MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Jonesia denitrificans DSM 20603 chromosome

Total Repeats: 6769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013174	ACGC	2	8	59	66	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013174	ATCG	2	8	197	204	25 %	25 %	25 %	25 %	256831256
3	NC_013174	TTTA	2	8	669	676	25 %	75 %	0 %	0 %	256831256
4	NC_013174	GGCG	2	8	818	825	0 %	0 %	75 %	25 %	256831256
5	NC_013174	CCAC	2	8	1881	1888	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_013174	GAGC	2	8	2132	2139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013174	GCAC	2	8	2761	2768	25 %	0 %	25 %	50 %	256831257
8	NC_013174	GTTG	2	8	2994	3001	0 %	50 %	50 %	0 %	256831257
9	NC_013174	TGGT	2	8	3466	3473	0 %	50 %	50 %	0 %	256831258
10	NC_013174	TCCT	2	8	4083	4090	0 %	50 %	0 %	50 %	256831258
11	NC_013174	TGTC	2	8	4546	4553	0 %	50 %	25 %	25 %	256831258
12	NC_013174	ATGG	2	8	4575	4582	25 %	25 %	50 %	0 %	256831258
13	NC_013174	GTGG	2	8	4838	4845	0 %	25 %	75 %	0 %	256831259
14	NC_013174	TGTT	2	8	4949	4956	0 %	75 %	25 %	0 %	256831259
15	NC_013174	TCAT	2	8	6205	6212	25 %	50 %	0 %	25 %	256831260
16	NC_013174	CAAA	2	8	6510	6517	75 %	0 %	0 %	25 %	256831260
17	NC_013174	ATGA	2	8	6564	6571	50 %	25 %	25 %	0 %	256831260
18	NC_013174	GGGT	2	8	6791	6798	0 %	25 %	75 %	0 %	256831260
19	NC_013174	CGCT	2	8	7841	7848	0 %	25 %	25 %	50 %	256831261
20	NC_013174	TTCA	2	8	8596	8603	25 %	50 %	0 %	25 %	256831261
21	NC_013174	TGCG	2	8	8699	8706	0 %	25 %	50 %	25 %	256831261
22	NC_013174	TTGA	2	8	8776	8783	25 %	50 %	25 %	0 %	256831261
23	NC_013174	TCCT	2	8	9008	9015	0 %	50 %	0 %	50 %	256831261
24	NC_013174	CCAG	2	8	9321	9328	25 %	0 %	25 %	50 %	256831261
25	NC_013174	GGAA	2	8	9913	9920	50 %	0 %	50 %	0 %	256831261
26	NC_013174	AACC	2	8	10179	10186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013174	GCCC	2	8	10572	10579	0 %	0 %	25 %	75 %	256831263
28	NC_013174	ACGA	2	8	10971	10978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013174	CTTT	2	8	11401	11408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013174	ACTG	2	8	12318	12325	25 %	25 %	25 %	25 %	256831266
31	NC_013174	GTCT	2	8	12424	12431	0 %	50 %	25 %	25 %	256831266
32	NC_013174	CGTG	2	8	12525	12532	0 %	25 %	50 %	25 %	256831266
33	NC_013174	TGGG	2	8	12570	12577	0 %	25 %	75 %	0 %	256831266
34	NC_013174	GCAG	2	8	12909	12916	25 %	0 %	50 %	25 %	256831267
35	NC_013174	GGTA	2	8	12952	12959	25 %	25 %	50 %	0 %	256831267
36	NC_013174	GTGG	2	8	13759	13766	0 %	25 %	75 %	0 %	256831267
37	NC_013174	GGTG	2	8	13961	13968	0 %	25 %	75 %	0 %	256831267
38	NC_013174	GGTG	2	8	14525	14532	0 %	25 %	75 %	0 %	256831268
39	NC_013174	GGTG	2	8	14644	14651	0 %	25 %	75 %	0 %	256831268
40	NC_013174	TGGG	2	8	14954	14961	0 %	25 %	75 %	0 %	256831268
41	NC_013174	GAAC	2	8	15529	15536	50 %	0 %	25 %	25 %	256831268
42	NC_013174	GTGG	2	8	15566	15573	0 %	25 %	75 %	0 %	256831268
43	NC_013174	GGTT	2	8	16279	16286	0 %	50 %	50 %	0 %	256831269
44	NC_013174	GTCA	2	8	16750	16757	25 %	25 %	25 %	25 %	256831269
45	NC_013174	GTGC	2	8	17055	17062	0 %	25 %	50 %	25 %	256831270
46	NC_013174	TGAG	2	8	17329	17336	25 %	25 %	50 %	0 %	256831270
47	NC_013174	GGGC	2	8	17603	17610	0 %	0 %	75 %	25 %	256831270
48	NC_013174	AACA	2	8	19655	19662	75 %	0 %	0 %	25 %	256831271
49	NC_013174	CACC	2	8	19710	19717	25 %	0 %	0 %	75 %	256831272
50	NC_013174	AGCA	2	8	19737	19744	50 %	0 %	25 %	25 %	256831272
51	NC_013174	AGCG	2	8	19899	19906	25 %	0 %	50 %	25 %	256831272
52	NC_013174	AGCA	2	8	20037	20044	50 %	0 %	25 %	25 %	256831272
53	NC_013174	ACAA	2	8	20311	20318	75 %	0 %	0 %	25 %	256831272
54	NC_013174	GCCC	2	8	20594	20601	0 %	0 %	25 %	75 %	256831273
55	NC_013174	TGGT	2	8	21193	21200	0 %	50 %	50 %	0 %	256831273
56	NC_013174	GCCC	2	8	21306	21313	0 %	0 %	25 %	75 %	256831273
57	NC_013174	GGGT	2	8	21337	21344	0 %	25 %	75 %	0 %	256831273
58	NC_013174	CAAC	2	8	21460	21467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013174	CGGC	2	8	21734	21741	0 %	0 %	50 %	50 %	256831274
60	NC_013174	CGCT	2	8	21836	21843	0 %	25 %	25 %	50 %	256831274
61	NC_013174	CGTG	2	8	21947	21954	0 %	25 %	50 %	25 %	256831274
62	NC_013174	GTGG	2	8	22028	22035	0 %	25 %	75 %	0 %	256831274
63	NC_013174	TGCC	2	8	22046	22053	0 %	25 %	25 %	50 %	256831274
64	NC_013174	GTTG	3	12	22279	22290	0 %	50 %	50 %	0 %	256831275
65	NC_013174	GCTT	2	8	22570	22577	0 %	50 %	25 %	25 %	256831275
66	NC_013174	GCGT	2	8	23464	23471	0 %	25 %	50 %	25 %	256831277
67	NC_013174	GCCA	2	8	24832	24839	25 %	0 %	25 %	50 %	256831277
68	NC_013174	ATGG	2	8	25453	25460	25 %	25 %	50 %	0 %	256831278
69	NC_013174	GGCA	2	8	25623	25630	25 %	0 %	50 %	25 %	256831278
70	NC_013174	CTCC	2	8	25770	25777	0 %	25 %	0 %	75 %	256831278
71	NC_013174	GGGC	2	8	25833	25840	0 %	0 %	75 %	25 %	256831278
72	NC_013174	GACA	2	8	26340	26347	50 %	0 %	25 %	25 %	256831278
73	NC_013174	ACCC	2	8	26409	26416	25 %	0 %	0 %	75 %	256831278
74	NC_013174	AGGA	2	8	27285	27292	50 %	0 %	50 %	0 %	256831279
75	NC_013174	CTGC	2	8	27665	27672	0 %	25 %	25 %	50 %	256831279
76	NC_013174	GCGG	2	8	27893	27900	0 %	0 %	75 %	25 %	256831279
77	NC_013174	CTGC	2	8	28027	28034	0 %	25 %	25 %	50 %	256831279
78	NC_013174	TTCG	2	8	28680	28687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013174	CCCA	2	8	28997	29004	25 %	0 %	0 %	75 %	256831280
80	NC_013174	GGTT	2	8	29153	29160	0 %	50 %	50 %	0 %	256831280
81	NC_013174	GCCC	2	8	29477	29484	0 %	0 %	25 %	75 %	256831280
82	NC_013174	GCCC	2	8	29677	29684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_013174	ATGT	2	8	30331	30338	25 %	50 %	25 %	0 %	256831281
84	NC_013174	GGGT	2	8	31163	31170	0 %	25 %	75 %	0 %	256831282
85	NC_013174	CAAC	2	8	31693	31700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013174	AATC	2	8	32063	32070	50 %	25 %	0 %	25 %	256831283
87	NC_013174	TGCA	2	8	32166	32173	25 %	25 %	25 %	25 %	256831283
88	NC_013174	AATA	2	8	32734	32741	75 %	25 %	0 %	0 %	256831283
89	NC_013174	AATG	2	8	33003	33010	50 %	25 %	25 %	0 %	256831284
90	NC_013174	GCGA	2	8	33231	33238	25 %	0 %	50 %	25 %	256831284
91	NC_013174	CATA	2	8	33731	33738	50 %	25 %	0 %	25 %	256831284
92	NC_013174	GGGT	2	8	34292	34299	0 %	25 %	75 %	0 %	256831285
93	NC_013174	GTGA	2	8	34497	34504	25 %	25 %	50 %	0 %	256831285
94	NC_013174	GAAA	2	8	34866	34873	75 %	0 %	25 %	0 %	256831285
95	NC_013174	TGCT	2	8	35871	35878	0 %	50 %	25 %	25 %	256831286
96	NC_013174	TGGG	2	8	36766	36773	0 %	25 %	75 %	0 %	256831286
97	NC_013174	TCGT	2	8	38207	38214	0 %	50 %	25 %	25 %	256831287
98	NC_013174	ATTT	2	8	38268	38275	25 %	75 %	0 %	0 %	256831287
99	NC_013174	ATTT	2	8	38697	38704	25 %	75 %	0 %	0 %	256831288
100	NC_013174	TTCG	2	8	38748	38755	0 %	50 %	25 %	25 %	256831288
101	NC_013174	TGTT	2	8	39188	39195	0 %	75 %	25 %	0 %	256831288
102	NC_013174	CTAT	2	8	39479	39486	25 %	50 %	0 %	25 %	256831288
103	NC_013174	GGCT	2	8	39506	39513	0 %	25 %	50 %	25 %	256831288
104	NC_013174	AGGG	2	8	39979	39986	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013174	TCTA	2	8	40516	40523	25 %	50 %	0 %	25 %	256831289
106	NC_013174	ATCG	2	8	42298	42305	25 %	25 %	25 %	25 %	256831290
107	NC_013174	CAAC	2	8	43634	43641	50 %	0 %	0 %	50 %	256831291
108	NC_013174	CCAC	2	8	43934	43941	25 %	0 %	0 %	75 %	256831291
109	NC_013174	ACTC	2	8	44114	44121	25 %	25 %	0 %	50 %	256831291
110	NC_013174	CAAC	2	8	44264	44271	50 %	0 %	0 %	50 %	256831291
111	NC_013174	CGCC	2	8	44680	44687	0 %	0 %	25 %	75 %	256831292
112	NC_013174	CGAG	2	8	44785	44792	25 %	0 %	50 %	25 %	256831292
113	NC_013174	CGAC	2	8	44911	44918	25 %	0 %	25 %	50 %	256831292
114	NC_013174	ACCA	2	8	44959	44966	50 %	0 %	0 %	50 %	256831292
115	NC_013174	ATCA	2	8	45255	45262	50 %	25 %	0 %	25 %	256831293
116	NC_013174	TCAG	2	8	45430	45437	25 %	25 %	25 %	25 %	256831293
117	NC_013174	AACG	2	8	45643	45650	50 %	0 %	25 %	25 %	256831293
118	NC_013174	ACCG	2	8	45796	45803	25 %	0 %	25 %	50 %	256831293
119	NC_013174	CACG	2	8	46475	46482	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013174	ACGC	2	8	46522	46529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013174	GCGT	2	8	46741	46748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013174	TGCA	2	8	46976	46983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013174	ACGC	2	8	47163	47170	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013174	ACCG	2	8	47261	47268	25 %	0 %	25 %	50 %	256831294
125	NC_013174	GAGT	2	8	47872	47879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013174	CCCT	2	8	48352	48359	0 %	25 %	0 %	75 %	256831295
127	NC_013174	ACAG	2	8	48650	48657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013174	GAAG	2	8	48675	48682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013174	ACCA	2	8	49406	49413	50 %	0 %	0 %	50 %	256831297
130	NC_013174	CTGG	2	8	49688	49695	0 %	25 %	50 %	25 %	256831297
131	NC_013174	ACCA	2	8	50534	50541	50 %	0 %	0 %	50 %	256831297
132	NC_013174	ACCT	2	8	50826	50833	25 %	25 %	0 %	50 %	256831297
133	NC_013174	CGCC	2	8	50924	50931	0 %	0 %	25 %	75 %	256831297
134	NC_013174	GCGA	2	8	51657	51664	25 %	0 %	50 %	25 %	256831298
135	NC_013174	AACC	2	8	51698	51705	50 %	0 %	0 %	50 %	256831298
136	NC_013174	CCAC	2	8	51788	51795	25 %	0 %	0 %	75 %	256831298
137	NC_013174	CGCT	2	8	51848	51855	0 %	25 %	25 %	50 %	256831298
138	NC_013174	AGCG	2	8	52050	52057	25 %	0 %	50 %	25 %	256831299
139	NC_013174	AACG	2	8	52304	52311	50 %	0 %	25 %	25 %	256831299
140	NC_013174	CAGC	2	8	52653	52660	25 %	0 %	25 %	50 %	256831299
141	NC_013174	CGCA	2	8	52861	52868	25 %	0 %	25 %	50 %	256831299
142	NC_013174	CAAC	2	8	52878	52885	50 %	0 %	0 %	50 %	256831299
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