MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Jannaschia sp. CCS1 plasmid1

Total Repeats: 918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007801	ATC	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057700
2	NC_007801	TCA	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057700
3	NC_007801	CGG	2	6	278	283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
4	NC_007801	ACG	2	6	292	297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057700
5	NC_007801	GGT	2	6	314	319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057700
6	NC_007801	ATC	2	6	435	440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057700
7	NC_007801	CGA	2	6	473	478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057700
8	NC_007801	CCA	2	6	512	517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057700
9	NC_007801	CCA	2	6	566	571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057700
10	NC_007801	ATC	3	9	582	590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057700
11	NC_007801	GGC	2	6	738	743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
12	NC_007801	GAA	2	6	810	815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89057700
13	NC_007801	GCC	2	6	831	836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057700
14	NC_007801	GCC	2	6	844	849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057700
15	NC_007801	GCA	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057700
16	NC_007801	TGA	2	6	893	898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057700
17	NC_007801	GGC	2	6	972	977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
18	NC_007801	CGG	2	6	1106	1111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
19	NC_007801	CGA	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057700
20	NC_007801	TCA	2	6	1201	1206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057700
21	NC_007801	CAG	3	9	1212	1220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057700
22	NC_007801	CCG	2	6	1334	1339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057700
23	NC_007801	GCG	2	6	1354	1359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
24	NC_007801	GCG	2	6	1418	1423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
25	NC_007801	CGC	2	6	1478	1483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057700
26	NC_007801	GAT	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057700
27	NC_007801	GCC	3	9	1974	1982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057701
28	NC_007801	CGA	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057701
29	NC_007801	GGA	2	6	2149	2154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89057701
30	NC_007801	CAT	2	6	2162	2167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057701
31	NC_007801	CGC	2	6	2467	2472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057701
32	NC_007801	GCA	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057702
33	NC_007801	GCG	2	6	3037	3042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057702
34	NC_007801	GAT	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057702
35	NC_007801	GCC	2	6	3144	3149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057702
36	NC_007801	ATG	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057702
37	NC_007801	CTG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057702
38	NC_007801	GGC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057702
39	NC_007801	TCC	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89057702
40	NC_007801	GGC	2	6	3597	3602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057702
41	NC_007801	GGC	3	9	3612	3620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057702
42	NC_007801	TGA	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057702
43	NC_007801	CGG	2	6	3883	3888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057702
44	NC_007801	TGC	3	9	3967	3975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057702
45	NC_007801	ACC	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057702
46	NC_007801	CTG	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057702
47	NC_007801	CAA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89057702
48	NC_007801	GCG	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057703
49	NC_007801	GGC	2	6	4331	4336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057703
50	NC_007801	CAG	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057703
51	NC_007801	ATC	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057703
52	NC_007801	CGT	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057703
53	NC_007801	CCG	2	6	4772	4777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057703
54	NC_007801	GCC	2	6	4836	4841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057703
55	NC_007801	GAT	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057703
56	NC_007801	CCG	2	6	4858	4863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057703
57	NC_007801	CCG	2	6	4881	4886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057703
58	NC_007801	CAG	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057703
59	NC_007801	GCA	2	6	5004	5009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057703
60	NC_007801	CCG	2	6	5028	5033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057703
61	NC_007801	GAA	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89057704
62	NC_007801	GCA	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057704
63	NC_007801	TGT	2	6	5703	5708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89057704
64	NC_007801	CGT	2	6	5929	5934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057704
65	NC_007801	GCC	2	6	5958	5963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057704
66	NC_007801	GAG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89057704
67	NC_007801	CTG	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057704
68	NC_007801	GAT	2	6	6353	6358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057704
69	NC_007801	CAC	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057704
70	NC_007801	TCA	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057704
71	NC_007801	CGA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057704
72	NC_007801	CCA	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057704
73	NC_007801	GCG	2	6	6624	6629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057704
74	NC_007801	CGG	2	6	6670	6675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057704
75	NC_007801	GGA	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89057704
76	NC_007801	ATC	2	6	6738	6743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057704
77	NC_007801	TCT	2	6	7298	7303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89057705
78	NC_007801	CGA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057705
79	NC_007801	ACC	2	6	7375	7380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057705
80	NC_007801	CAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057705
81	NC_007801	TGG	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057705
82	NC_007801	TTC	2	6	7633	7638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89057706
83	NC_007801	GCT	2	6	7708	7713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057706
84	NC_007801	AGC	2	6	7795	7800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057706
85	NC_007801	CGA	2	6	7831	7836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057706
86	NC_007801	CAT	2	6	7858	7863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057706
87	NC_007801	CAT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057706
88	NC_007801	TGA	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057706
89	NC_007801	ATG	2	6	8219	8224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057706
90	NC_007801	CTG	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057706
91	NC_007801	ACG	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057706
92	NC_007801	AAC	2	6	8436	8441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89057706
93	NC_007801	ATC	2	6	8462	8467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057706
94	NC_007801	GCA	2	6	8884	8889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057707
95	NC_007801	CGA	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057707
96	NC_007801	GAA	2	6	8984	8989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89057707
97	NC_007801	GCC	2	6	9029	9034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057708
98	NC_007801	GAT	2	6	9036	9041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057708
99	NC_007801	CCG	2	6	9186	9191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057708
100	NC_007801	GAA	2	6	9453	9458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89057709
101	NC_007801	TCG	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057710
102	NC_007801	GTC	3	9	9783	9791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057710
103	NC_007801	GAC	2	6	9816	9821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057710
104	NC_007801	GCG	2	6	9858	9863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057710
105	NC_007801	CGA	2	6	10110	10115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057711
106	NC_007801	GCT	2	6	10128	10133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057711
107	NC_007801	ATC	2	6	10395	10400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057712
108	NC_007801	GCT	2	6	10451	10456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057712
109	NC_007801	GAC	2	6	10481	10486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057712
110	NC_007801	GTT	2	6	10526	10531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89057712
111	NC_007801	TGT	2	6	10545	10550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89057712
112	NC_007801	GCG	2	6	10767	10772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057712
113	NC_007801	GCC	2	6	11042	11047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057712
114	NC_007801	ATC	2	6	11096	11101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057712
115	NC_007801	TGG	2	6	11247	11252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057712
116	NC_007801	GCG	2	6	11314	11319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057712
117	NC_007801	GGC	2	6	11386	11391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057712
118	NC_007801	CGG	2	6	11461	11466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057712
119	NC_007801	CGG	2	6	11589	11594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057712
120	NC_007801	ACC	2	6	11678	11683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057712
121	NC_007801	TGG	2	6	11781	11786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057712
122	NC_007801	CAG	2	6	11795	11800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057712
123	NC_007801	TGC	2	6	11821	11826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057712
124	NC_007801	CGA	2	6	11866	11871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057712
125	NC_007801	CGC	2	6	11876	11881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057712
126	NC_007801	GCC	2	6	11978	11983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057712
127	NC_007801	CAG	2	6	11993	11998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057712
128	NC_007801	ATC	2	6	12062	12067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057712
129	NC_007801	GAG	2	6	12146	12151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89057712
130	NC_007801	CGG	2	6	12301	12306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057712
131	NC_007801	AGC	2	6	12437	12442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057712
132	NC_007801	GAC	2	6	12494	12499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057712
133	NC_007801	GGA	2	6	12574	12579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89057712
134	NC_007801	GCG	2	6	12601	12606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057712
135	NC_007801	TGC	2	6	12651	12656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057712
136	NC_007801	CTG	2	6	12686	12691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057712
137	NC_007801	CGG	2	6	12811	12816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057712
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152	NC_007801	CGC	2	6	14318	14323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057714
153	NC_007801	GAC	2	6	14330	14335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057714
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162	NC_007801	TAC	2	6	15458	15463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057716
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164	NC_007801	AGC	2	6	15606	15611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057716
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