MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Jannaschia sp. CCS1 chromosome

Total Repeats: 83715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_007802	AAC	2	6	178935	178940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052677
3503	NC_007802	GCG	2	6	178974	178979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052677
3504	NC_007802	CTG	2	6	178992	178997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052677
3505	NC_007802	TGG	2	6	179026	179031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052677
3506	NC_007802	CATC	2	8	179035	179042	25 %	25 %	0 %	50 %	89052677
3507	NC_007802	CGC	2	6	179135	179140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052677
3508	NC_007802	CTA	2	6	179168	179173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052677
3509	NC_007802	CGC	2	6	179210	179215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052677
3510	NC_007802	CTG	2	6	179289	179294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052677
3511	NC_007802	CCG	2	6	179296	179301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052677
3512	NC_007802	ATT	2	6	179316	179321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89052677
3513	NC_007802	ACG	2	6	179393	179398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052677
3514	NC_007802	TCATG	2	10	179420	179429	20 %	40 %	20 %	20 %	89052677
3515	NC_007802	CTC	2	6	179499	179504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89052677
3516	NC_007802	CCG	2	6	179549	179554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052677
3517	NC_007802	GTC	2	6	179604	179609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052677
3518	NC_007802	CTT	2	6	179624	179629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052677
3519	NC_007802	CTT	2	6	179637	179642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052677
3520	NC_007802	CTTG	2	8	179660	179667	0 %	50 %	25 %	25 %	89052677
3521	NC_007802	GCG	2	6	179689	179694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052677
3522	NC_007802	GCA	2	6	179760	179765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052677
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3524	NC_007802	TCA	2	6	179826	179831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052678
3525	NC_007802	GCCGTG	2	12	179855	179866	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	89052678
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3528	NC_007802	CGA	2	6	179914	179919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052678
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3532	NC_007802	TCA	2	6	180012	180017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052678
3533	NC_007802	ATC	2	6	180074	180079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052678
3534	NC_007802	CGC	2	6	180094	180099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052678
3535	NC_007802	ATG	2	6	180353	180358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052678
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3537	NC_007802	CGC	2	6	180418	180423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052678
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3540	NC_007802	CGA	2	6	180529	180534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052678
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3542	NC_007802	ACG	2	6	180626	180631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052678
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3546	NC_007802	CGG	2	6	180903	180908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052678
3547	NC_007802	TGAA	2	8	180912	180919	50 %	25 %	25 %	0 %	89052678
3548	NC_007802	GC	4	8	180936	180943	0 %	0 %	50 %	50 %	89052678
3549	NC_007802	CGA	2	6	181139	181144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052679
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3551	NC_007802	TGA	2	6	181203	181208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052679
3552	NC_007802	GTG	2	6	181230	181235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052679
3553	NC_007802	GC	4	8	181375	181382	0 %	0 %	50 %	50 %	89052679
3554	NC_007802	GGC	2	6	181439	181444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052679
3555	NC_007802	ACCGC	2	10	181551	181560	20 %	0 %	20 %	60 %	89052679
3556	NC_007802	TC	3	6	181739	181744	0 %	50 %	0 %	50 %	89052679
3557	NC_007802	GTG	2	6	181754	181759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052679
3558	NC_007802	TCGCA	2	10	181780	181789	20 %	20 %	20 %	40 %	89052679
3559	NC_007802	TGAT	2	8	181803	181810	25 %	50 %	25 %	0 %	89052679
3560	NC_007802	TGGATG	2	12	181845	181856	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	89052679
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3562	NC_007802	G	6	6	182044	182049	0 %	0 %	100 %	0 %	89052679
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3588	NC_007802	CCGC	2	8	183331	183338	0 %	0 %	25 %	75 %	89052681
3589	NC_007802	CCAT	2	8	183362	183369	25 %	25 %	0 %	50 %	89052681
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3606	NC_007802	TC	3	6	184086	184091	0 %	50 %	0 %	50 %	89052682
3607	NC_007802	CGT	2	6	184170	184175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052682
3608	NC_007802	ATC	2	6	184229	184234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052682
3609	NC_007802	CG	3	6	184247	184252	0 %	0 %	50 %	50 %	89052682
3610	NC_007802	TCG	2	6	184355	184360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052682
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3612	NC_007802	G	6	6	184423	184428	0 %	0 %	100 %	0 %	89052682
3613	NC_007802	CG	3	6	184443	184448	0 %	0 %	50 %	50 %	89052682
3614	NC_007802	GCCA	2	8	184492	184499	25 %	0 %	25 %	50 %	89052682
3615	NC_007802	CAA	2	6	184504	184509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052682
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3619	NC_007802	G	6	6	184760	184765	0 %	0 %	100 %	0 %	89052683
3620	NC_007802	CTGG	2	8	184766	184773	0 %	25 %	50 %	25 %	89052683
3621	NC_007802	TCG	2	6	184795	184800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052683
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3623	NC_007802	TGA	2	6	184877	184882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052683
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3994	NC_007802	CGT	2	6	206130	206135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052702
3995	NC_007802	CTT	2	6	206148	206153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052702
3996	NC_007802	CTT	2	6	206227	206232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052702
3997	NC_007802	ATA	2	6	206275	206280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89052702
3998	NC_007802	GTC	3	9	206381	206389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052703
3999	NC_007802	TCA	2	6	206421	206426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052703
4000	NC_007802	CTCTTC	2	12	206435	206446	0 %	50 %	0 %	50 %	89052703

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