MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Jannaschia sp. CCS1 chromosome

Total Repeats: 91275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007802	ATC	2	6	216861	216866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052712
4502	NC_007802	TGC	2	6	216873	216878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052712
4503	NC_007802	GC	3	6	216899	216904	0 %	0 %	50 %	50 %	89052712
4504	NC_007802	CGG	2	6	216957	216962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052712
4505	NC_007802	CGGCC	2	10	217040	217049	0 %	0 %	40 %	60 %	89052712
4506	NC_007802	CAA	2	6	217072	217077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052712
4507	NC_007802	CCG	2	6	217098	217103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052712
4508	NC_007802	GTT	2	6	217135	217140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052712
4509	NC_007802	CCG	2	6	217257	217262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052712
4510	NC_007802	CAAC	2	8	217360	217367	50 %	0 %	0 %	50 %	89052712
4511	NC_007802	GGC	2	6	217384	217389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052712
4512	NC_007802	CG	3	6	217483	217488	0 %	0 %	50 %	50 %	89052712
4513	NC_007802	GCG	2	6	217495	217500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052712
4514	NC_007802	GC	3	6	217626	217631	0 %	0 %	50 %	50 %	89052712
4515	NC_007802	GCC	2	6	217638	217643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052712
4516	NC_007802	AAG	2	6	217746	217751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052712
4517	NC_007802	CGC	2	6	217758	217763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052712
4518	NC_007802	GTT	2	6	217834	217839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052713
4519	NC_007802	ACA	2	6	217944	217949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052713
4520	NC_007802	CGG	2	6	217979	217984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052713
4521	NC_007802	ATT	2	6	218015	218020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89052713
4522	NC_007802	GTG	2	6	218075	218080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052713
4523	NC_007802	TGC	2	6	218262	218267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052713
4524	NC_007802	GGC	2	6	218368	218373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052713
4525	NC_007802	GAG	2	6	218465	218470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052713
4526	NC_007802	GC	3	6	218541	218546	0 %	0 %	50 %	50 %	89052713
4527	NC_007802	TTCTG	2	10	218583	218592	0 %	60 %	20 %	20 %	89052713
4528	NC_007802	GC	3	6	218604	218609	0 %	0 %	50 %	50 %	89052713
4529	NC_007802	GC	3	6	218637	218642	0 %	0 %	50 %	50 %	89052713
4530	NC_007802	AGC	2	6	218688	218693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052713
4531	NC_007802	CGT	2	6	218752	218757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052713
4532	NC_007802	CCGCC	2	10	218800	218809	0 %	0 %	20 %	80 %	89052713
4533	NC_007802	T	8	8	218924	218931	0 %	100 %	0 %	0 %	89052713
4534	NC_007802	GACA	2	8	218949	218956	50 %	0 %	25 %	25 %	89052713
4535	NC_007802	GGA	2	6	219115	219120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052713
4536	NC_007802	ATG	2	6	219156	219161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052713
4537	NC_007802	GGTTT	2	10	219210	219219	0 %	60 %	40 %	0 %	89052713
4538	NC_007802	GGC	2	6	219241	219246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052713
4539	NC_007802	TCG	2	6	219249	219254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052714
4540	NC_007802	TCAG	2	8	219263	219270	25 %	25 %	25 %	25 %	89052714
4541	NC_007802	GCG	2	6	219387	219392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052714
4542	NC_007802	CAG	2	6	219394	219399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052714
4543	NC_007802	CCG	2	6	219429	219434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052714
4544	NC_007802	CG	3	6	219448	219453	0 %	0 %	50 %	50 %	89052714
4545	NC_007802	CG	3	6	219578	219583	0 %	0 %	50 %	50 %	89052714
4546	NC_007802	TGC	2	6	219642	219647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052714
4547	NC_007802	GCG	2	6	219675	219680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052714
4548	NC_007802	AGA	2	6	219683	219688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052714
4549	NC_007802	TTC	2	6	219776	219781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052715
4550	NC_007802	CGG	2	6	219823	219828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052715
4551	NC_007802	CCGA	2	8	219913	219920	25 %	0 %	25 %	50 %	89052715
4552	NC_007802	GAT	2	6	219954	219959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052715
4553	NC_007802	CG	3	6	220050	220055	0 %	0 %	50 %	50 %	89052715
4554	NC_007802	CATGGG	2	12	220145	220156	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	89052715
4555	NC_007802	GAC	2	6	220233	220238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052715
4556	NC_007802	CTGAT	2	10	220339	220348	20 %	40 %	20 %	20 %	89052715
4557	NC_007802	ACG	2	6	220379	220384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052715
4558	NC_007802	TGA	2	6	220406	220411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052715
4559	NC_007802	AG	4	8	220423	220430	50 %	0 %	50 %	0 %	89052715
4560	NC_007802	GCG	2	6	220519	220524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_007802	CG	4	8	220541	220548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_007802	ACC	2	6	220609	220614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052716
4563	NC_007802	ATG	2	6	220633	220638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052716
4564	NC_007802	CGT	2	6	220646	220651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052716
4565	NC_007802	GGA	2	6	220652	220657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052716
4566	NC_007802	CG	3	6	220724	220729	0 %	0 %	50 %	50 %	89052716
4567	NC_007802	CAG	2	6	220800	220805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052716
4568	NC_007802	CG	3	6	220845	220850	0 %	0 %	50 %	50 %	89052716
4569	NC_007802	ACG	2	6	220851	220856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052716
4570	NC_007802	GGGC	2	8	220877	220884	0 %	0 %	75 %	25 %	89052716
4571	NC_007802	GC	4	8	220883	220890	0 %	0 %	50 %	50 %	89052716
4572	NC_007802	TTC	2	6	220923	220928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052716
4573	NC_007802	GC	5	10	221047	221056	0 %	0 %	50 %	50 %	89052716
4574	NC_007802	AAC	2	6	221071	221076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052716
4575	NC_007802	AGG	2	6	221176	221181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052716
4576	NC_007802	GGT	2	6	221357	221362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052717
4577	NC_007802	CCA	3	9	221368	221376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052717
4578	NC_007802	TGT	2	6	221377	221382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052717
4579	NC_007802	CGA	2	6	221441	221446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052717
4580	NC_007802	CG	3	6	221491	221496	0 %	0 %	50 %	50 %	89052717
4581	NC_007802	GGT	2	6	221549	221554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052717
4582	NC_007802	GGC	2	6	221576	221581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052717
4583	NC_007802	ACG	2	6	221601	221606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052717
4584	NC_007802	CCA	2	6	221703	221708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052717
4585	NC_007802	GTG	2	6	221739	221744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052717
4586	NC_007802	TC	3	6	221849	221854	0 %	50 %	0 %	50 %	89052718
4587	NC_007802	CAC	2	6	221940	221945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052718
4588	NC_007802	CTCA	2	8	221967	221974	25 %	25 %	0 %	50 %	89052718
4589	NC_007802	CCGT	2	8	221986	221993	0 %	25 %	25 %	50 %	89052718
4590	NC_007802	CAT	2	6	222008	222013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052718
4591	NC_007802	CG	3	6	222060	222065	0 %	0 %	50 %	50 %	89052718
4592	NC_007802	ATC	2	6	222067	222072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052718
4593	NC_007802	CTC	2	6	222075	222080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89052718
4594	NC_007802	GGTC	2	8	222128	222135	0 %	25 %	50 %	25 %	89052718
4595	NC_007802	GCC	2	6	222227	222232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052718
4596	NC_007802	AGA	2	6	222298	222303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052718
4597	NC_007802	GAT	2	6	222342	222347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052718
4598	NC_007802	CGCA	2	8	222453	222460	25 %	0 %	25 %	50 %	89052719
4599	NC_007802	CGC	2	6	222564	222569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052719
4600	NC_007802	C	6	6	222602	222607	0 %	0 %	0 %	100 %	89052719
4601	NC_007802	TGC	3	9	222619	222627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052719
4602	NC_007802	GC	3	6	222740	222745	0 %	0 %	50 %	50 %	89052719
4603	NC_007802	CA	3	6	222903	222908	50 %	0 %	0 %	50 %	89052719
4604	NC_007802	CAAT	2	8	222946	222953	50 %	25 %	0 %	25 %	89052719
4605	NC_007802	AT	3	6	223034	223039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_007802	TTCT	2	8	223193	223200	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_007802	GTCC	2	8	223222	223229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_007802	GCCCGC	2	12	223460	223471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052720
4609	NC_007802	GCT	2	6	223472	223477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052720
4610	NC_007802	CAA	2	6	223496	223501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052720
4611	NC_007802	GCGAC	2	10	223522	223531	20 %	0 %	40 %	40 %	89052720
4612	NC_007802	GCTGC	2	10	223541	223550	0 %	20 %	40 %	40 %	89052720
4613	NC_007802	TGA	2	6	223615	223620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052720
4614	NC_007802	AGGC	2	8	223626	223633	25 %	0 %	50 %	25 %	89052720
4615	NC_007802	AC	3	6	223719	223724	50 %	0 %	0 %	50 %	89052720
4616	NC_007802	CGG	2	6	223800	223805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052720
4617	NC_007802	GCA	2	6	223989	223994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052720
4618	NC_007802	TTCGC	2	10	224001	224010	0 %	40 %	20 %	40 %	89052720
4619	NC_007802	TCAG	2	8	224077	224084	25 %	25 %	25 %	25 %	89052720
4620	NC_007802	CT	3	6	224107	224112	0 %	50 %	0 %	50 %	89052720
4621	NC_007802	GGAT	2	8	224152	224159	25 %	25 %	50 %	0 %	89052720
4622	NC_007802	ACGGC	2	10	224234	224243	20 %	0 %	40 %	40 %	89052720
4623	NC_007802	GAT	2	6	224366	224371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052720
4624	NC_007802	GGC	2	6	224423	224428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052720
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4626	NC_007802	GCG	2	6	224461	224466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052720
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4752	NC_007802	TCA	2	6	231371	231376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052727
4753	NC_007802	CGA	2	6	231402	231407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052727
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4756	NC_007802	GC	3	6	231487	231492	0 %	0 %	50 %	50 %	89052727
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4776	NC_007802	GCAAT	2	10	232407	232416	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4997	NC_007802	GGGT	2	8	245086	245093	0 %	25 %	75 %	0 %	89052739
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