	27945	27950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256831279
557	NC_013174	CTGC	2	8	28027	28034	0 %	25 %	25 %	50 %	256831279
558	NC_013174	AC	3	6	28035	28040	50 %	0 %	0 %	50 %	256831279
559	NC_013174	GCA	2	6	28075	28080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256831279
560	NC_013174	CGC	2	6	28083	28088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256831279
561	NC_013174	CTC	2	6	28092	28097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256831279
562	NC_013174	CAA	2	6	28202	28207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256831279
563	NC_013174	ATT	2	6	28771	28776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256831280
564	NC_013174	GA	3	6	28900	28905	50 %	0 %	50 %	0 %	256831280
565	NC_013174	CCCA	2	8	28997	29004	25 %	0 %	0 %	75 %	256831280
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568	NC_013174	CAG	2	6	29084	29089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256831280
569	NC_013174	GGTT	2	8	29153	29160	0 %	50 %	50 %	0 %	256831280
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572	NC_013174	TCG	2	6	29456	29461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256831280
573	NC_013174	CGA	2	6	29462	29467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256831280
574	NC_013174	GCCC	2	8	29477	29484	0 %	0 %	25 %	75 %	256831280
575	NC_013174	GCG	2	6	29498	29503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256831280
576	NC_013174	GT	4	8	29584	29591	0 %	50 %	50 %	0 %	256831280
577	NC_013174	CGA	2	6	29610	29615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256831280
578	NC_013174	CG	3	6	29905	29910	0 %	0 %	50 %	50 %	256831281
579	NC_013174	ACT	2	6	30029	30034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256831281
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581	NC_013174	GATCGC	2	12	30057	30068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256831281
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584	NC_013174	CA	3	6	30565	30570	50 %	0 %	0 %	50 %	256831282
585	NC_013174	CAC	2	6	30587	30592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256831282
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588	NC_013174	CAC	2	6	30676	30681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256831282
589	NC_013174	GC	3	6	30716	30721	0 %	0 %	50 %	50 %	256831282
590	NC_013174	GGT	2	6	30744	30749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256831282
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593	NC_013174	GAG	2	6	30787	30792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256831282
594	NC_013174	TGA	2	6	30831	30836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256831282
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596	NC_013174	GAG	2	6	30964	30969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256831282
597	NC_013174	CGA	2	6	30975	30980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256831282
598	NC_013174	TGA	2	6	30990	30995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256831282
599	NC_013174	AGG	2	6	30998	31003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256831282
600	NC_013174	C	6	6	31054	31059	0 %	0 %	0 %	100 %	256831282
601	NC_013174	GGGTG	2	10	31081	31090	0 %	20 %	80 %	0 %	256831282
602	NC_013174	CT	3	6	31105	31110	0 %	50 %	0 %	50 %	256831282
603	NC_013174	TGG	2	6	31125	31130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256831282
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605	NC_013174	GCG	2	6	31178	31183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256831282
606	NC_013174	CGT	2	6	31188	31193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256831282
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608	NC_013174	TGG	2	6	31230	31235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256831282
609	NC_013174	GTG	2	6	31289	31294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256831282
610	NC_013174	CGA	2	6	31308	31313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256831282
611	NC_013174	CGCTG	2	10	31398	31407	0 %	20 %	40 %	40 %	256831282
612	NC_013174	GAA	2	6	31464	31469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256831282
613	NC_013174	CGCGC	2	10	31480	31489	0 %	0 %	40 %	60 %	256831282
614	NC_013174	GTG	2	6	31526	31531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256831282
615	NC_013174	TTC	2	6	31947	31952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256831283
616	NC_013174	ACT	2	6	32028	32033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256831283
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618	NC_013174	AAAAT	2	10	32126	32135	80 %	20 %	0 %	0 %	256831283
619	NC_013174	TGCA	2	8	32166	32173	25 %	25 %	25 %	25 %	256831283
620	NC_013174	TA	3	6	32193	32198	50 %	50 %	0 %	0 %	256831283
621	NC_013174	ATTGGA	2	12	32453	32464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256831283
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623	NC_013174	GATGGA	2	12	32579	32590	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	256831283
624	NC_013174	A	6	6	32599	32604	100 %	0 %	0 %	0 %	256831283
625	NC_013174	AAG	2	6	32646	32651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256831283
626	NC_013174	AATA	2	8	32734	32741	75 %	25 %	0 %	0 %	256831283
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628	NC_013174	AAG	2	6	32955	32960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256831283
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757	NC_013174	GTT	2	6	39552	39557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256831288
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