MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ignavibacterium album JCM 16511 chromosome

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017464	TTACTA	2	12	1751	1762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017464	ATAAAA	2	12	30625	30636	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017464	ATTTGG	2	12	91465	91476	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017464	ACTTTT	2	12	100796	100807	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017464	GTTTTT	2	12	133215	133226	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017464	ATTAGA	2	12	133298	133309	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017464	TAATTT	2	12	182786	182797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017464	ATTTTT	2	12	192598	192609	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017464	AATTGG	2	12	203534	203545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017464	TAAAAA	2	12	208881	208892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017464	TAAAAA	2	12	232800	232811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017464	AAAACA	2	12	288156	288167	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017464	ATATGT	2	12	461742	461753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017464	TCTAAT	2	12	489078	489089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017464	ATTTTT	2	12	490794	490805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017464	AGTTCA	2	12	587868	587879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017464	ATTGAT	2	12	667643	667654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017464	AAATAA	2	12	684657	684668	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017464	GAAAAA	2	12	724646	724657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017464	TAAATA	2	12	738271	738282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017464	AAAAAC	2	12	741604	741615	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017464	ATTTGA	2	12	773490	773501	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017464	TCAGGG	2	12	799097	799108	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017464	GAAATA	2	12	805050	805061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017464	CAAAAT	2	12	807732	807743	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017464	TTTTTA	2	12	914003	914014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017464	AAAACA	2	12	962265	962276	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017464	AATAAA	2	12	990289	990300	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017464	TTTTGT	2	12	1003461	1003472	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017464	TTATTT	2	12	1035326	1035337	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017464	TTAAAT	2	12	1071149	1071160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017464	ACTAAG	2	12	1209598	1209609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017464	TCCCAA	2	12	1233812	1233823	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017464	AAATAA	3	18	1263157	1263174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017464	TTAAGA	2	12	1272739	1272750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017464	AAAGCA	2	12	1382080	1382091	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017464	AAGGGA	2	12	1382138	1382149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017464	CTTGTT	2	12	1386443	1386454	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017464	TCTTTT	2	12	1391063	1391074	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017464	TCTTAC	2	12	1391826	1391837	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017464	TCTTAC	2	12	1391844	1391855	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017464	TCTAAT	2	12	1444289	1444300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017464	ATTTCT	2	12	1482743	1482754	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017464	ATTTTT	2	12	1525396	1525407	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017464	TCAGCT	2	12	1541673	1541684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017464	TTTCAT	2	12	1546933	1546944	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017464	ACAAAA	2	12	1548118	1548129	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017464	ACAGAA	2	12	1580335	1580346	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017464	ATTGTA	2	12	1590694	1590705	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017464	TAAATT	2	12	1590733	1590744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017464	TTTTAT	2	12	1608774	1608785	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017464	GATTTT	2	12	1726118	1726129	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017464	TATCAT	2	12	1745284	1745295	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017464	AAGTTT	2	12	1805365	1805376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017464	ATTTTA	2	12	1811323	1811334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017464	TATTTT	2	12	1822047	1822058	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017464	ATTAAA	2	12	1878065	1878076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017464	CTTATC	2	12	1946728	1946739	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017464	CAATTT	2	12	2005389	2005400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017464	ACTATA	2	12	2015659	2015670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017464	CTAAAT	2	12	2042212	2042223	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017464	AATTTC	2	12	2113525	2113536	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017464	CTAAAT	2	12	2155003	2155014	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017464	CTTATT	2	12	2210549	2210560	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017464	TTAACC	2	12	2233589	2233600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017464	TTTATT	2	12	2259924	2259935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017464	AGAGTA	2	12	2268478	2268489	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017464	GAGTAA	2	12	2268497	2268508	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017464	CTTAAT	2	12	2310710	2310721	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017464	CAAAAA	2	12	2366533	2366544	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017464	AAAAAG	2	12	2393960	2393971	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017464	TTTAAG	2	12	2420648	2420659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017464	GTTTAA	2	12	2420665	2420676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017464	AACTTA	3	18	2421161	2421178	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017464	TTGATT	2	12	2438695	2438706	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017464	CTCTTT	2	12	2486831	2486842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017464	TTCAAA	2	12	2486950	2486961	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017464	GCAACA	2	12	2525473	2525484	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017464	ATATTT	2	12	2547171	2547182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017464	TAAAGC	2	12	2554690	2554701	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017464	AAATTA	2	12	2597886	2597897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017464	AAAAAG	2	12	2602661	2602672	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017464	TAAGTT	3	18	2627854	2627871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017464	GTTTAA	2	12	2627875	2627886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017464	AGTTAA	2	12	2628527	2628538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017464	AAGTTT	2	12	2628586	2628597	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017464	TTTTGT	2	12	2663991	2664002	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017464	TCATAT	2	12	2669023	2669034	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017464	TTAATG	2	12	2746248	2746259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017464	TCTAAT	2	12	2768402	2768413	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017464	AAAATA	2	12	2812891	2812902	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017464	ATTTTA	2	12	2814366	2814377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017464	TAAAAC	2	12	2814379	2814390	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017464	AAAATA	2	12	2820784	2820795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017464	AAAAAT	2	12	2960846	2960857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017464	ATAAAA	2	12	2983513	2983524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017464	ACATTT	2	12	2993334	2993345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017464	AAATTA	2	12	2998392	2998403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017464	TATCAT	2	12	3000654	3000665	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017464	GTATTT	2	12	3029887	3029898	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017464	ATTTTT	2	12	3043936	3043947	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017464	TTTAAT	2	12	3056950	3056961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017464	TGATTG	2	12	3072330	3072341	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017464	CAAAAA	2	12	3161731	3161742	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017464	TCTAAT	2	12	3167705	3167716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017464	GTAATA	2	12	3172919	3172930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017464	AACTTA	2	12	3175310	3175321	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017464	ATTTTT	2	12	3190779	3190790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017464	TAAAAA	2	12	3194253	3194264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017464	CTGTTT	2	12	3199482	3199493	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017464	CTTTGC	2	12	3206361	3206372	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017464	TTTAAA	2	12	3227588	3227599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017464	GTAATT	2	12	3324869	3324880	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017464	TTTTGC	2	12	3330383	3330394	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017464	TAAAAG	2	12	3355744	3355755	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017464	AGAGTA	2	12	3389359	3389370	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017464	TAAAAT	2	12	3389417	3389428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017464	GTATTT	2	12	3429528	3429539	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017464	GTATTT	2	12	3434497	3434508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017464	ATTTAA	2	12	3457777	3457788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017464	TATCAT	2	12	3460576	3460587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017464	ACTTAT	2	12	3511546	3511557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017464	CTTTTT	2	12	3524229	3524240	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017464	ATTTTT	2	12	3527827	3527838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017464	TCAGAA	2	12	3529162	3529173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017464	TAAAAA	2	12	3541694	3541705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017464	AAAATT	2	12	3548451	3548462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017464	ATTAAA	2	12	3552981	3552992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017464	TAGTAA	2	12	3597883	3597894	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017464	CTGAAA	2	12	3600213	3600224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017464	GAGTAA	2	12	3611358	3611369	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017464	AAAAAT	2	12	3613275	3613286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017464	AAAAAT	2	12	3647094	3647105	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017464	AAATAT	2	12	3658421	3658432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.