MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Jannaschia sp. CCS1 chromosome

Total Repeats: 91275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_007802	GCG	2	6	245286	245291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052739
5003	NC_007802	CAA	2	6	245292	245297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052739
5004	NC_007802	TGG	2	6	245310	245315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052739
5005	NC_007802	TCG	2	6	245387	245392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052739
5006	NC_007802	CG	3	6	245461	245466	0 %	0 %	50 %	50 %	89052739
5007	NC_007802	GCG	2	6	245528	245533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052739
5008	NC_007802	TGG	2	6	245568	245573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052739
5009	NC_007802	CGA	2	6	245649	245654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052739
5010	NC_007802	GAA	2	6	245698	245703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052739
5011	NC_007802	GC	3	6	245795	245800	0 %	0 %	50 %	50 %	89052739
5012	NC_007802	GGTG	2	8	246000	246007	0 %	25 %	75 %	0 %	89052739
5013	NC_007802	GTC	2	6	246031	246036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052739
5014	NC_007802	GAGT	2	8	246112	246119	25 %	25 %	50 %	0 %	89052739
5015	NC_007802	TC	3	6	246210	246215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5017	NC_007802	AAC	2	6	246287	246292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052740
5018	NC_007802	GCGAT	2	10	246438	246447	20 %	20 %	40 %	20 %	89052740
5019	NC_007802	AGG	2	6	246488	246493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052740
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5021	NC_007802	CTG	2	6	246613	246618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052740
5022	NC_007802	TCT	2	6	246641	246646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052740
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5025	NC_007802	CTG	2	6	246742	246747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052740
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5027	NC_007802	GAC	2	6	246936	246941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052740
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5034	NC_007802	GCA	2	6	247132	247137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052741
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5037	NC_007802	TGA	2	6	247458	247463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052741
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5039	NC_007802	GAG	2	6	247538	247543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052742
5040	NC_007802	GCG	2	6	247560	247565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052742
5041	NC_007802	TGG	2	6	247575	247580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052742
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5043	NC_007802	T	6	6	247718	247723	0 %	100 %	0 %	0 %	89052742
5044	NC_007802	CTG	2	6	247766	247771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052742
5045	NC_007802	T	7	7	247785	247791	0 %	100 %	0 %	0 %	89052742
5046	NC_007802	ATC	3	9	247949	247957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052742
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5050	NC_007802	ATG	2	6	248102	248107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052742
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5054	NC_007802	GA	3	6	248328	248333	50 %	0 %	50 %	0 %	89052742
5055	NC_007802	GGA	2	6	248338	248343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052742
5056	NC_007802	GGCG	2	8	248359	248366	0 %	0 %	75 %	25 %	89052742
5057	NC_007802	TCT	2	6	248369	248374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052742
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5060	NC_007802	GGAT	2	8	248638	248645	25 %	25 %	50 %	0 %	89052742
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5122	NC_007802	GAG	2	6	251849	251854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052742
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5125	NC_007802	GC	3	6	251902	251907	0 %	0 %	50 %	50 %	89052742
5126	NC_007802	GAG	2	6	251969	251974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052742
5127	NC_007802	CGG	2	6	251976	251981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052742
5128	NC_007802	CGG	2	6	251985	251990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052742
5129	NC_007802	CCG	2	6	251998	252003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_007802	GC	3	6	252062	252067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5131	NC_007802	CG	4	8	252096	252103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_007802	CGG	2	6	252211	252216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_007802	TGAA	2	8	252259	252266	50 %	25 %	25 %	0 %	89052743
5134	NC_007802	TGCTT	2	10	252301	252310	0 %	60 %	20 %	20 %	89052743
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5141	NC_007802	TCA	2	6	252820	252825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052743
5142	NC_007802	CTG	2	6	252834	252839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052743
5143	NC_007802	ATC	2	6	252841	252846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052743
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5157	NC_007802	CG	3	6	253410	253415	0 %	0 %	50 %	50 %	89052744
5158	NC_007802	ACG	2	6	253500	253505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052744
5159	NC_007802	GGA	2	6	253517	253522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052744
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5164	NC_007802	TGA	2	6	253688	253693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052744
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5166	NC_007802	CG	3	6	253817	253822	0 %	0 %	50 %	50 %	89052744
5167	NC_007802	CGG	2	6	253874	253879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052744
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5233	NC_007802	CGA	2	6	256962	256967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052747
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5245	NC_007802	GCGCC	2	10	257478	257487	0 %	0 %	40 %	60 %	89052747
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5251	NC_007802	CCG	3	9	257682	257690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052747
5252	NC_007802	CGA	2	6	257700	257705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052747
5253	NC_007802	GC	3	6	257945	257950	0 %	0 %	50 %	50 %	89052747
5254	NC_007802	GTT	2	6	257952	257957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052747
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5257	NC_007802	GC	3	6	258081	258086	0 %	0 %	50 %	50 %	89052747
5258	NC_007802	TGGGT	2	10	258129	258138	0 %	40 %	60 %	0 %	89052747
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5281	NC_007802	CAT	2	6	259140	259145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052748
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5287	NC_007802	ACCGA	2	10	259375	259384	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5288	NC_007802	AGC	2	6	259388	259393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5290	NC_007802	AGGG	2	8	259466	259473	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5291	NC_007802	GAC	2	6	259496	259501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052749
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5334	NC_007802	GCC	2	6	262234	262239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5335	NC_007802	CCG	2	6	262302	262307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052752
5336	NC_007802	CGA	2	6	262350	262355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052752
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5338	NC_007802	CGC	2	6	262447	262452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052752
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5362	NC_007802	TGG	2	6	263511	263516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052752
5363	NC_007802	GCT	2	6	263755	263760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052752
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5366	NC_007802	CGC	3	9	263845	263853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052752
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5368	NC_007802	GCT	2	6	263889	263894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5369	NC_007802	GCAC	2	8	263957	263964	25 %	0 %	25 %	50 %	89052753
5370	NC_007802	AGC	2	6	264034	264039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052753
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5372	NC_007802	CGT	2	6	264079	264084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052753
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5374	NC_007802	GGC	2	6	264136	264141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052753
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5499	NC_007802	GGC	2	6	270904	270909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052755
5500	NC_007802	CGCC	2	8	270918	270925	0 %	0 %	25 %	75 %	89052755

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