MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Idiomarina loihiensis GSL 199

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021286	GCTCT	2	10	8647	8656	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021286	TTGAG	2	10	24981	24990	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021286	CAGAA	2	10	32288	32297	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021286	AGCTC	2	10	50770	50779	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021286	TTCTT	2	10	52046	52055	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021286	CTAAT	2	10	52188	52197	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021286	AGAGG	2	10	59802	59811	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021286	TTGTT	2	10	61758	61767	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021286	TTAAG	2	10	83796	83805	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021286	TCCCC	2	10	130407	130416	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_021286	GTAAG	2	10	164455	164464	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021286	TTGAA	2	10	168944	168953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021286	TGAGT	2	10	171695	171704	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021286	TCATC	2	10	193919	193928	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021286	AATTT	2	10	202462	202471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021286	GCTAA	2	10	229713	229722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021286	AGCAA	2	10	274951	274960	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021286	CTGGT	2	10	298897	298906	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021286	TAACC	2	10	307413	307422	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_021286	GTTTA	2	10	313828	313837	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021286	TTCTT	2	10	325945	325954	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021286	ATTTT	2	10	326326	326335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021286	AAAAC	2	10	329467	329476	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021286	GTAGG	2	10	350005	350014	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021286	AACTA	2	10	362290	362299	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021286	ACTTA	2	10	366771	366780	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021286	AAAAT	2	10	379864	379873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021286	TGGAA	2	10	397359	397368	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021286	AGGTG	2	10	485631	485640	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021286	CCAGG	2	10	500055	500064	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_021286	CCAGG	2	10	525520	525529	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_021286	ACAAA	2	10	548443	548452	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021286	ATTAA	2	10	588749	588758	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021286	TATTT	2	10	591481	591490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021286	GTTAC	2	10	608134	608143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021286	CCAGG	2	10	610311	610320	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_021286	CAAAA	2	10	620782	620791	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021286	CCTGG	2	10	628835	628844	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021286	CACCT	2	10	677744	677753	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_021286	ATCTT	2	10	681787	681796	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021286	GAAAA	2	10	686384	686393	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021286	ATCTA	2	10	694573	694582	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021286	GTAAA	2	10	715463	715472	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021286	TTGCT	2	10	738821	738830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021286	TGTTA	2	10	740994	741003	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021286	CAATT	2	10	748234	748243	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021286	TATAA	2	10	789182	789191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021286	CGTCT	2	10	798984	798993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_021286	AAATT	2	10	813282	813291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021286	GGTCA	2	10	831466	831475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021286	GTTTT	2	10	864522	864531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021286	TTAAA	2	10	878792	878801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021286	ACCCT	2	10	882415	882424	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_021286	AGCTA	2	10	884006	884015	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021286	TTTTC	2	10	945319	945328	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021286	TTTTC	2	10	954929	954938	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021286	TCAGA	2	10	964382	964391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021286	ATGAA	2	10	965049	965058	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021286	AGCAC	2	10	992726	992735	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_021286	GATAA	2	10	1011616	1011625	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021286	TGCTC	2	10	1051696	1051705	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_021286	GAAAA	2	10	1075050	1075059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021286	TACAA	2	10	1075652	1075661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021286	AGTTT	2	10	1131180	1131189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021286	TGCTT	2	10	1136445	1136454	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021286	ATATT	2	10	1199791	1199800	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021286	TTCGT	2	10	1228968	1228977	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021286	AGTAA	2	10	1232344	1232353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021286	AAGCC	2	10	1249276	1249285	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_021286	CTCGT	2	10	1264656	1264665	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_021286	CGCCT	2	10	1264821	1264830	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_021286	TACCC	2	10	1264843	1264852	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_021286	CGACT	2	10	1265067	1265076	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_021286	GAAGA	2	10	1266381	1266390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021286	AACAC	2	10	1267859	1267868	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_021286	GCTTG	2	10	1268455	1268464	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021286	TTTCG	2	10	1268524	1268533	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021286	AAAAC	2	10	1268568	1268577	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_021286	GTTAA	2	10	1272234	1272243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021286	CTTCT	2	10	1305952	1305961	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_021286	GTTAA	2	10	1306728	1306737	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021286	ATAGT	2	10	1377178	1377187	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021286	TAAAA	2	10	1383422	1383431	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021286	TGTAG	2	10	1440719	1440728	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021286	TCACC	2	10	1482219	1482228	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_021286	AAACC	2	10	1484795	1484804	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_021286	TGAAA	2	10	1506647	1506656	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021286	TAAAT	2	10	1539784	1539793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021286	AGTAA	2	10	1540686	1540695	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021286	AGCTT	2	10	1544283	1544292	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021286	AACAA	2	10	1551372	1551381	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021286	TGTTC	2	10	1597253	1597262	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021286	CCCGC	2	10	1597963	1597972	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
94	NC_021286	ATTGC	2	10	1609445	1609454	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021286	CTAAC	2	10	1617338	1617347	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_021286	AATAA	2	10	1650571	1650580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021286	TCACT	2	10	1660785	1660794	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_021286	AGTTA	2	10	1692887	1692896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021286	TGTGT	2	10	1701225	1701234	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021286	AAGCT	2	10	1715747	1715756	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021286	GTTTT	2	10	1717910	1717919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021286	AGTTT	2	10	1722164	1722173	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021286	GCAAC	2	10	1723982	1723991	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021286	GACAA	2	10	1737513	1737522	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021286	TCAAA	2	10	1737539	1737548	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021286	AGCGC	2	10	1737624	1737633	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_021286	AATCC	2	10	1740147	1740156	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_021286	CGTAG	2	10	1740548	1740557	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021286	TTCAT	2	10	1751715	1751724	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021286	AAGAC	2	10	1761529	1761538	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021286	TGGAT	2	10	1766756	1766765	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021286	AGTTT	2	10	1769264	1769273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021286	CCTGG	2	10	1779793	1779802	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_021286	TCCTA	2	10	1855232	1855241	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_021286	TTAAT	2	10	1903348	1903357	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021286	CATGC	2	10	1903642	1903651	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_021286	CAGGC	2	10	1904507	1904516	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_021286	CTTCT	2	10	1906213	1906222	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_021286	TACGC	2	10	1907327	1907336	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_021286	CCAGG	2	10	1910644	1910653	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_021286	TTAAC	2	10	1914123	1914132	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021286	GCGGA	2	10	1914170	1914179	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021286	CCTGG	2	10	1919658	1919667	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_021286	ATAAC	2	10	1927724	1927733	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021286	AACCG	2	10	1928044	1928053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_021286	AACAA	2	10	1954033	1954042	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021286	TGCAC	2	10	1955230	1955239	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_021286	TAAAA	2	10	1955332	1955341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021286	CTCGT	2	10	2025366	2025375	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_021286	CGCCT	2	10	2025531	2025540	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_021286	TACCC	2	10	2025553	2025562	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_021286	CGACT	2	10	2025777	2025786	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_021286	GAAGA	2	10	2027091	2027100	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021286	AACAC	2	10	2028714	2028723	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_021286	GCTTG	2	10	2029310	2029319	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021286	TTTCG	2	10	2029379	2029388	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021286	AAAAC	2	10	2029423	2029432	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021286	GTTTA	2	10	2039205	2039214	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021286	GTCCA	2	10	2056130	2056139	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_021286	TAGAG	2	10	2113967	2113976	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021286	CATTA	2	10	2116548	2116557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021286	CTGGA	2	10	2126005	2126014	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021286	TCAAA	2	10	2139386	2139395	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021286	AATAA	2	10	2150274	2150283	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021286	TATTT	2	10	2150305	2150314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021286	CTAGC	2	10	2153940	2153949	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_021286	TGAAA	2	10	2156743	2156752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021286	TAATG	2	10	2191523	2191532	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021286	ATCGC	2	10	2193479	2193488	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_021286	GCTTT	2	10	2205203	2205212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_021286	AATAC	2	10	2205266	2205275	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021286	GAAGC	2	10	2208114	2208123	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_021286	AATTT	2	10	2219285	2219294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021286	GCACA	2	10	2219328	2219337	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_021286	GTGCA	2	10	2219370	2219379	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_021286	AGTTA	2	10	2223318	2223327	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021286	TTGTG	2	10	2223466	2223475	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021286	GAGCT	2	10	2231062	2231071	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_021286	CTGAC	2	10	2266464	2266473	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_021286	TCGCG	2	10	2274645	2274654	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_021286	CAATT	2	10	2286453	2286462	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_021286	TTTTC	2	10	2295251	2295260	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_021286	CCTGG	2	10	2314554	2314563	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
164	NC_021286	TAAAA	2	10	2323187	2323196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021286	ACGAT	2	10	2325666	2325675	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_021286	GTTAA	2	10	2340037	2340046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021286	TAAGG	2	10	2397878	2397887	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021286	GGTGG	2	10	2431043	2431052	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
169	NC_021286	CCTGG	2	10	2431189	2431198	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
170	NC_021286	CTCGT	2	10	2434177	2434186	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
171	NC_021286	CGCCT	2	10	2434342	2434351	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
172	NC_021286	TACCC	2	10	2434364	2434373	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
173	NC_021286	CGACT	2	10	2434588	2434597	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
174	NC_021286	GAAGA	2	10	2435903	2435912	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021286	AACAC	2	10	2437526	2437535	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
176	NC_021286	GCTTG	2	10	2438122	2438131	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
177	NC_021286	ATAAA	2	10	2456499	2456508	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021286	TGTTT	2	10	2518230	2518239	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021286	TGAGA	2	10	2576956	2576965	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
180	NC_021286	ATCAA	2	10	2592899	2592908	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
181	NC_021286	CCTGG	2	10	2598867	2598876	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
182	NC_021286	AGGTG	2	10	2638714	2638723	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021286	CCTGG	2	10	2638838	2638847	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NC_021286	GTTGG	2	10	2649283	2649292	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021286	TTAAG	2	10	2676997	2677006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021286	TAAAA	2	10	2706676	2706685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021286	CCTGG	2	10	2747376	2747385	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
188	NC_021286	CTCGT	2	10	2750520	2750529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
189	NC_021286	CGCCT	2	10	2750685	2750694	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
190	NC_021286	TACCC	2	10	2750707	2750716	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
191	NC_021286	CGACT	2	10	2750931	2750940	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
192	NC_021286	GCTTG	2	10	2754463	2754472	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
193	NC_021286	TATAA	2	10	2781740	2781749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_021286	TAAAA	2	10	2786650	2786659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021286	TAAGG	2	10	2796124	2796133	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
196	NC_021286	TGTGG	2	10	2800555	2800564	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
197	NC_021286	ATACT	2	10	2800577	2800586	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_021286	TTTTA	2	10	2801286	2801295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_021286	ATTTG	2	10	2839607	2839616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.